Nucléotide Flashcards
1- Quelle est la différence entre un sucre désoxyribose et ribose ?
Le désoxyribose possède un H à son carbone 2 ‘ alors que le ribose possède un OH au 2’.
2- Quelles bases azotées sont des purines? Et des pyrimidines ?
Purine = Guanine et Adénine
Pyrimidine = Uracile, Thymine et cytosine
3- Dessiner les différentes bases azotées ?
doc révision
4- Qu’est-ce qu’un nucléoside ?
Une base azotée avec son sucre. Il manque l groupement phosphate
5- Comment est attaché une purine à son sucre ? et une pyrimidine à son sucre ?
La purine va faire un lien entre le carbone 1’ du sucre et l’azote 9’ de la base. La pyrimidine va faire son lien entre le carbone 1’ du sucre et l’azote 1’ de la base.
- doc révision
6- Comment numéroter nucléotides (acide nucléiques) ?
On commence toujours avec les azotes, ils doivent avoir les chiffres les plus faibles. Par la suite, il faut commencer à numéroter les cycles avec le plus d’azotes, ensuite ceux avec des composants autres que des carbones ou hydrogènes, suivi par les plus grands cycles, suivi par le nitrogène le plus proche de la jonction entre cycles. Si les cycles sont de mêmes nombres, il faut numéroter celui avec le plus d’azotes en premier. Tu numérote vers la jonction la plus loin d’où tu as commencé à compter
7-Qu’est-ce qu’un nucléotide ?
C’est un nucléoside avec 1, 2 ou 3 phosphates lié au carbone 5’ du sucre
8- Qu’est-ce qu’un phosphate alpha? Beta ? Lambda? …
Alpha c’est le phosphate de la jonction 5’, beta c’est le deuxième phosphate après la jonction 5’ ….
9- Savoir comment dessiner les différents ribonucléotides ou désoxyribonucléotides
présentation
10- Reconnaitre la xanthine
présentation
11- Comment se fait la polymérisation des nucléotides ?
Le phosphate alpha sur le carbone 5’ va se coller au OH du nucléotide 3’ précédent. Le lien formé s’appelle un lien phosphodiester. Lors de cette adition un pyrophosphate va être relâchée. Cette élongation se fait toujours du 5’ vers le 3’ (parce qu’elle se fait toujours au niveau du OH)
12- Quelle est la structure de l’ADN?
Elle est formée de deux brins complémentaires qui sert de modèles lors de la réplication. Les purines vont faire des ponts hydrogènes avec une pyrimidine (A et T ou U et C et G). Le A va former 2 ponts avec le T ou le U dépendamment si l’on se retrouve dans une molécule d’ADN ou ARN. Les G vont faire 3 ponts avec les C. Il faut aussi savoir que les deux brins sont antiparallèles. Les deux brins vont ainsi former une hélice de PAS DROIT. Il tourne vers la gauche
13- Comment mesurer l’ADN ?
On utilise la paire de base comme unité ou encore le millier de paires de base. Il faut savoir que le génome fait 3x10^9 paires de bases. De plus la masse de l’ADN se compte par paire de base qui est égale à 660 g/mol en moyenne. On multiplie donc le nombre de paires de base par cette masse.
14- Comment les brins d’ADN peuvent se séparer ?
Puisque la seule chose qui les tient ensemble sont les ponts d’hydrogènes entre bases azotées, il est possible de séparer les deux brins en chauffant l’ADN. Il est alors dit que L’ADN fond ou encore qu’il se dénature. La vitesse dépend de la quantité de A-T et C-G puisque les liens entre AT sont plus faibles que les liens CG. Ainsi, une concentration plus élevée en AT mène à une température de dénaturation plus basse. Cette température est utile lors de l’utilisation d’amorces en laboratoire .
15- Comment les brins d’ADN peuvent se renaturer ?
Si on abaisse la température on dit que les brins s’annélisent s’ils rejoignent entre partenaire ou sinon qu’ils s’hybrident s’il rejoint un autre brin de séquence convenable. Les bases vont chercher à s’apparier selon leurs préférences. Il est ainsi possible d’hybrider des fragments d’ADN étranger si les séquences sont assez complémentaires
