Namenclature Flashcards
Oxidoreductases/dehydrogenases
Oxidation/reduction reactions
z.B. LDH (Lactic + NAD+ —–> Pyruvate +NADH+ H+)
Υποκατηγορίες ανάλογα με:
(α) την ομάδα δότη π.χ. CH=O, CH2NH2
(β) τον αποδέκτη π.χ. NADH
Transferases
Transfer reactions (of an atom/group)
z.B. Σερινο-υδροξυ-μεθυλο-τρανσφεράση (Ser + THF —> Gly + THF>O)
Όλα τα ένζυμα μπορούν να θεωρηθούν τρανσφεράσες
Υποκατηγορίες ανάλογα με την ομάδα μου μεταφέρουν
(α) μονοανθρακικές ομάδες (μεθυλοτρανσφεράσες, καρβοξυλοτρανσφεράσες)
(β) καρβονυλικές ομάδες
(γ) αζωτούχες ομάδες
(δ) φωσφορικές ομάδες (κινάσες)
Hydrolases
Bond-breaking reactions using water
z.B. Ουριάση (urea + H2O —> CO2 +2NH3)
Υποκατηγορίες:
(α) εστεράσες (σε εστερικούς δεσμούς): καρβοξυλάσες, φωσφατάσες
(β) γλυκοσυλάσες (σε γλυκοζιτικούς δεσμούς): Ο-υδρόλυση, Ν-υδρόλυση
Lyases
Bond-breaking reactions without water
(αντιδράσεις απομάκρυνσης ομάδων με σχηματισμό διπλού δεσμού, αντιδράσεις προσθήκης σε διπλό δεσμό)
z.B. Pyruvate decarboxylase (Pyruvate —-> Acetaldehyde + CO2)
Υποκατηγορίες:
λυάσες C-C / C-O / C-N
καρβοξυλυάσες / αλδεϋδολυάσες / κετοξυλυάσες
Isomerases
Reactions that yield different isomers
ενδομοριακές μεταβολές!
z.B. MethylmalonylCoA isomerase (methylmalonyl CoA —> succinic CoA)
Υποκατηγορίες:
cis/trans isomerases
που δρουν σε αμινοξέα/υδατάνθρακες/υδορξυοξέα
Ligases/synthases
Bond-formation reactions using the energy of a NTP (ATP)
z.B. Pyruvate carboxylase (Pyruvate + CO2 —> Acetoacetic acid)
Υποκατηγορίες:
σχηματισμός C-O (καρβοξυλάσες)
αμινοξυ-RNA λιγάση