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BIOCHIMIE STRUCTURALE > Module 8 > Flashcards

Module 8 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un oside?

A

Un glucide complexe

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Q

Qu’est-ce qu’un holoside?

A

Un oside formé par l’association de molécules d’oses ou de dérivés d’oses uniquement

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3
Q

Qu’est-ce qu’un hétéroside (aussi appelé glycoconjugué)?

A

Un oside formé par l’association d’un ou plusieurs oses avec une molécule non glucidique (aglycone)

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Q

Qu’est-ce qu’un disaccharide?

A

Un holoside formé de 2 résidus d’oses ou de dérivés d’oses réunis par une liaison glycosidique

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Q

Qu’est-ce qu’un oligosaccharide?

A

Un holoside formé de 3 à 20 résidus d’oses ou de dérivés d’oses

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6
Q

Qu’est-ce qu’un polysaccharide?

A

Un holoside formé de plus de 20 résidus d’oses ou de dérivés d’oses

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7
Q

Nommer les caractéristiques du maltose.

A
  • Homodisaccharide composé de D-glucose
  • Liaison α(1-4)
  • Produit de l’hydrolyse de l’amidon et du glycogène
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8
Q

Nommer les caractéristiques de la cellobiose.

A
  • Homodisaccharide composé de D-glucose
  • Liaison β(1-4)
  • Produit de l’hydrolyse de la cellulose
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9
Q

Nommer les caractéristiques du lactose.

A
  • Hétérodisaccharide composé de D-galactose et de D-glucose
  • Liaison β(1-4)
  • Sucre du lait
  • Source majeure d’énergie chez l’animal
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10
Q

Nommer les caractéristiques du sucrose.

A
  • Hétérodisaccharide composé de D-glucose et de D-fructose
  • Liaison α(1-2)
  • Présents dans les plantes, les fruits et le sucre de table
  • Disaccharide le plus abondant
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11
Q

Nommer les caractéristiques de l’α-amylose.

A
  • Polysaccharide composé d’unités de maltose
  • Liaison α(1-4)
  • Aucune ramification
  • Fonction: réserve d’énergie
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12
Q

Nommer les caractéristiques de l’amylopectine.

A
  • Polysaccharide composé d’unités de maltose
  • Liaison α(1-4)
  • Ramification α(1-6)
  • Fonction: réserve d’énergie
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13
Q

Nommer les caractéristiques du glycogène.

A
  • Polysaccharide composé d’unités de maltose
  • Liaison α(1-4)
  • Ramification α(1-6)
  • Fonction: réserve d’énergie
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14
Q

Nommer les caractéristiques de la cellulose.

A
  • Polysaccharide composé d’unités de cellobiose
  • Liaison β(1-4)
  • Aucune ramification
  • Fonction: structure
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15
Q

Nommer les caractéristiques de la chitine.

A
  • Polysaccharide composé d’unités de N-acétyl-D-glucosamine
  • Liaison β(1-4)
  • Aucune ramification
  • Fonction: structure
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16
Q

Nommer les caractéristiques de la portion glucidique du peptidoglycane.

A
  • Polysaccharide composé d’unités de N-acétyl-D-glucosamine et d’acide N-acétylmuramique
  • Liaison β(1-4)
  • Aucune ramification
  • Fonction: structure
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17
Q

Nommer les caractéristiques du glycosaminoglycane (GAG).

A
  • Polysaccharide composé d’unités d’osamine et d’acide uronique ou ose
  • Liaison variable
  • Aucune ramification
  • Fonction: structure
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18
Q

Qu’est-ce qu’un sucre réducteur? Donner des exemples.

A

Un holoside est réducteur lorsqu’au moins un de ses carbones anomériques est libre.

Exemples: le maltose, le cellobiose et le lactose sont des sucres réducteurs car ils possèdent un carbone anomérique libre

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19
Q

Donner un exemple d’un sucre non réducteur.

A

Le sucrose, dont les 2 unités sont reliées par un lien osidique entre les 2 carbones anomériques. L’oxydation n’est donc pas possible.

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20
Q

Qu’est-ce qu’une liaison glycosidique?

A

Une liaison covalente formée entre le carbone anomérique d’un ose et un hydroxyle (lien O-glycosidique), amine (lien N-glycosidique) ou thiol (lien S-glycosidique) d’une seconde molécule qui n’est pas nécessairement un ose.

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21
Q

Vrai ou Faux. La mutarotation est toujours possible et ce, même lorsque le carbone anomérique forme une liaison glycosidique.

A

Faux. Lors de la formation de la liaison glycosidique, il n’y a plus de mutarotation possible puisque la linéarisation du résidu n’est plus possible. Par conséquent, la configuration anomérique est gelée.

22
Q

Comment se nomme la réaction enzymatique catalysant la formation d’un lien glycosidique entre un ose et une autre molécule?

A

Glycosylation

23
Q

De quel type de liaison glycosidique sont formés les holosides?

A

Les holosides sont des polymères formés par des liens O-glycosidiques entre les résidus d’oses ou de dérivés d’oses. Ces liaisons se font entre le carbone anomérique d’un premier ose et l’un des groupements hydroxyle d’un second ose.

24
Q

Comment peut-on expliquer la grande diversité des holosides?

A

Par la versatilité de lien glycosidique. Par exemple, le carbone anomérique d’un ose peut former un lien O-glycosidique avec chaque OH de l’autre ose. De plus, le carbone anomérique peut prendre la configuration α ou β avant de former le lien, ce qui double le nombre de possibilités.

25
Q

De quels type de liaisons glycosidiques sont formés les hétérosides?

A

1) liaison N-glycosidique (N-hétéroside): la liaison se fait avec le groupement amide d’une asparagine
2) liaison O-glycosidique (O-hétéroside): la liaison se fait avec le groupement hydroxyle d’une sérine, d’une thréonine ou d’une hydroxylysine
3) liaison S-glycosidique (S-hétéroside): la liaison se fait avec le groupement thiol d’une cystéine

26
Q

Quels sont les hétérosides les plus fréquents? Donner des exemples dans chacune des catégories.

A

1) O-hétéroside

Ex: vaniline glycoside, glycolipides, certaines glycoprotéines

2) N-hétéroside

Ex: nucléosides/nucléotides et certaines glycoprotéines

27
Q

Comment la structure de l’α-amylose est reliée à sa fonction de réserve?

A

1) Polymère linéaire faiblement soluble dans l’eau
2) Constitué de 100 à 1000 unités de maltose
3) Les liens glycosidiques favorisent la formation d’une structure légèrement hélicoïdale, une forme compacte qui est idéale pour le stockage

28
Q

Comment l’amylopectine se différencie-t-elle de l’α-amylose?

A

Par la présence de ramifications qui préviennent la formation d’hélices, mais qui rendent elles-mêmes la macromolécule plus compacte

29
Q

Comment le glycogène se différencie-t-il de l’amylopectine, les deux ayant la même composition et structure?

A

Par la présence de plus de ramifications.

30
Q

Quel est le glucide le plus important dans l’alimentation humaine et de quoi est-il composé?

A

L’amidon est l’un des principaux polysaccharides de réserve et est composé de résidus de glucose. On le retrouve chez les plantes. C’est un mélange d’α-amylose et d’amylopectine.

31
Q

Quel est l’homologue de l’amidon chez les animaux?

A

Le glycogène

32
Q

Quel est le glucide le plus abondant sur Terre?

A

La cellulose, qui est le principal constituant des parois cellulaires (rôle structural).

33
Q

Comment la composition de la cellulose est liée à sa fonction structurale?

A

La cellulose est un sucre linéaire contenant jusqu’à 15 000 unités de D-glucose réunies par des liaisons osidiques β(1 –> 4). Ces liaisons permettent à la cellulose d’obtenir des chaînes droites qui peuvent se lier entre elles par des liaisons H afin de former des microfibrilles. Ceci confère aux fibres de cellulose une grande résistance mécanique et les rend insoluble dans l’eau.

34
Q

Où retrouve-t-on la chitine?

A

La chitine est le principal constituant structural de l’exosquelette des insectes et des crustacés. Elle est aussi présente dans la paroi cellulaire de certains champignons, certaines algues et certaines levures

35
Q

Vrai ou Faux. La composition de la portion peptidique du peptidoglycane varie selon l’espèce bactérienne, mais on observe fréquemment une alternance d’acides aminés des séries L et D.

A

Vrai

36
Q

Comment est stabilisé la paroi bactérienne par les peptidoglycanes?

A

Des ponts peptidiques sont formés entre les molécules de peptidoglycanes adjacents

37
Q

Quelles sont les différences entre les bactéries à Gram + et les bactéries à Gram - ?

A

Chez les bactéries à Gram +, l’épaisseur de la couche de peptidoglycanes est plus épaisse que chez les bactéries à Gram -. De plus, les ponts peptidiques formés dans les bactéries à Gram + contiennent 5 résidus de glycine, tandis que les ponts peptidiques des bactéries à Gram- se forment directement entre les peptides des peptidoglycanes.

38
Q

Où retrouve-t-on les protéoglycanes?

A

Les protéoglycanes sont formés majoritairement (95% de leur poids) de sucres, plus spécifiquement de glycosaminoglycanes (GAGs). On les retrouve principalement dans les tissus conjonctifs. Ils ont généralement des rôles structuraux en procurant un support extracellulaire aux organismes pluricellulaires.

39
Q

Comment les protéoglycanes confèrent-elles une grande élasticité et résistance aux chocs mécaniques?

A

À cause des nombreux groupements ioniques et polaires des glycosaminoglycanes.

En effet, les chaînes de glycosaminoglycanes portent plusieurs charges négatives (grâce à leurs groupements carboxyle et sulfate), ce qui attire un grand volume d’eau. La chaîne de glycosaminoglycanes hydratée occupe un volume environ 1000 fois plus important que la chaîne non hydratée.

Lorsqu’une pression est exercée sur une articulation, les molécules d’eau liées aux protéoglycanes du cartilage sont libérées jusqu’à ce que la force de répulsion entre les charges négatives s’oppose à une compression plus grande. Cela permet d’absorber le choc. Quand il n’y a plus de pression, les protéoglycanes se réhydratent progressivement.

40
Q

Décrire les caractéristiques des lectines.

A
  • Protéines présentes à la surface cellulaire qui induisent une réponse immunitaire
  • Traduisent le code glucidique en se liant spécifiquement à certains glucides
  • Les lectines sont présentes à la surface des cellules, par exemple les cellules endothéliales. Des cellules immunitaires (ex: neutrophiles) peuvent s’y lier et ainsi migrer et atteindre le site d’inflammation
41
Q

Donner un exemple d’osides qui permettent la reconnaissance cellulaire.

A

Les antigènes spécifiques des groupes sanguins, qui sont des glycoconjugués présents à la surface des érythrocytes.

42
Q

Quels rôles ont les osides à la surface des bactéries?

A

Ils ont des rôles contradictoires, pouvant servir à la fois d’antigènes et de camouflage d’antigènes.

43
Q

Qu’est-ce que les biofilms?

A

Les biofilms sont des colonies de bactéries qui sécrètent des polysaccharides servant de colle qui les protège contre l’environnement et qui souvent, leur permet de résister aux antibiotiques.

44
Q

Comment les bactéries peuvent-elles mieux adhérer aux surfaces et aux tissus?

A

Par la présence d’osides à leur surface

45
Q

Que sont les facteurs de nodulation et à quoi servent-ils?

A

1) Les facteurs de nodulation sont des lipopolysaccharides sécrétés par une bactérie et qui sont reconnus par la plante
2) Ils permettent à la plante de former des nodules sur les racines, ce qui favorise sa collaboration avec la bactérie
3) Les facteurs de nodulation sont des osides importants pour la communication bactérie/plante!

46
Q

Quels sont les 3 facteurs qui expliquent que les glucides sont plus difficiles à analyser que les protéines?

A

1) Les polysaccharides n’ont pas de masse moléculaire bien déterminée
2) La microhétérogénéité des sucres
3) La liaison glycosidique est beaucoup plus versatile que la liaison peptidique

47
Q

Quelles sont les méthodes pour analyser la composition d’un glucide complexe?

A

L’hydrolyse puis le HPLC ou la chromatographie gazeuse (CG)

48
Q

Quelles méthodes sont utilisées pour analyser la composition et la séquence des glucides complexes?

A

La RMN ou la spectrométrie de masse

49
Q

Quelles protéines peuvent être utilisées comme ligand dans une chromatographie d’affinité pour la purification des osides?

A

Les lectines

50
Q

Vrai ou Faux. Dans la même cellule, la taille, la composition et la séquence de la partie glucidique d’un oside donné sont variables.

A

Vrai

51
Q

Vrai ou Faux. En raison de la microhétérogénéité des sucres, des protéines identiques sont souvent associées avec des glucides différents.

A

Vrai

52
Q

Que signifie le terme glycome?

A

Le terme glycome est une terme de plus en plus utilisé dans la littérature qui réfère à l’ensemble des oses et des osides retrouvés dans un organisme. Il subit des variations constantes en réponse aux conditions environnementales et est relié à la microhétérogénéité.

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