Module 5 - Nucléotides et acides nucléiques Flashcards
Identifier les bouts 5’ et 3’ d’un brin d’ADN
5’ correspond au carbone du désoxyribose attaché à un groupe phosphate
3’ correspond au carbone attaché à un groupe OH
Différence entre ribose et désoxyribose
Ribose possède un groupement OH sur le carbone 2’ et le désoxyribose H à cette position
Différence entre un nucléoside et nucléotide
Nucléoside : base azotée + sucre (ribose et désoxyribose)
Nucléotide : Nucléoside ainsi que 1 à 3 groupes phosphates
Différence entre purine et pyrimidine?
Purines : bases à double anneau (A et G)
Pyrimidines : bases à anneau simple (C, T et U)
Les noms des phosphates dans un nucléotides triphosphate?
En partant du ribose : alpha, bêta, gamma
Quelle est la configuration de l’hélice ADN
Double hélice de pas droit
Appariement des bases dans l’ADN
A et T (2 ponts H)
C et G (3 ponts H)
Comment mesurer la concentration en ADN dans un solution?
Par absorbante aux UV à 260nm
Une D.O. de 1 correspond à une concentration de 50ng/uL d’ADN double-brin
Que se passe-t-il lorsqu’on chauffe de l’ADN?
Les deux brins se séparent (dénaturation). Ils peuvent se réapparier en refroidissant (hybridation)
Qu’est-ce que le Tm d’une séquence d’ADN?
La température à laquelle 50% des molécules d’ADN sont dénaturées
Quelle molécule est essentielle pour la synthèse de dTMP à partir de dUMP?
L’acide folique
R : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A ou G
Y : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
T ou C
M : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A ou C
W : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A ou T
S : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
C ou G
K : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
G ou T
N : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A ou T ou G ou C
B : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
C, G, T
D : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A, G, T
H : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A, C, T
V : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?
A, C, G
Sur quoi l’ADN pol doit elle s’appuyer pour commencer la réplication?
Une amorce ayant un bout 3’
Qu’est-ce qu’une endonucléase?
Enzyme qui coupe une séquence précise d’ADN, laisse les bouts 3’ OH et 5’ PO4
Peuvent laisser des bouts francs ou proéminents
Vient surtout du fonctionnement des bactéries
Qu’est-ce qu’une ligase
Recolle les ADN coupés, nécessitent l’extrémité 5’ PO4 et l’extrémité 3’ OH
Les brins doivent être complémentaires, peut recoller peut importe l’extrémité
Qu’est-ce que le principe de sites de restriction?
C’est une courte séquence d’ADN reconnue et coupée par endonucléase spécifique
Souvent des séquences palindromiques
Que produit le clivage?
Des extrémités cohésives ou franches
Quelle est l’utilité d’un site de restriction?
Retirer ou insérer des segments d’ADN dans un plasmide
Quelles sont les étapes d’actions de la puromycine?
Elle perturbe la synthèse protéiques est pro et eucaryotes
1. Imitation d’un ARNt par sa ressemblance à l’extrémité 3’ de celui-ci qui vient se lier au site A du ribosome
2. S’incorpore à la chaîne polypeptidique, mais empêche la liaison au prochain acide-aminé
3. Provoque l’arrêt prématuré de la traduction et libérant la chaîne polypeptidique incomplète créant une protéine non-fonctionnelle
Quelle est la masse molaire d’une paire de bases?
660 g/mol
Combien de paire de bases par tour d’ADN?
10 pb/tour
Fonction du site A du ribosome?
Endroit où l’ARNt porte l’anticodon correspondant à l’ARNm et entre dans le ribosome pour ajouter un nouvel acide-aminé
Fonction du site P du ribosome?
Site ou se retrouve la chaîne polypeptidique sur l’ARNt suite à la catalyse de la formation du lien peptidique de l’acide-aminé du site A avec celle du site P
Fonction du site E du ribosome?
Suite à la liaison sur le site P envoyé au A, l’ARNt se déplace sur site E puis quitte le ribosome
