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Biochimie structurale > Module 5 - Nucléotides et acides nucléiques > Flashcards

Module 5 - Nucléotides et acides nucléiques Flashcards

1
Q

Identifier les bouts 5’ et 3’ d’un brin d’ADN

A

5’ correspond au carbone du désoxyribose attaché à un groupe phosphate
3’ correspond au carbone attaché à un groupe OH

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Q

Différence entre ribose et désoxyribose

A

Ribose possède un groupement OH sur le carbone 2’ et le désoxyribose H à cette position

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3
Q

Différence entre un nucléoside et nucléotide

A

Nucléoside : base azotée + sucre (ribose et désoxyribose)
Nucléotide : Nucléoside ainsi que 1 à 3 groupes phosphates

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4
Q

Différence entre purine et pyrimidine?

A

Purines : bases à double anneau (A et G)
Pyrimidines : bases à anneau simple (C, T et U)

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5
Q

Les noms des phosphates dans un nucléotides triphosphate?

A

En partant du ribose : alpha, bêta, gamma

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6
Q

Quelle est la configuration de l’hélice ADN

A

Double hélice de pas droit

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7
Q

Appariement des bases dans l’ADN

A

A et T (2 ponts H)
C et G (3 ponts H)

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8
Q

Comment mesurer la concentration en ADN dans un solution?

A

Par absorbante aux UV à 260nm
Une D.O. de 1 correspond à une concentration de 50ng/uL d’ADN double-brin

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9
Q

Que se passe-t-il lorsqu’on chauffe de l’ADN?

A

Les deux brins se séparent (dénaturation). Ils peuvent se réapparier en refroidissant (hybridation)

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10
Q

Qu’est-ce que le Tm d’une séquence d’ADN?

A

La température à laquelle 50% des molécules d’ADN sont dénaturées

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11
Q

Quelle molécule est essentielle pour la synthèse de dTMP à partir de dUMP?

A

L’acide folique

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12
Q

R : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A ou G

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13
Q

Y : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

T ou C

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14
Q

M : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A ou C

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15
Q

W : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A ou T

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16
Q

S : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

C ou G

17
Q

K : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

G ou T

18
Q

N : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A ou T ou G ou C

19
Q

B : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

C, G, T

20
Q

D : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A, G, T

21
Q

H : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A, C, T

22
Q

V : Quelles bases azotées peuvent correspondre à cette lettre?

A

A, C, G

23
Q

Sur quoi l’ADN pol doit elle s’appuyer pour commencer la réplication?

A

Une amorce ayant un bout 3’

24
Q

Qu’est-ce qu’une endonucléase?

A

Enzyme qui coupe une séquence précise d’ADN, laisse les bouts 3’ OH et 5’ PO4
Peuvent laisser des bouts francs ou proéminents
Vient surtout du fonctionnement des bactéries

25
Q

Qu’est-ce qu’une ligase

A

Recolle les ADN coupés, nécessitent l’extrémité 5’ PO4 et l’extrémité 3’ OH
Les brins doivent être complémentaires, peut recoller peut importe l’extrémité

26
Q

Qu’est-ce que le principe de sites de restriction?

A

C’est une courte séquence d’ADN reconnue et coupée par endonucléase spécifique
Souvent des séquences palindromiques

27
Q

Que produit le clivage?

A

Des extrémités cohésives ou franches

28
Q

Quelle est l’utilité d’un site de restriction?

A

Retirer ou insérer des segments d’ADN dans un plasmide

29
Q

Quelles sont les étapes d’actions de la puromycine?

A

Elle perturbe la synthèse protéiques est pro et eucaryotes
1. Imitation d’un ARNt par sa ressemblance à l’extrémité 3’ de celui-ci qui vient se lier au site A du ribosome
2. S’incorpore à la chaîne polypeptidique, mais empêche la liaison au prochain acide-aminé
3. Provoque l’arrêt prématuré de la traduction et libérant la chaîne polypeptidique incomplète créant une protéine non-fonctionnelle

30
Q

Quelle est la masse molaire d’une paire de bases?

A

660 g/mol

31
Q

Combien de paire de bases par tour d’ADN?

A

10 pb/tour

32
Q

Fonction du site A du ribosome?

A

Endroit où l’ARNt porte l’anticodon correspondant à l’ARNm et entre dans le ribosome pour ajouter un nouvel acide-aminé

33
Q

Fonction du site P du ribosome?

A

Site ou se retrouve la chaîne polypeptidique sur l’ARNt suite à la catalyse de la formation du lien peptidique de l’acide-aminé du site A avec celle du site P

34
Q

Fonction du site E du ribosome?

A

Suite à la liaison sur le site P envoyé au A, l’ARNt se déplace sur site E puis quitte le ribosome

Biochimie structurale (6 decks)

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