Module 4. Génétique Flashcards
Lorsqu’on prend la distribution normale des performances observés, si j’ajoute un écart-type à la moyenne, quelle proportion de la population est-ce que je cerne ?
68% de la population
Lorsqu’on prend la distribution normale des performances observés, si j’ajoute 2 écarts-types à la moyenne, quelle proportion de la population est-ce que je cerne ?
95% de la population
Lorsqu’on prend la distribution normale des performances observés, si j’ajoute 3 écarts-types à la moyenne, quelle proportion de la population est-ce que je cerne ?
99% de la population
Quelle est l’équation liée à la génétique ?
P= G+ E
Phénotype, génotype, environnement.
Définissez l’héritabilité.
Représente la proportion (%) de la variation des
performances d’un caractère qui est attribuable à la
génétique donc transmissible à la progéniture
À quoi sert l’héritabilité ?
Utilisée pour séparer de la variation phénotypique
les composantes génétiques et environnementales
Que signifie un h2 de 100 ?
toutes les différences sont génétiques (transmissibles)
Vrai ou faux. L’héritabilité est constante dans toutes les populations.
Faux. Variation des valeurs pour un même caractère selon les études
Vrai ou faux. L’héritabilité évolue dans le temps.
Pour une population donnée, elle évolue au cours du temps
(changements environnementaux, sélection, gain ou perte de
diversité génétique)
Globalement, l’héritabilité pour les caractères de reproduction est ____.
faible (<20%).
Progrès génétique
réalisable par la
sélection est faible
Globalement, l’héritabilité pour les caractères de croissance est ____.
Moyenne (20-40%)
Progrès génétique
réalisable par la
sélection est moyen
Globalement, l’héritabilité pour les caractères de carcasse est ____.
Élevée (>40%)
Progrès génétique
réalisable par la
sélection est élevé.
Écrivez et expliquez l’équation de la réponse à la sélection.
RS = h2 x DS
RS= réponse à la sélection
H2= héritabilité
DS= différentiel de sélection
Plus l’héritabilité est élevée, plus ma réponse à la sélection est élevée.
Qu’est-ce qu’une corrélation Génétique et Phénotypique?
Relation entre deux caractères
(entre valeurs génétiques calculées ou entre performances observées)
Vrai ou faux. Une corrélation peut être positive ou négative.
Vrai.
Vrai ou faux. Les corrélations sont des mesures absolues pour un caractère.
Faux.
Nommez deux choses que les corrélations permettent de faire.
- Prédire la répercussion de la sélection sur un caractère sur la
valeur d’un autre (ex. pds naissance sur taux de survie) - sélectionner sur un caractère difficilement mesurable en
sélectionnant sur un autre caractère plus facilement mesurable
(ex. poids à 120 j corrélé négativement avec l’âge à la puberté)
Vrai ou faux. Une corrélation négative est nécessairement défavorable.
Faux. ex. pds à 120 j et âge à la 1re chaleur. On veut diminuer l’âge à la puberté. Donc c’est favorable. Une corrélation négative peut être favorable.
Vrai ou faux. Une corrélation positive est nécessairement favorable.
faux. épaisseur du gras dorsal et % gras carcasse
Vrai ou faux. Les corrélations liées au poids sont généralement positives.
Vrai, sauf pour le GMQ avec le % gras carcasse (corrélation négative).
Qu’est-ce qu’un ÉPD ?
Écart prévu de la descendance. Permet d’estimer la « vraie » valeur génétique d’un individu
Quel est le principe Genovis ?
Comparaison (+ ou ‐) par rapport à la moyenne
des performances (année en cours – 10 ans) de toutes les races
confondues (année de référence mobile)
En 2022, quelle est l’année de comparaison pour les performances ?
2012.
Vrai ou faux. Les ÉPD sont exprimés en unité réelle du caractère.
Vrai
Que signifie un ÉPD 100 jours de +3,5 kg pour un bélier Suffolk.
Que les agenaux qu’il poiduira pèseraient, en moyenne,
3,5 kg de plus à 100 jours d’âge que la moyenne de poids à 100
jours de tous les agneaux évalués en 2012 au niveau canadien
Comment augmenter la précision des ÉPD ?
En augmentant les connexions génétiques entre les troupeaux (vente de bélier, insémination).
Les ÉPD sont-ils en constante évolution ?
Oui, ils sont calculés toutes les semaines.
Qu’est-ce que la répétabilité ?
Mesure la PRÉCISION (« accuracy », « reliability ») de la valeur de
l’ÉPD estimée (calculée)
La répétabilité augmente en fonction…
du nombre d’informations utilisées pour le calcul.
Quels sont les risques lorsque la répétabilité est plus faible ?
Quand REP est basse (10‐20 %), il y a plus de chance de voir
changer la valeur de l’ÉPD avec l’arrivée de nouvelles informations
La répétabilité est plus élevée pour les caractères de _________ versus ceux de _________.
Croissance, reproduction. Le calcul de la répétabilité est lié au h2.
Quelles sont les chances de son tromper lorsque la répétabilité est >80.
Très faible.
Ne changera pas beaucoup
Quelles sont les chances de son tromper lorsque la répétabilité est entre 60 et 80.
Faible
Faible changement possible,
données sur plusieurs progénitures
Quelles sont les chances de son tromper lorsque la répétabilité est entre 40 et 60.
Modérée
Changement sans doute, quelques
données sur la progéniture
Quelles sont les chances de son tromper lorsque la répétabilité est <40.
Élevé
Grande possibilité de changement
avec plus d’informations
Qu’est-ce que la mesure aux ultrasons?
Mesures du gras dorsal et de l’épaisseur de l’oeil de longe sur
l’agneau vivant idéalement lors de la pesée à 100 j (73‐135 j), au
poids moyen autour de 35 kg (entre 30‐45 kg ‐ près de l’abattage).
Mesure par échographie entre la 3 ‐ 4e vertèbres lombaires
Qu’est-ce qu’un ÉPD direct ?
influence de l’individu lui‐même sur le paramètre
mesuré (sa propre génétique)
Qu’est-ce qu’un ÉPD maternel ?
ÉPD « maternel » : Influence de la mère sur le paramètre mesuré chez
l’agneau (ex. pds à 50 j dépend de la quantité et qualité [composition,
anticorps] du lait de la mère, comportement maternel‐soins…)
Qu’est-ce qu’un poids ajusté dans genovis ? En fonction de quoi sont-ils ajustés (4)?
- Ajustés pour l’âge à la pesée
- Le sexe
- L’âge de la mère
- Le nbre né et élevé
(équivalent à un mâle pesé exactement à 50 j, né et élevé simple, d’une mère de 4 ans)
À quoi sert le rang centile ?
Aide à situer un ÉPD dans une population d’animaux…
Aide donc à situer un animal dans la population de référence
Que signifie un rang centile 80 pour un animal ?
Un animal qui a un rang centile de 80 % pour un caractère
indique que 80 % des animaux lui sont inférieurs, alors que
20 % lui sont supérieurs
(il est donc dans le top 20 % supérieur de la population de référence)
À partir de quel rang centile, on considère l’animal comme supérieur à sa race.
+50
Vrai ou faux. Le rang centile sur Genovis considère les animaux de la même race seulement.
Vrai et faux. Les animaux sont classés par race si on a suffisamment d’animaux. Sinon, on parle d’un groupe de race. Par exemple, le North Country Cheviot est seul dans sa catégorie. À l’opposé, le Border Cheviot est comparé à 3 autres races (Leicester, British Milk Sheep, Clunn forest).
Quel est le critère Genovis le plus important pour déterminer si je garde ou non l’animal ?
Le rang centile.
Qu’est-ce qu’un indice génétique et quel est l’objectif ?
Indice génétique : Combinaison d’ÉPD pour obtenir qu’un seul
chiffre pour la valeur génétique d’un individu
-faciliter la sélection
Quels sont les trois critères sur lesquels sont basés les indices génétiques pour la sélection ?
- Valeur économique relative des caractères
- Héritabilité des caractères
- Corrélations entre les caractères
Quels sont les 4 ÉPD utilisés pour former l’indice de gain ?
- Survie des agneaux direct
- Poids 50 jours direct
- Poids naissance direct
- Gain 50-100 jours
À qui sert l’indice gain?
Sélection des
races paternelles
À qui sert l’indice maternel ?
Sélection des races
maternelles prolifiques
Pour races dont la prolificité
est près de l’optimal
(ex. Arcott Rideau, Romanov)
Globalement, de quoi est composé l’indice maternel ?
Caractères de reproduction
(53 %), croissance (41 %)
et intervalle d’agnelage (6 %)
Quel est le poids donné aux nombre d’agneau nés par agnelage dans l’indice maternel ?
10% du poids de l’indice est donné au nb d’agneau nés par agnelage. On ne veut pas le baisser mais on ne veut pas l’améliorer.
À qui sert l’indice maternel hausse prolificité ?
Sélection des races
maternelles non prolifiques
Prolificité à améliorer
(Ex. Dorset, Polypay)
Globalement, de quoi est composé l’indice maternel haute prolificité ?
Caractères de reproduction
hausse prolificité (53 %) et
croissance (41 %) et
intervalle d’agnelage (6 %)
Quel est le poids donné aux nombre d’agneau nés par agnelage (1er et suivant) dans l’indice maternel haute prolificité ?
On donne 8,5% pour le nés 1er agnelage et 15% pour le nombre nés à l’agnelage suivant.
Par rapport à l’indice gain, quels ÉPD sont ajoutés dans l’indice carcasse ?
On ajoute la mesure de la longe et de gras.
on garde les 4 autres critères.
1. Survie des agneaux direct
2. Poids 50 jours direct
3. Poids naissance direct
4. Gain 50-100 jours
À qui sert l’Indice Maternel Ultrasons (MAT U)?
On peut utiliser les brebis RI avec des races terminales pour faire nos agneaux de marché.
Prolificité près de l’optimal et
maintien bonne qualité de
carcasse (Ex. Arcott Rideau)
Quelle est la différence entre l’indice maternel et l’indice maternel ultrason ?
Longe & gras pour un total de 7%.
À qui sert l’Indice Maternel Ultrasons Hausse Prolificité (MAT UHP)?
Sélection des races
maternelles non prolifiques
Prolificité à améliorer et
maintien bonne qualité de carcasse
(Ex. Dorset, Polypay)
Quelle est la différence entre l’indice maternel HP et l’indice maternel ultrason (UHP)?
Longe & gras pour un total de 7%.
Vous parlez avec un producteur qui veut savoir quels critères il doit choisir pour sélectionner ces animaux ?
- Critères recherchés de la race
- Critères permettant la rentabilité de la ferme (nombre d’agneaux nés)
- Critères en fonction des points faibles de l’entreprise.
- Considérer les avantages et les limitations des indices génétiques. Par exemple, on peut se baser sur un critère mais si la répétabilité est très faible… je peux moins m’y fier.
- Faire le pont entre les indices et la conformation (ce qu’on voit en bergerie).
Le producteur a des races maternelles. Quels sont les critères sur lesquels il devra sélectionnés ?
- Nombre d’agneau à la naissance et au sevrage
- Poids au sevrage (production laitière)
- Fertilité (intervalle d’agnelage)
Le producteur a des races paternelles. Quels sont les critères sur lesquels il devra sélectionnés ?
- GMQ
- Gras dorsal
- Oeil de longe
- Critères de rentabilité
Plus le nombre de caractères sélectionnés
_______, moins le gain génétique pour chaque
caractère pris individuellement est _____.
Plus le nombre de caractères sélectionnés
augmente, moins le gain génétique pour chaque
caractère pris individuellement est élevé
Nommez deux corrélations génétiques négatives.
- Reproduction et croissance (brebis Dorset)
- Caractères paternels vs maternels
Quels points devons-nous observer en bergerie chez les animaux pour la sélection ?
- Anomalies physiques des femelles (hermaphrodisme)
- Anomalies physiques chez les mâles (cryptorchidie)
- Évaluation de la conformation (critères de race, défauts physiques majeurs liés à la longévité et aux performances)
Quel est le danger en sélectionnant sur l’ÉPD intervalle d’agnelage ?
Il dépend beaucoup du système de production que le producteur utilise. Il s’agit d’un critère pertinent dans le troupeau mais peu varié selon la régie. Un producteur peut donner la chance aux brebis aux 240 jours alors que pour un autre producteur ce sera 365 jours.
Est-ce possible de sélectionner sur la prolificité ?
Oui, même si l’héritabilité est faible. En France, avec des brebis Lacaune, ils ont augmentés la taille des portés de 1,6 à 2,0.
Elle est lente mais permanente (1,3 à 1,5% par année).
Définissez le différentiel de sélection.
Différence entre la valeur de la population moyenne et la moyenne de la population que je garde comme reproducteur.
Un producteur d’Arcott Rideau et de Romanov vous demande quels indices il doit utiliser pour sa sélection ?
MAT ou MAT U (ultrasons)
Le MAT U est utile pour la RI parce que certaines femelles sont utilisées dans le commercial.
Nommez les 4 ÉPD les plus importants pour les femelles prolifiques.
- ÉPD poids 50 jours
- ÉPD sevrés
- ÉPD survie des agneaux
- ÉPD intervalle d’agnelage (si je suis dans un système accéléré)
Est-ce que les RV et les RI sont régis de la même façon en terme de dessaisonnement ?
Les éleveurs de RI sont en photopériode. C’est comme s’ils étaient en saison sexuelle tout l’année.
Les éleveurs de RV sont en saillies naturelles toute l’année. Ils font généralement de l’effet bélier. Je peux avoir des baisses de fertilité en contre-saison qui ne sont pas comparables aux résultats en photopériode.
Quels indices doivent être utilisés pour sélectionner les animaux des races paternelles ?
GAIN OU CARCASSE
Nommez les 4 ÉPD les plus importants pour la sélection des sujets de races paternelles.
- ÉPD poids 50 jours
- ÉPD gmq 50-100
- ÉPD gras
- ÉPD longe
Quels sont les ÉPD secondaires sur lesquels ont peut travailler avec des animaux de races paternelles ?
- ÉPD poids 50 jours (direct et maternel)
- ÉPD nés et sevrés
- ÉPD survie des agneaux
- ÉPD intervalle d’agnelage
Quels sont les critères de sélection des mâles ?
- Conformation
- Critères de races
- Libido, surtout en contre-saison.
- Fertilité à valider
- Codon
Qu’est-ce que la tremblante ?
Maladie mortelle qui s’attaque au système nerveux des moutons. On parle d’une encéphalopathie spongiforme transmissible.
Causé par une anomalie des protéine membranaire (protéine prion ou PrP).
Quels sont les symptômes de la tremblante chez les ovins ?
Baisse de l’état de chair
Comportement agressifs
Tremblements de la tête
Manque de coordination
Démangeaisons
La tremblante est-elle une maladie à déclaration obligatoire ?
OUI.
Quelles sont les répercussions de la tremblante sur l’accès aux marchés ?
Plus difficile d’exporter puisque nous ne sommes pas exempt.
Expliquez la lutte génétique à la tremblante.
Par une analyse génétique, on peut détecter trois sites spécifiques (codons) du gène qui code pour la protéine PrP.
Combinaisons d’acides aminés sur trois sites spécifiques.
Nommez les trois sites ou codons liés à la tremblante. Quel est le codon le moins utile ?
136
154
171
Moins utile : 154
Quelles sont les possibilités pour le codon 136 ?
AA ou AV
(Alanine, alanine)
(alaine, valine)
La valine rend l’animal plus sensible à la tremblante.
Quelles sont les possibilité pour le codon 171?
RR, QR ou QQ
R: Arginine
Q: Glutamine
RR = les + résistants à la tremblante
Quel est le point de contamination le plus important pour la tremblante ?
La contamination a principalement lieu lors de la mise bas. Si on ne peut pas savoir avec quel animal la brebis contaminée était en contact, avant, on abattait tout le troupeau.
Expliquez l’impact de l’utilisation d’un bélier QQ dans un troupeau.
Le bélier donne assurément un allèle de susceptibilité à la tremblante à tous ses descendants. Globalement, ce choix peut augmenter la vulnérabilité du troupeau à la tremblante.
Expliquez l’impact de l’utilisation d’un bélier RR dans un troupeau.
Le bélier donne assurément un allèle de résistance à la tremblante à tous ses descendants. Globalement, ce choix peut augmenter la résistance du troupeau face à la tremblante.
Nommez des gènes important pour la sélection génétique.
- Tremblante
Prolificité : - Booroola
- Cambridge
- Iceland
Musculature : - Callipyge
- Carwell
- Myostatine
En pratique, nommez les 4 étapes de sélection.
- Cibler les seuils limites des critères de sélection (indice ou ÉPD)
- Identifier les agneaux ne répondant pas aux critères de sélection sur papier.
- Aller en bergerie et vérifier la conformation de TOUS les agneaux mâles. Les agneaux ayant de plus bas indices mais une excellente conformation pourront être gardés (les indices bougent dans le temps) alors que les agneaux ayant de forts indices mais une mauvais conformation seront réformés.
- Génotypage
Nommez des qualités recherchées des femelles commerciales.
- Bonne prolificité
- Qualité bouchère des agneaux
- Fertilité élevée en saison et en contre-saison sexuelle.
- Maturité sexuelle hâtive
- Bonne conformation
- Bonne rusticité (agnelages accélérés)
- Bonne production laitière (GMQ des agneaux)
Pourquoi faire des croisement ?
- Complémentarité des races : réunir des qualités différentes chez un même individu
- Vigueur hybride
Nommez 3 éléments liés à la vigueur hybride.
- Supériorité des individus F1 sur la moyenne des parents
- Interactions entre les gènes
- Diminution des tares liés à la consanguinité dans les races pures.
Donnez un exemple concret d’hétérosis ou de vigueur hybride.
Race A : Romanov (400 g/jour)
Race B : Dorset (600 g/jour)
La moyenne des 2 parents est de 500g/jour.
Les agneaux issus de ce croisements ont un gain de 550 g/jour (hétérosis).
Quel type de caractère profite davantage de l’hétérosis?
Les critères de reproduction (10 à 20%). L’amélioration est élevée.
Quel est l’effet de l’hétérosis sur les critères de croissance et de carcasse ?
Carcasse = nul (amélioration nulle)
Croissance = 5 à 10% (amélioration moyenne)
Est-ce que l’hétérosis remplace la sélection génétique ?
Non…
Les critères de carcasse et de croissance sont très peu amélioré par l’hétérosis. La reproduction est améliorée.
À l’opposé, les critères de conformation et de carcasse sont plus facilement améliorés par la sélection génétique.
On doit accoupler de bons individus de chaque race.
Vrai ou faux. Grâce à l’hétérosis, je peux croiser deux individus médiocres et obtenir de bonnes performances.
FAUX. On doit accoupler de bons individus de chaque race.
Qu’est-ce qu’un croisement statique à deux races ?
Je croise des Romanov avec des Dorset.
Si je croise des Texel avec des Polypay, qu’est-ce que j’observerai ?
- Hétérosis maximal pour les caractères de croissance
- Pas d’hétérosis pour les caractères de repro.
Qu’est-ce que le croisement statique à trois races ?
On fait une F1 (DPRV) qu’on croise avec une autre race (SU).
Les agneaux sont 1/2SU, 1/4DP, 1/4RV.
Quels sont les avantages du croisement statique à trois races ?
Les agneaux de marché et les mères profitent de l’hétérosis maximal.
Qu’est-ce qu’un croisement statique à 4 races ?
J’utilise une femelle F1 (DPRV).
J’utilise un mâle F1 (TX/SU)
Les agneaux sont issus de 4 races différents.
Quels sont les avantages et les inconvénients d’un croisement statique à 4 races ?
- Hétérosis maximale pour la libido et la précocité du mâle
- Hétérosis maximale pour les mères et la progéniture
- Hétérogénéité des agneaux par l’utilisation d’un bélier croisé (certains vont ressemble plus à une autre vs une autre)
Peu/pas d’avantages réels et pas recommandé en pratique.
Qu’est-ce que le croisement de retour ?
On a des F1 DP/RV.
On choisit la race qui a le plus de gabarit et on recroise (DP).
Quels sont les avantages et les inconvénients du croisement de retour?
- Les mères profitent de l’hétérosis maximale
- Facile car moins de races impliquées
- Le produit profite de seulement 50 % de l’hétérosis maximale.
- Qualité des carcasses ? Attention au choix des races !!
Qu’est-ce qu’un croisement rotatif à 2 races ?
L’éleveur alterne d’année en année entre les RV et les SU.
Les animaux sont soit 2/3SUx1/3RV ou 1/3SUx2/3RV.
Quels sont les avantages et inconvénients des croisements rotatifs à 2 races ?
- Toutes les femelles sont hybrides (2/3 hétérosis maximale)
- Permet de fonctionner sans intrant de femelles de race pure
- Exige un bon suivi de la constitution génétique des femelles pour savoir
quelle race de bélier à utiliser sur chacune d’elle - Hétérogénéité des femelles
Qu’est-ce que le croisement rotatif terminal ?
On utilise 70-80% des femelles issues du croisement rotatif (2/3DPx1/3RV ou 1/3DPx2/3RV) pour les accouplées en croisement terminal avec un SU pour produire des agneaux de marché.
Quels sont les avantages et inconvénients des croisements rotatifs terminal ?
- Mères profitent de 2/3 de l’hétérosis maximale
- La progéniture profite de l’hétérosis maximale
- Permet de fonctionner sans intrant de femelles de race pure
- Hétérogénéité des femelles (demande le suivi des constitutions génétiques des femelles)
Quels sont les avantages du croisement triple sur les brebis ?
- Prolificité élevée
- Désaisonnée
- Maternelle
- Vigueur hybride
- Uniformité des F1
Quels sont les avantages du croisement triple sur les agneaux ?
- Bonne croissance
- Bonne qualité de carcasse
- Uniformité des carcasses si les parents sont uniformes
- Vigueur hybride sur la survie et la croissance
Quels sont les problèmes liés au Croisement Triple avec Hybride
Prolifique ?
- Le choix des races est parfois douteux (hybride, pas prolifique). Donc, une des deux races doit être RV, RI ou FL.
- Choix des sujets reproducteurs (parents) parfois douteux : pas les meilleures brebis, un seul bélier utilisé pour faire les F1, hétérogénéité des femelles F1 (uniformité, performances).
- Conformation des sujets (peu de sélection, tout est vendu)
- Approvisionnement (beaucoup de petits troupeaux hybrideurs, sanitaire)
- Femelles prolifiques = il faut s’occuper des agneaux.
Comparer l’achat du F1 prolifique versus une croisée.
- 325$ versus 250$
- Moins d’agneau au premier agnelage pour les croisées
- Meilleure fertilité des femelles au 1er accouplement
- Productivité de l’hybride prolifique beaucoup plus élevée qu’une croisée
Est-ce qu’il y a un croisement supérieur à un autre ?
Pas tant de différence dans les performances dans un système photopériodique.
Quels sont les avantages du croisement SUXRI pour produire des agneaux de marchés ?
- Bonne croissance et carcasse
- Plus facile de produire son renouvellement
- Maternelle et laitière
Quels sont les inconvénients du croisement SUXRI pour produire des agneaux de marchés ?
- Hétérosis plus faible
- Femelles et agneaux plus hétérogènes
- Brebis peu désaisonnées
- Brebis trop prolifique
Quels sont les avantages du croisement MaternelleXPaternelle (DPxSU) pour produire des agneaux de marchés ?
- Facile de produire son renouvellement
- Régie plus facile
- Pas d’allaitement artificiel
- Désaisonnée
Quels sont les désavantage du croisement MaternelleXPaternelle (DPxSU) pour produire des agneaux de marchés ?
- Prolificité faible
- Demande un rythme d’agnelage plus rapide
- Rentabilité à surveiller
Nommez des conséquences de l’utilisation des femelles F18 (7)?
- Variation des génotypes
- Variation des phénotypes
- Manque d’uniformité des carcasse et variation de la qualité
- Difficultés de standardise la régie (reproduction, nutrition)
- Application des recherches difficiles…
- Sélection des agnelles sur quels critères ? Difficile et aléatoire.
- Augmentation du % de génotype paternel dans la femme d’élevage donc baisse des performances de reproduction.
Quels sont éléments du cercle vicieux improductif ? (3)
- Pas d’argent pour acheter des femelles productives
- Achat ou fabrication des femelles croisées
- Faible productivité de l’entreprise
Comment ont-fait pour choisir la structure de production ? (3)
- En accord avec la vision et les objectifs de l’éleveur.
- Objectifs de l’industrie (ASRA, classification, contrat agneaux lourds)
- Rentabilité de l’entreprise
