module 4 Flashcards
C’est quoi un PAS
document définissant les principales analyses statistiques
- Obligatoire pour demande de subvention, homologation et publication dans revue à facteur d’impact élevé
- Doit être finalisé et scellé avant l’exécution de l’étude et avant d’avoir les résultats
- Prévient la subjectivité dans le choix des analyses, le tripotage de données
- Doit déclarer la multiplicité si a lieu
- Se concentrent sur analyses se rapportant au CRP
- Décrit les méthodes analytiques qui seront utilisées, ne donne aucun résultat
Contenu d’un PAS complet
6 sections (50-300 p.:
- Administrative (chercheur, financement, auteur du PAS)
- Résumé de la qst de recherche et méthode d’étude
- Design et méthode de l’étude
- Principes de statistiques utilisés
- Population à l’étude
- Comment l’analyse des statistiques sera faite
Qu’est-ce qu’une variable
Caractéristique socio-démographique ou clinique mesurée sur chaque participant de l’étude
- Mesurée une seule fois ou pls
- Plusieurs par patients
- Variation entre les variables est au centre de l’erreur aléatoire
Qu’est-ce qu’une cédule de visite?
Protocole fixe d’évaluation des variables
Quelles sont les deux types de variables? et leur sous-type
BASELINE/VARIABLES MESURÉES AU RECRUTEMENT
-V. sociodémographique
-V. d’exposition
-V. présentation clinique (pas dans étude de prévention)
-facteurs de confusion connus
autres v associées au CRP
VARIABLES MESURÉES DURANT LE SUIVI SELON CÉDULES DE VISITES
-V. d’exposition
-CRP (souvent max 3 crp par étude) et critère de résultat secondaire
-V. d’innocuité
-V. de mécanisme (PD, PK)
-V. d’adhérence (est-ce que le patient suit bien le protocole)
autres v. selon contexte
Qu’est-ce qu’un diagramme CONSORT?
Consolidated standards of reporting trials
Organisme qui fait la promotion de la transparence dans la publication des résultats des études cliniques –> Il offre aux auteurs un moyen standard de préparer des rapports sur les résultats des essais, facilitant leur rapport complet et transparent et facilitant leur évaluation critique et leur interprétation.
DIAGRAMME consort=
- Figure résumant le suivi des participants dans l’étude
- premier diagramme qu’on produit pour présenter les résultats d’un ECR
- identifie rapidement cmb de patient ont été approché, consentis à l’étude, ont été perdus pendant le suivi et été inclus dans l’analyse du CRP
si avec mon diagramme CONSORT je vois que bcp de patients ont été perdus au suivi, qu’est-ce que je peux en déduire?
Mauvaise validité interne de l’étude
Le PAS se fait selon ITT et ITP. Définis ITT et ITP et dis si elles seront incluses dans les publication
ITT: Intention de traiter
ITP: Intention du protocole
les 2 seront incluses
Caractéristiques de ITT
POURQUOI: permettent encadrement formel
CRITÈRE: -Aucun patient dont on n’évalue pas le crp à la fin (donc aucun patient exclu)
AVANTAGE:
-Protège contre biais de confusion
DÉSAVANTAGE:
- Très difficile à réaliser en pratique
- Dilue amplitude de la réponse en sous-estimant le bénéfice et surestimant l’innocuité (car bcp des patient dont on va analyser le CRP seront non-adhérents)
*Les analyses mITT permettent quelques exclusions très spécifiques
Caractéristiques de ITP
CRITÈRE: -exclusion à priori des patients qui ne sont pas idéaux pour inclure seulement ceux qui risque de mieux répondre au traitement
AVANTAGE:
-résultats plus favorables que ceux d’ITT
DÉSAVANTAGE:
-Fait biais de confusion car on s’éloigne de la randomisation initiale
V ou F: Validité interne ITT=validité interne ITP
F: ITT>ITP
4 fonctions de la première table
- Donne estimations ponctuelles de la réponse à la recherche clinique
- Décrit la population de participants recruté pour l’étude
- Permet d’entrevoir certains problèmes dans les données
- Permet de faire la comparaison facilement entre les groupes
elle présentera aussi les statistiques descriptives des variables de baseline
quelle est la différence entre la présentation des variables venant des études de prévention vs études thérapeutique a/n table 1
La table 1 des études de prévention va contenir peu de variables de présentation cliniques tandisque la table 1 des études thérapeutique va en contenir plus
Qu’est-ce qu’une donnée brute?
données qui sont, à la fin de l’étude, validées et vérifiées
Que permet un diagramme en boite/histogramme
- visualisation des données brutes et variables dérivées qui auront été calculées (plupart des analyses statistiques faites à partir de variables dérivées)
- résument l’Info pour en faciliter l’interprétation
Désavantage des diagramme en boite/histogramme
-Résumé donc perte d’information
Associer les description suivant à une façon de présenter de le résumé de l’information d’une variable:
a) Présentation à l’aide d’une moyenne, médiane
b) Présentation avec une écart-type, IQR
c) Figure de style histogramme
a) Mesure de tendance centrale
b) Mesure de dispersion
c) Distribution (présentée par figure)
comment appelle ton une analyse descriptive avec…
a) une dimension
b) deux dimensions
c) pls dimensions
a) univariée
b) bivariée
c) multivariée
Que permettent les dimensions de l’analyse descriptive
- Plus il y a de dimension plus la table/figure donnera de l’information
- Peut déterminer les différences, les associations et les tendances
*Dans un ECR on inclu toujours la dimension des groupes d’expérimentation
Comment on détermine IQR
IQR=Q3-Q1
Que représente Q2
La médiane
Quelles sont les 7 statistiques descriptives?
Proportion, centile, IQR, moyenne, écart-type, diagramme en boite, histogramme
Pourquoi la valeur manquante est-elle particulièrement un problème?
Pour le CRP et l’exposition
Augmente le risque de biais de confusion
Qualité de l’exécution de l’étude
Comment communique t-on les valeurs manquantes
À la table 1, rajouter une ligne indiquant le nb de participant avec valeur manquante
Avec quelle stats je peux exprimer les résultats de variable de nature…
a) Dichotomique
b) Ordinal
c) Catégorique
d) Continue
e) Temps d’incidence
a) Proportion, tableau de contingence
b) Bcp de valeur: centile, IQR, diagramme en boite et histogramme
Peu de valeur: Proportion et IQR, tableau de contingence
c) Proportion, tableau de contingence
d) Tout sauf proportion
e)Centile ou Kaplan Meier
Si ma taille se situe au 42ième centile, qu’est-ce que ça veut dire?
Je suis plus petite (ou égale) que 58% des gens de mon âge
Que représente la médiane en terme de centile?
50e centile
Qui est plus robuste: la moyenne ou la médiane? pourquoi?
Médiane–>moins sensibles aux valeurs extrêmes et distributions asymétriques
Comment peut-on calculer la médiane
si groupe impair: valeur au centre
si groupe par: moyenne des 2 chiffres au centre
si distribution très asymétrique: moyenne géométrique
si courbe Kaplan Meier: Valeur à 50% de survivant/décès (50e centile)
Qu’est-ce que le mode
Valeur la plus fréquente d’une distribution
Quelle est la différence entre une distribution uni-modale et multi-modale?
Le nombre de bosse:
Unimodale = une bosse
Multi-modale = pls bosses
attention, s’il y a plusieurs bosses il y a plusieurs modes
À quoi sert l’écart-type
Détermine l’erreur aléatoire et la précision de la réponse à la question de recherche clinique
comment s’appelle le carré de l’écart-type
La variance
Quelle formule j’utilise pour l’écart-type dans le cas où les variables sont de nature dichotomique?
racine carrée de p(1-p)
où p est la proportion observée et
p=0,5 donne écart type maximum
p=0 ou 1 donne aucune écart type
À quoi correspond la distribution marginale dans un tableau de contingence?
Colonne totale
Qu’estce que cela veut dire si la porportion observée dans une cellule est différente aux produits des marginales dans un tableau de contingence
Le CRP n’est pas indépendant des groupes (sauf si différence causée par erreur aléatoire ou biais) aka LES DEUX TRAITEMENTS SONT DIFFÉRENTS
Comme le CRP est dépendant–>connaitre le groupe donneune info sur le crp
Dans quelle conditon je peux affirmer qu’il y a indépendance du CRP
Lorsqu’il n’y a aucune différence entre les deux groupes de traitement