Module 2 Flashcards

1
Q

VRAI ou FAUX :

Les enzymes peuvent catalyser des réactions qui, en temps normal, ne sont pas thermodynamiquement possible

A

Faux

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2
Q

Quels sont les deux principes de base de la thermodynamique?

A
  • Premier principe : L’énergie totale de l’univers demeure constante
  • Second principe : L’entropie de l’univers augmente
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3
Q

Définir Entropie.

A

Degré de désordre ou de hasard

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4
Q

Quels énoncés sont vrai :
a. Les organismes sont des systèmes ouverts

b. la cellule est en équilibre avec son environnement
c. La cellule se trouve dans un état stationnaire dynamique
d. l’énergie interne d’un système réactionnel est appelée entropie totale
e. L’énergie libre est l’énergie interne d’un système susceptible d’être utilisée pour effectuer un travail utile.

A

a, c, e

b. jamais en équilibre
d. Enthalpie totale

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5
Q

Que rprésente la différence entre l’enthalpie (H) et l’énergie libre (G)?

A

L’énergie entropique (TS)

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6
Q

Quel renseignement peut nous donner la variation d’énergie libre?

A

Le sens de l’évolution d’un système réactionnel

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7
Q

Que signifie ces valeurs de G?

  • G=0
  • G < 0
  • G > 0
A

G=0
- Réaction à l’équilibre
G<0
- réaction spontané dans le sens indiqué. Exergonique
G>0
- réaction spontané dans la direction inverse. endergonique

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8
Q

Entre quelles valeurs de G la réaction est réversible? Si G dépasse ces valeurs?

A

Une réaction ayant une ΔG entre -10 et 10 kJ/mole est généralement réversible ; par contre,
une réaction ayant une ΔG très élevée (ΔG < -10 ou ΔG > 10) est essentiellement irréversible.

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9
Q

Quels énoncés sont faux? Expliquer.

a. G peut nous informer sur le sens de la réaction et sa vitesse.
b. H permet de prédire le sens de l’évolution d’une réaction
c. H nous renseigne sur la nature d’une réaction ( type de liaison chimique).
d. Pour une réaction endothermique, H < 0.
e. TS reflète le niveau de dispersion de l’énergie d’un système
f. Si les produits d’une réaction sont plus nombreux et moins complexe, S<0

A

a. G n’informe pas sur la vitesse
b. H ne peut pas prédire le sens, juste sa nature
d. Pour une réaction endothermique H>0
f. Si les produits d’une réaction sont plus nombreux et moins complexe, S>0

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10
Q

De quoi dépend G?

A

Lénergie stockée dans chaque molécule et la concentration de chaque molécule dans le mélange réactionnel.

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11
Q

Quel facteur peut être modifié pour rendre une réaction thermodynamiquement favorable

A

La concentration des composés

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12
Q

Qu’est ce que la thermodynamique classique?

A

La description quantitative des échanges de chaleur et d’énergie des équilibres chimiques.

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13
Q

Dans quel domaine la bioénergétique est-elle utile?

A
  • production d’énergie à l’intérieur de la cellule
  • Les différents échanges énergétiques avec l’environnement
  • Les réactions chimiques qui sont impliqués avec les échanges énergétiques a
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14
Q

Donner un autre nom pour état stationnaire

A

Homéostasie.

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15
Q

Quelle est la différence entre état stationnaire et équilibre?

A

Équilibre G=0

État stationnaire le G de plusieurs réactions peut être < 0

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16
Q

Que peut faire la cellule avec l’énergie?

A

Elle peut la transformer, la consommer, l’extraire ou l’échanger.

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17
Q

Quelle est la différence entre les conditions standards et les conditions standards biochimiques?

A

Concentration de l’eau à 55M et pH=7

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18
Q

Une réaction thermodynamiquement défavorable peut-elle tout de même se produire?

A

Oui, si elle est couplée à une réaction favorable ou si elle est dans des conditions biologiques standards tout en maintenant Q eq.

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19
Q

Quels sont les critères de la construction d’une voie métabolique à partir de réactions isolées?

A

1) Chaque réaction doit être spécifique.

2) La somme des ∆G des réactions constituant la voie doit être thermodynamiquement favorable (∆G < 0).

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20
Q

Lors de quels processusphysiologique est utilisée l’ATP?

A

Lors des contractions musculaire, du transport actif primaire, du repliement des protéines et lors des diverses synthèses de biomolécules

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21
Q

De quoi est formée l’ATP?

A

D’une adénosine à laquelle trois groupement phosphoryles sont liés via un lier phosphoester et deux liens phosphoanhydride

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22
Q

Quelle est la différence entre l’ATP, l’ADP, et l’AMP?

A

Le nombre de groupement phosphate. Respectivement 3, 2 et 1 groupement.

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23
Q

Quels facteurs rendent l’hydrolyse de l’ATP favorable?

A
  • Les forces de répulsions électrostatique des groupements chargés d’un pyrophosphate qui sont partiellement illiminés après l’hydrolyse.
  • La stabilisation par résonance d’un lien anhydride eest moindre que celui de ses produits
  • Les produits sont plus stables, car ils sont plus hydratés que l’ATP.
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24
Q

VRAI ou FAUX

L’ion magnésium stabilise l’ATP et est essentiel pour l’hydrolyse. Expliquer

A

Vrai, il a pour effet de neutraliser partiellement les charges sur les atomes d’oxygène et de diminuer la répulsion électrostatique. De plus, de nombreuses enzymes qui hydrolyses l’ATP sont inactives en absence de mg.

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25
Q

Pourquoi le magnésium est essentiel a l’hydrolyse de l’ATP?

A

Premièrement, les interactions entre l’ion magnésium et les atomes d’oxygène du groupe
phosphoryle maintiennent le nucléotide dans une conformation bien définie qui est reconnue
spécifiquement par certaines enzymes.
• Deuxièmement, l’ion métallique augmente le nombre d’interactions entre le complexe
ATP-Mg2+ et l’enzyme, ce qui augmente l’énergie de liaison.
• Finalement, la neutralisation des charges négatives des groupements phosphoryle de l’ATP
par le Mg2+
favorise la réaction en diminuant la répulsion entre ces derniers et la paire
d’électrons du nucléophile.

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26
Q

Pourquoi l’hydrolyse de l’ATP est difficile en milieu aqueux? Quel avantage cette caractéristique apporte?

A

Parce que l’énergie d’activation nécessaire pour l’hydrolyse est très élevée.
L’ATP peut transporter son énergie potentielle chimique d’une enzyme à une autre sans risque d’hydrolyse.

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27
Q

Il est favorable pour la cellule d’utiliser seulement les lien P et non la molécule D’ATP au complet. VRAI ou FAUX?

A

FAUX.
Il est plus facile pour l’ATP d’être capturer spécifiquement en raison de son plus grand volume. Cette reconnaissance spécifique est essentielle au bon fonctionnement de la celluole.

28
Q

Pourquoi l’ion magnésium est essentiel pour l’hydrolyse enzymatique?

A
  1. MAINTIEN CONFORMATION DÉFINIE
  2. NÉCESSAIRE À LA RECONAISSANCE PAR ENZYME
  3. AUGMENTE INTERACTION AVEC ENZYME
  4. NEUTRALISE LES CHARGE NEG
29
Q

L’hydrolyse d’une mole d’ATP libère combien d’énergie?

A

50 KJ

30
Q

VRAI ou FAUX
a. L’ATP constitue un réservoir d’énergie

b. L’énergie consommer par le corps est uniquement produit et consommer sous forme d’ATP.
c. L’ATP doit être regénérer environ 1300 fois par jour

A

a. Faux, l’ATP est sans cesse hydrolyser puis regénérer
b. Faux 50% est utilisée sous forme d’ATP
c. Vrai

31
Q

Quels type de mécanismes assurent le renouvellement d’ATP?

A
  1. Phosphorylation oxydative
  2. Photosynthèse
  3. Phosphorylation au niveau du substrat
  4. Transphosphoorylation entre nucléotides
32
Q

À quoi sert la transphosphorylation entre nucléotides?

A

Maintenir la concentration des différents formes de nucléotides.

33
Q

Quel mécanisme utilise l’hydrolyse d’autres composés riche en énergie pour former l’ATP?

A

phosphorylation au niveau du substrat

34
Q

d’autres types de molécules riches en énergie existe. Nommer les.

A
  • Les acyl phosphates
  • Les énol phosphates
  • Les phosphoguanidines
  • Les composés avec un lien thioester
35
Q

VRAI ou FAUX

L’hydrolyse des acyl phosphates est favorisée par les mêmes facteurs qui soutiennent l’hydrolyse de l’ATP?

A

Vrai

36
Q

VRAI ou FAUX
La capacité de l’énol phosphate à transferer son groupement est favorisée par les mêmes facteurs qui soutiennent l’hydrolyse de l’ATP?

A

FAUX

Ça s’explique par le fait que la forme céto est plus stable que la forme énol.

37
Q

VRAI ou FAUX. Expliquer.

a. La phosphocréatine est présente uniquement dans les cellules musculaires.
b. La phosphocréatine sert de «tampon» d’énergie

C. Cette réaction ne requiert aucun enzyme

d. Elle représente une réserve de quelque minutes lors de l’exercice physique intense
e. Le même composé est présent chez tout les organismes

f. On appelle ces composés phosphagènes en
raison de leur groupement guanidine phosphorylé

A

a. Faux, cellulaire musculaire et nerveuse
b. Vrai
c. Faux, créatine kinase
d. Faux, Quelques minutes au repos et quelques secondes lors d’un exercice physique intense.
e. Faux, phosphoarginine chez le homard
f. Vrai

38
Q

Pourquoi la phosphocréatine est-elle capable de phosphoryler l’ADP en ATP?

A

à la forte compétition entre les formes de résonance
du groupement guanidine, qui est encore plus prononcée que celle des liaisons
phosphoanhydrides

39
Q

Le transfert du groupement phosphoryle entre la phosphocréatine et l’ADP est-il réversible? Quelle est la logique de cette réaction

A

Elle est réversible. La direction des réactions est très sensible aux changements de concentrations.

40
Q

Comment fonctionne le principe de la réserve d’énergie avec la phosphocréatine?

A

Dans les cellules au repos, le besoin en ATP est faible et le ratio ATP/ADP est
élevé. La réaction ira alors dans la direction de la synthèse de phosphocréatine
afin de mettre en réserve l’énergie.
• Par contre, quand l’activité métabolique est intense et que le ratio ATP/ADP est
faible, l’équilibre de la réaction est déplacé vers la synthèse d’ATP.

41
Q

De quoi est formée la CoA? Quel groupement forme le centre réactif?

A

D’un nucléotide (ADP), une molécule de panthoténate et une molécule de 2-mercaptoéthylamine. Le groupement thiol

42
Q

À quoi peuvent servir les groupement thioester?

A

La synthèse d’un NTP à partir d’un NDP

Transfert des groupements acyles à des molécules réceptrices

43
Q

Est-il possible de créer de l’ATP à partir de ADP? si oui dans quelles conditions et comment?

A

oui, à partir de 2 molécules d’ADP quand la concentration d’ADP est élevé et la concentration d’ATP est faible et à l’aide de l’enzyme adénylate kinase.

44
Q

Comment la cellule peut garder la concentration D’ATP, ADP et AMP constante?

A

Grâce à la réversibilité des réaction catalysées par la créatine kinase et l’adénylate kinase

45
Q

Sous quelle formes l’énergie peut-elle être retenues?

A

Sous forme chimique et sous forme de potentiels réducteurs

46
Q

Vrai ou Faux

a. l’oxydation est une réaction provoquant le gain d’un électron
b. Un agent oxydant donne un électron
c. un agent réducteur donne ses électrons
d. La réduction provoque le gain d’un électron

A

a. faux
b. faux
c. vrai
d. vrai

47
Q

On dit d’une molécule qu’elle est oxydé parce qu’elle a perdu ou gagné un électron?

A

perdu

48
Q

Quelle de ces réaction est la demi réaction de l’agent réducteur? celle de l’agent oxydant?

  1. A–>A + e-
  2. A + e- –> A
A
  1. réducteur

2. Oxydant

49
Q

Pour une réaction catabolique les produits sont-ils oxydés ou réduits? leur cofacteurs?

Pour une réaction anabolique?

A

Catabolique : produits oxydés et cofacteurs réduits

Anabolique : produits réduits et cofacteurs oxydés

50
Q

De quoi est formé le NAD+?

A

la liaison d’un AMP à un nucléotide contenant le groupement nicotinamide.

51
Q

En quoi le NADP+ diffère du NAD+?

A

Le NAD+ et le
NADP+ diffèrent au niveau de la position 2′ de l’AMP. Le groupement hydroxyle à
cette position n’est pas phosphorylé dans le NAD+
, alors qu’il porte un groupement
phosphoryle dans le NADP+
.

52
Q

Vrai ou faux

a. Le NAD+ et le NADP+ agissent sans le besoin d’enzyme
b. LE NAD+ et le NADP+ agissent presque toujours comme cofacteurs pour les kinases
c. Les réactions impliquent toujours le transfert de 2 électrons à la fois
d. Les 2 composés sont insolubles

A

a. Faux
b. Faux, pour les déshydrogénases
c. Vrai
d. Faux stables et solubles

53
Q

Pour quelles réactions le NADH est utilisé?

Le NADPH?

A

NADH : synthèse d’atp via phosphorylation oxydative

NADPH : agent réducteur lors des réactions anaboliques

54
Q

Quel avantage le NADH/NADPH a par rapport au FAD/FMN?

A

Sa stabilité et sa solubilité permet de transporter son pouvoir réducteur d’une enzyme à une autre. FAD/FMN non, car il forme un groupement prosthétique lié à des protéines

55
Q

Quelle est la différence entre le FAD et le FMN?

A

Le FMN est consitué d’un mononucléotide lié à un alditol. Le FAD est formé d’un AMP lié à la portion glucidique du FMN

56
Q

Quelle est la forme oxydé du FAD?

A

quinone
Semi-oxydé = semiquinone
réduite = hydroquinone.

57
Q

Vrai ou faux

a. Chez les procaryotes, les réactions d’oxydoréductions se produisent dans les mitochondries.
b. CoQ est soluble dans l’eau
c. Le CoQ assure le transport et le transfert des électrons entre certains complexes enzymatiques contenus dans les membranes?
d. La CoQ est un oxydant moins puissant que le NAD et le FAD et donc elle peut réduire ces derniers

A

a. Faux dans la membrane plasmique
b. Faux, il est liposoluble.
c. vrai
d. Faux, contraire

58
Q

De quoi est constituer la queue de la CoQ?

A

D’unité isopréniques à cinq carbone

59
Q

Combien d’électron la CoQ peut accepter?

A

2, mais seulement 1 à la fois.

60
Q

Comment est appelée sa forme oxydée? sa forme semi-oxydée? Sa forme réduite?

A

respectivement Ubiquinone, semiquinone et Ubiquinol

61
Q

Qu’est ce que le potentiel de réduction?

A

la mesure de la tendance des espèces chimiques à être

réduites ou oxydées

62
Q

Que veut dire une petite et une grande valeur du potentiel de réduction?

A

Plus la valeur de E est petite, plus la substance a la capacité de donner des électrons, ce
qui en fait un bon agent réducteur.
À l’inverse, plus le potentiel est grand, plus la substance a de l’affinité pour les électrons,
ce qui en fait un excellent accepteur, donc un agent oxydant.

63
Q

Comment est-il possible de déterminer le sens d’une réaction avec la force électromotrice standard?

A
positif = vers la droite
Négatif= vers la gauche (inverse)
64
Q

Nommez les principales autres formes d’énergie (autre que l’ATP) utilisées par la
cellule.

A

Les composés phosphorylés, Les thioesters et les cofacteurs réduits

65
Q

Quelles molécules se retrouve dans les tissus musculaire et a comme fonction la réserve d’énergie?

A

Les phosphagènes. Son rôle est de permettre la regénération d’ATP via la phosphorylation au niveau du substrat

66
Q

Lequel(s) des cofacteurs participant aux réactions d’oxydoréduction :

a) Est présent dans les membranes?
b) Est présent dans le cytosol?
c) Est un groupement prosthétique?
d) Peut transférer 2 électrons à la fois?
e) Ne peut capter qu’un seul électron à la fois?

A

a. CoQ
b. NAD+ ou NADP+
c. FAD/FMN
d. FAD, FMN, NAD+, NADP+
e. CoQ