Module 1- introduction à la Biochimie Flashcards
Quelles sont les 3 caractéristiques de tout les êtres vivants?
1-métaboliser différentes susbtances
2-répondre à des stimulis environnementaux
3-se reproduire
Qu’est-ce que la biochimie?
La biochimie est la science qui étudie le vocabulaire de la chimie pour l’appliquer à la biologie.
Comment se nomment les molécules composants le vivant?
molécules biologiques ou encore biomlécules
Qui a prouver la fin du vitalisme et comment à t-il réussit? Et qu’est-ce que le vitalisme?
Il s’agit de Friedrich Wöhler qui a synthètisé de l’urée à partir d’un composé inorganique (cyanate d’ammonium). Le vitalisme est une théorie stipulant qu’il fallait une force vitale pour produire des molécules du vivants.
Qu’a fait Eduard Buchner?
Il a découvert que les enzymes jouent un rôle important de catalyseur. Il a réussit avec Emil Fisher a le démontrer. Buchner par la fermentation du glucose et Fischer par l’hydrolyse du sucrose.
Que font les enzymes et que fermettent-elles?
Elles catalysent, ainsi, elles accélèrent les réactions et les rendent plus efficaces. La vitesse augmente jusqu’à 10e20. Elle augmente la spécificité des réactions (expliquant le petits nb de produits intermédiaires ou de déchets)
Qu’est-ce que le mécanisme de clé-serrure?
C’est la complémentarité des surfaces entre enzymes et son substrat (ce qui est la base de la spécificité biologique biologique et de la reconnaissance moléculaire).
Complétez:
ADN —->______—–>_______
(Dogme centrale de la biologie moléculaire)
ARN, PROTÉINE
Mise à part l’aide qu’il a apporté à Buchner pour la découverte du caractère catalyique des enzymes, qu’à découvert Emil Fisher sur les enzymes?
Spécificité ezymatique (clef-serrure)
Qu’ont découvert Avery, MacLeod et McCarty?
Que l’ADN est le matériel génétique (par conjugaison bactérienne)
Qui fit la découverte de la structure des protéines?
Il s’agit de Kendrew et Perutz.
Et qui de par une photographie de 1952 détermina la structure en double hélice de l’ADN?
Watson & Crick
Le flux d’information entre l’ADN et les protéines est ________
unidirectionnel
Quels sont les 6 éléments chimiques représentant la majorité de la constitution du vivant? Et pouquoi eux en particulier?
C, H, O, N, P et S (97%)
Ils peuvent former des liens covalents. Ils sont les éléments les plus légers et la force des liens covalents est inversement proportionnel à la taille de l’atome.
Quels sont les 5 ions essentiels pour toutes les espèces vivantes?
Na+, K+, Ca2+, Mg2+ et Cl-
Quels est le nombre de liaisons possibles pour H, O, S, N, C, P?
1, 2, 2, 3, 4, 5
Toutes les biomolécules contiennent du ________. Et pourquoi?
carbone, capable de former un nb presque infinie de composé en raison de sa capacité à établir jusqu’à 4 liens covalents (simple, double et triple). Grâce aux liens C-C, la formation de très longue chaînes est possible. Permet molécule linéaire, ramifiées ou cyclique.
Les groupes fonctionnels forment la partie _______ des molécules.
réactive
Les types de groupements fonctionnels:
R - OH
nom groupement, nom composé, exemple
Hydroxyle, alcool, glucide
Les types de groupements fonctionnels:
1. R 2. R
| |
O = C - H O = C - R’
nom groupement, nom composé, exemple
1 et 2 : Carbonyl
- aldéhyde, glucides (aldose)
- cétone, glucides (cétose)
Les types de groupements fonctionnels:
1. R
|
O = C - OH
nom groupement, nom composé, exemple
Carboxyl, acide carboxylique, acides gras (lipides) et acides aminés
Les types de groupements fonctionnels:
1. R 2. R
| |
H - N - H H - N - R’
nom groupement, nom composé, exemple
Amine (secondaire en 2), amine, primaire:acides aminés et secondaire: Proline
Les types de groupements fonctionnels: O
||
R - O - P - O-
|
nom groupement, nom composé, exemple O-
phosphoryle, x , acides nucléiques et acides aminés modifiées
Les types de groupements fonctionnels:
R - SH
nom groupement, nom composé, exemple
sulfhydryle, thiol, 1 seul acide aminé (cystéine)
Quelles sont les 4 classes des biomolécules et les 2 niveaux de ceux-ci?
4 classes: protéines, glucides, lipides, acides nucléiques
2 niveaux: biomolécules simples, macromolécules
À quoi ressemble les cycles azotés suivants: Imidazole, Indole, Pyrimidine (base azotée), et Purine (base azoté) et donnez des exemples pour chacun?
p:13 de powerpoint 1.
imidazole (1 seul acide aminé: histidine), indole (1 seul acide aminé: tryptophane), pyrimidine (acides nucléiques: thymine, cytosine, uracile), purine (acides nucléiques: adéine, guanine)
Liens importants: O O O
1. O R’ 2. O R’ 3. 4. || 5. || ||
\_N/ \_O/ R-O-R’ R-O-P-OH R-O-P-O-P-OH
/ \ / | | |
R H R OH OH OH
- AMIDE, lien peptidique (protéine)
- ESTER, acylglycérols (lipide)
- ÉTHER, liaison osidique (glucide)
- ESTER PHOSPHORIQUE, nucléotides & phospholipides
- ANHYDRIDE PHOSPHORIQUE, nucléotides
Dans les protéines, quels en sont les constituants, la structure générale, les macromolécules, et le liens entre les constituants?
Ils sont constitués d’acides aminés, sont des groupements amine, carboxyle, les macromolécules sont les peptides, polypeptides,et protéines, relié par des liens peptidiques (liens amides)
Dans les glucides, quels en sont les constituants, la structure générale, les macromolécules, et le liens entre les constituants?
Ils sont composés de monosaccharides, les groupements sont hydroxyle et carbonyle, les macromolécules sont les polysaccharides et les liaisons sont des liens éther ou encore glycosidiques.
Dans les acides nucléiques, quels en sont les constituants, la structure générale, les macromolécules, et le liens entre les constituants?
Ils sont composés de nucléotides, sont des groupements monosaccharides, des bazes azotés et des groupements phosphates, les macromolécules sont les acides nucléiques, les polynucléotides, et ARN, ADN. Les liens sont des phosphodiester.
Dans les lipides, quels en sont les constituants, la structure générale, les macromolécules, et le liens entre les constituants?
Ils sont composés d’acides gras, leurs groupements sont des chaînes hydrocarbonée et des groupements carboxyle. Les macromolécules sont des lipides et les liens sont des liens ester.
Que forment les membranes et des quoi sont-elles constituées?
Elles forment une barrière selective entre l’intérieur et l’extérieur de la cellule. Elles permettent de concentrer des substances chimiques facilitant les réactions chimiques. Elles sont constituées de lipides et de protéines. (responcable de la force et de la forme des cellules) et contiennent recepteurs aux stimulis externes.
Quel est le cycle de l’énergie?
soleil->organismes photosynthétiques->autres organismes
Métabolisme? Catabolisme? Anabolisme?
- ensemble des réactions chimiques qui permettent la dégradation ou la synthèse des biomolécules.
- réaction de dégradation
- réaction de synthèse
Pourquoi couple-t-on les réactions catabolistes et anablistes?
L’un requiert de l’énergie (anabolique) alors que l’autre en demande (catabolique)
La vitesse d’un réaction est directement proportionnel à la
______________ ____ _________
CONCENTRATION DES RÉACTIFS
V1=k1[A][B]
V-1=k-1[C][D]
où A+BC+D
Quelle est la formule de la constante d’équilibre?
keq= [C]éq[D]éq / [A]éq[B]éq = [produit]éq / [réactifs] éq
Les organismes en tant que système utilisent quels lois de la thermodynamique?
Conservation de l’énergie
Accroissement global de l’entropie
Définissez les variables suivantes utilisées en bioénergétique
enthalpie (H), entropie (S), énergie libre de Gibbs (G)
leur utilités et les formules qui si rapporte?
Le changement d’enthalpie est le changement d’énergie interne sous forme de chaleur. permet savoir si exothermique, endo et si réaction favorable (delta Hune réaction… si - (exergonique), favorisée, si + (endorgonique) réaction inverse favorisée et si nulle, équilibre
delta G = delta H - T x delta S
À quoi correspond ces dates? 4,6 milliards d'années 3,5 milliards d'années 1,8 milliards d'années 700 à 900 millions d'années
4,6 milliards d’années: formation de la terre
3,5 milliards d’années: âge le plus vieux fossile de cellule
1,8 milliards d’années: apparition des eucaryotes
700 à 900 millions d’années: apparition des organismes pluricellulaire
Quelles sont les similarités de toutes les cellules? (3)
Les mêmes biomolécules
Les mêmes sentiers métaboliques
Le même code génétique
Comparez les procaryotes et les eucaryotes
P: pas de noyau ni autre organite, petite cellule, unicellulaire
E: noyau et autres organites, grosse cellule, uni ou pluricellulaire
À quoi correspond les procaryotes est quelle est environs leur proportion dans le monde du vivant?
Correspond à 2 domaines du vivant: archaebactéries et eubactéries
Ce sont les organismnes vivants les plus abondants (occupe virtuellement toutes les niches écologiques)
Énumérez les principales composantes de la cellule procaryote et leur rôle
Paroi cellulaire: support mécanique
Membranes cellulaire: barrière physique selective
Membrane externe: Support mécanique
Nucléoïde: où est concentrer le chromosome
Ribosome: synthèse des protéines
Quesque paroi cellulaire et rôle? (eucaryote)
protection contre bris mécanique
Membrane cellulaire? rôle? (eucaryote)
barrière physique sélective
Noyau? (eucaryote)
stockage de l’information génétique
Reticulum endoplasmique? (eucaryote)
Lien de synthèse des protéines non cytosoliques et des lipides
Appareil de Golgi? (eucaryote)
Modification, transport et sécrétion des produits cellulaires
Ribosome? (eucaryote)
synthèse des protéines
Mitochondries? (eucaryote)
usine énergique de la cellule
Chloroplaste? (eucaryote)
siège de la photsynthèse
Lyposome? (eucaryote)
réservoir d’enzymes de dégradation
Peroxysome? (eucaryote)
réservoir d’enzyme d’oxydation
Vacuole? (eucaryote)
stockage de nutriments ou de déchets métaboliques
Cytosquelette? (eucaryote)
Responsable de la forme et du mouvement de la cellule.
