Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Virologie > Module 1 > Flashcards

Module 1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un virion ?

A

Terme pour désigner la particule virale infectieuse complète constituée d’un génome (ARN ou ADN) et entourée d’une capside de nature protéique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Comment est appelé l’ensemble constituée du génome et de la capside ?

A

Nucléocapside

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Qu’est-ce qu’un virus enveloppé ?

A

Il contient une enveloppe de nature lipidique autour de la nucléocapside

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

De quoi se compose le génome viral

A

ADN ou ARN *Jamais les deux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Le génome viral code pour quoi ?

A

Protéine de structure (capsides ou glycoprotéine), enzymes, protéines de régulation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Quelles sont les 7 classes de Baltimore ?

A

Classe 1 : ADN db linéaire
Classe 2 : ADN sb +
Classe 3 : ARN db (rare)
Classe 4 : ARN sb +
Classe 5 : ARN sb -
Classe 6 : ARN sb + rétrovirus
Classe 7 : ADN db et rétrotranscription

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

sur quoi se base la classification proposée par baltimore ?

A

Sur leur génome

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quelles sont les 4 types de polymérases ?

A

ADN pol ARN dép (rétrotranscriptase) : Construction d’ADN à partir d’ARN
ADN pol ADN dép : Construction d’ADN à partir d’ADN
ARN pol ARN dép : Construction d’ARN à partir d’ARN
ARN pol ADN dép : Construction d’ARN à partir d’ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quelle polymérase est nécessaire pour les virus formé d’ARN ?

A

ARN pol ARN dép

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Où se produit la réplication des virus formé d’ARN ?

A

Dans le cytoplasme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

De quoi les virus formés d’ADN ont-ils besoin ?

A

réplication nucléaire, ADN pol et ARN pol ADN dép

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

De quelles classes de virus, les archées peuvent se faire infecter ?

A

classe 1 et 2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

De quelles classes de virus, les eucaryotes peuvent-ils se faire infecter ?

A

classe 1 à 7

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Les bactériophages appartiennent à quelles classe ?

A

1 à 4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Quelle autre forme de classification (autre que Baltimore) est utilisée pour classifier les virus ? Quels sont les désavantage ?

A

Classification des virus selon le comité international de taxinomie, qui se base sur plusieurs critères : séquence consensus, taille du génome, type de capside, nature de l’hôte. Classification en constante variation, ne respecte pas la phylogénie.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Donnez un exemple de classification selon le comité international.

A

Pour le papillomavirus, gène L1 qui code pour protéine de la capside, et si similarité de 60% ou plus dans la séquence de L1, même genre, et si 70% ou plus, même espèce.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Pourquoi aucune classification des virus ne permet de faire un arbre phylogénétique détaillé ?

A

Car aucun marqueur précis et suffisamment conservé ne peut être utilisé entre virus éloignés.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Quel est le rôle de la capside

A

De nature protéique, elle stabilise et protège le génome viral. Chez certains virus nus, elle participe à l’adsorption à la cellule hôte.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Comment nomme-t-on les sous-unités de la capside ?

A

Les capsomères

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Quelles sont les formes possibles de capside ?

A

Hélicoïdale, icosaédrique et complexe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Pourquoi existe-il une pression sélective pour un petit génome chez les virus ?

A

C’est plus avantageux pour les virus d’avoir un petit génome, car cela permet l’évasion du système immunitaire de l’hôte, une réplication rapide, et de former plus de descendants par cellule infectée.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Comment les virus parviennent-ils à conserver un petit génome ?

A

Plutôt que de former une seule grosse protéine (gros gène) pour la capside, les virus ont tendance à former de nombreuses copies d’une seule petite protéine (petit gène).
Également, l’assemblage est souvent spontané (autoassemblage des capsomères), ce qui minimise l’énergie nécessaire et évite l’implication d’une enzyme codée par le génome.
Aussi, en utilisant la machinerie cellulaire de l’hôte, pas besoin de gènes qui codent pour ces enzymes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Comment est déterminé la taille de la capside ?

A

Par la taille du génome.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vrai ou faux ? Justifiez.
L’assemblage de la capside est toujours spontannée.

A

Faux, certains virus ont besoin des chaperones de l’hôte pour aider à l’assemblage stable de la capside (ex : phage lambda a besoin de la chaperonne GroE de E. coli pour s’assembler).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Qu’est-ce qu’une chaperones ?

A

Protéines contenues dans la cellule qui favorise la stabilité et le repliement des protéines. Les chaperones ne différencient pas les protéines de l’hôte des protéines virales, donc certains virus utilisent les chaperones pour l’assemblage de leur capside.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Comment se fait l’assemblage de la capside chez le virus à capside hélicoïdale ?

A

Un site de fixation précis se retrouve sur le
génome viral : le packing signal (pac).
Le pac est reconnu par un premier capsomère, qui s’y lie. Les autres capsomères s’emboîtent ensuite l’un dans l’autre automatiquement et de façon symétrique, ils se maintiennent par des forces électrostatiques et hydrophobes.
Chaque capsomère détient un creux dans lequel le génome se loge.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Qu’est-ce qu’un icosaèdre ?

A

Un icosaèdre est un polyèdre formé de l’assemblage de 20 triangles équilatéraux. Il possède 12 sommets, 20 faces et 30 arrêtes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Combien de capsomères forment la capside icosaédrique, au minimum ?

A

3 minimum par faces, donc 60 capsomères au minimum.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Comment le génome est-il organisé dans la capside icosaédrique ?

A

Dans plusieurs cas, le génome (chargé négativement) est lié à des acides aminés chargés positivement sur la capside (acides aminés basiques).Sans cette organisation, il ne pourrait pas être libéré et déroulé adéquatement lors d’une infection.

30
Q

Qu’est-ce que la capside de symétrie complexe ?

A

Une capside de symétrie complexe désigne toute forme qui est ni strictement hélicoïdale, ni icosaédrique. Ex : bactériophage T4, possède une queue hélicoïdale et une tête icosaédrique. Pour d’autre virus, les observations ne permettent tout simplement pas de déterminer la forme précise.

31
Q

Qu’est-ce que l’enveloppe ? De quoi est-elle constituée ?

A

C’est une couche lipidique qui entoure la capside. Elle provient de la cellule hôte qui a été infectée : membrane cytoplasmique, membrane nucléaire, réticulum endoplasmique.

32
Q

Vrai ou faux ? Justifiez
Les virus enveloppés sont plus résistants à l’extérieur que l’hôte que les virus nus ?

A

Faux, les virus enveloppés sont généralement moins résistants à l’extérieur de l’hôte, car l’enveloppe lipidique est plus sensible aux conditions environnementales (chaleur, sécheresse, agent chimique)

33
Q

Quelle est la particularité des virus enveloppés lors du bourgeonnement ?

A

L’acquisition de glycoprotéine (molécule permettant liaison spécifique à une future cellule).

34
Q

À de rares exceptions, seuls des virus nus infectent les bactéries et les plantes. Pourquoi ?

A

Parce que les bactéries et cellules végétales ont une paroi cellulaire contrairement aux cellules eucaryotes, ce qui constitue un obstacle aux virus enveloppés.

35
Q

Qu’est-ce que les glycoprotéines ? Nommez 2 synonymes.

A

lles servent à l’attachement à une récepteur spécifique chez les cellules-
cibles de l’hôte.
Elles sont généralement antigéniques. On les utilise dans la composition de plusieurs vaccins.
Elles sont synonymes de spicules (spikes) ou projections.

36
Q

Vrai ou faux ? Justifiez
Seuls les virus enveloppés possèdes des glycoprotéines ?

A

Faux, les virus nus aussi peuvent en posséder, et elles sont ancrées dans la capside plutôt que dans l’enveloppe.

37
Q

Nommez des enzymes transportées dans le virion.

A

Lysozyme chez les bactériophages (dégradation de la paroi bactérienne et formation d’un trou pour l’entrée du génome viral)
Certains virus d’animaux transportent des enzymes qui digèrent les glycolipides et les glycoprotéines qui relient les tissus pour faciliter la libération et la prolifération des particules virales.

38
Q

Les virus sont-ils des êtres vivants ? Donnez les arguments pour et contre.

A

Il n’y a pas de consensus sur la question ; certains disent que oui, d’autres que non.

Argument pour (ce sont des êtres vivants) :
- Information génétique codé (génome)
- Réplication
- Mutations ; évolution génétique ; adaptation ; réponse à une pression de sélection

Argument contre (ce ne sont pas des êtres vivants) :
- Aucune indépendance
- Parasite obligatoire
- Pas composé de cellule
- Aucun système de production d’énergie (utilise l’énergie de la cellule hôte qu’il parasite)

39
Q

Chez les différents « êtres vivants », quels sont les avantages à avoir un génome formé d’ARN ? Quels sont les désavantages ? Donnez des exemples.

A

Désavantage :
- ARN est une macromoléculaire instable
- Sensible à l’hydrolyse (réaction spontannée)
- Sensible aux Rnase
- Impossible de former un gros génome d’ARN
Avantages :
- Réplication rapide
- Plus de mutations

40
Q

Qu’est-ce qu’un réservoir ?

A

Source de l’agent infectieux. Les virus peuvent se répliquer dans leurs réservoirs. Le virus peut muter dans le réservoir, ce qui peut faciliter sa transmission à d’autres espèces comme l’humain.

41
Q

Qu’est-ce qu’un vecteur ?

A

Il transporte l’agent infectieux et le transmet.

42
Q

Quels sont les modes de transmission des virus ?

A

Par microgoutelettes et aérosols, fécale-orale, parentérale, sexuelle, mère-enfant, via des vecteurs.

43
Q

Décrivez les virus qui se transmettent par microgoutelette et aérosol.

A

Ils sont enveloppés et instables hors des microgoutelettes. Ils peuvent affectés les voies respiratoires supérieures (nez, sinus, pharynx, larynx) et les voies respiratoires inférieures (bronches et poumons). La température optimale est de 33 degré pour les voies supérieures et de 37 degré pour les voies inférieures.
Ex : rhinovirus et influenzavirus.

44
Q

Décrivez les virus qui se transmettent par voie fécale-orale.

A

Ils sont généralement nus et stables dans l’environnement. Ils peuvent résister des semaines dans l’envrionnement ou dans un échantillon d’eau. Ils résistent aussi généralement au pH faible de l’estomac, et leur DMI est faible.
Ex : virus de Norwalk (DMI = 10), hépatite, rotavirus = gastro (DMI = 100)

45
Q

Comment appelle-t-on les objets inanimés et porteurs de virus ?

A

Fomites.

46
Q

Que veut dire la transmission parentérale ?

A

Par injection (aiguilles, matériel médical), via sans contaminé (ex : VIH et hépatites B et C)

47
Q

Décrivez la transmission sexuelle des virus ?

A

Implique un contact prolongé de muqueuse à muqueuse, car ces virus sont souvent fragiles. (ex : VIH, VPH, herpès)

48
Q

Quels sont les type de transmission mère-enfant ?

A

4 types : prénatale (avant naissance), congénitale (au cours de la grossesse) et périnatale (au cours de la naissance - sang, urine, selles de la mère lors du passage de l’enfant) et postnatal (allaitement). Ex : VIH et hépatite B et C.

49
Q

Quel est l’«objectif» d’un virus ?

A

Persister dans la population et assurer une descendance.

50
Q

Qu’est-ce que le tropisme ?

A

C’est la préférence du virus pour un type précis de cellule. Les glycoprotéines assurent cette spécificité.

51
Q

Lors de la transmission sexuelle du VIH, où ce virus peut-il passer ?

A

Entre les cellules épithéliales, via les cellules du MALT qui l’internalisent (cellules dendritiques) et qui le transportent vers la circulation sanguine.

52
Q

Quelles sont les 3 grandes stratégies chez les virus eucaryotes ?

A

Infection aigue (virulente) : réplication et transmission rapide
Infection persistante : réplication lente et peu de symptômes
Infection latente : génome du virus intégré au génome de l’hôte (ex: herpès), donc long épisodes sans réplication, transmission lente.

53
Q

Pour la dissémination du virus, quels systèmes sont utilisés par les virus ?

A

Le système lymphatique (polio), la circulation sanguine (virémie, VIH), les trajets nerveux (rage)

54
Q

Où les virus ont-ils tendance à se répliquer ?

A

Au site initial de l’infection.

55
Q

Quels sont les effets d’une infection sur les tissus ?

A

Il n’y a pas de relation entre les effets cytotoxiques des virus et les manifestations cliniques.
Cela dépend du tissu touché par l’infection.
Par exemple, la gastro se multiplie dans les cellules épithéliales sans créer de lésions, mais les processus osmotiques sont pertubés, donc diarrhée. Le polio provoque la lyse des cellules épithéliales de l’intestin, mais pas de symptôme, car les entérocytes se regénèrent continuellement. Elle cause plutôt des manifestations cliniques si le virus se propagent dans les voies lymphatiques pour atteindre d’autre tissus.

56
Q

Quelles sont les 5 étapes de l’infection au niveau cellulaire ?

A

1) adsorption
2) pénétration
3) expression des gènes viraux et réplication
4) assemblage
5) libération

57
Q

Décrivez le mécanisme de l’adsorption.

A

Virus nus : la capside détient généralement une complémentarité de charge avec un récepteur cellulaire.
Virus enveloppé : les glycoprotéines ancrées dans l’enveloppe détiennent une complémentarité de charge avec un récepteur cellulaire.

58
Q

Décrivez le mécanisme de la pénétration du virus nu.

A

Il entre par endocytose. Une fois dans la cellule via l’endosome, il peut soit y avoir altération de capside et injection du génome ou perméabilisation de l’endodosome et de la capside et injection du génome. Pour les bactériophages, il n’y a pas d’endocytose et la capside est altéré et le génome est injecté directement.

59
Q

Décrivez le mécanisme de la pénétration chez les virus enveloppés.

A

Il peut y avoir fusion de la capside et de la membrane plasmique de la cellule hôte, et injection de la nucléocapside du virus. Sinon, le virus entre par endocytose, et il y a une fusion ph-dépendante de l’enveloppe et de la membrane de l’endosome, puis après un certain temps, la nucléocapside est éjectée de l’endosome.

60
Q

Décrivez le mécanisme de la pénétration chez les phytovirus.

A

Comme il y a une paroi cellulaire épaisse formée de cellulose, pas de fusion de membrane possible. La pénétration se fait via des insectes, des protozoaires, des nématodes, des lésions, par le pollen et les semences. Les virus se propagent d’une cellule à l’autre via les plasmodesmes pour éviter d’entrer en contact avec l’extérieur de la cellule.

61
Q

Décrivez l’expression et réplication cellulaire des virus de classe 1 et 2.

A

La classe 1, est l’ADN db et la classe 2 est l’ADN sb +. Ils doivent se rendre au noyau pour utiliser l’ADN polymérase, et l’ARN pol ADN dép.
Dans le noyau, d’abord, il y a réplication d’ADN par l’ADN pol. transcription en ARNm, par l’ARN pol ADN dép. Ensuite, l’ARNm est exporté vers les cytoplasme, et les protéines sont formées.

62
Q

Quelle est la particularité des virus à ARN concernant l’expression et la réplication ?

A

Le cycle de réplication est cytoplasmique : aucune enzyme nucléaire ne peut être utile.
Les ARN-polymérase ARN-dépendante n’existent pas chez les mammifères (selon les connaissances actuelles). Les virus à ARN codent donc cette enzyme dans leur génome.

63
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’ARN pol ARN dép.

A

Elle est multifonctionnelle, elle assure la formation de brins d’ARN complémentaires pour répliquer le génome et pour former des ARNm. Certains ajoutent même une queue poly-A en 3’ et une coiffe en 5’.
Elle fait souvent des erreurs ; hautement mutagène

64
Q

Comment se produit l’expression et la réplication des virus de la classe 4.

A

Classe 4 = virus à ARN+.
L’ARN + est identique à l’ARNm.
Directement dans le cytoplasme, l’ARN + peut être traduit en protéines, et il est répliquer (transcrit) en ARN - par la ARN pol ARN dép.

65
Q

Nommez une particularité de certains virus de la classe 4 ?

A

Particularité chez certains de ces virus : l’ARN messager est transcrit en une seule polyprotéine qui catalyse son propre clivage en plusieurs protéines individuelles. Sur un même ARNm, il y a plusieurs opérons, donc plusieurs codons d’initiation et plus codons de terminaison qui permettent la synthèse de plusieurs protéines à partir d’un seul ARNm.

66
Q

Décrivez l’expression et la réplication des virus de la classe 5.

A

Classe 5 = ARN -
ARN - signifie que cet ARN est complémentaire à l’ARNm, il ne peut donc pas être directement traduit par le ribosome. Il faut la ARN pol ARN dép forme un brin complémentaire +, qui sera lui traduit par le ribosome. L’ARN pol virale est transportée dans les virions pour assurer le début du cycle à chaque nouvelle infection.

67
Q

Décrivez l’expression et la réplication chez les virus de la classe 3.

A

Classe 3 = ARN db (rare)
Le brin - est utiliser pour former des ARNm, et les 2 brins sont utilisés pour répliquer le génome.

68
Q

Décrivez l’expression et la réplication chez les virus de classe 6.

A

Classe 6 = rétrovirus.
Génome formé d’ARN+. Le virus possède une rétrotranscriptase, qui une ADN pol ARN dép. Elle a aussi une activité Rnase. Une fois dans le cytoplasme, le RT transforme l’ARN + en ADNdb. Elle est hautement mutagène. Dans le cas des rétrovirus, c’est la molécule d’ARN qui est encapsidée pour former le virion et la rétrotranscription s’effectue au moment où la nucléocapside virale pénètre dans le cytoplasme de la cellule infectée. L’ADN db est transporté au noyau, puis une intégrase catalyse son intégration dans le génome. Il peut demeurer latent ou être activement transcrit par la machinerie de l’hôte pour produire d’autre ARN + et former d’autre protéines à partir des ARNm viraux.

69
Q

Décrivez l’expression et la réplication chez les virus de classe 7.

A

Classe 7 = ADN db + rétrotranscriptase
Après pénétration, l’ADN db se rend au noyau. Des ARNm sont formé grâce à l’ARN polymérase de l’hôte. Ces ARNm vont dans le cytoplasme et sont traduits en protéines, dont la RT. Ces ARNm sont encapsidé avec la RT, et dans la capside, les ADN db sont formés par la RT et les virions quittent la cellule.

70
Q

Comment se fait l’assemblage des virus ?

A

Il est spontannée, dans le sens où aucune enzyme est nécessaire. Les capsomères s’emboîtent automatiquement pour former la capside grâce à des forces électrostatiques et des liaisons hydrophobes.

Virologie (5 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions