Microbiote Flashcards
Def microbiote
E de micro-organismes vivant dans un environnement donné
Microbiote oral contient plusieurs niches écologiques où vivent plusieurs communautés microbiennes
Def microbiome
E formé par le microbiote, pour leur génome, et tout ce qui les entoure
Holobionte
Organisme humain + micro-organismes qu’il héberge
Composition corps bactéries
70% d’eau
Leur poids sec
55% protéines
10% lipides
40% ribosomes
20% ARN
3% ADN
Éléments obligatoires des bactéries (5)
- paroi cellulaire
- membrane plasmique
- ribosomes (40% de leur poids sec)
- appareil nucléaire: ADN+ARN: localisé dans zone dans cytosol appelée nucléoïde
- cytoplasme
Éléments facultatifs
- capsule (+ périphérique que mbn)
- 1 ou + plasmides: ADN extra-chromosomique, contient les gènes de résistance aux antibiotiques
- 1 ou + flagelles
- pili sexuels: participent à la conjugaison: échange de matériel génétique par échange de plasmides
- pili communs (fimbriae)
Pili communs (fimbriae)
- de 1 à 2um
- fonction d’adhérence sur un support
- polymère protéique constitué de pilines organisées en hélice, qui une fois repliée, forme un cylindre creux
- à l’extrémité de ce cylindre, l’adhésine est une protéine d’attache capable de se lier aux récepteurs glycosylés des membranes eucaryotes
Paroi Gram +
- plus épaisse: 30 à 300nm
- 40 à 80% de peptidoglycane
- acides téichoïque et lipotéichoïque (LTA) insérés dans le peptidoglycane
Gram -
- moins épaisse (20 à 30nm)
- peptidoglycane 10%
- espace péri plasmique: très hydrophile
- membrane externe : 50% de leur masse c’est des protéines: composée d’une bicouche lipidique constitué d’une couche interne composé de PL et d’une couche externe composé de LPS (logique car sucre toujours côté externe)
État planctonique
- bactéries sous forme d’amas mobiles dans des suspensions
- bactéries animées par les mouvements des lipides
- dépourvue de toute attache à une surface
État sessile
- sous forme d’amas adhérents à des surfaces avec remaniement permanent, forment les biofilms
- c’est la formation de biofilms qui leur permet de coloniser
Conséquence: cellule en suspension n’exprime pas les mêmes gènes que les cellules adhérentes
N’expriment pas les mêmes gènes, donc n’ont pas le même phénotype, ne produisent donc pas les mêmes sub matricielles appelées exopolymères
Une modif de l’expression génique permet de passer d’un état à l’autre
Deux types de mode de développement
Homogène (que en laboratoire) ou hétérogène (++ fréquent)
Mode de développement hétérogène
Formation de biofilms en microcolonies discontinues séparées pas des espaces remplis de liquide, nutriments et déchets
AI des gram -
Petite molécule signal, lipophile, diffusible, qui active une protéine de régulation de la transcription appelée R (intracellulaire)
- l’activation de cette protéine conduit à la transcription de gènes responsables de modif phénotypiques - dont la réduction de la mobilité, conduisant à la formation d’un biofilm
AI des gram +
- peptide signal, hydrophile
- active récepteur membranaire HK
- transduction du signal généré par l’activation des HK conduit à une cascade de signalisation impliquant des protéines régulatrices de la réponse cellulaire (RR) - induit diminution de la mobilité des microorganismes
QQ à deux niveaux
- extracellulaire par la dégradation ou séquestration de molécules signal AI
- intracellulaire grâce à des inhibiteurs du QS
Bactéries aérobies strictes
Pseudomonas
Acinetobacter
Neisseria
Bactéries microaérophiles
Se développent lorsque la pression partielle d’O2 est inférieure à celle de l’air
Campylobacter
Mycobacteriaceae
Bactéries aéro-anaérobies facultatives
Entérobactéries comme les Escherichia, Salmonella
Streptocoques
Staphylocoques
Bactéries anaérobies strictes
Bactérie dans les flores normales
Bactéries intestinales: bacteroides, fusobacterium, clostridium
Colonisateurs précoces
Premières à se fixer à la PAE: streptocoques (Gram +)
Permettent la liaison d’autres protéines Fusobacterium nucleatum
dyslipidémie et stéatite hépatique non alcoolique
dyslipidémie: taux élevé de cholestérol ou de triglycérides dans le sang
sté
Composition chiffres microbiote buccal
En moyenne 10e10 et entre 500 et 1000 espèces diff, donc conduit à dépôt rapide au niveau
- des dents: 10e5/ mm2 en qq heures
- sur la face interne de la joue: 1 cellule épithéliale eucaryote pour 0 à 25 bactéries
- sur la face dorsale de la langue: 1 cellule épithéliale eucaryote pour 100 bactéries