Microbio - Micro-organismes ** COMPLET ** Flashcards
Comment sont classés les micro-organismes? (8)
- Domaine
- Règne
- Embranchement
- Classe
- Ordre
- Famille
- Genre
- Espèce
Donnez l’exemple d’E. Coli
- Domaine
- Genre
- Espèce
- Souche
- Domaine : Bacteria.
- Genre : Escherichia
- Espèce : Coli
- Souche : Sakai (sérotype O157:H7)
Quels sont les 3 domaines de la vie?
- Bacteria.
- Archaea.
- Eucarya.
Types cellulaires : Que sont les 3 types cellulaires?
- Procaryotes.
- Eucaryotes.
- Archées.
Donnez les principales caractéristiques du domaine bacteria.
- Quels types de cellules (2 caractéristiques).
- Taille.
- Est ce que ce domaine contient des pathogènes?
- Cellules procaryotes / Cellules unicellulaires.
- Ordre du micromètre.
- Majorité des espèces de bactéries ne sont pas pathogènes.
Donnez les principales caractéristiques du domaine Archea.
- Cellule.
- Est ce que ce domaine contient des pathogènes?
- Cellules procaryotes.
- Pas d’archée pathogène.
Donnez les principales caractéristiques du domaine Eucarya.
- Qui la composent?
- Quels sont les principaux micro-organismes qui le composent?
- Est ce que ce domaine contient des pathogènes?
- Cellules eucaryotes / uni ou pluricellulaires.
- Mycètes, protozoaires.
- Oui.
Que sont les cellules procaryotes? Qui sont-ils?
- Cellule simple.
- Pas de noyau.
- Un seul chromosome libre.
- -» Bactéries.
Que sont les cellules eucaryotes ? Qui sont-ils?
- Cellule complexe.
- Avec noyau.
- Plusieurs chromosomes.
- -» Cellules humaines/animales/végétales, protozoaires.
Que sont les archées?
Quels sont leurs caractéristiques particulières au niveau morphologique?
- Cellules qui ressemblent aux procaryotes
- Lipides membranaires uniques, paroi chimiquement différente et une composition particulière des ribosomes.
Archées :
Quels sont des caractéristiques uniques des archées?
- Peuvent être des organismes méthanogènes (producteurs de méthanes).
- Inclut des bactéries halophiles extrêmes (milieux salés).
- Inclut des bactéries thermophiles extrêmes (sources chaudes).
Comment sont divisés le domaine eucarya? Donnez les différents exemples.
- En règnes.
- -» Protistes, mycètes, plantes, animaux.
Comment sont divisés le domaine procaryotes?
En embranchements.
Terminologie :
Qu’est-ce que le 1er mot? Qu’est-ce que le 2e mot?
Lequel des deux commencent par une majuscule?
- 1e mot : Genre (majuscule)
- 2e mot : Espèce (minuscule).
Est-ce que les bactéries d’une même espèce sont complètement identiques?
Non –» le terme de souche désigne chaque isolat.
Qui est inclut dans les micro-organismes (4) ?
- Bactéries.
- Virus.
- Mycètes.
- Protozoaires.
Donnez 5 caractéristiques des micro-organismes.
- Très petite taille.
- Unicellulaire.
- Inclut les procaryotes et eucaryotes.
- Ont un potentiel métabolique (sauf virus).
- Capable de se reproduire de façon autonome (sauf virus).
Est-ce que les virus appartiennent à un domaine ou un règne?
Non.
Virus : Pourquoi sont-ils si spéciaux? (3 caractéristiques).
- Acellulaire.
- Non vivant.
- Réplication semi-autonome : Ils doivent infecter une cellule hôte qui va assurer leur réplication.
Que sont les prions?
Que passe-t-il quand ils entrent en contact avec les protéines N de l’hôte?
- Protéines qui ont une conformation anormale.
- Réaction en chaîne –» accumulation de protéines anormales –» atteintes du SNC avec le temps.
Qu’est-ce que le génotype?
Qu’est-ce que le phénotype?
Génotype : Caractéristiques génétiques des microbes.
Phénotype : Caractéristiques observables qui découlent du génotype (ex : morphologie, fonction).
En pratique clinique, que visent les techniques de laboratoires? Donnez 4 exemples de techniques.
- Identification des micro-organismes.
- Morphologiques.
- Biochimiques
- Sérologiques.
- Génétiques.
Qui sont les plus gros : les procaryotes ou les eucaryotes?
Eucaryotes.
Où retrouve-t-on les micro-organismes?
Partout ! Ils sont omniprésents.
- Air, eau, sol, tissu animaux, végétaux.
Quels sont des moyens que les micro-organismes ont développés pour se procurer l’énergie nécessaire à leurs activités vitales?
1- Respiration.
2- Photosynthèse.
3- Fermentation.
4- Dégradation de produits organiques.
Quel est le groupe le plus abondant d’être vivant?
Les micro-organismes.
Combien de cellules humains contient l’être humain?
Combien contient de cellules micro-organismes?
10^13
10^14
Que sont les bactéries? Comment est la structure cellulaire? Est-ce qu'il y a de l'ADN et l'ARN? Comment est la réplication? Quelle sorte de microscope sont utilisés?
- Organismes procaryotes.
- Pas d’organelles complexes.
- Possède de l’ADN et l’ARN.
- Réplication autonome.
- Visibles en microscopie optique.
Que sont les virus? Est-ce qu'il y a de l'ADN et l'ARN? Comment est la réplication? Qu'est-ce la capside? Quelle sorte de microscope sont utilisés?
- Organisme acellulaire non-vivant.
- ADN OU ARN (jamais les deux en même temps).
- Réplication semi-autonome.
- Structure protéique entoure le matériel génétique.
- Microscope électronique.
Que sont les mycètes?
Comment est la structure cellulaire?
Qu’est-ce qui est leur source d’énergie/nutriments?
Nommez les 2 types de mycètes.
- Organismes eucaryotes.
- Structure cellulaire + complexe que bactéries.
- Matière organique en décomposition.
- Levures / moissisures.
Classez les micro-organismes en fonction de leur taille : Mycètes, Virus, Bactéries
Mycètes > Bactéries > Virus.
Mycètes :
Que sont les levures?
À quoi contribue-t-elle?
Peuvent-elles causer des infections chez l’humain?
- Mycètes unicellulaires.
- Revalorisation des déchets agricoles/industriels + rôle-clé dans l’industrie alimentaire.
- Oui.
Mycètes :
Que sont les moisissures?
Quels sont leur utilités?
Peuvent-elles causer des infections chez l’humaine?
- Champignons multicellulaires.
- Industrie alimentaire / pharmaceutique.
- Oui via libération de toxines dangereuses.
Que sont les protozoaires?
Où les retrouve-t-on?
Comment agissent-ils?
Est-ce qu’ils peuvent causer des infections?
- Microorganismes eucaryotes.
- Eau, sols humides, intérieur d’un organisme.
- Entité autonome ou parasitaire.
- Oui –» ex : toxoplasmose, malaria, dysenterie amibienne.
Que sont les enveloppes bactériennes ?
Différentes structures qui entourent les cellules bactériennes.
Enveloppe bactérienne :
- Qu’est-ce que la capsule?
- Est-elle indispensable à la survie des bactéries?
- Quel est son rôle?
- Enveloppe visqueuse à la surface de certaines bactéries.
- Non.
- Protection contre la phagocytose par les cellules immunitaires ET favorise l’adhésion des bactéries aux cellules épithéliales.
Enveloppe bactérienne :
- Qu’est-ce le glycocalyx?
- Quel est son rôle?
- Feutrage extra cellulaire qui est plus irrégulier que la capsule.
- Faciliter l’adhésion des bactéries aux surfaces et l’adhésion entre les bactéries.
Enveloppe bactérienne :
- Qu’est-ce que la paroi cellulaire?
- Quel est son rôle?
- Quel sont les deux structures de paroi cellulaire?
- Que contient la paroi cellulaire?
- Comment s’appelle les LPS dans la membrane externe?
- Est ce que les ATB ciblent plus facilement les gram négatif ou les gram positif?
- Enveloppe semi-rigide.
- Donner de la structure aux bactéries.
- Gram + / Gram -
- Gram + = peptidoglycan épais / Gram - = peptidoglycan mince + membrane externe avec des LPS.
- Antigène O.
- Gram positif.
Enveloppe bactérienne :
- Qu’est-ce que la membrane cytoplasmique?
- Quel est son rôle?
- Comment effectue-t-elle son rôle?
- Paroi mince qui est faite d’une bicouche de phospholipides + protéines mobiles.
- Barrière osmotique qui régulent les ions et les substances nutritives.
- Par pénétration sélective de certaines substances.
Constituants internes : Qui sont-ils?
Cytoplasme, ribosomes, matériel génétique.
Qu’est-ce que le cytoplasme?
Fluide qui contient les ribosomes et l’appareil nucléaire.
Que font les ribosomes?
Synthèse des protéines.
Comment est le matériel génétique des bactéries?
ADN double brin sans membrane nucléaire.
Que sont les plasmides (matériel génétique) ?
ADN extra-chromosomique qui codent pour des propriétés facilitant la survie.
Qui est l’antigène K?
Qui est l’antigène H?
- K = Capsule.
- H = Flagelles.
À quoi servent les flagelles?
Sont-ils visibles au microscope?
- Ils assurent la mobilité des bactéries.
- Oui avec une coloration spéciale.
Qui possèdent des pili?
À quoi servent les pili?
- Les bactéries gram nég.
- Fixer les bactéries aux surfaces.
Nommer 1 type particulier de pili.
À quoi servent-ils?
Comment s’appelle ce phénomène?
- Pili sexuels.
- Transfert unilatéral de matériel génétique entre bactéries.
- Conjugaison.
Spores :
Quel est le rôle des spores bactériennes?
- Les spores permettent aux bactéries de survivre dans des conditions défavorables –» le matériel génétique et les éléments vitaux à la survie sont stockés.
Spores bactériennes :
Quel est le processus déclenché lorsque les conditions sont défavorables?
Quelle est le processus déclenché lors que les conditions redeviennent favorables?
- Sporulation.
- Germination (spore reprend sa forme végétative).
Spores bactériennes :
Quels bactéries peuvent faire des endospores?
Gram nég –» Bacillus et Clostridium.
Spores des mycètes :
Est-ce que les spores des mycètes ont aussi un rôle de survie?
Non. Rôle de reproduction et dispersion.
Nommez 4 maladies par des bactéries sporulées.
Gangrène (clostridium)
Tétanos (clostridium)
Botulisme (clostridium)
Anthrax (bacillus)
Trier les composantes :
Paroi cellulaire, membrane plasmique, pili, spore, chromosome, flagelles, cytoplasme, plasmide, ribosomes, capsule.
A. Obligatoires
B. Facultatives
Paroi cellulaire - A Membrane plasmique - A Pili - B Spore - B Chromosome - A Flagelles - B Cytoplasme - A Plasmide - B Ribosomes - A Capsule - B
Nommez 4 morphologies bactériennes
1- Bâtonnets (bacilles)
- Sphères (cocci)
- Entre-deux (coccobacilles)
- Virgules (vibrio).
Est-ce que les bactéries sont toujours isolée ?
Non.
- Isolée.
- Paires (diplocoques).
- Chaînettes (streptoccoques).
Quelles sont les caractéristiques observables possibles d’une colonie bactérienne? (6).
1- Forme. 2- Élévation. 3- Bordure. 4- Surface. 5- Opacité. 6- Pigmentation
À quoi sert une coloration simple?
Donnez 3 exemples
- Faire ressortir les cellules en entier.
- Méthylène, Crystal violet, safranine.
Nommez les 5 étapes de la coloration de Gram
- Fixation des cellules à la lame.
- Coloration primaire avec Crystal violet –» cells seront bleues.
- Application d’iode pour donner des formes moléculaires + grosses.
- Décoloration à l’alcool –» gram + = bleu / gram - = transparent.
- Double vérification avec safranine –» gram + = bleu / gram nég = rose.
À quoi sert la coloration de gram?
Diviser les bactéries en deux grands groupes et mieux orienter la sélection des ATB à utiliser.
Quels bactéries réagissent mal à la coloration de gram?
Quel colorant est utilisé?
- Mycobactéries.
- Ziehl-Neelsen.
Quel est le microscope traditionnel?
Nommez 1 désavantage.
- Microscope optique en champ clair.
- En absence de colorations, difficile de voir les cellules bactériennes translucides.
À quoi sert le microscope optique à fond noir?
À voir les cellules qui peuvent être difficilement colorées.
Qu’est-ce que le microscope électronique?
Est-ce que ce microscope est bcp utilisé en microbiologie?
- Microscope très sophistiqué –» l’échantillon observé sera traversé par un faisceau d’électron mobile.
- Non. Davantage utilisé en pathologie.
À quoi servent les tests biochimiques (phénotypiques) ?
À identifier les bactéries une fois leur croissance obtenue.
Tests biochimiques
Qu’est-ce les labos de bactériologie clinique utilisent de nos jours? Qu’est-ce que cette technique donne comme info?
- Microplaquettes de 96 puits avec plusieurs réactifs.
- Un code chiffrés (grâce une analyse informatique) qui correspond à caractéristiques phénotypiques spécifiques –» identification des espèces bactériennes.
Test immunologiques (test phénotypique) : ELISA
- Qu’est-ce que cette technique?
- Combien d’anticorps sont utilisés?
- Pourquoi appelle-t-on cette méthode le « sandwich »
- Quelle est l’utilité de la méthode sandwich?
- Technique d’identification qui utilisent des Ac spécifiques.
- 2
- L’antigène est pris entre un Ac de capture et un Ac de détection.
- Double reconnaissance de l’antigène et augmentation de la spécificité du test.
Test génotypique - Séquençage de l’ADN
Quel est son avantage?
Quel est son désavantage?
- Résultat uniforme d’un labo à l’autre ET il existe des bases de données publiques fiables.
- Trop long et trop complexe pour labo médical.
Test génotypique - Dx moléculaire par TAAN
Quel est condition pour faire ce test?
Si cet condition est rempli, que se passe-t-il?
- Une séquence génétique particulière doit déjà avoir été identifié dans une espèce bactérienne.
- L’outil génétique sera capable de détecter l’espèce dans un échantillon.
Combien de temps prennent les méthodes phénotypiques?
Entre 48 et 64h.
Combien de temps prennent les méthodes génotypiques?
- Environ quelques heures.
- Toutefois, environ 1 ou 2 jours avant le résultat soit communiqué.
Qu’est-ce qu’un virus nu? Qu’est-ce qu’un virus enveloppé?
Enveloppé : Vole une partie de la membrane de l’hôte.
Nu : Ne vole pas une partie de la membrane de l’hôte.
Les solutions hydro alcoolisés ciblent davantage quel type de virus?
Ceux avec une bicouche lipidique (donc les virus enveloppés).
Nommez les 3 enzymes impliqués dans les rétrovrus (ex : VIH) + leurs fonctions
Transcriptase inverse : Transcrit l’ARN viral en ADN.
Intégrase : Intègre l’ADN viral à l’ADN de l’hôte.
Protéase : Favorise la maturation des protéines virale.
Nommez l’enzyme important des virus influenzae + fonction
Neuraminidase : Contribue au relargage des virus hors des cellules –» pourra donc aller infecter d’autres cellules.
