MICROBIO 1B: Microbiote Flashcards
quelles sont les 2 grandes étapes historiques qui ont mené au séquencage du microbiote
Human genome project: séquencage du génome humain
Human Microbiome Project: analyser la composition génétique de la population microbienne vivant sur un adulte en bonne santé
selon le Human Microbiome Project, le ratio bactéries : cellules humaines est…
10:1
le foetus vit dans un milieu…
stérile
à la naissance, le bébé entre en contact avec…
la flore normale de sa mère, c’est le début de la colonisation de sa peau et de son système digestif par la flore normale
vrai ou faux, au niveau du microbiote du bébé naissant, il n’y a aucune différence entre un accouchement vaginal et un accouchement par césarienne
faux, l’accouchement vaginal est préférable pour aider à construire le microbiote de l’enfant
dans les années qui suivent la naissance, l’enfant entre également en contact avec…
d’autres personnes et des bactéries de son environnement
définit le microbiote
ensemble des micro-organismes qui résident sur un site donné (ex.: peau, narines, tractus géniot-urinaire, tractus digestif)
définit le microbiome
ensemble des micro-organismes et de leurs gènes qui résident sur un site donné
quelles sont les différences principales entre le microbiome central (core microbiome) et le microbiome secondaire
microbiome central:
- espèces bactériennes présentes chez plus de 95% des personnes humaines à un site donné
- représente la majorité des bactéries présentes ç un site donné
- moins varié que le microbiome secondaire
microbiome secondaire:
- espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
- grande variété d’espèces
- chaque espèce est en plus petite quantité comparativement au microbiome central
donne 1 exemple de bactérie présente dans le microbiome central de la peau et 1 dans celui du tractus digestif
peau: staphylococcus epidermidis
tractus digestif: escherichia coli
vrai ou faux, le microbiote cutané est identique sur toute la surface du corps
faux, il varie selon le site
vrai ou faux, le microbiote cutané est influencé par la présence ou non de glandes sébacées et par l’humidité
vrai
vrai ou faux, le sexe n’ajoute aucune variabilité au microbiote cutané
faux, il varie selon le sexe
le tractus digestif est un système…
ouvert de la bouche à l’anus
pour ce qui est du microbiote du tractus digestif, y-a-t’il une variation selon le segment
oui, la diversité et la quantité de bactéries varient selon le segment du tube digestif
combien de bactéries sont présentes dans le microbiote du tractus digestif
10^14 : 100 000 000 000 000
combien d’espèces de bactéries sont présentes dans le microbiote du tractus digestif?
sont-elles cultivables?
plus de 500
la majorité sont non-cultivables pcq les exigences nutritives de la plupart des bactéries sont impossibles à reproduire en labo
le microbiote sain varie grandement selon 3 choses
d’une personne à l’autre
d’une région géographique à l’autre
en fonction de l’âge
est-ce que l’allaitement joue un rôle dans la variabilité du microbiote d’un enfant
oui, il augmente la variété de bactéries chez l’enfant
chez les adultes et les personnes agées, le microbiote est constamment modifié et raffiné selon…
la diète, la prise de médicaments et d’autres facteurs
nomme les 3 grands roles du microbiote intestinal
fonctions métaboliques
stimule l’immunité innée
prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
décrit les fonctions métaboliques du microbiote intestinal
métabolise certains nutriments plus facilement ce qui les rend disponibles aux cellules de l’hote:
- grosses molécules d’hydrates de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes
- les acides comme acétate, propionate et butyrate limitent la croissance de certaines bactéries indésirables
protège contre certaines infections entériques
de quelle facon le microbiote intestinal est-il en mesure de protéger contre certaines infections entériques
- en tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
- en stimulant la production de mucine, d’immunoglobuline IgA et des peptides antimicrobiens (AMPs)
- en stimulant la production d’IL-22 (augmente la résistance des cellules épithéliales) et d’IL-1beta (augmente le recrutement de cellules inflammatoires)
nomme 4 facteurs externes qui influencent le microbiote
hygiène personnelle (savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale)
diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) + diversifiée ou non
eau (avec chlore vs eau de puits)
prise d’antibiotique
quelle est la localisation de la majorité des bactéries
salive et colon
pour quelle raison peut-on observer une diminution du nombre de bactéries entre la salive et l’estomac
à cause de l’acidité gastrique
explique le problème entre la prise d’antiacides et le microbiote
augmentation du pH via inhibition des pompes H+ ce qui permet une meilleure prolifération bactérienne des agents pathogènes
la prise d’antiacides ne devrait donc pas excéder 3 mois pour éviter d’affaiblir les défenses immunitaires
que signifie dysbiose
altération de la flore normale
nomme 5 maladies associées à une dysbiose
- diarrhée à clostridioides difficile (DACD)
- colite ulcéreuse
- maladie céliaque (entéropathie au gluten)
- vaginite à candida
- obésité
comment se développe une diarrhée à clostridioides difficile DACD
prise d’antibiotique qui altère la flore normale du colon
prolifération du C. difficile (perte de compétition alimentaire)
C. difficile produit des toxines responsables de la diarrhée
décrit ce qui provoque une colite ulcéreuse
prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit une sulfatase qui dégrade la couche de mucine (colon pas capable d’absorber l’eau donc diarrhée)
augmentation de Prevotellaceae qui produit des chemokines inductrices d’inflammation (donc crampes abdos)
quel est le lien entre une dysbiose et l’obésité
certains individus ont des bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables, c’est ca qui génère le surplus de poids
quelle expérience peut confirmer la théorie qui lie le microbiote et l’obésité
l’étude sur les souris: une souris mince qui avale des selles d’une souris grosse aura un changement de son microbiote qui, maintenant peuplé de bactéries dégradant plus efficacement les grosses molécules, entrainera son obésité
donne des exemples de maladies du système immunitaire et de maladie métabolique qui sont associées à une dysbiose
syst. immunitaire: atopie, asthme, sclérose en plaque
méta.: diabète
décrit ce qu’implique la symbiose
tolérance immune
homéostasie intestinale
métabolisme sain
vrai ou faux, la manipulation du microbiome humain est un traitement prometteur pour certaines maladies
vrai, par exemple dans le traitement de la DACD, on observe une efficacité de 40-96% après une seule transplantation fécale provenant de qqun avec un microbiote intestinal sain
en quoi consiste un probiotique
mélange de bactéries et/ou de levure ingérées dans le but de coloniser (meme temporairement) l’intestin
la majorité des probiotiques contiennent…
des bactéries Gram positif comme Bifidobacterium et Lactobacillus
des levures comme Saccharomyces
l’efficacité d’un probiotique dépend de…
des microorganismes choisis, de la dose, de la survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité)
comparé à un médicament, quel est un des désavantages des probiotiques
moins bon controle sur la composition exacte et la concentration résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac
qu’est-ce qu’une pouchite et comment est-ce que les probiotiques peuvent-ils aider
certains patients subissent une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale, mais cela a tendance a causer des problèmes au niveau de l’absorption de l’eau
ces patient ont plus souvent besoin d’aller à la selle et c’est pourquoi on leur crée un réservoir pour l’accumulation de selles qui remplace le rectum
chez certains patients, le réservoir peut s’inflammer et entrainer de fortes diarrhées, c’est ce qu’on appelle une pouchite
les probiotiques peuvent diminuer la pouchite soit l’inflammation de ce réservoir
nomme 2 indications de probiotiques
pouchite
entérocolite nécrosante
décrit ce qu’est une entérocolite nécrosante, donne en les causes possibles et le taux de mortalité
maladie qui touche l’intestin chez les enfants nés prématurément (avant 37 semaines) et qui se manifeste par un gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans la paroi de l’intestin
causes: prédisposition génétique, intestin immunoréactif, réponse inflammatoire immature
mortalité: 20-30%
comment peut-on utiliser les probiotiques en lien avec l’entérocolite nécrosante
on en donne aux prématurés pour prévenir une entérocolite nécrosante en colonisant l’intestin
est-ce que l’INESSS recommande l’utilisation de probiotiques dans la prévention ou le traitement de la DACD
non
est-ce qu’il y a des contre-indications pour les probiotiques
oui, les immuno-supprimés
qu’est-ce qu’un prébiotique
produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes désirables (ce ne sont donc pas directement des bactéries mais bien des produits qui stimulent les bonnes bactéries à se reproduire)
vrai ou faux, le yogourt en vente libre est un prébiotique
faux, parce qu’il est composé de bactéries
