Métodos de secuenciación Flashcards
–Cortar el ADN genómico en pedazos pequeños y unir ADAPTADORES, chip
– El resultado de múltiples rondas de PCR es un pequeño grupo de productos de PCR idénticos los cuales sirven como templados de secuenciación
-Aparece SEÑAL FLUORESCENTE, fosforo radiactivo
High-throughput 1
Secuenciación por síntesis Seq Illúmina
Mas utilizada
Adaptadores de PCR terminan en grupos químicos que se adhieren a cuentas microscópicas
–Emulsión mantiene cada cuenta en un pequeño compartimento de agua donde se produce reacción de PCR local
-Variación en pH en micropozo detectado por semiconductor
CLOROFOROS
High-throughput method 2: Ion torrent
Secuenciación de torrente de iones
- Cada uno de los nucleótidos con sonda fluorescente de agrega uno a uno al chip.
- Usa terminadores reversibles y detector óptico.
- Convierte una señal fluorescente en una señal electrónica
High-throughput method 3
Secuenciación de una sola molécula de DNA
Diseñado para lecturas de secuenciación extremadamente largas (hasta 1 Mb)
-El templado es una cadena larda monocatenaria de ADN
High-throughput method 4, tercera generación
Secuencia de nanoporos
Radiación
Primera generación