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Genómica y Proteómica > Presentación 5 > Flashcards

Presentación 5 Flashcards

1
Q

El Instituto Nacional del Cáncer de EUA define a un recurso de muestras biológicas como

A

Colección de muestras humanas y datos asociados con fines de investigación, entidad física donde se almacena la colección y todos os procesos políticas relevantes

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2
Q

Tipos de preguntas antes de la recolección de las muestras

A
  • Cuáles son los objetivos
  • Análisis de laboratorio
  • Tipo de muestras
  • Cuántos especímenes
  • Volumen o tamaño
  • Almacén
  • Protocoles de recolección
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3
Q

Puntos en los que debe de estar enfocado todo el proceso

A
  • Diseño del protocolo

- Análisis

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4
Q

Tipos de muestras más allá de las biopsias son

A
  • Sangre
  • Semen
  • Orina
  • Saliva
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5
Q

En los últimos años se han desarrollado métodos de análisis en base a

A

Saliva

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6
Q

La recolección de muestras de sangre debe de ser realizada por …… entrenados para evitar causar molestias o comprometer la calidad y cantidad de la muestra

A

Flebotomistas

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7
Q

Sistema con tubos de plástico o vidrio intercambiables para recolectar sangre

A

Sistema de Becon-Dickenson Vacutainer

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8
Q

Se refiere al factor de minimizar el tiempo entre la recolección y estabilización y procesamiento demuestras de tejido

A

Sincronización

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9
Q

El mejor enfoque es…

A

Recolectar
Estabilizar (congelar o fijar)
Y procesar lo más rápido posible

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10
Q

En los especímenes de autopsias es importante…

A

Conocer el intervalo de tiempo entre la muerte y la recolección y el procesamiento de la muestra

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11
Q

Con células bocales exfoliadas, es una excelente fuente de ADN para estudios

A

La saliva

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12
Q

Verdadero o Falso
La auto-recolección de células bucales es un método seguro y conveniente que se puede usar para reducir el costo y recolección de muestras y es preferible por parte de los pacientes

A

Verdadero

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13
Q

Factor que nos dice que las muestras se procesan de acuerdo con el diseño del estudio y los métodos más apropiados para preservar los analíticos de interés

A

Procesamiento de muestras

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14
Q

De la sangre se pueden obtener separación en fracciones por ejemplo….

A

Plasma, capa leucocitaria, glóbulos rojos.

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15
Q

El método de procesamiento utilizado para las muestras de sangre depende de…

A

Los análisis de laboratorio que se realicen

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16
Q

Es una forma rentable de preservar los linfocitos viables para la recuperación posterior del ADN o para que la transformación del virus Epstein-Barr cree líneas celulares linfoblastoides como fuente de cantidades ilimitadas de ADN

A

Crioconservación

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17
Q

Las células bucales recogidas utilizando el protocolo de enjuague bucal se procesan mediante

A

Centrifugación de suspensión celular

  • Resuspensión de un tampón
  • Procesan/congelan para su uso fututo
18
Q

Para la extracción de ADN generalmente se considera la extracción con…

A

Fenolcloroformo

Pero otros métodos estándar que son más eficientes, menos costosos y que utilizan menos toxicos proporcionan rendimeintos y AND similares de peso molecular similar

19
Q

Las técnicas para medir la calidad y la cantidd de AND varían desde…

A
  • Absorbancia
  • Métodos fluorescencia
  • PCR en tiempo real
20
Q

Es una medida aproximada de la pureza de DNA y la contaminación de proteínas

A

Relación A260/A280

21
Q

Los métodos adicionales para medir la calidad del DNA incluyen

A

Electroforesis en gel

22
Q

Verdadero o Falso

El ARN es más estable que el AND y es más fácil de extraer intacto

A

Falso
El ARN es menos estable porque es solo 1 cadena y por ende es más difícil de extraer intacto

Es sensible a la degradación de nucleasas

23
Q

Permiten el depósito de miles de puntos conteniendo genes o parte de genes sobre un portaobjetos para su estudio en paralelo

A

Micromatirces o microarreglos

Microarreys: pequeño/distribución ordenada

24
Q

Principal fuente de ácidos nucleicos

A

Saliva

25
Q

La metodología clásica utilizada para la detección y cuantificación de mRNA presente en una célula es el análisis por

A

Northern blot

Donde una sonda radioactiva en solución se une con un RNAm inmovilizado en un soporte.

26
Q

Southern blot

A

ADN

27
Q

En ensayos (PCR) el principio fundamental es la

A

Hibridización

Que se basa en complementariedad de las bases pero su debilidad es la detección

28
Q

Gracias a los micro arreglos podemos….

A

Tener una visión instantánea de actividad de genomas completos o de u grupo selecto de genes, en lugar de hacer gen por gen

29
Q

Tipos de aspectos a considerar para microarreglos

A
  • Genes que se expresan en ciertos tejidos
  • Genes expresados en diferentes estímulos
  • Patrones de expresión
30
Q

Procesamiento preciso en un soporte sólido de elementos que funcionen como detectores moleculares en altas densidades

A

Concepto básico en microarreys

31
Q

Para poder clasificar los microarreys debemos dejar claro que se entiende por…..

A

Target (blanco) y que se define como probe (sonda)

El blanco es molécula libre y la sonda inmovilizada.

32
Q

Son porciones de DNA sintético de cadena simple que pueden ser cortas (15-25 nucleótidos) o largas (50-120)

A

Las sondas

33
Q

Verdadero o Falso

Los microarrey por oligonucleótidos son muy baratos

A

Verdadero

34
Q

En el Miroarrey de proteínas las sondas son

A

Anticuerpos fijados a portaobjetos de vidrio y los blancos son muestras de suero o tejido

35
Q

Restricción de microarrey por…

A

Dificultad de fabricar a inmovilizar estructuras 3-D como son las proteínas y detectar interacciones de proteínas plegadas.

Mantener la forma de los anticuerpos y mantenerlo en el análisis

36
Q

FOTOS

En los microarreys el principio fundamental es la

A

Hibridización de ácidos nucleicos y detección por fluorescencia

37
Q

Los niveles de detección has aumentado significativamente mostrando en tiempo real la duplicación exacta del material inicial en la reacción de PCR por incorporación de fluoróforos a la doble cadena reciente

A

RT-PCR

38
Q

La palabra microarrey significa

A

Pequeña distribución ordenada

39
Q

Permiten tener un visión instantánea de actividades de genomas completos o de grupo selecto de genes

A

Microarreys

40
Q

Fragmentos que pueden ser presintetizados y depositados en portaobjetos por robots o sintetizados insitu y depositados por ink jet o fotolitografía

A

Microarreys de oligonucleótidos

41
Q

Las sondas de este estudio son anticuerpos fijados portaobjetos de vidrio y los blancos son muestras de suero o tejidos.

A

Microarreys de proteínas

Genómica y Proteómica (9 decks)

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