Méthodes d'étude des macromolécules Flashcards
UV lointain
100 nm - 250nm
UV proche
250 nm - 400 nm
Spectre Visible
400 nm - 800 nm
Infrarouge proche
800 nm - 2000 nm
Infrarouge moyen
2k nm - 16k nm
Infrarouge lointain
> 16k nm
Environnement du fluorophore plus apolaire (hydrophobe)
Blue shift
(ex : coeur hydrophobe de protéine)
Environnement du fluorophore plus polaire (hydropohile)
Red shift
(ex : eau)
Si fluorophore figé dans la protéine
Restitution d’energie importante sous forme de fluorescence
IF >> chaleur
Si fluorophore libre dans la protéine
Restitution d’energie sous forme de chaleur préférentiellement
IF << Chaleur
Dichroïsme circulaire
= Déviation des composantes circulaires d’une onde polarisée
θ = valeur d’éllipticité molaire
Dichroïsme Circulaire - Structures Secondaires
Hélice α
UV lointain (180 - 240 nm)
- 195 nm : θ positif et >>0
- à 208 nm et 222 nm : θ négatif et <<0
Dicroïsme circulaire - Structures Secondaires
Feuillet β
UV lointain (180 nm - 240 nm)
- 195 nm : θ positif mais >0
- Entre 205 et 220 nm : θ négatif mais <0
Dichoïsme circulaire - Structures Secondaires
Random Coil
UV lointain (180 nm - 240 nm)
- Autour de 195 nm : θ grandement négatif puis oscille autour de 0 quand λ augmente
Dichroïsme circulaire - Structures Tertiaires
UV proche (250 nm - 320 nm)
- 250-270 -> Phe impliqué
- 270-290 -> Tyr impliqué
- 280-300 -> Trp impliqué
Sans structure tertiaire : signal proche de 0