Mécanismes de régulation Flashcards
Inclus dans expression génique
Vrai ou faux
Les promoteurs indépendants d’un activateur ont une forte affinité pour l’ARNpol.
Faux
faible affinité + leur séquence souvent éloignée du consensus -35/-10
La protéine répresseur/activateur p4 d’un phage (B.subtilis) réprime un promoteur tellement fort que……
ARNpol ne peut le quitter
Est-ce que tous les activateurs peuvent faire à toutes les étapes de l’initiation?
Oui
Décrire les 4 modes action des activateurs avec ARNpol
- promoteur typique -35/-10
- attachement à élément Up
- CAP en amont promoteur peut contacter région ARNpol + stabilise
- prot s’attache de manière coopérative aux opérateurs (contacte σ70 et αCTD)
Est-ce que les activateurs peuvent contacter ARNpol avant son attachement au promoteur ?
OUI
Vrai ou faux
Activateurs ne peuvent pas altérer l’espace -35/-10.
Faux, ils peuvent le rendre optimal pour ARNpol
Définir atténuation
+ exemple
ARNpol a quitté promoteur mais termine prématurément dans la région leader du transcrit
Survient seulement si le produit de l’éperon n’est pas requis
exemple: opéron trp E.Coli
Dans atténuation, la terminaison de transcription est due à ?
à structure secondaire précédant une suite de Us dans ARN
Prévenir formation structure secondaire dans l’atténuation : besoin antiterminateur.
Séquence ABC
Association BC induit ?
Association AB induit ?
BC : terminateur = gène OFF
AB : anti terminateur = gène ON
Atténuation transcription chez E.Coli opéron trp
Structure 1:2 + 3:4 induit ?
rôles de 1:2 et 3:4 ?
Structure 2:3 induit ? rôle ?
1:2 = structure pause de transcription
3:4 = terminateur
==> structures terminent transcription
2:3 = anti terminateur
==> Structure permet transcription gène trp
Comment est régulée l’atténuation de l’operon trp? E.coli
Niveau de ARNt Trp chargé en trp est élément clé.
Trop de ARNt Trp chargé (donc présence trp) = formation structure causant arrêt transcription = atténuation
(structure 1:2 et 3:4)
Si pas de ARNt Trp chargé (donc absence trp) = formation 2:3 = transcription a lieu
Quantité normale ARNt Trp = ribosome va jusqu’au codon stop = arrêt normal
Vrai ou faux
L’atténuation de l’opéron trp est exactement similaire chez B.subtilis et E.coli
Faux
différence dans la détection des niveaux de tryptophane
E.coli : ribosome
B.subtilis : protéine TRAP
Comment agit TRAP ?
TRAP forme une roue interagissant avec séquence triplet si lié par tryptophane
Présence trp, interaction ARN/TRAP prévient anti terminateur = atténuation
Absence trp, aucune interaction TRAP/ARN: formation anti terminateur
TRAP est un activateur ou répresseur ? de quel opéron ?
Répresseur de l’opéron trp chez B.subtilis
tryptophane = co-répresseur
Vrai ou faux
TRAP n’agit qu’au cours de la traduction.
FAUX
peut agir lors initiation traduction
Comment TRAP peut inhiber l’initiation de la traduction ?
Interaction avec des triplets proches de RBS -> empêche attachement du ribosome au RBS
Comment TRAP peut-elle être empêchée d’agir ?
Protéine anti-TRAP synthétisée selon niveau ARNt Trp chargé
Définir riboswitch
élément ARN contrôlant l’expression des régions codantes en amont en détectant un signal régulateur directement
Que signifie directement dans la définition d’un riboswitch ?
PAS besoin de traduction ou protéine régulatrice pour détecter un signal régulateur
Vrai ou faux
Le riboswitch répond à des ligands.
Vrai
et aussi des métabolites
Vrai ou faux
Si la majorité des ARNt d’un aa sont chargés, la transcription se termine moins souvent dans la région leader de ARN.
FAUX
si ARNt chargé = + souvent région leader
si ARNt non chargé = - souvent dans région leader
Vrai ou faux
Le ribowitch ne détecte pas les ARNt chargés.
Faux
Atténuation de la transcription par riboswitch. Décrire la situation si :
- Beaucoup de métabolite
- Niveau limitant de métabolite
- Bcp : Présence anti anti terminateur A:B \+ terminateur C:D => fin transcription
- Peu
Antiterminateur B:C
=> transcription continue
Définir antiterminaison processive
ARNpol directement modifiée par protéines régulatrices
= augmente vélocité et processivité
Vrai ou faux
La demi-vie des ARNms chez E.coli ont une demi-vie élevée
Faux
Vrai ou faux
Pour dégradation ARNm,
Initiation par clivage par une exoribonucléase et des endoribonucléases terminent la dégradation complète.
FAUX
initiation par 1 endoribonucléase (coupure spé)
termine processus par DES exoribonucléases
Vrai ou faux
La régulation de la traduction se fait le plus souvent au niveau de l’élongation.
Comment ?
faux
au niveau de l’initiation via formation structure secondaire dans ARN emprisonnant le TIR
Interaction avec TIR par ?
TRAP, protéines ribosomales, ARNs
Vrai ou faux
Les modifications post-transcriptionnelles sont irréversibles.
Faux
comment appelle t-on?
La stabilité d’une protéine dépend de ses propriétés instrinsèques mais peut aussi être modifiée en réponse à stress environnemental.
Protéolyse régulée
fait intervenir des adaptateurs et anti-adaptateurs
Comment est régulé σS par des adaptateurs et anti-adaptateurs ?
toujours synthétisé
absence stress : dégradation par ClpXP grâce adapteur Rss
Présence stress : Ira anti-adaptateur de Rss et l’inactive
accumulation de σS
Que permet σS?
Expression gènes requis pour réponse général au stress
