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MCB2992 > Expression génique > Flashcards

Expression génique Flashcards

1
Q

Nommer les étapes de l’expression génique

A
  • transcription (brinADN matrice transcription en ARNm)

- traduction (traduction de ARNm en langage aa)

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Q

Citer éléments permettant expression d’un gène (6)

A

Promoteur (-35/-10)
Site d’initiation transcription (+1)
Site d’attachement ribosome à ARNm (RBS)
Code initiateur traduction + arrêt (fin protéine)
Site de terminaison transcription (fin ARNm)

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Q 
Polymérases ADN et ARN peuvent discriminer NTPs et dNTPS via :
- position 5 du ribose
- position 2 du ribose
- position 3 du ribose 
?
A

position 2

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Q

Vrai ou faux

G:U contribue à la stabilité de l’ARN

A

FAUX

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Q

Nommer structures secondaire dans ARN (2)

A

hairpin

pseudoknot

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6
Q

Nommer les 5 sous-unités de l’ARN polymérase coeur

A
  • 2 s-u alpha : interaction sqce en amont promoteur + via extrémités N-term et C-term)
  • 1 s-u bêta et 1 bêta’ : activité catalytique et fixation sur ADN
  • 1 oméga : catalyse mais ne reconnaît pas promoteur
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7
Q

Différence entre ARNpol coeur et ARNpol holoenzyme ?

A

ARNpol holoenzyme contient facteur sigma permettant reconnaissance promoteur

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8
Q

Quels phosphates sont éliminés lors de la polymérisation?

  • β
  • γ
  • α
A
  • β

- γ

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9
Q

Quelle holoenzyme reconnaît les promoteurs des gènes de ménage?
Quelle est la distance optimale ?

A

celle possédant facteur σ70

PS: transcription début avec purine

distance optimale 17 Nt

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10
Q

Remettre dans l’ordre
A / relâche de σ et passage à phase élongation
B / initiation et cycles de transcription abortive
C / interaction de σ avec l’holoenzyme
D / terminaison de la transcription
E / interaction ARNpol/promoteur = complexe fermé
F / évasion de l’ARNP du promoteur
G / isomérisation et formation du complexe ouvert

A

C-E-G-B-F-A-D

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11
Q

Associer sous-unités σ avec son lieu de reconnaissance
σ4, σ2, σ3

proche de β dans canal site actif

proche de β’ + interagit avec région A:T riche du -10 = formation RPc

reconnaît -35 db

A

4 -> reconnaît -35

2 -> proche de β’ + interaction A:T -10

3 -> proche de β site actif

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12
Q

Définir conséquence de :
1/ séquence -10 étendue / absence -35
2/ élément UP en +

A

1/ σ3 interagit avec section étendue

2/ UP reconnu par s-u α

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13
Q

Vrai ou Faux

L’isomérisation est le passage du complexe ouvert au complexe fermé

A

FAUX, c’est l’inverse, grâce à σ2

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14
Q

Quel est le mode d’action de la rifampicine ? A quel moment de la transcription ?

A

Interaction avec β : bloque synthèse ARN + trappe ARNpol dans complexe initiation

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15
Q

Décrire l’initiation transcription

A
  • arrivée NTP (ATP ou GTP) dans canal secondaire
  • interaction avec Nt +1 brin matrice
  • 2ème NTP entre + interaction avec +2
  • relâche 2 pyrophosphates
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16
Q

Définir transcription abortive

A

arrêt de la polymérase par la rencontre avec une boucle σ3-2. Induit le relâchement de l’ARN d’env 10 Nt

17
Q

Trouver l’intrus

Un promoteur fort est :

  • une séquence ADN permettant forte interaction avec ARNpol
  • séparation rapide des brins d’ADN
  • transition rapide de ANRpol en phase d’élongation
  • haut taux de transcription abortive
A

“haut taux de transcription abortive”

=> FAIBLE TAUX

18
Q

Vrai ou Faux

Le complexe d’élongation est très stable

A

VRAI

19
Q

Vrai ou Faux

La transcription processive est facultative

A

FAUX

Obligatoire. ARNpol ne peut pas quitter matrice ADN sans interrompre irréversiblement la transcription

20
Q

Qu’induit une pause de l’ARNpol ?

A

La suite en U dans ARN induit instabilité ARN/ADN => arrêt de l’ARNpol
=> formation structure épingle cheveux

21
Q

De quelles façons peut se terminer la transcription ? les définir

A
  • terminaison rho-independante
    si la structure en épingle induite par la pause peut déstabiliser ARNpol en couvrant Nt ARN/ADN => arrêt
  • terminaison rho-dépendante
    due à interaction protéine rho/sqce C riche ARN
    rattrape ARNpol via activité hélicase puis stop
22
Q

Compléter

La traduction met en jeu …protéines ribosomales + …ARN ribosmaux et …ARNts

A

53 protéines ribosomes
3 ARNr
86 ARNts

23
Q

Remettre en ordre

Initiation de la traduction :

A/ entrée de ARNt initiateur avec N-formyl-méthionine + appariement codon initiateur
B/ ajout de 50S
C/ reconnaissance du site RBS par ARN 16S et s-u 30 du ribosome
D/ IF1, IF2, IF3 ajustent la formation du complexe

A

C-A-D-B

24
Q

Remettre en ordre

Elongation traduction
A / Catalyse liaison peptidique
B / Entrée ARNt chargé en A
C / Translocation ARNt en A vers P

A

B-A-C

25
Q

Remettre en ordre

Terminaison traduction
A/ RFE permet relargage ARNM 50S + 30S
B/ aucune arrivée ARNt 
C/ codon stop 
D/ arrivée de RF1, RF2 : stimule transfert peptide site P sur H2O
A

C-B-D-A

26
Q

Décrire la trans-traduction: tmRNA

A

tmRNA est chargé d’un alanine, arrive au site A, ajoute queue de 10aa à protéine engendrée par ARNm tronqué

Queue reconnue par protéase ClpXP : dégrade protéine tronquée

27
Q

Décrire phénomène de polarité

A

survient lorsque traduction prématurée dans le premier gène d’un opéron

induit terminaison par protéine rho

MCB2992 (8 decks)

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