Maturation des ARNm - Rokeach Flashcards

1
Q

Quelles sont les différences entre les Eucaryotes et les Procaryotes vues dans ce chapitre?

A

EUCARYOTES:
1. Transcription et maturation se font simultanément dans le noyau VS traduction se fait dans les ribosomes du cytoplasme
2. Maturation de l’ARN pré-messager en ARNm avant de sortir dans le cytoplasme pour être traduit
3. Information des gènes est discontinue, c-à-d présence d’introns (régions non codantes) et d’exons (régions codantes)
4. 1 seul ARNm code généralement pour 1 protéine (s’il y a épissage alternatif lors de la maturation, possibilité d’obtenir plusieurs isoformes d’une même protéine)
PROCARYOTES:
1. Transcription et traduction se font dans le même endroit: LE CYTOPLASME
2. Pas de maturation
3. Information des gènes est continue
4. 1 seul ARNm polycistronique peut coder pour plusieurs protéines + présence d’opérons ( = unité d’ADN bactérien qui comporte plusieurs gènes contrôlés par un seul promoteur en amont)

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2
Q

Quelles sont les 3 étapes de la maturation de l’ARN pré-messager?

A
  1. Ajout d’une coiffe en 5’
  2. Ajout d’une queue poly-A en 3’
  3. Épissage de l’ARN
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3
Q

À compléter: La phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase II permet non seulement la libération des 1)_________ (sauf pour 2)_______), mais aussi le recrutement de 3)___________.

A

1) Facteurs généraux de la transcription
2) TFIID avec son TBP
3) Facteurs impliqués dans la maturation de l’ARN pré-messager

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4
Q

Quels facteurs impliqués dans la maturation de l’ARN pré-messager jouent un rôle dans l’ajout d’une queue poly-A?

A

Facteurs de clivage CPSF (Cleavage/Polyadenylation Specificity Factor) et CstF (Cleavage Stimulation Factor)

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5
Q

Quels sont les rôles de la coiffe en 5’? Quand est-elle rajoutée?

A
  1. Stabilité: protège l’ARNm contre les nucléases du cytoplasme
  2. Facilitation de l’exportation de l’ARNm vers le cytoplasme
  3. Stimulation de la traduction de l’ARNm en protéines par les ribosomes
    Elle est rajoutée lorsque le transcrit d’ARN atteint environ 25 nucléotides de longueur.
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6
Q

À compléter: Le clivage de l’ARN s’effectue environ 1)____ après le 2)_______, tandis que l’ajout de la coiffe en 3)_____ s’effectue lorsque le transcrit d’ARN atteint 4)_______ en longueur.

A

1) 15 nucléotides
2) signal de polyadénylation
3) 5’
4) 25 nucléotides

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7
Q

Quels sont les rôles de la queue poly-A en 3’?

A
  1. Stabilité: protège l’extrémité 3’ de l’ARNm, malgré la dégradation progressive de la queue dans le cytoplasme
  2. Facilitation de l’exportation de l’ARNm vers le cytoplasme
  3. Stimulation de la traduction de l’ARNm par les ribosomes en indiquant les ARNm matures prêts à être traduits
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8
Q

Quelle est l’enzyme qui catalyse le clivage de l’ARN? Qu’en est-il de celle qui catalyse l’addition d’une queue poly-A en 3’?

A

Poly-A polymérase (pour les 2)

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9
Q

Quelles protéines retrouve-t-on au niveau de la queue poly-A?

A

PABP (Poly-A Binding Proteins); stabilisent la queue poly-A

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10
Q

Que se passe-t-il avec les facteurs de clivage lors de la 2e étape de la maturation de l’ARN pré-messager? Quel est l’impact de cet événement?

A

Les facteurs de clivage portés par la queue C-terminale phosphorylée de l’ARN polymérase II sont transférés au signal de polyadénylation porté par l’ARN pré-messager, ce qui permet:
1-Clivage de l’ARN environ 15 nucléotides après le signal de polyadénylation
2- Ajout d’une queue poly-A en 3’

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11
Q

Quelles sont les étapes précises de l’épissage de l’ARN?

A

1- U1 snRNP se lie par complémentarité à la séquence portée par la jonction exon 1/intron
2- U2 snRNP se lie par complémentarité à la séquence entourant le point de branchement de l’intron
3- Recrutement de U4/U6 snRNPs et de U5 snRNP, lequel va forcer l’association de U1 et U2 de sorte à rendre plus favorable la formation du lasso
4- Relâchement de U1 et de U4 snRNP
5- Adénine du point de branchement attaque l’extrémité 5’ de l’intron (nucléotide G)
6- Extrémité 5’ libre de l’intron se lie de façon covalente au 2’OH porté par la ribose à laquelle est liée l’adénine du point de branchement, ce qui forme le lasso
7- Extrémité 3’ de l’exon 1 se lie de façon covalente à l’extrémité 5’ de l’exon 2 (nucléotide G), ce qui libère le lasso
8- snRNPs sont libérés pour être recyclés

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12
Q

Qu’est-ce que le spliceosome?

A

La machinerie d’épissage formée par les divers snRNPs (Small Nuclear Ribonucleic Particles)

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13
Q

Qu’est-ce que l’épissage de l’ARN?

A

Étape finale de la maturation de l’ARN pré-messager en ARNm au cours de laquelle les introns sont excisés et les exons sont reliés ensemble par des liens covalents

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14
Q

À compléter: Les exons sont généralement des régions 1)_____, mis à part pour 2)_____ et 3)_____, tandis que les introns sont des régions 4)______. La taille d’un exon est généralement plus 5)_____ que celle d’un intron.

A

1) Codantes
2) 3’UTR
3) 5’ UTR
4) Non codantes
5) Courte

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15
Q

Quelles sont les séquences nucléotidiques importantes lors de l’épissage de l’ARN?

A
1- Fin d'un exon: AG
2- Début d'un intron: GURAGU (où R = purine)
3- Point de branchement d'un intron: A
4- Fin d'un intron: CAG
5- Début d'un exon: G
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16
Q

Qu’est-ce qui explique la diversité de protéines chez l’humain? Pourquoi?

A

C’est l’épissage alternatif.
Explication: Environ 60% des gènes humains sont transcrits en ARN pré-messager pouvant subir un épissage alternatif, ce qui implique qu’il y aura différents ARNm produits et, par conséquent, différentes protéines traduites.

17
Q

Quel est le % de gènes humains transcrits en ARN pré-messager pouvant subir l’épissage alternatif?

A

60

18
Q

À compléter: L’épissage alternatif varie selon 1)_______ et augmente le 2)________ chez les Eucaryotes.

A

1) Le type de cellule

2) Potentiel de codage du génome

19
Q

Expliquez l’énoncé suivant à partir de l’exemple du gène de l’alpha-tropomyosine: ‘‘L’épissage alternatif varie selon le type de cellules.’’

A

Le gène de l’alpha-tropomyosine est transcrit en ARN pré-messager pouvant subir, lors de sa maturation, un épissage alternatif:

  • Chez les cellules musculaires, cet épissage alternatif fait en sorte que le rôle de l’alpha-tropomyosine sera la régulation des interactions entre l’actine et la myosine.
  • Chez les cellules non musculaires, cet épissage alternatif fait en sorte que le rôle de l’alpha-tropomyosine sera la régulation du cytosquelette.
20
Q

Pourquoi qualifie t-on l’épissage alternatif de ‘‘tissu spécifique’’?

A

Parce que l’épissage alternatif peut donner naissance à des variantes d’ARNm présente dans un tissu spécifique, et pas dans l’autre

21
Q

Donnez un exemple de comment un intron peut éviter l’excision pendant l’épissage de l’ARN.

A

Par la présence d’un facteur répresseur de l’épissage

22
Q

Qu’arrive-t-il si un intron n’est pas excisé lors de la maturation de l’ARN pré-messager?

A

Il agira en tant qu’exon optionnel dans l’ARNm mature et sera ensuite traduit en protéine.

23
Q

Comment est-ce que la cellule s’assure que seuls les ARNm MATURES sont exportés vers le cytoplasme pour être traduits par les ribosomes?

A

Complexe de pores nucléaires reconnaissent et exportent uniquement les ARNm matures dotés d’un ensemble de protéines spécifiques, soit :
1- PABP (Poly-A Binding Proteins)
2- EJC (Exon Junction Complex)
3- Protéine de liaison à la coiffe (Cap-Binding Protein)

24
Q

À compléter: 1)_______ augmente le potentiel de codage du génome des Eucaryotes.

A

L’épissage alternatif

25
Q

Vrai ou faux. Il y a des ARNm que l’on trouvera uniquement chez un tissu spécifique, et pas chez un autre.

A

Vrai

26
Q

Vrai ou faux. L’humain est doté d’une grande diversité de protéines attribuable à ses nombreux gènes.

A

Faux