M3S2 Composition De La Matiere Vivante Flashcards
Qu’est-ce que la matière organique ?
Elle composent la matière vivante (animaux, végétaux, micro-organisme)
Elle est composé des atomes de carbone, d’hydrogène, d’oxygène et d’azote CHON
Qu’est-ce que la chimie organique ?
- C’est la chimie des molécules carbonées
- elle définit le modèle d’écriture des molécules
- elle définit la position du carbone asymétrique qui aura des fonctions particulières
Comment s’organise le carbone ?
Il met en jeu quatre électrons de valence pour faire quatre liaisons covalentes simples, des liaisons double ou plus rarement des lésions triple
Quelles sont les différentes écritures des molécules ?
- formule brute
- formule semi développée
- formule développée
- formule topologique
Qu’est-ce que la formule brute ?
Écriture la plus simple est la plus contacte
Ex C6H12O6
Les atomes de carbone et d’hydrogène sont toujours noté En premier. les suivants sont notés par ordre alphabétique. Cette écriture permet de connaître l’organisation des atomes dans l’espace.
Qu’est-ce que la formule semi développée ?
Toutes les fonctions chimiques sont notés ainsi que les liaisons covalentes à l’exception des liaisons carbone hydrogène
Ex CH3-CH2-CH2-CH3
Qu’est-ce que la formule développée ?
Dans cette écriture, tous les atomes et toutes les liaisons covalentes apparaissent
Qu’est-ce que la formule topologique ?
Cette représentation simplifiée est utilisée en chimie organique. Elle met en évidence le squelette Hydrocarboné de la molécule sans notés certains atomes. par définition, un angle représentera un carbone. Les atomes d’hydrogène ne sont pas noté, mais déduit, et une barre simples représente une fonction -OH
Qu’est-ce que des isomère ?
- Molécules ayant la même formule brute, mais une formule développée différente
- c’est l’organisation des fonctions autour du carbone asymétrique qui diffère
Quelles sont les différentes familles d’isomérie ?
- isomère de constitution
- stéréo-isomère (énantiomères, diastereoisomere)
Qu’est-ce que les isomère de constitution ?
Il diffère par la position des atomes au sein de la molécule de différentes manières :
- isomérie de position: une fonction est déplacé dans la molécule
- isomérie de fonction : les atomes s’associent pour former des fonctions différentes
- isomérie du squelette carboné =isomérie de chaîne : la chaîne principale de carbone s’organise différemment dans l’espace avec des possibilités de ramification différentes
- isomère d’insaturation : Lison Carbonnier, simple, double ou triple sont à des positions différentes
Qu’est-ce que les stéréo-isomère énantiomère ?
Deux molécules sont les images miroir, l’une de l’autre qui ne sont pas superposable
Une molécule ayant deux énantiomère est dite Chiral
Qu’est-ce que des stéréo-isomère diastéréo - isomère ?
L’organisation des molécules dans l’espace diffèrent, mais on ne retrouve pas cette image miroir
Qu’est-ce qu’une fonction chimique ?
Une fonction est un groupement d’atomes, formant une entité ayant une fonction particulière en solution. Leurs connaissances permet de prévoir leur comportement dans une réaction chimique.
Quelles sont les fonctions chimiques importante ?
- la fonction alcool ou hydroxyle -OH
- la fonction amine -NH2
- la fonction carbonyle -C=O
- la fonction thiol -SH
- la fonction carboxylique -COOH
- la fonction amide R-CO-NH2
- les acide phosphorique
- la fonction ester R-CO-O-R’
Qu’est-ce qu’un acide phosphorique ?
- composé d’un atome de phosphore, faisant quatre liaisons avec quatre atomes d’oxygène
- selon le pH de la solution, ces atomes d’oxygène pourront être seul, non chargé, seul chargé négativement, ou lié à un hydrogène
- il existe plusieurs formes d’acide phosphorique
Qu’est-ce qu’une réaction de phosphorylation ?
L’ajout d’un acide phosphorique sur une fonction alcool
Quelles sont les fonctions alcool (où hydroxyle) -OH ?
- alcool primaire : un radical + CH2 + OH, l’alcool est à l’extrémité d’une chaîne carbonée.
- alcool secondaire : deux radicaux plus un seul hydrogène, en plus de la fonction OH
- alcool tertiaire : trois radicaux, pas d’hydrogène en plus de l’alcool
Quelles sont les fonctions amine -N ?
- amine primaire : un radical et deux hydrogène sous forme NH3+
- amine secondaire : R1-NH-R2
- amine tertiaire : l’azote porte trois radicaux
Qu’est-ce que la fonction amide ?
R-CO-NH2
Condensation d’un acide carboxylique et d’une fonction amine
Qu’est-ce qu’une fonction carbonyle ?
-C = O
Fonction cétone : Carbonnier à deux radicaux. L’oxygène est alors insérer à une chaîne.
Fonction aldéhyde : carbone, il y a un radical et un hydrogène. L’oxygène est alors l’extrémité de la molécule.
Qu’est-ce qu’une fonction carboxylique -COOH ?
- fonction acide
- permet la création de liaison hydrogène. Par exemple avec un solvant polaire comme l’eau, l’alcool et d’autres acide carboxylique
- à pH physiologique, elle est sous forme COO-
Qu’est-ce que la fonction thiol -SH ?
Se retrouve sur l’acide aminé cystéine
Qu’est-ce que la fonction ester R-CO-O-R’ ?
Réaction d’estérification (ester + eau) entre un acide carboxylique et un alcool primaire
Quelles sont les réactions chimiques principales ?
- condensation et hydrolyse
- phosphorylation
- estérification
- amidification
- hemiacetalisation
Qu’est-ce que la condensation ?
Retrait d’eau permettant la formation d’une liaison covalente
Qu’est-ce qu’une hydrolyse ?
Ajoute do permettant la rupture de liaison covalente
Qu’est-ce que la phosphorylation ?
Ajout d’un phosphate inorganique sur une fonction alcool, forment une liaison covalente entre le phosphate et la molécule organique avec perte d’eau. C’est donc un cas de condensation.
Qu’est-ce que l’estérification ?
- Condensation réversible entre un acide carboxylique est un alcool pour donner un ester
- cette réaction peut avoir lieu entre un accède carboxylique, et une fonction thiol et donnera alors un thioester
Qu’est-ce que l’amidification ?
Condensation réversible entre un acide carboxylique et une amine pour donner un amide
Qu’est-ce qu’une hemiacetalisation ?
Condensation entre une fonction carbonyle et un alcool
Carbone porte alors le nom d’hemiacetal, essentiel lors de la cyclisation des oses
Qu’est-ce que la matière minérale ?
C’est la matière inorganique, c’est-à-dire dépourvu de carbone, donc des minéraux
Sous quelle forme trouve-t-on les minéraux ?
Dans le vivant, et son le plus souvent solution sous forme d’ions
On peut également les retrouver sous forme de Christophe , formant de la matière solide (calcium dans la composition des os ou des dents)
Dans la nature et minéraux sont souvent solide, comme le sel
Qu’est-ce que les macro élément ?
Calcium
Phosphore
Potassium
Soufre
Sodium
Chlore
Magnésium
Retrouver en grande quantité
Qu’est-ce que les micros éléments ?
Iode
Fluor
Fer
Zinc
Brome
Retrouve en quantité faible
Qu’est-ce que les oligo-éléments ?
En quantité inférieur à 0,1 g
- risque de carence : fer, iode, cuivre, zinc, sélénium, chrome, molybdène, bore
- carence à faible risque : manganèse, étain , nickel, silicium, vanadium
Quelles sont les fonctions des minéraux ?
Essentiel pour l’organisme, leur carence empêcherait d’assurer certaines fonctions
- le sodium : transporteur au glucose dans l’intestin et le rein, potentiel d’action neuronal
- le calcium : contraction musculaire, on se fixant à la calmoduline
- le fer : Fe2+ transport de l’oxygène dans les érythrocytes
- le cuivre, le zinc et le chrome : cofacteur enzymatique
- le magnésium : cofacteurs de plusieurs enzyme de la glycolyse
