Lourdes Pt2 Flashcards

1
Q

¿Por qué se dice que los procariotes tienen un ADN ahorrativo?

A

Porque no tienen mucha carga de ADN basura, sino que casi todo su genoma es codificante.

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2
Q

EN TERMINOS GENERALES, luego van a estar diciendo “La lourdes habla tonterías”. En términos generales, en las bacterias los genes que codifican para una vía metabólica, están ______.

A

Juntitos.

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3
Q

¿Qué es un operón y cuál es su estructura?

A

Un operón es un cluster de genes bajo el control de un solo promotor.

Las partes son: Promotor, Operador, los genes, y el gen regulador que va a codificar para la proteína represora.

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4
Q

¿Cuál es la diferencia entre control negativo y positivo?

A

En el control negativo cunado la proteína se adhiere a una secuencia del operón esta reprime la expresión del mismo, en el positivo, se une y actúa como cofactor para su transcripción.

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5
Q

Di un ejemplo y la definición de un operón represible.

A

En el operón inducible, la molécula que va a interactuar con la proteína represora se va a llamar corepresor. Y cuando se une a la represora hace que tenga una afinidad por el operador, Si no se une, no se activa el represor y no se pega.

Ejemplo, el triptófano, cuando hay triptfano en el ambiente, no se debe producir, por lo tanto, el triptófano se pega a la proteína represora e inactiva el operón de triptófano.

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6
Q

Di un ejemplo y la definición de un operón inducible.

A

En un operón inducible la molécula que interactúa con la proteína represora se llama inductor y cuando se unen, esta inhibe a la represora, causando que no se una al operador y que el gen se transcriba.

Un ejemplo es la lactosa, cuando esta está en el medio, inactiva a la represona para que se codifiqeun los gnes para su metabolismo.

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7
Q

V o F. Cuando hay glucosa, El AMPc baja

A

Porsupuesto.

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8
Q

Explica cómo es un control positivo el que haya glucosa en el medio, y cómo afecta al cambio climático.

A

No afecta, bueno, no c. Pero ya te pregunto la pregunta buena más luego.

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9
Q

Explica cómo es un control positivo el que haya glucosa en el medio, y cómo afecta al operón de la lactosa

A

A ver, primero hayq ue cachar que las bacterias van a querer degradar la glocsa primero antes que la lactosa, cause la glucosa es más simple.

AHORA, cuando existe glucosa, el AMPc va a bajar porque el AMPc es una proteína que activa la transcripción de enzimas degradantes de LACTOSA. Pero como sí hay glucosa en el medio, ps no hay necesidad.

Evidentemente cuando baja la glucosa, se necesita metabolizar la lactosa. El AMPc sube y se adhiere con otra proteína llamada CRP ha una secuencia en el operón de lactosa que está antes del promotor para que el RNA polimerasa pueda unirse de manera muy EFI100-T

Gracias. :)

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10
Q

Aparte del funcionamiento de los operones, ¿Cuáles otros mecanismos existen pra la regulación génica en procariontes?

A

Atenuación y Riboswitches.

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11
Q

¿Qué es la Atenuación?

A

Un proceso de regulación génica protagonizado por el RNAm, lo que pasa es que cuando se necesita parar la transcripción de un operón, la secuencia líder (Que es la primera) cambia de estructura secundaria y sirve como señal para el operón para que se silencie.

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12
Q

V o F. El Riboswitch es cuando combinas el Bongo y el de Maracuyá

A

No, pero es un nombre excelente.

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13
Q

¿Qué es entoncesf el Riboswitch?

A

Son RNAm que pueden unirse a metabolitos pequeños. Como la Glucosamina o adenina. Cuando estos se pegan normalmente dan la señal para reprimir la expresión de este gen por retroalimentación.

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14
Q

¿Cuáles son los niveles de control de las eucariotas?

A

1ro a nivel Transcripcional
2do Procesamiento del transcrito primario
3ro A ver si llega o no al citoplasma
4to Se traduce o no
5to ¿Cuanto tiempo permanece la proteína?

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15
Q

Microarray y RNAsec de ADN. ¿Quejeso?

A

Nos permiten hacer un análisis de qué genes están activos en un determinado momento en la célula

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16
Q

¿Por qué el control de transcripción en eucariotas es más complejo que en procariotas?

A

Poooorque, porqueeee, porque pues hay muchos factores de transcripción para todo. Entonces la combinación de estos en las secuencias reguladors son las que van a determinar si se transcribe o no ese gen.

17
Q

¿Qué son los factores transcripcionales?

A

Proteínas reguladoras

18
Q

¿Cuáles son los dos dominios funcionles en los factores transcripcionales?

A

El primero se va a unir al ADN y otro le va a permitir interactuar con otras proteínas.

19
Q

¿Qué son los motivos?

A

Estructuras secundarias funcionales de los dominios que se pegan al ADN en un factor transcripcional.

20
Q

¿Cuáles son los principales motivos? Cuenta como son.

A

Dedos de Zinc:
Va a tener un ión de Zinc que, en la proteína, está unido a dos Cisteinas y a dos Histidinas.

Helice - asa - hélice: Tiene hélices con dos colas de aminoácidos básicos que son los que interactúan con el ADN. Cuando estas hélices pueden estar hechos por diferentes genes.

Cremallera de Leucina: Tiene héices alfa, en forma de dímero, en la que cada 7 aminoácido va a haber una Leucina que forma una especie de cierre.

21
Q

V o F. Los factores transcripcionale, normalemente, se unen a los surcos menores.

A

Falsaso.

22
Q

Cuando una hélice - asa - hélice está hecha por diferentes génes. ¿Cómo se llama? ¿Y si no?

A

Si está hecha por diferentes: Heterodímeros.

Si no: Homodímeros.

23
Q

¿Cuál es el gen AP1?

A

Es un gen que ayuda a el control de la división celular y que tiene un factor transcripcional con motivo de cremallera de leucina.

24
Q

¿Por qué genes están sintetizados los diímeros de la cremallera de leucina?

A

Por los Fos y los Jun.

25
Q

¿Qué es la caja TATA?

A

Una secuencia reguladora.

26
Q

¿Cuáles son las secuencias necesarias para la transcripción en eucariotas?

A

En la sección nuclear está la caja TATA (Promotor nuclear), hasta -35

En la sección proximal está la CAAT box y la GC box. (NF1, SP1) Hasta -115. Aquí se controla la frecuencia con la que se transcribe el gen.

Y en la Región distal, están secuencias reguladoras que se les llama los elementos de respuesta. -115 en adelante

27
Q

¿Qué es la Inmuno precipitación de cromatina o ChiP?

A

Es una técnica que identifica qué proteína/factor de transcripción se pega a una secuencia específica.

28
Q

¿Cuándo se activa el gen PEPCK y qué transcribe?

A

Ayuda a la producción de glucosa. Transcribe para el fosfoenolpiruvato carboxinasa.

29
Q

¿Cómo se da la activación de un gen por una hormona esteroide?

A

La hormona ingresa en el citoplama y se una a receptores Glucocorticoides que va a cambiar su configuración para que ingrese al núcleo.

Ahora actúa como factor transcripcional. Por ejemplo, en el caso del cortisol, se producen dímero que se unen a secuencias palindrómicos en el ADN.

30
Q

¿Cuáles son los elementos de Transcripción y para qué sirven?

A

Polimerasa, Mediador, Factores generales (TAF’s), Complejo de modificación de histona, Complejo de remodelación de cromatina, Enhancer, Activador transcripcional, y el Aislador
El factor transcripcional interactúa con todas estas para que se pueda transcribir el gen.

31
Q

¿Cuáles son los tipos de Co-activadores?

A

Los co-activadores de la transcripción basal. (Mediador y TAF’s)

A nivel de regulación de la cromatina.

Btw, la secuencia aislante crea dominios en los genes.

32
Q

¿Cuál es el esquema del nucleosoma?

A

Formado por histonas (H3, H4 y H2A Y B).

Las colas están en el extremo amino y se pegan grupos metilo y acetilo.

33
Q

V o F. La herencia epigenética no tiene que ver con la secuencia del ADN.

A

Claro que sí. You’re doing great. Ya mismo se acaba la segunda clase. Toma aguita, keep going.

34
Q

¿Cuál es el proceso de la activacuón de la transcripción?

A

El receptor glucocoritcoide se une una secuencia CRE, un elemento de respuesta.

Esto produce que le atraiga al complejo CDP, que contiene la Acetil transferasad e histona, y acetila las colas histónicas.

Cuando están acetiladas se abren las colas, esto le llama al SWI/SNF.

Los nucleosomas se deslizan y el ADN queda expuesto para transcribirse

35
Q

¿Cuáles son las posibles remodelaciones de las cromatinas?

A

-Sliding
-Cambio conformacional: Deja una protuberancia de cromatina que deja expuesta la caja TATA.
-Intercambio de histonas: Histonas variantes que hace que se suelte un poquito más el ADN.
DIsociasión de histonas.

36
Q

¿Qué es la represión transcripcional?

A

Pues formas a nivel de la cromatina en la que se reprime la epresión de un gen.
Acá igual, a diferencia del otro, existen factores REPRESORES. que interactúan con complejos represores.

Por ejemplo, está la desacetilasa, que desacetila las colas.

Luego también puede venor la Metiltransferasa que metila las colas y les bloquea.

37
Q

¿Qué resulta curioso de la Metilación de la histona H3K36?

A

Que su metilación promueve la transcripción, ya que ordena este proceso.

38
Q

¿Qué son las importinas?

A

Son receptores de transporte que transportan macromoléculas del citoplasma al núcleo.

39
Q

¿Qué son las exportinas?

A

Son receptores de transporte que transportan macromoléculas desde el núcleo hacia el citoplasma