capitulo 11 Flashcards
¿Cuál es el intermediario entre un gen y el polipéptido?
mRNA
¿Qué dice el Dogma Central?
Replicación—> Transcripción—> Traducción
¿Dónde se da la transcripción?
en el núcleo
¿Dónde se da la traducción?
En el citoplasma
¿Se transcribe todo el genoma?
No, a diferencia de la replicación solo se transcriben los genes.
¿Qué características tiene el RNA polimerasa?
sintética sólo en sentido 5’-3’ de manera progresiva
¿Se transcriben las 2 cadenas?
No, solo se transcribe una de las dos cadenas de la doble hélice.
¿Qué indica la secuencia promotora?
- Donde debe pegarse la enzima
- Cuál de las dos cadenas transcribir
- El inicio del gen (+1)
Para la iniciación de transcripción en bacterias es necesario…
La enzima central y la proteína sigma factor quien se encargará de encontrar la región promotora.
¿Qué es el RNA polimerasa?
Es una holoenzima compuesta por 5 cadenas polipeptídicas.
Para que comience la elongación en bacterias, es necesario…
que el factor sigma se libere porque inhabilita un poco la acción polimerasa. Y se vuelve el favtor de elongación de la transcripción.
¿Cuales son las secuencias corriente abajo?
Son las que están después del +1 (punto de inicio)
¿Cuál es son los números corriente arriba?
Los que están antes del +1, son negativos
¿Qué corriente tiene la región promotora?
Corriente arriba.
¿Qué característica tiene la secuencia de DNA -10 y -35 en bacterias?
Generalmente son conservados, es decir son los mismos en todas las bacterias con pequeñas excepciones.
En bacterias hay dos maneras para finalizar la transcripción, ¿Cuales son?
- Mediante la proteína RHO que se encarga de bloquear la maquinaria de transcripción
- Si no hay la proteína RHO, la cadena molde de DNA llegará a una secuencia de terminación donde formará una estructura tallo-boucle que va a desconfigurar la maquinaria.
¿La terminación de transcripción en bacterias es la misma en eucariotas?
No.
¿Qué características tienen las secciones de DNA reconocidas como tallo y boucles?
Los tallos tienen complementariedad entre las 2 cadenas mientras los boucles no.
¿Cuál es el factor sigma estudiando en la transcripción de bacterias?
Sigma Factor 70 de mantenimiento.
¿Existe un solo factor sigma?
No.
¿Qué característica tiene la RNA polimerasa 1? (Eucariota)
Transcribe cadenas largas de RNA.
28S, 18S, 5.8S
¿Qué característica tiene la RNA polimerasa 2? (Eucariota)
Transcribe mRNA, la mayoría de los de los ARN nucleares (snRNA y snoRNA), microRNA’s, y RNA telomerasa.
¿Qué característica tiene la RNA polimerasa 3? (Eucariota)
Transcribe tRNA, 5S rRNA, entre otros.
¿Cuáles son las polimerasas características de las plantas?
Polimerasa 4 y 5, encargadas en procesos de interferencia.
¿El transcripto primario es el producto final?
No, tiene que pasar por el proceso de splicing.
¿Qué hace el proceso de splicing/ “corte y empalme”?
Procesa el transcripto primario, en el se perderán nucleótidos de ambos extremos y de los intermedios.
¿Cuál es el producto de la transcripción en eucariotes?
Pre mRNA, transcripto primario.
¿Cómo se llama la subunidad grande de los ribosomas?
60S
¿Cómo se llama la subunidad pequeña de los ribosomas?
40S
¿Qué es una ribonucleoproteina?
Son complejos proteicos unidos a moléculas de RNA nucleolares pequeños
¿Qué enzima sintetiza los ribosomas 28S, 5.8S y 18S
RNA polimerasa 1
¿Cómo se procesan los rRNA 18S y 5.8S y 28S?
La polimerasa 1 transcribe el transcripto primario 45S (13 mil nucleótidos) a partir de genes en clusters y va procesando hasta llegar a 18S y 32S. A partir de 32S se forma 28S y 5.8S
¿Qué función tiene el snoRNA de caja CD en el procesamiento de pre-RNA?
Añadir grupos metil a nucleótidos para que no quiten los nucleótidos maracados al momento en del procesamiento
¿Qué función tiene el snoRNA de caja H/ACA en el procesamiento de pre-RNA?
Genera un tallo-boucle donde para formar pseudouridinas.
¿Qué se une entre exones?
EJC el complejo proteico
¿Qué hizo el experimento de Beatle Tatum?
Se mutaron con diferentes mutaciones una neuroespora y se hicieron crecer en diferentes medios. Se evidenció que un gen -> Un RNA funcional.
¿Cómo es la estructura bidimensional de los RNA ribosómico?
Está formado por tallos y hazas. Los tallos se forman al unir dos cadenas complementarias de ARN.
En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega
Desde -35 al -10
En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega
Desde -35 al -10
En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega
Desde -35 al -10
En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega
Desde -35 al -10
En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega
Desde -35 al -10
En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega
Desde -35 al -10
¿Por qué es importante la secuencia -10 en el inicio de la transcripción?
Porque la polimerasa, a través del factor sigma, ubica muy bien a la maquinaria de transcripción y que empiece en el lugar exacto.
¿Cuál son los rRNAs de la subunidad 60S?
5S, 5.8S, 28S y 49 proteínas ribosomales.
¿Cuáles son los rRNAs de la subunidad 40S del ribosoma?
18S y 33 proteínas ribosomales
¿Qué hace la ribonucleoproteina U3 snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?
Le quita nucleótidos del extremo 5’ al pre-RNA
¿Qué hace el exosoma snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?
Comolejo de proteínas por más de 12 exonucleasas
¿Qué hace el exosoma snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?
Comolejo de proteínas por más de 12 exonucleasas
¿Qué hace el exosoma snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?
Comolejo de proteínas por más de 12 exonucleasas
¿Qué mecanismo se despierta cuando para traducir no se desprende el EJC?
NMD: Nonsense mediated decay quien elimina el mRNA
¿Qué son los polirribosomas?
Son mensajeros
V o F. Los genes para el tRNA tienen un sitio específico en el genoma
Fal
So
Falso.
Están en clusters en distintas partes del genoma.
¿Qué es la Ribonucleasa P?
Tiene cadenas polipeptídicas, pero tiene segmentos de ARN que actúa como nucleasa.
¿Cuál es la diferencia entre el hnRNA I y el hnRNA II?
El hnRNA II ya tiene la cadena de metilguanosina y la cola Poli(A)
¿Qué es lo que le hace especial al hnRNA?
Que es el transcrito primario de genes de herencia mendeliana
¿En dónde está la secuencia promotora de los genes en Eucariotas?
-24/-32. Se llama Caja TATA
¿Qué hace la proteína TBP?
Es parte del ensamblaje del complejo de preinicio de la transcripción. Causs una modificación molecular en la hebra de ADN y se pega a la caja TATA y le llama al TAF y forma el complejo TF2D
Luego de que se reconoce la caja TATA por la TF2D, ¿Qué otras moléculas se agregan al complejo de pre-inicio?
- Se une el TF2B, y TF2A, para que se pueda pegar la RNA polimerasa 2 con la TF2F.
- Finalmente entran el TF2E y TF2H.
¿Cómo se activa la RNA polimerasa 2?
TODA PROTEÍNA TIENE UN AMINO TERMINAL Y CARBOXILO TERMINAL.
Entonces en su cola se fosforila por las cinasas las serinas 5 por el TF2H. Logra safarse del complejo de preinicio y c VA.
¿Qué pasa con el complejo TF2D una vez que se activó la ARN polimerasa 2?
-Dependiendo del control génico que c d. Se queda ahí para que pueda unirse otra polimerasa.
¿Cuál es la estructura de un mRNA?
(5’)Región metil guanosina, región codificante, región no traducida, cola poly(A) de entre 250pb (3’)
¿Por qué se dice que los genes son interrumpidos?
Porque su secuencia no es transcrita directamente, sino que son divididos por los intrones.
Describa el proceso para añadir el casquete metilguanosina.
El nucleótido del extremo 5’ va a tener 3 fosfatos. Pierde un fósforo y se le añade un metilguanosina de forma invertida por un puente 5’ 5’ fosfodiester. Y también se metila el azúcar del primer extremo 5’ Y yam.
Describe cómo se forman las cadenas poly(A)
Cuando se reconoce la secuencia AAUAAA por la endonucleasa, después de 20-30 nucleótidos, se corta. La polimerasa Poli(A) que sin molde de ADN, pone entre 50 y 250 nucleótidos de Adenina.
¿Cuál es la secuencia 5’ y 3’ para que se corten los intrones?
5’ AGGU.
3’ AGG
¿Qué proteínas intervienen en el corte y empalme?
Ribonucleoproteínas.
Describe los primeros 3 pasos del corte y empalme.
- Se unen las proteínas SR en las secuencias ESE.
- Se une la RNP U1 en el extremo 5’ y la U2 porque la U2AF le llama, en el extremo 3’. Son complementarios y forma un a doble cadena.
- Entra un complejo de U4, 5, Y 6. El U6 y la U4 entran pegaditas.
- Sale el U1 y el U4.
- El U6 corta, y forma el lazo con la U2 en el extremo 5’
- El U5 y el U6 corta el extremo 3’
- Sale intrón, se unen exones.
¿Qué estructura en el snRNP es común para todas las del splisiosoma?
Sm peotein.
¿Cuánto tiempo pasa desde que se da un transcrito primario, y se produce un mRNA?
TRICK QUESTION. Todo se da al mismo tiempo
V o F. Los Tripletes pueden ser transponibles.
False, man.
¿Qué significa que el ADN es degenerado?
Que existe más de un codón que codifica apra más de un aminoácido.
¿Cual es el margen de seguridad de la traducción?
- El que los codones puedan cambiar en el último par y se pueda producir el mismo aminoácido casi.siempre.
- El que incluso si es un diferente aminoácido las estructuras secundarias y terciarias podrían hacer que proteínas diferentes cumplan la misma función
¿En el tRNA por qué es importante el brazo intermedio?
Porque va a tener el anticodón.
¿Cuáles son las partes importantes del tRNA?
El brazo intermedio y el brazo aceptor en el que se pega el aminoácido.
¿Qué es el bamboleo?
Un mismo tRNA puede reconocer dos codones. Solo si cambia el de la tercera posición del codón
¿Cómo se llama y qué hace la proteína que le pega el aminoácido al tRNA?
Aminoacil sintetasa.
- Se da a través de la activación del aminoácido.
- Se pone ATP al aminoácido y queda un aminoacil AMP.
- Y luego este aminoacil AMP se une al tRNA
¿Codón de inicio?
AUG
¿Como empieza la reducción en bacterias?
Se reconoce la secuencia Heinshaigarga (? Jajajaja no c sí es así, pero suena así. Porque es comolementaria al rRNA del ribsoma y luego ya le dice que esté pilas que unos 20 nucleótidos más abajo está el codón de inicio.
Explique el inicio de síntesis en bacterias.
Se une el RNA al codón de inicio y se permite que se unan tres factores de de iniciación. El IF1 que estabiliza la unión del rRNA pequeño, el IF2 que hace que el rRNA grande no c pegue antes de hora y el IF2 que permite que se pegue el codón de inicio. Pero consume energía en forma de GTP este último
Explique el inicio de síntesis en bacterias.
Se une el RNA al codón de inicio y se permite que se unan tres factores de de iniciación. El IF1 que estabiliza la unión del rRNA pequeño, el IF2 que hace que el rRNA grande no c pegue antes de hora y el IF2 que permite que se pegue el codón de inicio. Pero consume energía en forma de GTP este último
¿En qué parte de la subunidad grande del ribosoma se pega el primer codón?
En la parte P
¿Cómo inicia la síntesis de proteínas en eucariotas?
Casi igual, se une el complejo 43S con los favtores de inicio de transcripción y, con ayuda del EIF4E, busca el casquete de metilguanosina.
-Luego ya se pone pilas para encontrar el AUG.
Hay que cachar que este mRNA está en forma circular por diferentes proteínas.
¿Como se da el enlace peptídico y entre los aminoácidos de la traducción?
Entre el extremo carboxilo y el grupo amino del otro. Por la peptidiltranferasa
