capitulo 11 Flashcards

1
Q

¿Cuál es el intermediario entre un gen y el polipéptido?

A

mRNA

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Q

¿Qué dice el Dogma Central?

A

Replicación—> Transcripción—> Traducción

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3
Q

¿Dónde se da la transcripción?

A

en el núcleo

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4
Q

¿Dónde se da la traducción?

A

En el citoplasma

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5
Q

¿Se transcribe todo el genoma?

A

No, a diferencia de la replicación solo se transcriben los genes.

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6
Q

¿Qué características tiene el RNA polimerasa?

A

sintética sólo en sentido 5’-3’ de manera progresiva

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7
Q

¿Se transcriben las 2 cadenas?

A

No, solo se transcribe una de las dos cadenas de la doble hélice.

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8
Q

¿Qué indica la secuencia promotora?

A
  • Donde debe pegarse la enzima
  • Cuál de las dos cadenas transcribir
  • El inicio del gen (+1)
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9
Q

Para la iniciación de transcripción en bacterias es necesario…

A

La enzima central y la proteína sigma factor quien se encargará de encontrar la región promotora.

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10
Q

¿Qué es el RNA polimerasa?

A

Es una holoenzima compuesta por 5 cadenas polipeptídicas.

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11
Q

Para que comience la elongación en bacterias, es necesario…

A

que el factor sigma se libere porque inhabilita un poco la acción polimerasa. Y se vuelve el favtor de elongación de la transcripción.

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12
Q

¿Cuales son las secuencias corriente abajo?

A

Son las que están después del +1 (punto de inicio)

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13
Q

¿Cuál es son los números corriente arriba?

A

Los que están antes del +1, son negativos

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14
Q

¿Qué corriente tiene la región promotora?

A

Corriente arriba.

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15
Q

¿Qué característica tiene la secuencia de DNA -10 y -35 en bacterias?

A

Generalmente son conservados, es decir son los mismos en todas las bacterias con pequeñas excepciones.

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16
Q

En bacterias hay dos maneras para finalizar la transcripción, ¿Cuales son?

A
  1. Mediante la proteína RHO que se encarga de bloquear la maquinaria de transcripción
  2. Si no hay la proteína RHO, la cadena molde de DNA llegará a una secuencia de terminación donde formará una estructura tallo-boucle que va a desconfigurar la maquinaria.
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17
Q

¿La terminación de transcripción en bacterias es la misma en eucariotas?

A

No.

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18
Q

¿Qué características tienen las secciones de DNA reconocidas como tallo y boucles?

A

Los tallos tienen complementariedad entre las 2 cadenas mientras los boucles no.

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19
Q

¿Cuál es el factor sigma estudiando en la transcripción de bacterias?

A

Sigma Factor 70 de mantenimiento.

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20
Q

¿Existe un solo factor sigma?

A

No.

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21
Q

¿Qué característica tiene la RNA polimerasa 1? (Eucariota)

A

Transcribe cadenas largas de RNA.

28S, 18S, 5.8S

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22
Q

¿Qué característica tiene la RNA polimerasa 2? (Eucariota)

A

Transcribe mRNA, la mayoría de los de los ARN nucleares (snRNA y snoRNA), microRNA’s, y RNA telomerasa.

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23
Q

¿Qué característica tiene la RNA polimerasa 3? (Eucariota)

A

Transcribe tRNA, 5S rRNA, entre otros.

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24
Q

¿Cuáles son las polimerasas características de las plantas?

A

Polimerasa 4 y 5, encargadas en procesos de interferencia.

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25
Q

¿El transcripto primario es el producto final?

A

No, tiene que pasar por el proceso de splicing.

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26
Q

¿Qué hace el proceso de splicing/ “corte y empalme”?

A

Procesa el transcripto primario, en el se perderán nucleótidos de ambos extremos y de los intermedios.

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27
Q

¿Cuál es el producto de la transcripción en eucariotes?

A

Pre mRNA, transcripto primario.

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28
Q

¿Cómo se llama la subunidad grande de los ribosomas?

A

60S

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29
Q

¿Cómo se llama la subunidad pequeña de los ribosomas?

A

40S

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30
Q

¿Qué es una ribonucleoproteina?

A

Son complejos proteicos unidos a moléculas de RNA nucleolares pequeños

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31
Q

¿Qué enzima sintetiza los ribosomas 28S, 5.8S y 18S

A

RNA polimerasa 1

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32
Q

¿Cómo se procesan los rRNA 18S y 5.8S y 28S?

A

La polimerasa 1 transcribe el transcripto primario 45S (13 mil nucleótidos) a partir de genes en clusters y va procesando hasta llegar a 18S y 32S. A partir de 32S se forma 28S y 5.8S

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33
Q

¿Qué función tiene el snoRNA de caja CD en el procesamiento de pre-RNA?

A

Añadir grupos metil a nucleótidos para que no quiten los nucleótidos maracados al momento en del procesamiento

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34
Q

¿Qué función tiene el snoRNA de caja H/ACA en el procesamiento de pre-RNA?

A

Genera un tallo-boucle donde para formar pseudouridinas.

35
Q

¿Qué se une entre exones?

A

EJC el complejo proteico

36
Q

¿Qué hizo el experimento de Beatle Tatum?

A

Se mutaron con diferentes mutaciones una neuroespora y se hicieron crecer en diferentes medios. Se evidenció que un gen -> Un RNA funcional.

37
Q

¿Cómo es la estructura bidimensional de los RNA ribosómico?

A

Está formado por tallos y hazas. Los tallos se forman al unir dos cadenas complementarias de ARN.

38
Q

En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega

A

Desde -35 al -10

38
Q

En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega

A

Desde -35 al -10

38
Q

En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega

A

Desde -35 al -10

39
Q

En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega

A

Desde -35 al -10

39
Q

En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega

A

Desde -35 al -10

40
Q

En bacterias, el factor sigma de la transcrpción, a qué número de secuencia se pega

A

Desde -35 al -10

41
Q

¿Por qué es importante la secuencia -10 en el inicio de la transcripción?

A

Porque la polimerasa, a través del factor sigma, ubica muy bien a la maquinaria de transcripción y que empiece en el lugar exacto.

42
Q

¿Cuál son los rRNAs de la subunidad 60S?

A

5S, 5.8S, 28S y 49 proteínas ribosomales.

43
Q

¿Cuáles son los rRNAs de la subunidad 40S del ribosoma?

A

18S y 33 proteínas ribosomales

44
Q

¿Qué hace la ribonucleoproteina U3 snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?

A

Le quita nucleótidos del extremo 5’ al pre-RNA

45
Q

¿Qué hace el exosoma snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?

A

Comolejo de proteínas por más de 12 exonucleasas

45
Q

¿Qué hace el exosoma snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?

A

Comolejo de proteínas por más de 12 exonucleasas

46
Q

¿Qué hace el exosoma snoRNA en el procesamiento de pre-RNA?

A

Comolejo de proteínas por más de 12 exonucleasas

47
Q

¿Qué mecanismo se despierta cuando para traducir no se desprende el EJC?

A

NMD: Nonsense mediated decay quien elimina el mRNA

48
Q

¿Qué son los polirribosomas?

A

Son mensajeros

49
Q

V o F. Los genes para el tRNA tienen un sitio específico en el genoma

A

Fal
So
Falso.
Están en clusters en distintas partes del genoma.

50
Q

¿Qué es la Ribonucleasa P?

A

Tiene cadenas polipeptídicas, pero tiene segmentos de ARN que actúa como nucleasa.

51
Q

¿Cuál es la diferencia entre el hnRNA I y el hnRNA II?

A

El hnRNA II ya tiene la cadena de metilguanosina y la cola Poli(A)

52
Q

¿Qué es lo que le hace especial al hnRNA?

A

Que es el transcrito primario de genes de herencia mendeliana

53
Q

¿En dónde está la secuencia promotora de los genes en Eucariotas?

A

-24/-32. Se llama Caja TATA

54
Q

¿Qué hace la proteína TBP?

A

Es parte del ensamblaje del complejo de preinicio de la transcripción. Causs una modificación molecular en la hebra de ADN y se pega a la caja TATA y le llama al TAF y forma el complejo TF2D

55
Q

Luego de que se reconoce la caja TATA por la TF2D, ¿Qué otras moléculas se agregan al complejo de pre-inicio?

A
  • Se une el TF2B, y TF2A, para que se pueda pegar la RNA polimerasa 2 con la TF2F.
  • Finalmente entran el TF2E y TF2H.
55
Q

¿Cómo se activa la RNA polimerasa 2?

A

TODA PROTEÍNA TIENE UN AMINO TERMINAL Y CARBOXILO TERMINAL.

Entonces en su cola se fosforila por las cinasas las serinas 5 por el TF2H. Logra safarse del complejo de preinicio y c VA.

56
Q

¿Qué pasa con el complejo TF2D una vez que se activó la ARN polimerasa 2?

A

-Dependiendo del control génico que c d. Se queda ahí para que pueda unirse otra polimerasa.

57
Q

¿Cuál es la estructura de un mRNA?

A

(5’)Región metil guanosina, región codificante, región no traducida, cola poly(A) de entre 250pb (3’)

58
Q

¿Por qué se dice que los genes son interrumpidos?

A

Porque su secuencia no es transcrita directamente, sino que son divididos por los intrones.

59
Q

Describa el proceso para añadir el casquete metilguanosina.

A

El nucleótido del extremo 5’ va a tener 3 fosfatos. Pierde un fósforo y se le añade un metilguanosina de forma invertida por un puente 5’ 5’ fosfodiester. Y también se metila el azúcar del primer extremo 5’ Y yam.

60
Q

Describe cómo se forman las cadenas poly(A)

A

Cuando se reconoce la secuencia AAUAAA por la endonucleasa, después de 20-30 nucleótidos, se corta. La polimerasa Poli(A) que sin molde de ADN, pone entre 50 y 250 nucleótidos de Adenina.

61
Q

¿Cuál es la secuencia 5’ y 3’ para que se corten los intrones?

A

5’ AGGU.

3’ AGG

62
Q

¿Qué proteínas intervienen en el corte y empalme?

A

Ribonucleoproteínas.

63
Q

Describe los primeros 3 pasos del corte y empalme.

A
  • Se unen las proteínas SR en las secuencias ESE.
  • Se une la RNP U1 en el extremo 5’ y la U2 porque la U2AF le llama, en el extremo 3’. Son complementarios y forma un a doble cadena.
  • Entra un complejo de U4, 5, Y 6. El U6 y la U4 entran pegaditas.
  • Sale el U1 y el U4.
  • El U6 corta, y forma el lazo con la U2 en el extremo 5’
  • El U5 y el U6 corta el extremo 3’
  • Sale intrón, se unen exones.
64
Q

¿Qué estructura en el snRNP es común para todas las del splisiosoma?

A

Sm peotein.

65
Q

¿Cuánto tiempo pasa desde que se da un transcrito primario, y se produce un mRNA?

A

TRICK QUESTION. Todo se da al mismo tiempo

66
Q

V o F. Los Tripletes pueden ser transponibles.

A

False, man.

67
Q

¿Qué significa que el ADN es degenerado?

A

Que existe más de un codón que codifica apra más de un aminoácido.

68
Q

¿Cual es el margen de seguridad de la traducción?

A
  • El que los codones puedan cambiar en el último par y se pueda producir el mismo aminoácido casi.siempre.
  • El que incluso si es un diferente aminoácido las estructuras secundarias y terciarias podrían hacer que proteínas diferentes cumplan la misma función
69
Q

¿En el tRNA por qué es importante el brazo intermedio?

A

Porque va a tener el anticodón.

70
Q

¿Cuáles son las partes importantes del tRNA?

A

El brazo intermedio y el brazo aceptor en el que se pega el aminoácido.

71
Q

¿Qué es el bamboleo?

A

Un mismo tRNA puede reconocer dos codones. Solo si cambia el de la tercera posición del codón

72
Q

¿Cómo se llama y qué hace la proteína que le pega el aminoácido al tRNA?

A

Aminoacil sintetasa.

  • Se da a través de la activación del aminoácido.
  • Se pone ATP al aminoácido y queda un aminoacil AMP.
  • Y luego este aminoacil AMP se une al tRNA
73
Q

¿Codón de inicio?

A

AUG

74
Q

¿Como empieza la reducción en bacterias?

A

Se reconoce la secuencia Heinshaigarga (? Jajajaja no c sí es así, pero suena así. Porque es comolementaria al rRNA del ribsoma y luego ya le dice que esté pilas que unos 20 nucleótidos más abajo está el codón de inicio.

75
Q

Explique el inicio de síntesis en bacterias.

A

Se une el RNA al codón de inicio y se permite que se unan tres factores de de iniciación. El IF1 que estabiliza la unión del rRNA pequeño, el IF2 que hace que el rRNA grande no c pegue antes de hora y el IF2 que permite que se pegue el codón de inicio. Pero consume energía en forma de GTP este último

75
Q

Explique el inicio de síntesis en bacterias.

A

Se une el RNA al codón de inicio y se permite que se unan tres factores de de iniciación. El IF1 que estabiliza la unión del rRNA pequeño, el IF2 que hace que el rRNA grande no c pegue antes de hora y el IF2 que permite que se pegue el codón de inicio. Pero consume energía en forma de GTP este último

76
Q

¿En qué parte de la subunidad grande del ribosoma se pega el primer codón?

A

En la parte P

77
Q

¿Cómo inicia la síntesis de proteínas en eucariotas?

A

Casi igual, se une el complejo 43S con los favtores de inicio de transcripción y, con ayuda del EIF4E, busca el casquete de metilguanosina.
-Luego ya se pone pilas para encontrar el AUG.
Hay que cachar que este mRNA está en forma circular por diferentes proteínas.

78
Q

¿Como se da el enlace peptídico y entre los aminoácidos de la traducción?

A

Entre el extremo carboxilo y el grupo amino del otro. Por la peptidiltranferasa