Le Monde Des Agents Infectieux Flashcards
Quelles sont les catégories de microorganismes et leurs tailles approximatives
Protozoaires : 10-100 microns
Champignons : 10 microns
Bactéries : 1 micron
Virus : 0,01 micron
Quels sont les trois maillons de la chaîne épidémiologique ?
Agent infectieux
Hôte
Voie de transmission
Le point d’entrée et de sortie le contact entre les maillons
Quels éléments vont caractériser l’hôte
La susceptibilité qui dépend de l’âge et du sexe (variations anatomiques)
Immunodépression Matériel de greffe Intoxication (tabac, diabète, etc) Génétique Microbiote Ci-infection
Quelles sont les différentes voies de transmission
Direct : d’individu a individu
Indirect : par l’eau ou l’alimentation contaminée
Quelles sont les caractéristiques de la voies de transmission directe
Elle peut être
verticale : de la mère à l’enfant lors de l’accouchement ou in utero
Ou
Horizontale : par la peau, l’air, etc
Donner des exemples de voies de transmission indirectes
Viande pas cuite : trichinose
Œuf et poulet : salmonella
Hamburger : e. Coli 0157-H7
Porc : listeria
Fruits et légumes : hépatite A/E, E. Coli 0104-H4
Poissons cru : anisikiases
Animaux : contact indirect entre individus
Arthropodes vecteurs :
Tique : fièvre boutonneuse méditerranéenne ; Lyme
Poux : bartonella quintana
Moustique : dengue, fièvre jaune, chikungunya
Quelles sont les dates importantes de l’histoire de la microbiologie
- 6eme siècle : Mahavira dans le jahinisme postule l’existence de vie microbiologique
- 1er siècle : Varron : première idée de propagation par microbes dans livre d’agriculture
1000 : avicienne pense que tubercule ou méningite sont infectieuse, il identifie les voies de transmission
1350 : ibn al khatib : premières méthodes pour briser la chaîne épidémiologique
1550 : fracastore parle de réels organismes porteurs de maladies, notemment syphilis
Fin 17ème : Leuuwenhoek : marchand invente le précurseur du microscope
18ème : spallanzani prouve que la génération spontanée est fausse et montre que l’ébullition stérilise
1859 : pasteur : fermentation produit microbes ; levures = champi ; défenseurs de la théorie des germes
1905 : Koch : établit lien entre microbe et maladies infectieuses ; identifie bacille de Koch dans la tuberculose ; développe les critères de Koch
Quels sont les critères de Koch
Observation
Prélèvement et culture de l’agent
Injection à une souris : expérimentation animale
Prélèvement chez cette souris et observation : elle devrait être identique à la première
Qui a introduit le terme microbe
Chirurgien Charles Sedillot en 1878
A quoi correspond un microbe
Procaryote : donc pas les champignons ou les protistes ni les prions
Qu’est ce qu’un procaryote
Sans noyau, ni organites presque toujours unicellulaire
Divisé en deux domaines : archées et bactérie
Partout où la température est <140°
N = 5.10^30 : moitié de la bio masse
Quel domaine et plus proche l’un de l’autre entre eucaryote procaryote archees
Archees et eucaryote
Quelles sont les principales formes de bactéries
Cocci : rond
Bacille : long
Sphirocete : particulier
Quel est le rôle de la paroi bactérienne
Résistance rigidité protection
Si destruction: bactéricidie
Comment appelle t on la reproduction des bactéries ?
Par scissiparité
Quels sont les deux modes de fonctionnement des bactéries
Cellules individuelles ou colonies
Qu’est ce qu’un spore
Structure qui sert de mécanisme de survie
Quelles sont les critères de classification des bactéries
Forme
Arrangement
Morphologie
Respiration ou capacité métabolique
Phylogenie
Donner deux exemples d’arrangement bactérien
En collier : streptocoque
Gratuite de raison : staphylocoque
Comment détecter la morphologie de la bactérie
Coloration au gram qui se base sur la propriété de la paroi des bactéries
Gram + : violettes
Gram - : roses
Comment définit on une nouvelle espèce de bactéries
Sur le gène 16S, au delà de 1,3% de différence
On découvre 500 espèces par an
15000 connues
Qu’est-ce qu’un clone bactérien
Grutier dans l’espèce les propriétés diffèrent
Par exemple plusieurs clone de tuberculose : plus ou moins virulent ou guérissable
Quelles bactéries retrouve t on le plus à l’hôpital
10 sont responsables de 80%
600 différentes
- staphylococcus aureus
- Escherischia coli
- pseudonomas aeruginosa
- staphylococcus epidermis
- klebsiella pneumoniae
- enterococcus fecalis
- enterobacter cloacae
- proteus mirabilis
- streptococcus agalactiae ( groupe B )
- enterobacter aerogene
quels sont les différents types d’interaction des bactéries
- Biofilms
- Les bactéries prédatrices
- Les bactéries mutualistes
- Les bactéries pathogènes
- Les bactéries proies
qu’est-ce qu’un biofilm
crée des agrégats multicellulaires permettant au bactéries d’échanger une variété de signaux moléculaires pour la communication et permet aux bactéries d’avoir un comportement multicellulaire coordonné ( division du travail, accès aux ressources non utilisés par les bactéries simples, défense, optimisation de la survie par différenciation en type cellulaire distincts )
quel est le mécanisme d’attaque des bactérie prédatrices ?
- formation essaims de cellules qui tuent et digèrent les bactéries qu’ils entourent
- attachement a la proie pour les digérer et en absorber les éléments nutritifs
- envahissement des cellules et multiplication dans le cytosol
ces bactéries auraient évolué des saprophages
quel rôles sont assurés chez l’homme par des bactéries
- immunité du tube digestif
- synthèse de vitamine
- conversion des sucres en acide lactique
- fermentation des carbohydrates complexes non digestibles
- inhibition d’autre bactéries toxiques ( probiotiques )
dans quels conditions survient la colite a claustridium difficile ? comment la traite t on
- sujet de + 65 ans
- peu être toxinogène ( synthèse notamment de O27 )
- modification du microbiote digestif par antibiotiques
se traite par greffe fécale
selon quels facteurs varie le pouvoir pathogène des bactéries
- selon le micro organisme
- selon l’inoculum ( la quantité de bactéries )
- selon les défenses de l’hôte
qu’estce que le spectre d’interaction d’une bactéries ?
ses effets et les circonstances sous lesquelles se développent ces effets ex des bactéries commensales qui deviennent opportuniste (≠ obligatoire pour bactéries toujours pathogènes ) ; ou certaines bactéries qui ne cause des pathologies que chez un organe et pas un autre
donner des exemples de mécanismes chez les bactériophages
- infection et lyse de la bactérie hote
- insertion dans le génome bactérien, deviennent dormants et peuvent être réactivés ou passés à la génération suivante
- infection d’une bactérie par une autre : transfert horizontal de gène avec le génome du phage et une partie du bactérien
exemple : diphtéries, scarlatine, botulisme
donner des exemples de role des archées
- nitrification
- recyclage hydrogène et production de méthane
- représente 8-10% des microorganismes du tube digestif
- cause certaines pathologies ( abcès cerebraux )
quels eucaryotes retrouve-t-on chez l’homme ?
champignons, protistes ( protozoaires, hématozoaires,, animaux ( helminthes, arthropodes ), micro algues
quelles sont les principales caractéristiques des virus
<200nm ADN ou ARN ( jamais les deux ) parasite obligatoire intracellulaire strict incapable de fission binaire
qu’est ce qu’un prion
(proteinaceous infectious only), ce sont des agents transmissibles non conventionels.
ce sont des protéines ayant la même séquence que les protéines naturelles mais ayant une structure différente et qui vont transformer les protéines normales en prions
responsables d’encéphalopathies spongiformes transmissibles