Le code épigénétique Flashcards
Définition: le code épigénétique
Définit les modifications transmissibles et réversibles de l’ADN régulant l’expression des gènes sans affecter la séquence nucléotidiques.
Les trois mécanismes du code épigénétique
1) Régulation de l’expression des gènes
2) Sources de variations épigénétiques embryonnaires et fœtale
3) Évolution
Les 3 cibles de la méthylation
1) Histones (compaction)
2) Cytosine
3) ARN non-codants
2 faits sur la méthylation des cytosine
°Groupe CH3 sur le carbone 5
°Cytosine méthylée en amont d’une guanine (CpG)
La méthylation à l’échelle…
°Moléculaire
°Tissulaire
°0, 50 ou 100% (un brin vs l’autre)
°De 0 à 100% (en regardant tout les brins)
°C’est quoi le mosaïcisme
°Ex
°État dans lequel deux ou plusieurs populations de cellules avec des génotypes différents coexiste dans un organisme
°Le chromosome inactivé peut différer d’une cellule à l’autre
3 mécanismes de régulation de transcription par la méthylation
°Que font les groupement méthyl
1) Inhibition de la liaison d’un facteur activateur de la transcription
2) Inhibition de la liaison d’un facteur inhibiteur de la transcription
3) Inhibition de la liaison d’un facteur CTCF qui change la composition de l’ARNm mature
°Encombrement stérique
3 caractéristiques ilôts CpG
°Formule
1) Séquence d’environ 200pb
2) Plus de 50% GC
3) Plus de 0,6 nCpG obs/CpG attendus
° nCpG/( (nC * nG)/ longueur de la séquence)
DNMTs:
°DNMT1
°DNMT3a et b
°DMNT2
°DMNT3L
°Assure la méthylation sur le deuxièmes brin
°Méthylation pour la première fois mais sur un brin
°Méthylation de l’ARN
°Empreinte génomique
Mécanisme de la déméthylation (5)
1) Tet hydroxyle les cytosine méthylés
2a) Aid et APOBEC désamine les cytosines hydroxylés
2b) Tet hydroxyle encore les cytosines hydroxylés
3) Les cytosines sont excises par TDG ou SMUG1
4) Activation de la voie de réparation par excision de base (BER) et substitution par des cytosines non méthylées
3 étapes épigénétiques lors des périodes fœtales et embryonnaires
1) Réinitialisation totale de l’épigénome
2) Différenciation et croissance
3) Forte activité des DNMTs
Transition de la cytosine à la thymine:
°Comment
°Si C non méthylée
°Si C méthylée
°Ce que ça cause
°Méthylation favorise la transition
°En U (système de réparation performant)
°En T ((système de réparation non performant)
°Maladie génétique
