La virologie Flashcards
Comment peut-on qualifier les virus à leur état extracellulaire?
Ils sont comme une molécule organique: inerte et absence de métabolisme
Comment peut-on qualifier les virus à leur état intracellulaire?
Ils ont des fonctions, réactions et molécules caractéristiques des organismes vivants
Pourquoi dit-on que les virus sont des parasites intracellulaires obligatoires?
Car ils monopolisent les activités cellulaires et forcent la cellules à produire des particules virales
Quelle est l’unité infectieuse de base?
Le virion
Vrai ou faux. Il est facile de déterminer l’origine évolutive des virus.
Faux, ils n’ont aucun gène commun
Quels sont les 3 constituants de base du virus?
- Acides nucléiques
- Capside
- Enveloppe
Quels composants des virus sont présents chez tous les virus?
Les acides nucléiques et la capside
Vrai ou faux. On retrouve l’enveloppe chez plusieurs virus.
Vrai
Quels 4 types d’acides nucléiques peut-on retrouver dans les virus?
- ADN:1
- ADN:2
- ARN:1
- ARN:2
Quelles molécules d’acides nucléiques sont toujours absentes de la cellule infectée?
ADN:1 et ARN:2
Comment une cellule hôte peut-elle répliquer de l’ADN:1 ou de l’ARN:2?
En faisant intervenir les enzymes viraux
Quelle est la taille moyenne des acides nucléiques des virus?
4-12 Kb
Combien de Kb possède un gène?
Environ 1
Vrai ou faux. Tous les virus sont haploïdes.
Faux, la plupart le sont, mais il existe quelques diploïdes
Pourquoi dit-on que le génome des virus est fragmenté?
Car il y a des gènes différents pour chaque partie du virus
De quoi est formée la capside des virus?
De capsomères
Qu’est-ce qu’un capsomère?
Un assemblage de protomères (sous-unités protéiques)
Qu’est-ce qui donne la forme aux virions?
La capside
Quelles sont les 3 types de symétrie de capside possibles?
- Polyédrale
- Hélicoïdale
- Binaire
Quel est ce type de capside?
Hélicoïdal
Quel est ce type de capside?
Polyédrale (isocaèdre)
Quel est ce type de capside?
Binaire/mixte
Quels sont les 3 types de capsomères retrouvés dans une symétrie polyédrale?
- Faces
- Arrêtes
- Sommets
Vrai ou faux. Les capsides à symétrie polyédrale ont un rapport surface/volume élevé.
Vrai
Nommer des types de virus avec une capside polyédrale.
Virus de la poliomyélite et virus de la fièvre aphteuse
Combien de type de capsomères retrouve-t-on dans les capsides à symétrie hélicoïdale?
1 seul type
Quelle est l’apparence en microscopie électronique d’un virus à symétrie hélicoïdal?
Un bâtonnet creux
Nommer des types de virus qui ont une symétrie hélicoïdale?
Virus de la mosaïque du tabac, rage, oreillon, rougeole et COVID
À quel type de virus la symétrie binaire est-elle exclusive?
Aux bactériophages
Nommer des types de bactériophages qui ont une symétrie binaire
T paires d’E Coli et DT1 de Streptococcus thermophilus
Quels sont les rôles de la capside?
- Protection de l’acide nucléique
- Attachement à la cellule cible via les protéines de la capside, fibres/spicules ou queue
Où est située l’enveloppe?
À l’extérieur de la capside
D’où provient l’enveloppe du virus?
De la membrane cytoplasmique ou nucléaire de la cellule infectée
De quoi est composée l’enveloppe?
Phospholipides, protéines cellulaires et glycoprotéines virales
Nommer 2 types de glycoprotéines virales de l’enveloppe.
Hémaglutinine et neuraminidase
Quelle partie de l’enveloppe peut être utilisée pour créer un vaccin?
Les glycoprotéines
Quelle forme de capside possède le SARS-COV-2?
Hélicoïdale
Est-ce que le SARS-COV-2 est un virus enveloppé?
Oui
Quels sont les rôles de l’enveloppe?
- Protection
- Reconnaissance des récepteurs spécifiques sur la cellule hôte
- Pénétration/sortie de la cellule hôte
Quel est la fonction de l’hémagglutinine?
Agglutine les globules rouges
Quel est le rôle de la neuraminidase?
Digère l’acide neuramique
Qu’est-ce qu’une nucléoprotéine virale?
Une protéine virale associée avec de l’acide nucléique virale qui est absente de la cellule infectée
Quelles sont les fonctions des nucléoprotéines d’origine virale?
- Empaquetage de l’acide nucléique viral
- Réplication et lecture de l’acide nucléique virale
Est-ce que les protéines internes de la capside sont présentes chez tous les virus?
Non, mais chez plusieurs
Qu’est-ce qui forme la nucléocapside?
Acide nucléique, capside et nucléoprotéines
Est-ce que l’enveloppe fait partie de la nucléocapside?
Non
Quelle peut être la taille d’un virion?
10-400 nm
Quelle est la taille du plus gros virion (mimivirus)?
1000 nm
Vrai ou faux. Il y a augmentation de la taille durant la réplication virale.
Faux
Quelles sont les 5 étapes du cycle viral?
- Adsorption à la surface de la cellule
- Pénétration de la cellule infectée
- Réplication des constituants viraux
- Assemblage des constituants viraux
- Sortie des virus
Est-ce que l’adsorption à la surface de la cellule est une étape réversible?
La reconnaissance oui, mais pas l’attachement
Entre la reconnaissance et l’attachement, quelle étape est la plus spécifique?
L’attachement (la reconnaissance se fait selon des collisions au hasard)
Qu’est-ce qui est spécial concernant le cycle de réplication virale des virus de plantes?
Il y a fusion des 2 premières étapes (pas de récepteurs connus)
Qu’est-ce qui pénètre dans la cellule pour les bactériophages?
Seulement l’acide nucléique, la capside reste à l’extérieur
Quel type de virus peut utiliser le mécanisme de fusion directe?
Les virus enveloppés
Quels sont les 2 mécanismes de pénétration que les virus animaux peuvent utiliser%
Fusion directe et endocytose (viropexie)
Comment se fait la pénétration par fusion directe des virus enveloppés?
Il y a fusion entre l’enveloppe du virus et la membrane cytoplasmique de la cellule infctée, et expulsion de la nucléocapside dans le cytoplasme
Qu’est-ce que la décapsidation?
Libération de l’acide nucléique qui migre au cytoplasme ou au noyau
Qu’est-ce que la phase d’éclipse?
Lorsque le virus est absent au microscope
Quels sont les événements précoces de la réplication des constituants viraux?
Hausse de la quantité d’acides nucléiques et activation des enzymes de réplication ou de lecture de l’acide nucléique
Quels sont les événements tardifs de la réplication des constituants viraux?
Formation des protéines de structures (capsomères, glycoprotéines d’enveloppe, protéine de queue, enzyme de lyse)
À quel moment y a-t-il fin de la phase d’éclipse?
À la fin de l’encapsidation
À quel moment y a-t-il début de la phase d’éclipse?
Lorsque la décapsidation est faite
Comment se fait l’encapsidation des capsides polyédrales?
Il y a interaction capsomères/acides nucléiques et fermeture de la capside
Comment se fait l’encapsidation des capsides hélicoïdales?
Il y a interactions capsomères/acides nucléiques et empilement hélicoïdal
Comment se fait l’encapsidation des capsides binaires?
La queue et la capside s’assemblent de façon indépendante
Est-ce que la phase d’éclipse est plus longue chez les virus animaux ou chez les phages?
Chez les virus animaux (1-10h), chez les phages c’est plutôt 15-20 min
Quels sont les 3 modes de sorties de la cellule du virus?
- Lyse de la cellule
- Bourgeonnement
- Canaux cellulaires
Quels types de virus sortent par lyse de la cellule infectée?
Des virus nus (sans capsides)
Quels types de virus sortent par bourgeonnement?
Des virus enveloppés
Quels types de virus sortent par des canaux cellulaires?
Des virus à réplication nucléaire
Quels modes de sortie de la cellule entraîne une mort cellulaire?
La lyse cellulaire
Quels modes de sortie de la cellule entraîne une survie cellulaire?
Le bourgeonnement et les canaux cellulaires
Combien de virus sont produits en moyenne par une cellule?
103 à 106
Combien de virus (phages) sont produits en moyenne par une cellule infectée par des T paires?
102 à 103
Selon quels critères peut-on faire la classification des virus?
- Hôtes et tissus infectés
- Types d’acides nucléiques
- Présence d’enveloppe
- Processus de réplication des acides nucléiques
- Taille
- Nombre de capsomères
- Propriétés immunologiques
- Nombres de gènes
- Sites de réplication
Quelle type de nomenclature doit-on utiliser pour nommer les virus?
La nomenclature linnéenne
Quel est l’ordre des virus?
Virales
Quelle est la famille des virus?
Viridae
Quel est le genre et espèce des virus?
Virus
Quels sont les 3 modes de culture avec des virus?
- Culture de cellules vivantes
- Oeufs de poulets
- Culture de tissus
Quel type d’oeuf est utilisé pour cultiver les virus?
Un oeuf de poulet embryonné
Qu’est-ce qui arrive lorsqu’on infecte une culture de tissus avec des virus?
Des effets cytopathiques caractéristiques
Quels effets cytopathiques peut-on observer sur les cellules de tissus en culture lorsqu’ils sont infectés par un virus?
- Arrondissement des cellules
- Hausse ou baise de volume
- Agrégation
- Formation de corps d’inclusion
- Lyse
- Formation de syncitia
Quel vaccin a été produit en utilisant une culture de tissus de rein de singe?
Le vaccin Salk contre la Poliomyélite
Quelles sont les 4 méthodes d’identification des virus?
- Microscopie électronique
- Réaction avec anticorps spécifiques
- Infections expérimentales
- Amplification et séquences de l’acide nucléique
Quelle est la plus grande limite dans l’identification des virus?
Temps et argent
Par quelle partie du virus se fait l’acquisition des gènes?
Par la capside
Vrai ou faux. Les virus sont les organismes qui évoluent le plus rapidement.
Vrai
Vrai ou faux. Les virus sont les entités biologiques les plus abondantes dans la biosphère.
Vrai
Dans les océans, combien retrouve-t-on de virions/ml?
106-109 virions/ml
Dans quels cycles de matière sont impliqués les virus?
Cycles du carbone et de l’azote
Quelles sont les fonctions écologiques des virus?
- Contrôle des populations
- Court-circuit des cycles de la matière organique (viral shunt)
Dans quel contrôle de populations les virus agissent-ils?
Dans les marées d’algues rouges et dans les fermentations industrielles
De quoi sont composés les viroïdes?
D’ARN simple brin circulaire
Combien de nucléotides composent le génome des viroïdes?
270 à 380
Quels types de pathogènes sont les viroïdes?
Phytopathogènes
Qu’est-ce qu’un phytopathogène?
Un pathogène qui infecte les plantes
Nommer un exemple de viroïde phytopathogène.
Le tubercule en fuseau de la pomme de terre
Combien y existe-t-il de viroïdes phytopathogènes?
Environ 20
Quelle est la taille du génome des viroïdes comparés aux virus?
10x plus petit que le plus petit virus
Est-ce que les viroïdes possèdent une capside?
Non
Vrai ou faux. Il existe des intermédiaires d’ADN des viroïdes
Faux.
Avec quoi interfèrent les viroïdes?
Avec la régulation génique
Où s’accumulent les viroïdes dans la cellule de l’hôte?
Dans le cytoplasme
Vrai ou faux. L’ARN:1 est fragile dans l’environnement.
Vrai
Comment se fait la transmission des viroïdes?
Transmission cellule-cellule, pollen et abrasion
Pourquoi dit-on que les virusoïdes sont des ARN satellites?
Car ils dépendent de virus auxiliaires
Que fournit le virus auxiliaire au virusoïde?
La capside et/ou l’enveloppe
Quel est le virusoïde le plus connu et quel virus agit comme son auxiliaire?
Le virusoïde de l’hépatite D, auxiliaire est le virus de l’hépatite B
De quoi est formé un virusoïde?
ARN simple brin circulaire jusqu’à 1700 nucléotides
Vrai ou faux. Les viroïdes et les virusoïdes codent pour des protéines.
Faux, les virusoïdes codent pour des protéines, mais pas les viroïdes
Qu’est-ce qu’un virophage?
Un virus infectant d’autres virus
Nommer un exemple de virophage.
Sputnik
De quoi sont composés les prions?
De protéines
Est-ce que les prions ont une capside et des acides nucléiques?
Non
Quelle est la taille d’un prion comparé à un virus?
100 x plus petit qu’un virus
Comment se fait la réplication d’un prion?
Par modification d’une protéine cellulaire (Prpc)
Est-ce que les prions sont très résistants?
Oui, ils résistent à l’autoclave et aux protéases