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PACES Biochimie > la transcription > Flashcards

la transcription Flashcards

1
Q

quelle est la structure I d’un ARN?

A

structure primaire en monobrin d’ARN proche de ADN

  • ose = ribose
  • bases azotées puriques et pyrimidiques
  • acide phosphorique
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Q

quelles sont les structures II et III d’un ARN?

A

structures II et III : établissement de LH entre les bases . la structure II et III peuvent être complxexs

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3
Q

quels sont les trois types d’ARN? quels sont leurs rôles?

A 
ARN m (<5%) : synthèse des protéines
ARNt (15% ) synthèse des protéines
ARNr (80%) structure interne des ribosomes.
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4
Q

quels sont les coefficients de sédimentation des différents ARN?

A

ARNm: coef de sédimentation variable
ARN t = 4s
ARN r = 28 s 18 s 5.8 s 5 s

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5
Q

par quels enzymes sont synthétisés les ARN et à quel niveau de la cellule?

A

ARNm synthétisés par ARN pol II dans nucléoplasme
ARNt snthétisé par ARN pol III dans nucléoplasme
ARN r 28s 18s 5.8s synthétisés par pol Idans le nucléole
ARN r 5s synthétisé par ARN pol III dans nucléoplasme

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6
Q

quelles sont les caractéristiques générales de ARNm?

A

ARN m = ~5% de la totalité des ARN/ produit dans le noyau / monocaténaire + très instables/ continent l’information génétique pour coder une protéine/ codé par brin direct ou tardif / ARNm eucaryotes = monocistronique + besoin de maturation
procaryotes = polycistroniques + pas besoin de maturation.

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7
Q

sur quoi est copié l’ARN?

A

ARN = recopiage d’un brin d’ADN matrice = brin anti sens
ARN a la meme séquence que l’ADN codant (=sens)
MAIS thymines remplacées par Uraciles
brin matrice lu en 3’–> 5’ par ARNpol –> synthèse ARN dans sens 5 ‘–> 3’

attention les 2 brins peuvent coder des protéines.

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8
Q

de quoi sont dépendantes les ARN polymérases

A

ARN pol sont ADN dépendantes –> la synthèse de ARN dépend de matrice ADN

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9
Q

combien y a-t-il d’ARN pol chez les procaryotes et les eucaryotes?

A 
proc = 1 ARN pol
euc  = 3 ARN pol
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10
Q

présenter ARN pol I ( localisation, type ARN, sensibilité a alpha amanitine, sensibilité a actinomycine).

A

ARN pol I dans nucléole + synthèse ARNr 5.8 s + 18s + 28 s

+ insensible à alpha amanitine et sensible à actinomycine

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11
Q

Idem pour ARN pol II

A

ARN pol II dans nucléoplasme + synthèse ARNm

+ très sensible à alpha amanitine et sensible à actinomycine

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12
Q

Idem pour ARN pol III

A

ARN pol II dans nucléoplasme + synthèse ARNr 5s +ARNt

+ peu sensible à alpha amanitine et sensible à actinomycine

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13
Q

de quoi ont besoin les ARN pol pour fonctionner ( préciser pour le cas de l’ARN pol II)

A

activité de ARN pol a besoin de cofacteurs de transcription ARN pol II TF IID

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14
Q

que reconnait l’ARN pol II lors de l’initiation de la transcription des ARNm?

A

ARN pol II reconnait séquence d’ADN spécifique = promoteur

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15
Q

donner les caractéristiques du promoteur.

A

caractéristiques du promoteur
- en amont du site d’initiation
-situé en 5’ du brin codant
-sert pour initier la transcription ADN en ARN
-contient TATAbox( -30 paires de bases) + séquence riche en GC
-séquence variable selon le gène
- contient site de fixation pour prot ( facteurs de transcription)
attention n’est PAS transcrit–> pas de séquence intronique ou séquences codantes
-pas de signal poly adenylation
-activité influencée par elements à distance de celui ci: entrancers +silencers

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16
Q

quel est le rôle de TF-IID?

A

TFIID = cofacteur de transcription –> role = fixation à la TATA box
–> initiation mise en place complexe initiation de transcription.

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17
Q

qu’est-ce que le complexe d’initiation à la transcription?

A

le complexe d’initiation à la transcription regroupe plusieurs facteurs de transcription qui se fixent sur TFIID

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18
Q

comment s’effectue l’élongation de la transcription de l’ADN?

A

élongation des ARNm

  • assuré par ARNpol II ADN dépendante
  • ARN pol II parcourt brin matrice en 3’–> 5’ MAIS synthèse du brin transcrit en 5’–> 3’
  • association de NMP à dNMP par ARN pol II complémentaire et anti parallèle au brin matrice.
  • topoisomérase = ouverture +fermeture de la double hélice d’ADN
  • 1 morceau du transcrit (8pdb) toujours au contact de l’ADN matrice pendant la synthèse –> segment hybride ADN ARN
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19
Q

a quel moment l’élongation de l’ARN m se termine?

A

fin élongation ARNm quand lecture de signaux de terminaison sur ARN
–> ARN pol II libère ADN matrice et ARNm néosynthétisé.

20
Q

combien existe-t-il de mécanismes de terminaison de la transcription de l’ARNm?les nommer.

A

2 mécanismes de terminaison de la transcription:

  • terminaison Rho dépendante
  • Rho indépendante
21
Q

décrire la terminaison Rho dépendante.

A

terminaison Rho dépendante :
facteur de terminaison Rho a activité ARN-ADN hélicase ADP dépendante + signal terminaison porté par ARN nouvellement transcrit.
JAMAIS par ADN.

22
Q

décrire la terminaison Rho indépendante.

A

terminaison Rho indépendante = formation épingle à cheveux arrive au contact de la bulle + met en pause lecture de ARN+ formation LH dans épingle a cheveux déclenche l’arrêt complet de la transcription.

23
Q

quels sont les caractéristiques de la maturation des ARNprém?

A

maturation des ARNprém
conserne QUE les ARN monocistroniques eucarytotes
-dans noyau
-plusieurs étapes : addition de coiffe en 5’ + queue poly A + excision des introns ( = épissage)

24
Q

comment se forme la coiffe en 5’ lors de la maturation des ARNm?

A

formation de la coiffe en 5’

  • hydrolyse du premier NTP en NDP
  • addition GMP a l’extrémité 5’ –> pont triphosphate
  • activation méthyltransférase –> méthylation position 7 du GMP
25
Q

que reconnait le CBC et a quoi sert-il?

A

CBC (cap binding complex) = complxe protéique qui reconnaît coiffe 7 méthyl guanosine
–> prévient les attaques exonucléasiques.

26
Q

quel est le rôle de la coiffe 7 méthyl guanosine?

A

rôle de la coiffe =

  • située en 5’ d’un ARNm mature ou en cours de maturation
  • protège l’ARN m
  • améliore la traduction car recrute certains facteurs d’initiation de la traduction. ( eIF4E)
27
Q

quel est le mécanisme aboutissant à l’addition d’une queue polyA sur ARNm?

A

addition queue pôly A

  • reconnaissance séquence AAUUAA = signal polydénylation par des endonucléases
  • à partir de l’extrémité 3’OH libre gégérée par une coupure une adénylate polyA polymérase ajoute un nombre variable de résidus A (entre 100 et 200)
  • -fixation prot PABP sur la queue de poly A en 3’ de ARNm –> protection de l’ARN
28
Q

la queue polyA est-elle codée par ADN?

A

queue poly A n’est pas codée par ADN , elle n’est pas complémentaire d’une séquence poly T de l’ADN.

29
Q

de quelles sortes de séquences sont formés les gènes?

A

gène codant pour protéines = fragments de séquences exoniques codantes séparées par des introns non codants.

30
Q

qu’arrive-t-il aux introns avant la traduction?

A

avant traduction les introns sont excisés . on ne les retrouve pas dans les ARNm matures cytoplasmiques.

31
Q

donner les caractéristiques de l’épissage.

A

caractéristiques de l’épissage:

  • participe à la maturation des ARNm eucaryotes monocistroniques
  • dans le noyau
  • besoin de séquences concesus : site donneur/ accepteur d’épissage + site de branchement
  • peut générer des ARNm différents par épissage alternatif = un gène donne plusieurs protéines ou plusieurs versions d’une protéine.
32
Q

quelles sont les séquences concensus de l’épissage ?

A

3 séquences concensus d’épissage

  • site donneur ( jonction intron. exon en 5’)–> 2 premières bases de l’intron toujours GU
  • site accepteur ( jonction intron/ exon en 3’) –> 2 dernières bases de intron toujours AG
  • si de branchement 20 à 30 pb en amont de accepteur
33
Q

où commence l’épissage des introns?

A

epissage des introns commence immédiatement après le site donneur d’épissage

34
Q

qu’est-ce que le spliceosome?

A

spliceosome = structure multiprotéines associant plusieurs ribonucléoprotéines chargé d’éliminer les introns pour obtenir ARNm mature.

35
Q

que permet l’épissage alternatif?

A

épissage alternatif = génère plusieurs ARNm aux propriétés différentes ( +- stables/ +-traduit efficacement) et plusieurs protéines différentes. peut être tissus dépendant.

36
Q

combien de protéines peut traduire un ARNm mature?

A

même si l’épissage alternatif permet la synthèse de plusieurs ARNm différents chacun reste monocistronique = 1 ARNm = 1 protéine.

37
Q

quand sont formés les hnRNPs?

A

hnRNPs= formées dès qu’un ARNm ( mature ou non) est produit.

38
Q

à quoi servent les hnRNPs?

A

hnRNPs facilitent la maturation des pré ARN m + transport des ARNm matures vers le cytosol pour leur traduction.

39
Q

quels % représentent les ARNr parmi tous les ARN cellulaires?

A

ARNr = 80% des ARN cellulaires

40
Q

sous quelle forme se présentent les ARNr?

A

ARNr complexé à des protéines dans les SU ribosomales.

41
Q

combien d’ARNr existe-t-il?

A 
4 ARN r matures 
18s
5.8s
28s
5s
\+ 1 pré ARN r = pré ARN 45s
42
Q

quels ARNr appartiennent à la grande sous unité ribosomale?

A

grande SU ribosomale = ARN r 28s + 5.8s + 5s

43
Q

l’ARNr 18s appartient-il a la grande ou la petite SU ribosomale?

A

petite SU ribosomale = 18s

44
Q

dans la formation de quels ARNr intervient l’ARN pol III et quel est le lieu de cette synthèse?

A

ARN pol III = synthèse ARN r 5s dans le nucléoplasme

45
Q

dans la formation de quels ARNr intervient l’ARN pol I et quel est le lieu de cette synthèse?

A

ARN pol i = synthèse ARN r 18 s + 5.8s + 28s dans le nucléole.

46
Q

a quoi sert ARN pré r 45s?

A

pré ARN r se divise en ARN r 18 +5.8 +28

47
Q

quels sont les caractéristiques des ARNt?

A

ARNt
15% des ARN cellulaires
constante de sédimentation 4s
synthèse par ARN pol III dans nucléoplasme
continet des bases modifiées post transcription par méthylation réduction acétylation
se termine par séquence CCA en 3’ / porte acide aminé
participe à la synthèse protéique

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