Krebs Flashcards
Où se déroule le cycle de l’acide citrique?
Dans la matrice mitochondriale.
En état d’hypoxie, il y a accumulation de lactate. Pourquoi?
Car les phosphorylations oxydatives s’arrêtent, tout comme le cycle de Krebs. S’en résulte d’une accumulation de pyruvate qui est changé en lactate. Cela cause une acidose métabolique.
Décrire la molécule d’acétyl-CoA.
La CoA transporte l’acétyl (CH3CO-SCoA). Le lien thioester (très énergétique) se forme sur le gr. thiol du B-mercaptoéthylamine. On y trouve aussi un résidu acide pantothénique (vit B5) et un ADP.
Quelle est la première étape pour que le pyruvate rejoigne le cycle de Krebs?
Il doit d’abord être transporté dans la matrice mitochondriale.
V ou F. La quantité d’énergie nécessaire à la synthèse d’ATP est fixe à 50kJ/mol.
Faux, elle est proche de ce chiffre mais dépend des concentrations en substrats et produits environnants.
Pour transformer le pyruvate en A-CoA, on le fait passer par quel complexe?
Complexe pyruvate déshydrogénase (PDH).
Quels sont les 3 avantages des complexes multi-enzymatiques?
La vitesse est augmentée car la distance entre les sites actifs est réduite. On peut guider les intermédiaires, réduisant les réactions annexes. La régulation peut être coordonnée.
De quoi est composé le complexe PDH?
De E1, E2, E3, ainsi que 5 coenzymes dont deux covalentes: TPP, lipoamide, CoA, FAD, NAD+.
Chez les mammifères, ajouter environ 12 copies de E3BP ainsi que quelques PDH kinase et PDH phosphatase, qui régulent son activité.
À quoi sert la protéine E3BP (E3 binding protein) et où la retrouve-t-on?
Elle lie E3 au coeur de E2, dans le complexe PDH.
Comment se nomme E1 et quelle est sa fonction?
C’est l’enzyme pyruvate déshydrogénase, qui libère un CO2 et fixe le TPP, pour donner du hydroxyéthyl-TPP.
Comment se nomme E2 et quelle est sa fonction?
Elle se nomme dihydrolipoamide transacétylase. Le groupement hydroxyéthyl est transféré au lipoamide et E1-TPP est régénéré.
E2 transfère aussi l’acétyl vers le CoA.
Comment se nomme E3 et quelle est sa fonction?
C’est dihydrolipoamide déshydrogénase. Le dihydrolipoamide a été réduit pendant la réaction qui lie l’acétyl au CoA. On doit le régénérer (retirer 2H). E3 devra aussi être régénérée.
À quoi sert le NAD+ dans le complexe PDH?
À réoxyder E3 après qu’elle ait régénéré la lipoamide de E2.
Quel est l’effet poison de l’arsenic?
Il inactive E2 en se liant à ses S.
Quelle étape du complexe PDH est irréversible?
La première, car elle est trop exergonique, une fois la liaison covalente rompue et le CO2 libéré.
Quels effecteurs allostériques inhibent le complexe PDH?
Les deux produits: acétyl-CoA et NADH, qui compétitionnent pour le site actif (inhibition compétitive par les produits).
Si la synthèse d’acétyl-CoA est renversée, quelle molécule s’accumule?
Au plus, de l’hydroxyéthyl-TPP, puisque le retour au pyruvate serait trop endergonique.
Comment fonctionne la phosphorylation du complexe PDH?
Les PDH kinase et phosphatase sont intégrées au complexe. E1 phosphorylé est inactive.
Que favorise la PDH phosphatase?
La formation d’acétyl-CoA, puisque l’enzyme déphosphoryle E1 et l’active, ce faisant.
Que favorise la PDH kinase?
Elle entraîne le ralentissement de la formation d’acétyl-CoA, puisque la phosphorylation de E1 rend le complexe inactif.
Par quoi est activée la PDH phosphatase?
Le Mg2+, Ca2+
Par quoi est activée la PDH kinase? Inhibée?
Activée par les produits: A-CoA et NADH // Inhibée par ADP (manque d’énergie), pyruvate (trop substrat), Ca2+ et K+.
Quelle est la 1ère réaction du cycle de Krebs? Qu’est-ce qui la caractérise?
Il y a condensation d’oxaloacétate et d’acétyl-CoA pour former du citrate. Elle est irréversible puisque le clivage de l’acétyl-CoA est très exergonique.
