Jedrce Flashcards
Kako je sestavljeno jedrce?
- področje v jedru
- ni obdano z membrano
- znotraj so deli molekul DNA (kromosomov), ki vsebujejo grene za rRNA
Kaj poteka v jedrcu?
- sinteza ribosomskih podenot
Od česa so odvisni velikost, oblika in število jedrc v jedru?
- od aktivnosti celice
- od faze celice, v kateri se nahaja
Koliko jedrc je v začetku faze G1?
- jedrc je 10 -> 2 za vsak akrocentričen kromosom (celica se pripravlja na replikacijo DNA)
* - na koncu se jedrca združijo: FUZIJA JEDRC
Kateri procesi potekajo v jedrcu?
- transkripcija
- procesiranje prekurzorske rRNA
- združevanje različnih RNA ter proteinov v RNP
Katera stvar sintetizira RNA?
- različni tipi RNA polimeraz
Na katere 3 dele razdelimo jedrce?
- nitasti / fibrilarni
- zrnali / granulirani
- vmesni / intermediarni
Kaj se nahaja v nitastem delu jedrca?
akrocentrični kromosomi z geni, ki vsebujejo zapis za rRNA
Kaj se nahaja v zrnatem delu jedrca?
ribosomski proteini in podenote ribosomov
Kaj je vmesni del?
- strukturni prehod med nitastim in zrnatim delom
Kje v jedru se oblikuje jedrce?
- v predelu, kjer so kromosomi z geni za molekule rRNA
Na katera dela delimo nitasti/fibrilarni del?
- zgoščen nitasti del
- center nitastega dela
Opiši zgoščen nitasti del (fibrilarni del)?
- poteka transkripcija rRNA kodirajočih genov
- začetek procesiranja pre-rRNA
Opiši center nitastega dela (fibrilarni del)?
- geni za DNA, ki kodirajo rRNA (rDNA)
- odseki akrocentričnih kromosomov 13, 14, 15, 21, 22 (in 1, ki ni v jedrcu)
- nukleolarni organizacijski centri 13, 14, 15, 21, 22
Opiši zrnat del jedrca?
- dokončno procesiranje pre-rRNA
- urejanje rRNA in proteinov v ribosomske podenote
*
Nastajanje: - telomeraz
- RNP (sodeluje pri procesiranju mRNA v jedru)
- ribonukleoproteinskih delcev
- SRP (sodeluje pri translaciji v citosolu)
V jedrcu nastajajo tudi SRP in nRNP. Opiši ju.
A) SRP: sodelujejo pri translaciji, ker omogočajo vezavo ribosoma z mRNA na ER
B) nRNP: sodelujejo pri procesiranju mRNA iz pre-mRNA
Primer česa je sinteza holesterola s povratno zanko?
transkripcija
Kontrola koncentracije holesterola na ravni ER ima v membrani 2 transmembranska proteina. Katera?
- SREBP
- SCAP
Kaj se zgodi s holesterolom pri transkripciji, ko ga je dovolj?
- veže se na SCAP
Kaj se zgodi s holesterolom pri transkripciji, če raven pade?
- SCAP je brez vezanega holesterola
- od ER se odcepi vezikel, ki ima na svoji membrani spremenjeno obliko SCAP brez holesterola in je povezan s SREBP
- vezikel vstopi v GA
- GA proteaze cepijo SREBP, sprosti se citosolna domena
- citosolna domena ima SREBP in jedrni lokalizacijski signal - z vezavo na importine vstopi v jedro
- v jedru citosolna domena SREBP postane transkripcijski faktor za encime, ki sodelujejo pri transkripciji encimov za sintezo holesterola
- mRNP se iz celice izloči z eksportini
- ko se mRNP sprosti iz eksportina v citosolu, omogoča sintezo holesterola (sintetizira se na ribosomih, prosto v citosolu)
Kje se označujejo lokusi genov za rRNA in kako jih označujemo?
- na delih DNA, ki jih označujemo kot nukleolarno organizacijsko regijo oz. rDNA
Kje najdemo do 200 zapisov za sintezo rRNA?
Zakaj?
- na akrocentričnih kromosomih
* - za rRNA nimamo multiplikatornih sistemov (npr. ena mRNA sintetizira več enakih encimov)
Kje najdemo gene za rRNA?
na enem odseku, enega za drugim
Na katere regije je razdeljen kromosom?
na intronske in ekstronske regije
Kaj vsebuje gen za rRNA?
- zapis za 3 oz. 4 vrste rRNA
- vse se prepisujejo z RNA polimerazo I
* - 5.8S velika podenota ribosoma (60S)
- 18S mala podenota ribosoma (40S)
- 28S velika podenota ribosoma (60S)
- dodatna 5S -> zapis na kromosomu 1 (ni v jedrcu), prepisuje se z RNA polimerazo III
Kako poteka sinteza RNA?
- preRNA (45S): transkripcija s pomočjo RNA polimeraze I, razen za 5S (RNA polimeraza III)
- procesiranje v zrelo rRNA: izraz intronov -> dobimo 4 tipe rRNA : 18S, 5.8S, 28S, 5S
- nastale rRNA se povežejo z ribosomskimi proteini (geni na drugih mestih) -> nastanejo ribosomski partikli
- ribosomski partikli se v jedru procesirajo in nastajajo ribosomske podenote
Kako se tvorijo ribosomske podenote?
- 18S rRNA + proteini = mala podenota 40S -> mala podenote približa kodon in antikodon, omogoči njuno povezavo
- 5S + 5.8S + 28S + proteini = velika podenota 60S -> velika podenota katalizira nastanek peptidne vezi
Kje in v kaj se povežeta mala (40S) in velika (60S) podenota?
- v citoplazmi
- povežeta se v ribosom
-> proteini dajejo ribosomu obliko
-> rRNA ima strukturno in katalitično funkcijo
Kaj sodeluje pri procesiranju in kemijskih modifikacijah pre-rRNA?
- snoRNA (small nucleolar RNA)
Kaj je funkcija snoRNA?
- prepozna specifične sekvence na pre-rRNA
- lahko povzroči spremembo uracila v psevdouridin in metilira ribozo, kar omogoči nastanek rRNA
Kje najdemo prokariontske kromosome?
Kakšni so?
- v mitohondrijih
- je manjši, hitrejši, manj natančen
Katere oblike polimeraz poznaš?
- RNA polimeraza I: rDNA -> rRNA
- RNA polimeraza II: DNA -> mRNA
- RNA polimeraza III: DNA -> tRNA
