Introduction à la microbiologie et aux microorganismes Flashcards
Les grandes catégories de microorganismes
Bactéries
Champignons
Parasites
Virus
Prions
Bactérie structure, reproduction, paroi
Unicellulaire
Fission binaire
Paroi peptidoglycans
Champignon structure, reproduction, paroi
Unicellulaire ou pluricellulaire
Fission binaire ou reproduction sexuée
Parois chitine
Parasite structure, reproduction, paroi
Unicellulaire ou pluricellulaire
Fission binaire ou reproduction sexuée
Complexité variable jusqu’à petits animaux
Virus structure, reproduction, paroi
Acellulaire
Réplication via machinerie génétique de l’hôte
Capside +/- enveloppé
Prion structure, reproduction, paroi
Protéine (ø matériel génétique)
Réplication via machinerie génétique de l’hôte
Aucune
Bactérie relation avec l’hôte
Free-living (Intracellulaire facultatif ou obligatoire)
Champignon relation avec l’hôte
Free-living (Intracellulaire facultatif)
Parasite relation avec l’hôte
Free living
Virus relation avec l’hôte
Intracellulaire obligatoire
Prion relation avec l’hôte
Intracellulaire obligatoire
Différents types relation hôte et agent infectieux
1.Commensal (ø dommage/bénéfice hôte ou agent infectieux)
2.Saprophyte (bénéfice agent infectieux, ø dommage hôte)
3.Parasite (bénéfice agent infectieux, dommage hôte)
4.Symbiose (bénéfice hôte et agent infectieux)
Différence microorganismes colonisant vs pathogène
colonisant :
-microorganisme vivant surface interne ou externe corps
-commensal, saprophyte, symbiose (ø dommage hôte)
pathogène:
-obligatoire vs opportuniste
-dommage hôte = parasite
Pathogène obligatoire
Infection de tous les hôtes
Pathogène opportuniste
Infection seulement si hôte immunodéprimé
Les 4 grandes modalités diagnostiques dans un labo de microbiologie
- Examen direct
- Culture
- Immunodiagnostic (ex. détecter présence anticorps)
- Diagnostique moléculaire
Les grandes classes de champignons pathogènes
Levures (candida, cryptococcus, malassezia)
Dimorphes (entre les 2)
Filamenteux (hyalins, dématiés)
Caractéristiques levure Candida spp.
Unicellulaire
+ gros qu’une bactérie (5-8 microns)
Ovale ou ronde
Réplication par bourgeonnement
Colonise peau, muqueuses, TGI
Candidose oropharyngée
-Atteinte muqueuse orolabiale
-Plaques blanches ou rougeurs peuvent être absentes
-Généralement facteur prédisposant (antibiotiques, corticostéroïdes inhalés, immunosupression), mais peut-être premier symptôme d’une maladie non diagnostiquée
-Attention imitateurs, cas sévères
Traitement candidose oropharyngée
1 Nystation rince-bouche (polyène)
#2 Fluconazole (voriconazole, posaconazole) si plus sévère ou répond pas au rince bouche
Traitement vulvovaginite Candida
Si 1er épisode : référer MD
Si épisodes semblables, traitement vente libre
#1 Clotrimazole (topiques) min 3 jours crème ou ovule vaginal et peut-être - efficace vu agit pas en intérieur
#2 fluconazole 1 dose 150 mg (per os) (attention si enceinte, azolés danger foetus)
Vulvovaginite Candida
Femme post pubère
Même facteurs risque de candidose oropharyngée sauf récidives fréquentes sans explication
-Homme = balanite
- symptômes : érythème, douleur +/- écoulement blanchâtre
Candida infections systémiques traitement
Azoles
Echinocandins
Polyènes (Nystatin, Amphotéricine B)
5-fuorocytosine (5-FC) ( combinaison seulement)
Infection candida
-Colonise peau, intention, muqueuses
-Opportuniste associée avec antibiotiques, immunosupression
-Infections endroits humides (ongles, peau (plis), muqueuses buccale (+/- oesophage ) et génitale)
-Infections sites profonds
Quand peut-t-on offrir traitement en vente libre pour candida
Topique vente libre ok si
Candidose oropharyngée ou vulvovaginite non-compliquée (récidive) chez des gens en bonne santé
Quand référer toujours au MD candida
Immunosupprimés
Grossesse
Symptômes sévères
Difficultés à s’alimenter, uriner
Caractéristiques levures cryptococcus
Levure encapsulée
Environnement (oiseaux, végétaux), cosmopolite
Inhalée -> pneumonie -> méningoencéphalite
Infection cutanée, urinaire
Traitement : Fluconazole ou amphotéricine B +/- 5-FC
Caractéristiques levures malassezia
Levure humaine ou animale
Lipophile
Infection cutanées (surtout thorax)
Pityriasis versicolor (infection) ( hyper ou hypopigmentation cutanée, tronc > membre)
Autres infections : dermatite séborrhéique, pellicules, fungémie rare (intralipide)
Traitement pityriasis versicolor
Topique (à connaître) :
Selenium sulfide 2.5 % (ou Selsun Blue 1 %)
Ketoconazole (Nizoral)
Clotrimazole 1 %
Systémique (rare):
Fluconazole
Itraconazole
Caractéristiques champignons filamenteux
Pluricellulaires
Hyphes
Organes de fructification
Aspect duveteux
Levures vs filamenteux
-Unicellulaire vs pluricellulaire
-Bourgeonnement vs nymphes et organes fructification conididies (spores)
-Colonisant humain > environnement (sauf cryptococcus) vs colonisant environnement > humain
-Infx immunosuprimés et immunocomptés vs immunosupprimes»_space; immunocompétents
-superficielles ++ vs profondes ++
Traitement de choix pour les aspergillus
Voriconazole
Champignons filamenteux Dermatophytes
Infection surface peau, poils, cheveux, ongles
Via personne à personne, animaux ou fomites(surfaces, objets)
Infecte gens système immunitaire normal
Démartophytes présentation cliniques
Tinea capitis
“ barbae
“ manum
“ unguium
“ cruris
“ pedis
“ corporis
Traitement dérmatophytes
1 Allylamine -> Terbinafine (Lamisil) (Topique ou po)
#2 Clotrimazole (topique) (azoles)
griséofulvine
Si peau et non sévère -> traitement topique
Tous les autres -> systémique
Facteurs de risque aspergillose invasive
-Immunosuppression prolongée et profonde
-environnement riche en coniques d’Aspergillus (rénovation, agriculture)
diagnostic aspergillose invasive
Symptômes respiratoire (toux, dyspnée, douleur thoracique, hémoptysie)
Fièvre
Lésions cutanées/autres ogranes
Culture liquide/tissus infecté
Tests antigéniques sanguins ou sur liquide bronchique (galactomannan)
Aspergillose traitement
1 voriconazoles
azoles (sauf fluconazole)
débuter rapidement
diminuer immunosuppression si possible
+/- chirurgie
Aspergillus
Champignon de l’environnement
Acquisition par inhalation surtout
Chez patients immunosupprimés
Surtout poumons
Traitement : azoles (sauf fluconazole)
Levures
colonisant peau et muqueuses
infections superficielles et profonde
antifongiques efficaces : tous (sauf echinocandin et cryptocoque)
topique ou systémique selon sévérité