Introducción bioquímica Flashcards

1
Q

¿Qué es la bioquímica?

A

Ciencia que estudia los procesos químicos y fisicoquímicos de los organismos vivos

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2
Q

Según la NASA, ¿Cuál es la definición de “vida”?

A

Es un sistema químico autosustentable capaz de evolucionar (darwinista)

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3
Q

La vida es un sistema químico altamente complejo, sus características son:

A
  • Está compuesto de carbono
  • Reacciones en medios acuosos
  • Necesita energía
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4
Q

¿Qué estructuras celulares comparten todas las células?

A

Compartimientos, membrana plasmática, citoplasma, material genético y membrana nuclear.

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5
Q

Para el estudio de la bioquímica se requieren fundamentos:

A

Celulares, químicos, físicos y genéticos.

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6
Q

¿Qué es el protoplasma?

A

Representa a la materia viva.
Incluye al citoplasma y núcleo.
En él ocurren las reacciones químicas que modifican sustancias que llegan como resultado de su intercambio constante con el exterior.

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7
Q

¿Qué es la bioquímica estática?

A

Estudio de las sustancias que componen la materia viva.
-Investiga las transformaciones que ocurren en las sustancias, desde el momento de su entrada hasta su devolución al exterior

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8
Q

¿Qué son las enzimas?

A

Son biocatalizadores que aceleran las reacciones:

-actúan bajo condiciones fisiológicas específicas de temperatura, presión, acidez y otros factores

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9
Q

¿Qué es la bioquímica dinámica?

A

Conjunto de las transformaciones

-Reacciones de síntesis y degradación del metabolismo

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10
Q

Es el objeto de estudio más importante de la bioquímica

A

El metabolismo

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11
Q

Los organismos se clasifican de acuerdo a la fuente de la cuál obtienen energía en:

A
  • Fotótrofos (energía de la luz)

- Quimiótrofos (energía de la oxidación de combustibles químicos)

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12
Q

Los fotótrofos a su vez se subdividen según su fuente de carbono en:

A
  • Autótrofos (carbono del CO2)

- Heterótrofos (carbono de compuestos orgánicos)

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13
Q

Los quimiótrofos a su vez se subdividen en:

A
  • Litótrofos (combustibles inorgánicos)

- Organótrofos (combustibles orgánicos)

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14
Q

La estructura celular se ensambla a partir de subunidades:

A
  • Monómeros
  • Uniones covalentes
  • Interacciones no covalentes
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15
Q

¿Qué son las biomoléculas?

A

Compuestos de carbono con grupos funcionales variables

*esto es posible gracias a la versatilidad del carbono

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16
Q

Si fueran enlaces iónicos en vez de covalentes, al entrar en contacto con H20 se:

A

Disolverían

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17
Q

De los grupos funcionales de las biomoléculas, para la célula surgen:

A

Compuestos del compartimiento citoplasmático

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18
Q

¿Qué es un metaboloma?

A

Conjunto de metabolitos en una célula que participan en vías o procesos

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19
Q

Los átomos de carbono pueden formar dobles enlaces entre ellos que permiten la libre rotación, verdadero o falso:

A

Falso (los enlaces dobles fijan los átomos de carbono)

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20
Q

¿Cuál es la subunidad monomérica a partir de la cuál se ensamblan las proteínas y los ácidos nucleicos?

A

Proteínas: aminoácidos

Ácidos nucleicos: nucleótidos

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21
Q

La células se componen principalmente de H20 y macromoléculas que son:

A

Proteínas, ácidos nucleicos, lípidos y polisacáridos.

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22
Q

La función de una biomolécula depende de:

A

Sus grupos funcionales y su estereoquímica (configuración molecular)

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23
Q

Las interacciones entre moléculas son ____, y requieren configuraciones determinadas entre las moléculas que interactúan.

A

estereoespecíficas

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24
Q

Los estereoisómeros se subdividen en:

A

Isómeros geométricos (cis, trans)

Isómeros ópticos (enantiómeros, diastereoisómero)

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25
Q

¿Qué es un enantiómero?

A

Compuestos de carbono con los mismos enlaces químicos, pero diferente configuración.

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26
Q

¿Qué es un carbono/centro quiral?

A

Un carbono con 4 sustituyentes distintos

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27
Q

¿Cómo calcular el número de configuraciones posibles?

A

2ⁿ

*n= número de carbonos quirales

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28
Q

¿Cuál es la diferencia entre los enantiómeros y los diastereoisómeros?

A

Los enantiómeros son imagen espejo, y los diastereoisómeros no son imagen espejo.

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29
Q

El arreglo espacial puede tener diferentes posiciones en el espacio por la libertad de rotación de los enlaces:

A

simples

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30
Q

¿Qué es un sitio activo?

A

Donde ingresa el metabolito para liberar el producto.

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31
Q

Las células requieren energía para:

A

Hacer síntesis, moverse y expresar información genética.

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32
Q

Los organismos vivos están en dynamic steady state; no están en equilibrio con el ambiente. Verdadero o falso.

A

Verdadero

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33
Q

Los organismos vivos son sistemas de tipo___ porque intercambiamos energía y materia con el ambiente.

A

abiertos

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34
Q

Los organismos vivos se rigen por la __ y __ ley de termodinámica.

A

1ra: energía constante, no se crea ni destruye, sólo se transforma.
2da: Universo tiende al desorden; necesitamos energía para evitarlo (por que si no morimos)

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35
Q

Los sistemas biológicos liberan productos menos organizados lo que ___la entropía del Universo.

A

Aumenta

36
Q

Los sistemas biológicos sintetizan macromoléculas complejas y almacenan y replican la información, lo que ___la entropía del Universo.

A

Disminuye

37
Q

¿Cuáles son las características del agua?

A
  • Es solvente polar
  • Cada H comparte un par de e- con el oxígeno
  • Orbitales sp3
  • La estructura y función celular están adaptados para ocurrir en ella
38
Q

En el agua líquida, los puentes de hidrógeno ___, no hay orden y es un modelo _____

A

Se doblan

Modelo continuo uniforme

39
Q

Proveen la fuerza cohesiva que convierte el agua sólida en un líquido a temperatura ambiente

A

Los puentes de hidrógeno

40
Q

Las biomoléculas se clasifican en:

A
  • Polares (interacción H20-soluto, adheridas a la molécula)

- No polares (interacción hidrofóbica, alejadas de la molécula)

41
Q

¿Cuál es más electronegativo, el hidrógeno o el oxígeno?

A

El oxígeno

42
Q

Por su arreglo espacial, cada H2O sólida puede formar __ puentes de hidrógeno, mientras que en estado líquido forma solamente __.

A

Sólido: 4

Líquido: 3.4-3.5

43
Q

El agua es un solvente polar porque:

A

disuelve biomoléculas polares y sales

44
Q

El agua forma puentes de hidrógeno con:

A

Fl, O, N

45
Q

¿Qué son los compuestos anfipáticos?

A

Contienen regiones externas polares (interactúan con el H2O) e internas no polares (hidrofóbicas)

-Forman micelas

46
Q

Son cruciales para la estructura y función macromolecular:

A
  • Puentes de hidrógeno
  • Fuerzas de Van der Waals
  • Interacciones hidrófobas
47
Q

¿Qué es la ionización?

A

La constante producción que tiene el H2O para formar H+ y OH-

*kw= 1.0 x 10-14

48
Q

¿Por qué no existen los protones libres en las soluciones?

A

Porque los iones H+ son hidratados para formar iones hidronio:

(H+) + H2O= H3O

49
Q

¿Cuáles son los ácidos débiles en los aminoácidos y en los nucleótidos?

A

Aminoácidos: grupos amino y carboxilo

Nucleótidos: grupos fosfato

50
Q

La conformación de una molécula no puede ser aislada, debido a que son interconvertibles. Verdadero o falso.

A

Verdadero.

51
Q

Las alfa hélices son solubles en H2O, verdadero o falso.

A

Verdadero.

52
Q

¿Qué es el metabolismo?

A

Es la interconversión de compuestos químicos en el cuerpo, por vías:

  • anabólicas
  • anfibólicas (ciclo de krebs)
  • catabólicas
53
Q

¿Qué puede ocasionar una alteración en el metabolismo?

A

Ayuno prolongado, ejercicio, embarazo, deficiencia enzimática o nutricional, secreción anormal de hormonal.

54
Q
¿Cuántos genomas poseen los siguientes organismos?
VIH
Mycoplasma genitalium
Mus musculus
Humano
A

VIH: 9
Mycoplasma genitalium: 525
Mus musculus: 20,210
Humano:25,000

55
Q

El tamaño de los genomas depende de:

A

La cantidad de proteínas que dicho organismo requiere para cumplir su ciclo de vida

56
Q

¿Qué es un enlace covalente?

A

Es una unión química que involucra el compartir pares de e- entre átomos (pares compartidos o pares de unión)
El compartir le permite a cada átomo adquirir el equivalente a un orbital externo completo, es decir, tener una configuración electrónica estable.

57
Q

¿Cuáles son los tipos de enlaces covalentes?

A
  • Enlaces sigma (los más fuertes) que se llevan a cabo cuando hay una sobreposición de frente entre los orbitales de dos átomos distintos
  • Enlaces Pi son más débiles y se deben a la sobreposición lateral entre orbitales p (o d).
58
Q

El enlace simple tiene enlaces del tipo:

A

Sigma

59
Q

El enlace doble tiene enlaces del tipo:

A

Consiste de una unión sigma y una Pi.

60
Q

El enlace triple tiene enlaces del tipo:

A

Consiste de una unión sigma y dos Pi.

61
Q

Un enlace covalente no polar es la unión de :

A

Dos átomos con electronegatividad idéntica

62
Q

Un enlace covalente polar es la unión de:

A

Dos átomos con electronegatividad desigual

63
Q

Responsable del punto de ebullición tan alto del agua

A

Puentes de hidrógeno

64
Q

Son fuerzas mucho más débiles, y más susceptibles a sufrir perturbaciones, que se disipan cuando hay mayores distancias entre las moléculas que interactúan

A

Fuerzas de van der Waals:

65
Q

La fuerza de dispersión de Londres ocurre entre dipolos:

A

Inducidos instantáneamente

66
Q

La fuerza electrostática se describe como la ley de ___,

A

Coulomb.

67
Q

En un medio acuoso, la interacción no covalente más fuerte es _______ el cual puede llegar a tener una fuerza de hasta 44 kj/mol.

A

El puente de hidrógeno,

68
Q

Tipos de transformaciones de energía que pueden ocurrir en una célula:

A
  • Energía química a mecánica: ATP-sintasa para producir ATP.
  • Energía química en calor: Liberación de calor durante la cadena de transporte de electrones.
  • Energía mecánica a química: Movimiento de la ATP- sintasa para hidrolizar ATP.
  • Energía química a cinética: Movimiento de actina sobre la miosina mediante la hidrólisis del ATP durante la contracción muscular.
69
Q

La reacción catalizada por la peptidil transferasa para crear un enlace peptídico ¿es energéticamente favorable?

A

Por si sola no lo es, requiere la adición de energía en la forma de GTP para poder ocurrir.

70
Q

¿Cómo podemos usar el acoplamiento de reacciones para propiciar una reacción energéticamente desfavorable?

A

Las células acoplan estas reacciones endergónicas con exergónicas, dando un proceso total que es exergónico:
-la suma de los ΔG de todas las reacciones involucradas da como resultado un número negativo.

*La fuente energética usada es la energía liberada por la ruptura de enlaces fosfoanhidrídos, como los presentes en el ATP y el GTP.

71
Q

Las moléculas de agua están constantemente intercambiando protones unas con otras ¿Qué iones resultan de este intercambio? ¿Cuál de estos iones tiene mayor concentración en una solución de agua pura?

A

Resultan los iones hidronio (H3O) y los iones hidroxilo (OH)
-Hay exactamente la misma concentración de ambos.

72
Q

¿Qué es un ácido?

A

Es un donador de protones

Ejemplo: ácido clorhídrico (HCl), el cual se disocia casi
totalmente en agua para dar H+ y Cl-

73
Q

¿Qué es una base?

A

Es un aceptor de protones

Ejemplo: NaOH que se ioniza completamente para dar iones OH-, los cuales son capaces de aceptar protones

74
Q

¿Qué es osmolaridad?

A

Se refiere a la concentración de una sustancia en una solución.

75
Q

¿Qué es ósmosis?

A

Proceso mediante el cual un disolvente se mueve a través de una membrana semipermeable.

76
Q

El agua en una célula isotónica:

A

Entra y sale (equilibrio)

77
Q

El agua en una célula hipotónica:

A

Entra

78
Q

El agua en una célula hipertónica:

A

Sale

79
Q

Los puentes de hidrógeno forman ___ dipolos de la molécula.

A

2: uno en cada enlace H-O

80
Q

Los puentes de hidrógeno están constantemente rompiéndose y formándose en moléculas adyacentes “flickering clusters”, V/F

A

Verdadero

81
Q

Los puentes de hidrógeno tienen mayor fuerza cuano están en:

A

Línea recta

82
Q

Son más fuertes que una interacción de van der Waals, pero menos fuertes que un enlace iónico o covalente

A

Puentes de hidrógeno

83
Q

Son responsables de las características físicas y químicas peculiares de los compuestos de N, O y Fl.

A

Puentes de hidrógeno

84
Q

En este tipo de fuerzas, la interacción es dependiente de distancia entre átomos o moléculas.

A

Fuerzas de van der Waals

85
Q

Este tipo de fuerza también se aplica a veces para referirse a la fuerza Debye (entre un dipolo permanente y su dipolo inducido correspondiente) o la fuerza Keesom (entre dipolos moleculares permanentes)

A

Fuerzas de London

86
Q

Fuerzas que parecen ser muy débiles, pero en algunos tipos como la
fuerza entre un electrón y un protón que en conjunto componen un átomo de hidrógeno son muy fuertes.

A

Fuerza electrostática

87
Q

Las alfa hélices mantienen su forma gracias a la presencia de fuerzas del tipo:

A

Puentes de hidrógeno