Intra - B

Question 1

Qu’est-ce que la transcription et quel rôle joue-t-elle dans l’expression des gènes?

Answer 1

La transcription est le processus par lequel l’ADN est copié en ARN par l’ARN polymérase. Elle permet de convertir l’information génétique de l’ADN en une molécule d’ARN messager (ARNm) qui sera utilisée pour la traduction en protéines. La transcription est la première étape de l’expression génique.

Question 2

Quelle est la différence entre le brin codant et le brin matrice lors de la transcription?

Answer 2

Le brin matrice (ou brin non-codant) est le brin d’ADN utilisé comme modèle par l’ARN polymérase pour synthétiser l’ARN.

Le brin codant (ou brin sens) a la même séquence que l’ARN transcrit (à l’exception de l’uracile qui remplace la thymine), mais il n’est pas directement lu par la polymérase.

Question 3

Dans quelle direction se déplace l’ARN polymérase le long du brin matrice, et dans quelle direction est synthétisé l’ARN?

Answer 3

L’ARN polymérase se déplace le long du brin matrice dans la direction 3’ → 5’, et l’ARN est synthétisé dans la direction 5’ → 3’.

Cela signifie que les nucléotides sont ajoutés à l’extrémité 3’ de l’ARN en cours de synthèse.

Question 4

Qu’est-ce qu’une liaison phosphodiester et comment se forme-t-elle durant la transcription?

Answer 4

Une liaison phosphodiester est une liaison covalente qui unit les nucléotides dans une chaîne d’ARN ou d’ADN. Elle se forme lorsqu’un groupe hydroxyle (–OH) en 3’ d’un nucléotide attaque le groupe phosphate en 5’ d’un nucléotide entrant, libérant une molécule de pyrophosphate (PPi) et formant une chaîne continue.

Question 5

Quelle est la source d’énergie pour la formation des liaisons phosphodiester lors de la synthèse d’ARN?

Answer 5

L’énergie nécessaire pour former les liaisons phosphodiester provient de l’hydrolyse des nucléotides triphosphates (NTPs) en nucléotides monophosphates (NMPs). La libération du pyrophosphate (PPi) génère l’énergie qui catalyse la liaison entre les nucléotides.

Question 6

Pourquoi l’ARN polymérase est-elle capable de synthétiser un ARN sans amorce?

Answer 6

Contrairement à l’ADN polymérase, l’ARN polymérase n’a pas besoin d’une amorce car elle peut directement initier la synthèse de l’ARN à partir d’un simple brin d’ADN. Elle reconnaît une séquence spécifique du promoteur en amont du gène pour commencer la transcription.

Question 7

Qu’est-ce que la région hybride ADN-ARN observée dans le complexe de transcription?

Answer 7

La région hybride ADN-ARN est la zone au sein de la bulle de transcription où l’ARN synthétisé est temporairement apparié au brin matrice de l’ADN. Cette région est ensuite déplacée et l’ARN est libéré alors que la bulle de transcription progresse le long de l’ADN.

Question 8

Comment l’ARN polymérase maintient-elle la structure de la bulle de transcription?

Answer 8

L’ARN polymérase sépare les deux brins d’ADN pour créer la bulle de transcription, puis réenroule les brins après le passage de l’enzyme.

Elle stabilise cette structure en interagissant avec l’ADN double brin en amont et l’ARN simple brin en aval, tout en avançant le long de la matrice.

Question 9

Quelle est la différence entre une ARN polymérase simple et une ARN polymérase multiprotéique?

Answer 9

- Simple : composée d’une seule sous-unité, comme celles retrouvées dans certains virus.

- Multiprotéique : comme celles des bactéries et des eucaryotes, est composée de plusieurs sous-unités qui coopèrent pour réaliser la transcription et réguler l’expression des gènes.

Question 10

Pourquoi la direction de la transcription est-elle importante pour l’orientation des gènes?

Answer 10

La direction de la transcription détermine quel brin de l’ADN sert de matrice. Si l’orientation de la transcription est inversée, le brin opposé sera utilisé, ce qui produira un ARN avec une séquence différente. L’orientation correcte est cruciale pour produire les bons transcrits et éviter des erreurs d’expression génique.

Question 11

Quelles sont les trois grandes étapes de la synthèse des ARN?

Answer 11

L’initiation, l’élongation, et la terminaison.

Ces étapes se succèdent pour permettre à l’ARN polymérase de se fixer sur le promoteur, de transcrire l’ARN le long de la matrice d’ADN, et de libérer l’ARN nouvellement formé.

Question 12

Que se passe-t-il durant l’initiation de la transcription?

Answer 12

L’initiation commence par la liaison de l’ARN polymérase au promoteur du gène. Ensuite, l’ARN polymérase déroule localement l’ADN pour créer une bulle de transcription. Une courte séquence d’ARN de 2 à 9 bases est synthétisée et souvent relâchée plusieurs fois avant que la polymérase ne s’engage pleinement dans l’élongation.

Question 13

Qu’est-ce que l’initiation abortive et pourquoi se produit-elle?

Answer 13

L’initiation abortive se produit lorsque de courtes chaînes d’ARN (2-9 nucléotides) sont synthétisées et relâchées avant que l’ARN polymérase ne passe en mode élongation. Cela se produit souvent pendant les premières étapes de la transcription, car la polymérase doit se stabiliser et libérer son site de départ avant de poursuivre l’élongation.

Question 14

Quelles transformations se produisent durant l’étape d’élongation?

Answer 14

Durant l’élongation, l’ARN polymérase progresse le long de l’ADN matrice, ajoutant des nucléotides complémentaires à l’extrémité 3’ de l’ARN en formation. La région d’ADN déroulée avance avec l’enzyme, tandis que la région répliquée se réenroule immédiatement après le passage de l’ARN polymérase, ce qui maintient la structure globale de l’ADN intacte.

Question 15

Que se passe-t-il pendant la terminaison de la transcription?

Answer 15

Lors de la terminaison, l’ARN polymérase atteint une séquence de terminaison sur l’ADN. Cette séquence provoque la dissociation de l’ARN polymérase, la libération de l’ARN nouvellement formé, et la réformation complète de la double hélice d’ADN.

Question 16

Comment les étapes de la transcription peuvent-elles être visualisées par microscopie électronique?

Answer 16

La microscopie électronique permet de visualiser les différentes étapes de la transcription grâce à des images des gènes en cours de transcription.

Les fibrilles d’ARN (structures en forme de “brosses”) sont visibles à partir des sites d’initiation jusqu’aux sites de terminaison, indiquant la progression de l’ARN polymérase et l’élongation de l’ARN.

Question 17

Que représentent les chromosomes en “brosse de cheminée” du Triton?

Answer 17

Les chromosomes en “brosse de cheminée” observés par microscopie électronique montrent des structures où plusieurs ARN polymérases transcrivent simultanément le même gène, créant une apparence en brosse. Chaque “poil” de la brosse représente un ARN en cours de synthèse.

Question 18

Comment peut-on distinguer les sites d’initiation et de terminaison de la transcription sur les images de microscopie?

Answer 18

Les sites d’initiation sont caractérisés par de courts ARN, formant de petites fibrilles près de la région de départ du gène. À mesure que la transcription progresse, les ARN deviennent plus longs, atteignant leur longueur maximale au site de terminaison, où ils sont ensuite relâchés.

Question 19

Quelles sont les sous-unités principales de l’ARN polymérase bactérienne et quelles sont leurs fonctions?

Answer 19

• α (alpha) : Liée à la reconnaissance du promoteur et à la régulation.
• β (bêta) : Impliquée dans la liaison aux nucléotides et la catalyse.
• β’ (bêta prime) : Interagit avec l’ADN matrice.
• σ (sigma) : Facteur d’initiation, nécessaire pour le ciblage du promoteur et le démarrage de la transcription.

Question 20

Quelle est la différence entre les sous-unités du cœur de l’enzyme (core enzyme) et le facteur sigma?

Answer 20

Les sous-unités α, β, et β’ constituent le cœur de l’enzyme (core enzyme) et sont responsables de l’élongation de l’ARN.

Le facteur sigma (σ), quant à lui, est essentiel pour initier la transcription en reconnaissant et en se liant au promoteur de l’ADN. Une fois l’initiation terminée, sigma est souvent relâché.

Question 21

Pourquoi le facteur σ est-il essentiel à l’initiation de la transcription, mais pas à l’élongation?

Answer 21

Le facteur σ est essentiel pour cibler le promoteur et démarrer la transcription en positionnant l’ARN polymérase au bon endroit sur l’ADN. Une fois l’initiation accomplie, la structure de l’ARN polymérase change, et σ se dissocie, permettant au cœur de l’enzyme de poursuivre l’élongation.

Question 22

Comment les différentes sous-unités interagissent-elles pour stabiliser l’enzyme sur l’ADN?

Answer 22

Les sous-unités β et β’ forment une pince autour de l’ADN pour le stabiliser, tandis que les sous-unités α interagissent avec des séquences spécifiques du promoteur pour renforcer la liaison. Le facteur σ se positionne pour reconnaître la boîte -10 et la boîte -35 du promoteur, assurant ainsi une initiation précise.

Question 23

Quelles sont les trois types d’ARN polymérases chez les eucaryotes et quels ARN synthétisent-elles? (pas sûre que c’est à l’exam)

Answer 23

- ARN pol I : Synthétise les précurseurs des grands ARNr (28S, 18S, 5.8S).

- ARN pol II : Synthétise les précurseurs des ARNm et certains ARN non codants (snRNA, miRNA).

- ARN pol III : Synthétise les petits ARN (ARNt, l’ARN 5S et les ARN de l’ARN 7SL).

Question 24

Où se trouvent les différents types d’ARN polymérases dans la cellule eucaryote?

Answer 24

L’ARN polymérase I est localisée dans le nucléole, où elle transcrit les grands ARNr.

L’ARN polymérase II est située dans le nucléoplasme et est responsable de la transcription des ARNm.

L’ARN polymérase III se trouve également dans le nucléoplasme et est responsable de la transcription des petits ARN.

Question 25

Vrai ou faux ? Des sous-unités sont partagées entre les ARN polymérases I, II, et III chez les eucaryotes.

Answer 25

Plusieurs sous-unités sont partagées entre les trois types d’ARN polymérases. Ces sous-unités sont impliquées dans des fonctions conservées comme l’assemblage et la stabilité des complexes polymérases.

Question 26

Quelles sont les trois étapes de la liaison de l’ARN polymérase bactérienne au promoteur?

Answer 26

1. Recherche du promoteur : L’holoenzyme (complexe complet) de l’ARN polymérase se fixe et se détache successivement de l’ADN tout en cherchant la séquence du promoteur.
2. Formation du complexe promoteur fermé : L’ARN polymérase trouve le promoteur et s’y lie de manière lâche, formant un complexe fermé.
3. Formation du complexe promoteur ouvert : L’ARN polymérase se lie étroitement au promoteur et déroule une courte section de l’ADN pour initier la transcription.

Question 27

Qu’est-ce qu’un complexe promoteur fermé et comment évolue-t-il en complexe ouvert?

Answer 27

Un complexe promoteur fermé se forme lorsque l’ARN polymérase se lie faiblement au promoteur sans encore dérouler l’ADN. Il devient un complexe ouvert lorsque l’ARN polymérase stabilise sa liaison, induit un changement de conformation, et déroule une courte section de l’ADN autour du site d’initiation pour permettre l’accès à la matrice.

Question 28

Quelle est la position de la sous-unité σ (sigma) par rapport aux séquences du promoteur?

Answer 28

La sous-unité σ70 de l’ARN polymérase bactérienne se lie aux régions -10 et -35 du promoteur, facilitant la reconnaissance et la liaison initiale.

La région -10 est appelée la boîte Pribnow et est essentielle pour le positionnement correct de l’ARN polymérase.

Question 29

Que se passe-t-il après la formation du complexe ouvert au niveau de l’ADN?

Answer 29

Une fois le complexe ouvert formé, l’ARN polymérase initie la synthèse d’ARN en utilisant le brin matrice de l’ADN. Les premiers nucléotides d’ARN sont ajoutés au site +1, et l’ARN polymérase commence à élonger la chaîne tout en déroulant davantage l’ADN en aval.

Question 30

Quelle est l’importance des régions -10 et -35 pour la transcription chez les bactéries?

Answer 30

Les régions -10 et -35 du promoteur sont des séquences conservées qui sont essentielles pour la reconnaissance par l’ARN polymérase. Ces régions déterminent la force de la liaison de la polymérase et influencent la fréquence de la transcription du gène.

Question 31

Quelle est la structure de l’ARN polymérase bactérienne associée à l’ADN et comment les sous-unités sont-elles positionnées?

Answer 31

L’ARN polymérase bactérienne est un complexe asymétrique composé de sous-unités α, β, β’, et σ. Les sous-unités α se lient au promoteur en amont, les sous-unités β et β’ forment la pince qui stabilise la liaison de l’ARN polymérase au niveau du site d’initiation, tandis que la sous-unité σ reconnaît et stabilise le promoteur.

Question 32

Comment les facteurs sigma sont-ils nommés et quelle est leur fonction?

Answer 32

Les facteurs sigma sont nommés selon leur masse moléculaire (ex : σ70 pour 70 kDa) ou selon leur rôle fonctionnel (ex : σ32 pour le choc thermique). Leur principale fonction est de diriger l’ARN polymérase vers des promoteurs spécifiques en reconnaissant des séquences consensus -35 et -10, ce qui permet l’initiation de la transcription de gènes spécifiques.

Question 33

Quels sont les éléments clés d’un promoteur bactérien typique et pourquoi sont-ils importants?

Answer 33

• Région -35 : Séquence consensus (ex : TTGACA), reconnue par la sous-unité sigma.
• Région -10 (boîte de Pribnow) : Séquence TATAAT, facilitant l’ouverture de l’ADN.
• Site +1 : Point de démarrage de la transcription.

Ces éléments sont essentiels pour le positionnement de l’ARN polymérase et pour déterminer la fréquence de transcription du gène.

Question 34

Comment les promoteurs sont-ils régulés par des éléments cis et trans ?

Answer 34

Les éléments cis sont des séquences d’ADN situées près du gène cible (comme les régions -35 et -10) qui régulent directement l’initiation de la transcription.

Les facteurs trans sont des protéines (comme les facteurs sigma ou les régulateurs transcriptionnels) qui se lient à ces éléments cis pour moduler la transcription. Elles peuvent recruter l’ARN polymérase, stabiliser le complexe ouvert (activation), ou bloquer l’accès de l’ARN polymérase au promoteur (répression), modulant ainsi l’expression des gènes en fonction des besoins cellulaires.

Question 35

Quel serait l’impact d’une mutation de la boîte -10 sur l’activité de l’ARN polymérase?

Answer 35

Une mutation de la boîte -10 (TATAAT → TGTGAG) pourrait diminuer ou éliminer l’affinité de l’ARN polymérase pour le promoteur, empêchant la formation du complexe ouvert. Par conséquent, la transcription ne peut pas débuter correctement, ce qui se traduit par l’absence de gène transcrit, visible sur un gel PAGE en comparaison avec un gène WT.

Question 36

Comment les séquences consensus affectent-elles la force des promoteurs?

Answer 36

Les séquences consensus idéales (comme TTGACA pour -35 et TATAAT pour -10) augmentent la probabilité de liaison de l’ARN polymérase, ce qui renforce l’initiation de la transcription. Les divergences par rapport à ces séquences réduisent l’efficacité de liaison et affaiblissent la transcription, rendant le promoteur “plus faible”.

Question 37

Qu’est-ce que la technique d’empreinte à l’ADNase I et que permet-elle de détecter?

Answer 37

La technique d’empreinte à l’ADNase I (DNAse I footprinting) permet de détecter le site de liaison d’une protéine sur l’ADN. L’ADN est d’abord incubé avec ou sans la protéine d’intérêt, puis traité avec l’ADNase I, une enzyme qui coupe l’ADN de manière aléatoire. Lorsque la protéine est liée, elle protège les régions de l’ADN en contact, créant ainsi une zone sans coupure (empreinte). L’empreinte est ensuite visualisée par électrophorèse pour identifier les sites de liaison spécifiques de la protéine.

Question 38

Comment les bandes d’empreinte apparaissent-elles sur un gel après traitement à l’ADNase I?

Answer 38

Sur le gel, les fragments d’ADN non protégés par la protéine seront coupés de manière régulière, produisant un motif de bandes correspondant à chaque coupure.

En présence de la protéine, la région protégée apparaîtra comme une zone claire (pas de bandes), car l’ADNase ne peut pas couper dans cette région. Cela indique le site de liaison de la protéine sur l’ADN.

Question 39

Quel est le rôle de la méthode Maxam-Gilbert dans l’analyse d’empreinte?

Answer 39

La méthode Maxam-Gilbert est utilisée pour générer des fragments de référence en coupant spécifiquement l’ADN à des bases particulières. Ces fragments de référence sont utilisés pour comparer les bandes obtenues avec et sans la protéine, facilitant l’identification précise des positions nucléotidiques protégées par la protéine.

Question 40

Dans quel contexte utilise-t-on l’empreinte au DMS (diméthyl sulfate) et qu’est-ce qu’elle révèle?

Answer 40

L’empreinte au DMS est utilisée pour identifier les bases de l’ADN qui sont protégées ou exposées lorsqu’une protéine est liée. Le DMS méthyle les bases d’adénine et de guanine. Si une protéine est liée à une région particulière de l’ADN, ces bases seront protégées de la méthylation, indiquant les contacts protéine-ADN. Inversement, certaines protéines induisent des distorsions qui exposent des bases normalement inaccessibles, révélant des sites de désappariement de l’ADN.

Question 41

Comment le DMS est-il utilisé pour générer des empreintes?

Answer 41

Le DMS méthyle les bases accessibles dans l’ADN en présence ou en absence de la protéine d’intérêt. Après élimination de la protéine, l’ADN est traité pour cliver les bases méthylées, produisant des fragments de tailles variables. Ces fragments sont analysés par électrophorèse, et les bandes révélant des zones protégées ou exposées indiquent les sites de liaison ou de distorsion de l’ADN par la protéine.

Question 42

Comment les sites de coupure varient-ils entre la méthode ADNase I et DMS?

Answer 42

Avec la méthode ADNase I, seules les régions directement protégées par la protéine sur l’ADN apparaissent sous forme d’empreinte. Avec la méthode DMS, les régions de contact direct ainsi que les sites de distorsion de la double hélice induits par la protéine peuvent être détectés, fournissant une carte plus complète de l’interaction protéine-ADN.

Question 43

Quelle est la différence entre les empreintes obtenues avec une protéine activatrice et une protéine répresseur?

Answer 43

Une protéine activatrice peut induire une distorsion dans l’ADN, exposant certaines bases et créant des bandes supplémentaires sur le gel.

Un répresseur, en revanche, protège généralement les régions de l’ADN en se liant fortement, créant de grandes zones sans coupure.

Question 44

Pourquoi l’empreinte d’ADN est-elle utile pour comprendre la régulation génique?

Answer 44

L’empreinte d’ADN révèle non seulement les sites de liaison des protéines régulatrices, mais aussi leur effet sur la structure de l’ADN. Elle permet d’identifier où et comment les régulateurs transcriptionnels se fixent, aidant à comprendre leur rôle dans l’activation ou la répression de la transcription.

Question 45

Quelles sont les principales composantes du complexe Pol II-ADN-ARN durant l’élongation et leurs rôles? (DÉFI)

Answer 45

• Attache (Clamp) : Portion de la sous-unité RPB2 qui piège l’ADN dans le sillon, assurant une forte processivité et la stabilité du complexe.
• Entonnoir (Funnel) : Ouverture permettant l’entrée des nucléotides triphosphates (NTPs) nécessaires à l’élongation de l’ARN.
• Ion catalytique Mg²⁺ : Situé dans le centre actif, cet ion lie le phosphate du dernier NTP ajouté, facilitant l’allongement de la chaîne d’ARN.
• Gouvernail (Rudder) : Maintient l’hybride ARN-ADN stable dans la bulle de transcription et dissocie l’ARN en cours de synthèse pour permettre à l’ADN de se réapparier.
• Pont (Bridge) : Élément mobile impliqué dans la translocation du complexe, déplaçant le complexe ARN-ADN de 1 nucléotide (nt) pour chaque NTP ajouté.
• Mur (Wall) : Portion de la sous-unité RPB2 qui dirige l’ARN et l’ADN à un angle de 90° en dehors du centre actif, facilitant la séparation de l’ARN nouvellement synthétisé.

Question 46

Quel est le rôle de l’Attache (Clamp) dans l’élongation de la transcription?

Answer 46

L’Attache (Clamp) piège fermement l’ADN dans le sillon de l’ARN polymérase II, ce qui stabilise le complexe Pol II-ADN-ARN. Cela empêche le complexe de se dissocier prématurément et assure une processivité élevée, permettant la transcription de longues séquences sans interruption.

Question 47

Comment l’Entonnoir (Funnel) participe-t-il à l’élongation de l’ARN?

Answer 47

L’Entonnoir est une ouverture par laquelle les NTPs (nucléotides triphosphates) pénètrent dans le centre actif de l’ARN polymérase II. Ce passage guide les NTPs jusqu’au site d’addition (A), où ils sont incorporés dans la chaîne d’ARN en croissance.

Question 48

Que se passe-t-il au niveau de l’ion Mg²⁺ dans le centre actif de l’ARN polymérase II?

Answer 48

L’ion Mg²⁺ catalyse la formation de la liaison phosphodiester entre le nucléotide entrant et l’extrémité 3’ de la chaîne d’ARN en croissance. Il stabilise le phosphate du NTP, facilitant l’attaque nucléophile du groupe hydroxyle (-OH) 3’ de l’ARN.

Question 49

Quel est le rôle du Pont (Bridge) dans le mécanisme de translocation?

Answer 49

Le Pont (Bridge helix) est un élément mobile qui oscille pour permettre le déplacement de l’ADN-ARN hybride dans le complexe Pol II de 1 nt à chaque cycle de synthèse. Ce mouvement propulse l’ARN et l’ADN matrice d’un pas en avant, ouvrant la voie à l’ajout du prochain NTP.

Question 50

Comment le Gouvernail (Rudder) aide-t-il à maintenir la bulle de transcription?

Answer 50

Le Gouvernail stabilise la bulle de transcription en maintenant l’hybride ARN-ADN intact. Il aide également à dissocier l’ARN de l’ADN matrice à mesure que la transcription progresse, favorisant la séparation des brins d’ARN nouvellement synthétisés et la reformation de la double hélice d’ADN.

Question 51

Que se passe-t-il au niveau du Mur (Wall) après la translocation?

Answer 51

Le Mur redirige l’ARN nouvellement synthétisé et l’ADN vers l’extérieur du centre actif, à un angle de 90°, ce qui facilite la séparation de l’ARN de la matrice d’ADN. Cela permet à l’ARN de se détacher complètement du complexe Pol II pour être traité ou traduit.

Question 52

Comment fonctionne le mécanisme de translocation du duplex ARN-ADN dans la bulle transcriptionnelle?

Answer 52

Le mécanisme de translocation implique le mouvement coordonné du Pont (Bridge helix) et du Mur (Wall) après l’ajout d’un NTP. Le Pont se déplace, poussant l’ARN et l’ADN d’un nucléotide en avant, tandis que le Mur change d’orientation pour repositionner l’ARN sortant et permettre à un nouveau NTP de s’incorporer au site A.

Question 53

Quel est le rôle de la Bridge Helix (hélice pont) dans le cycle de synthèse-translocation?

Answer 53

La Bridge Helix joue un rôle clé dans le déplacement de l’ADN-ARN hybride de 1 nt à chaque cycle de translocation. Ce déplacement cyclique de la Bridge Helix assure une translocation fluide et précise du complexe Pol II, permettant un processus d’élongation continu et efficace.

Question 54

Pourquoi l’orientation du Mur (Wall) est-elle importante pour la synthèse d’ARN?

Answer 54

Le Mur (Wall) guide l’ARN en cours de synthèse vers un angle de 90°, ce qui l’éloigne du site actif et l’aide à se détacher de l’ADN. Sans cette redirection, l’ARN resterait potentiellement lié à l’ADN matrice, entraînant des arrêts de transcription et une synthèse inefficace.

Question 55

Quel est le rôle des facteurs de transcription généraux lors de l’initiation de la transcription?

Answer 55

Les facteurs de transcription généraux (comme TBP, TFIIB, et TFIIH) aident l’ARN polymérase II à se lier au promoteur, à dérouler l’ADN et à initier la transcription de manière correcte.

Question 56

Comment la terminaison transcriptionnelle est-elle contrôlée chez les bactéries, et quel est le rôle de la structure en tige-boucle formée dans l’ARN?

Answer 56

Lors de la terminaison rho-indépendante, une séquence palindromique riche en GC dans l’ARN transcrit se replie pour former une structure en tige-boucle, suivie d’une série de résidus uracile (U).

Cette structure en tige-boucle agit comme un signal de terminaison en bloquant temporairement l’ARN polymérase, ce qui ralentit ou arrête sa progression.

La faible interaction entre la série d’uridines de l’ARN et la séquence complémentaire d’adénines sur l’ADN entraîne ensuite la dissociation de l’ARN du brin matrice, libérant ainsi le transcrit d’ARN.

La séquence riche en GC est essentielle car elle confère une grande stabilité à la tige-boucle, rendant cette barrière plus efficace pour arrêter l’ARN polymérase et permettre la terminaison complète de la transcription.

Question 57

Quel est le rôle du facteur Rho dans la terminaison de la transcription chez les bactéries?

Answer 57

Le facteur Rho est une protéine hélicase hexamérique qui se lie à un site spécifique de l’ARN, migre le long du transcrit dans le sens 5’ → 3’ et interagit avec l’ARN polymérase pour provoquer la dissociation du complexe ARN-ADN, terminant ainsi la transcription.

Question 58

Comment Rho reconnaît-il les sites de terminaison sur l’ARN?

Answer 58

En se liant à une séquence riche en cytosine sans structure secondaire dans l’ARN. Il migre ensuite le long de l’ARN jusqu’à rattraper l’ARN polymérase, la dissocie, et libère l’ARN en déroulant l’hybride ARN-ADN.

Question 59

Quelle est la différence entre la terminaison rho-dépendante et rho-indépendante?

Answer 59

La terminaison rho-dépendante implique le facteur Rho qui interrompt la transcription, tandis que la terminaison rho-indépendante repose sur la formation de structures en tige-boucle suivies de séquences de résidus U dans l’ARN pour détacher l’ARN polymérase.

Question 60

Quel est le processus de terminaison de la transcription chez les eucaryotes?

Answer 60

Chez les eucaryotes, la terminaison implique un clivage du transcrit d’ARN au niveau du site de polyadénylation (AAUAAA) par des complexes protéiques, suivi de l’ajout d’une queue poly(A) par l’enzyme PAP à l’extrémité 3’ de l’ARNm. Cette queue protège l’ARNm de la dégradation.

Question 61

Quel est le rôle de la polyadénylation dans la terminaison de la transcription chez les eucaryotes?

Answer 61

La polyadénylation stabilise l’ARNm en ajoutant une série de résidus adénine (queue poly(A)) à son extrémité 3’. Cette queue est essentielle pour la stabilité, le transport, et la traduction de l’ARNm.