hérédité Flashcards

1
Q

définition acide nucléiques

A

polymères de nucléotides

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Q

différence entre ribose et déoxyribose

A

ribose possède un Oxygène de plus que le déoxyribose

Ribose trois liens OH
deoxyribose deux lien OH

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3
Q

Quelles sont les purines (+ structure de base)

A

adénine et guanine

un cycle de 6 et un cycle de 5 (possède 4 N en tout)

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Q

quelles sont les Pyrimidines (+ structure)

A

thymine
uracile
Cytosine

Structure cycle de 6, 3 double liaison, 2 N

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5
Q

Particularités de chacune des structures des bases azotées.

A

adénine (fct NH2 sur le sur cycle à 6)
guanine (fct cétone à la place du NH2 de l’adénine + NH2 en bas à gauche)

Cytosine (cétone en haut, NH2 en bas gauche)
Uracile ( cétone en haut et en bas à gauche)
Thymine (Cétone en haut et en bas à gauche + CH3 en haut à droite)

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6
Q

Qu’est ce qu’un nucléotide

A

sucre à 5 carbones (ribose/déoxyribose)

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7
Q

Avec qui se fait le lien beta glycosidique

A

purine: N9 avec C1 du sucre
pyrimidines: N1 avec C1 du sucre

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8
Q

Quelles sont les deux autres types de liens

A

lien phopho-ester

lien phopho-anhydryde RICHE EN ÉNERGIE

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9
Q

Quelle est la base azoté qui a seulement un role dans ARN

A

Uracile

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10
Q

qu’est ce qu’un déoxyribonucléotide (composante)

A

base azoté
deoxyribose (un lien OH)
phosphate

  • même chose pour un ribonucléotide (sauf ribose car deux lien OH)
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11
Q

Les nucléotides tri phosphate sont des ..
Les nucléotides cycliques sont des…

A
  1. monnaies énergétiques
  2. messagers intracellulaires + régulateur métabolisme et reproduction
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12
Q

Caractéristiques principales des bases azotés triphosphate

A

ATP: énergie
GTP: participe synthèse prots
CTP: participe synthèse lipide
UTP: Impliqué métabolisme glucide

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13
Q

règle de chargaff

A

A/T = C/G = 1
A+T pas égal C+G

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14
Q

Watson et Crick on créé un modèle

A

A = T
G = C

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15
Q

orientation de la liaison phosphodiester

A

5’ à 3’

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16
Q

nb de liaisons entre A-T et C-G

A

2: A-T, OH et NH

3: C-G, OH, NH, OH

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17
Q

caractéristique double hélice ADN

A

5’ à 3’
extrémité 5’ = phosphate
extrémité 3’ = OH

base sont perpendiculaires aux montants
torsion engendré par noyau des bases
incrément = 10,4 pbs

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18
Q

à pH neutre comment agit le nucléotide

A

sera un polyanions associés avec du Mg ou protéines cationiques (K ou R)

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19
Q

Quelles sont les forces qui stabilisent la double hélice

A

hydrophobes
van de Waals entre bases
liaison H entre bases
interactions électrostatiques (entre P, Mg ou protéines cationiques)

*ADN monocaténaire moins stable que bicaténaire

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20
Q

ADN et la vie sont basé sur quoi

A

phi , angle entre les deux pentagone (36 degré) de l’un des cotés

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21
Q

qu’est ce que le nombre d’or

A

ce qui nous plait le mieux

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22
Q

quels sont les types d’agents dénaturants

A

In vivo (réplication ou transcription)
In vitro (augmentation température, agent chaotropiques ex: urée ou chlorure de guanidium)

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23
Q

plus la température est élevé plus il y a de … dans le génome

A

de base C et G

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24
Q

Qu’elles sont les trois conformations de l’ADN

A

A: adn encore plus tordu
B: pu tant de diff entre sillons, pas problème
Z: detwister cela fait apparaitre encore plus les bases, plus facile pour prots de lire la séquence

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25
Q

Qu’elles sont la grandeur des conformations

A

A = + petit
B = moyen
Z = + long

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26
Q

Quels sont les trois types ADN

A

ADN génomique
ADN mitochondriale
ADN chloroplaste

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27
Q

quelle est la structure des polynucléotides monocaténaires quand ils sont stable

A

ils veulent former des épingles/boucles

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28
Q

ARN structure

A

sucre= ribose
T remplacé par U
brins monocaténaires peuvent s’apparier et former régions bicaténaires (DUPLEX)

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29
Q

Différent type ARN et proportion

A

ARNr = 80%
ARNt = 15%
ARNm = 3%
snRNA= activités catalytiques, maturations grands ARN

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30
Q

Qu’est ce qui se passe chez l’eucaryote en lien avec ADN

A

2m ADN dans un noyau de 5um
condensation 100 000x

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31
Q

stade compression ADN

A

ADN à interphase
perle sur une corde - solénoïde (6 nucleosome par tour) - loop (50 tour par loop)

ADN chromosomique
miniband (18 loops) - Chromosome (empilement minibands)

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32
Q

Étape collier de perle (interphase et compression ADN)

A

ADN + histones (octamère d’histones)

histones : H1, H2A, H2B, H3 et H4
prots basiques riche en R et K
séquence aa bien conservé

146pbs
54pbs + H1 va venir sceller le tout

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33
Q

2 autres Étapes interphase

A
  1. solénoïde : = chromatine
  2. boucle de chromatine associés au prots non-histoniques
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34
Q

Que vont faire le R et K dans la compression de ADN

A

neutraliser les charges négatives du phosphate

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35
Q

ADN des bactéries et archéobactéries sont associés à ..

A

des protéines non-histoniques (=prots chargé +)

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36
Q

la réplication de l’ADN est …

A

semi-conservatrice

elle est faite par machinerie protéique

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37
Q

Réplication de l’ADN chromosomique chez E.Coli (caractéristique)

A

bidirectionnel
origine et terminaison unique
20-30min

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38
Q

Réplication de l’ADN génomique chez eucaryote

A

plusieurs bulles de réplications donc multiples origines et terminaisons
1h

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39
Q

enzymes de réplication chez E.coli (réplication et/réparation ADN)

A

ADN pol 1 : les deux
ADN pol 2 :juste réparation
ADN pol 3 : juste réplication

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40
Q

rx élongation d’une chaine par adn pol (fct)

A

1.appariement du NTP
2. attaque nucléophile phosphore alpha par le 3’ OH libre
3. formation lien phosphodiester et élimination groupe pyrophosphate (formation IRRÉVERSIBLE)
4.enzyme saute nucléotide suivant

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41
Q

Que nécessite ADN pol 3

A

une matrice et une amorce avec extrémité 3’OH

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42
Q

caractéristique de ADN pol 3

A

enzyme processive (contre la distributivité)
av: besoin de peut pour copier entièreté du génome
TRÈS VITE

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43
Q

Quelles sont les deux activités de l’ADN pol 3

A

activité polymérase 5’ à 3’
activité exonucléase 3’ à 5’

  • elle est capable de défaire ce qu’elle fait
    ** erreur cumulative arrive chez E.coli avant Eucaryote
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44
Q

on lit de … à …
on tricote de … à …

A
  1. 3’ à 5’
  2. 5’ à 3’
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45
Q

Au fur et à mesure de la réplication il y aura des…

A

brins discontinues

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46
Q

avec quoi on fait la synthèse d’un amorce d’ARN
avec quoi on fait la synthèse d’un ADNsb (sb= simple brin)

A

la primase du primosome
ADN pol 3

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47
Q

Role ADN pol 1

A

activité exonucléase :
-éliminer amorce de l’ARN 5’-3’
-lecture d’épreuve 3’-5’ (détacher mauvais duo de base)

activité polymérase : synthèse adn 5’-3’

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48
Q

ADN ligase role et condition de fctionnement

A

role: éliminer des brèches , essentiels entre fragments d’okazaki

conditions; 3’ OH-ADN et 5’ P-ADN
et de ATP chez eucaryote/bactériophagies et NAD+ chez bactéries

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49
Q

Quelle est le deuxième problème dans La Fourche de réplication et cet on le gère

A

déroulement entraine des torsions en aval

détorsion par les topoisomérase (comme gyrase)

hélicase sépare les brins
** nécessite ATP

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50
Q
A
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51
Q

quelles est le troisième problème dans La Fourche de réplication et cet on le gère

A

éviter formation d’épingles a cheveux

SSB ou prots qui se fixe sur le brin monocaténaire empêche ADN de se réapparier

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52
Q

qu’est ce qu’un SSB

A

tétramères
qui se fixe coopérativements (recouvre 32 nts)

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53
Q

quelles est 4e problème dans La Fourche de réplication et cet on le gère

A

formation d’une boucle pour la synthèse du brin retardé

54
Q

la lenteur de la réplication est causé par quoi

A

par les histones lié à ADN pendant la réplication

55
Q

conséquence d’un mutation chez uni et pluricellulaire

A

unicellulaire: transmis à descendance
destruction Dun gène peut entrainer mort organisme

pluricellulaire: pas transmis par descendance sauf si elle touche génome d’une cellule germinale
destruction d’un gène peur entrainer : tumeur ou perte de fct avec mort cellulaire

56
Q

cause des modifications chimique
conséquence

A

Radiation ionisantes
Rayon UV: conséquence Xeroderma pigmentosium cela cause des érythèmes (maladie de peau), maladie autosome récessive, déficience de la photolyase

57
Q

quels sont les types de modifications chimiques lors de la réparation de ADN

A

Méthylation
Désamination
Dépurination
Dépyrimidination
Agents intercalaires (bromure d ’éthidium, acridine orange, actinomycine D)
=> déformation de la double hélice

58
Q

Les 3 mécanismes de réparation

A
  1. par excision-réparation
    -endonucléase
    -helicase + exonucléase
    -ADN pol 1
    -ADN ligase
  2. dimères de thymidine
    -enzyme photoactivatrice
  3. désamination d’une cytosine en uracile
    -ADN pol 1
    -ADN ligase
    - uracile N-glycosylase
    -endonucléase
59
Q

que font les ADN glycosylases

A

retire les bases endommagés

60
Q

diff entre nucléotide et nucléoside

A

nucléoside n’a pas de phosphate seulement base et sucre

61
Q

ou est l’hydorxyl manquant sur le deoxyribose

A

sur le 2 Carbone

62
Q

lien phospho anhydre
phospho ester
phospho diester

A
  1. P-O-P
  2. P-O-C
  3. C-O-P-O-C
63
Q

définition gène

A

séquence d’ADN transcrite

64
Q

Qui à le + de gènes entre eucaryotes et procaryote

A

eucaryote

65
Q

Le facteur transcripteur et facteur promoteur
qui est cis et qui est trans

A

transporteur = trans
promoteur = cis

66
Q

structure de arn polymérase chez E.coli
alpha,beta,beta’, sigma,

A

a: assemblage de enzyme
b’: fixe enzyme ADN
b: lie NTP
sigma: initie transcription

67
Q

structure arn polymérase chez eucaryote

A

ARN pol 1: transcription grand ARNr
ARN pol 2 : transcription ARNm
ARN pol 3 : transcription ARNt et petit ARNr

68
Q

Qu’Est ce qu’il y a entre procaryote et eucaryote

A

ancêtre commun d’ARN polymérase

69
Q

principale diff entre ARN pol et ADN pol

A

ARN pol n’a pas de lecture d’épreuve et n’a pas d’amorce. L’ARN pol est moins vite et à plus de taux d’erreur que ADN pol

70
Q

diff entre eucaryote et E.coli pour la séquence promotrice

A

E.coli: un promoteur mais PLUSIEURS séquence codantes

Eucaryote: un promoteur pour UNE séquence codante

71
Q

structure promoteur chez E.coli

A

+1 initiateur
-10 taatat box
-35 cat box

72
Q

qu’est ce qu’un promoteur puissant implique

A

un fort taux de transcription et plusieurs ARN en arrête de poisson

73
Q

fct initiation à transcription

A

sigma s’attache car reconnait une séquence et amène ARN pol

attire NTP qui s’attache, à ce moment sigma se détache

ARN pol va avancer de plus en plus en ouvrant ADN

74
Q

qu’est ce qu’une ouverture de 18 pbs

A

une bulle de transcription

*ouverture de hélice demande bcp énergie

75
Q

de quelle façon le ribonucléotide 3P arrive il

A

par diffusion (formera lien H)

76
Q

pourquoi les 1er nts polymérisés restent plus longtemps sur ADN

A

car il y a une formation double hélice ADNsb-ARN transitoire

77
Q

2 produits qui inhibe ARN polymérase du procaryote

A

rifampicine: inhibe translocation ARN pol de ADN matrice

rifamycine: se lie Beta et empêche l’entrée du nts au site initiation

utilise 2 produits contre tuberculose et infections gram+
** n’affecte pas ARN eucaryote

78
Q

vitesse d’élongation est plus lente chez région riche en C-G pourquoi

A

3 liaisons H plus long que 2 liaisons H

79
Q

Pendant l’élongation sigma qui l’ARN pol pour l’arrivé de…

A

Nus A

80
Q

fct terminaison de transcription

A

riche en CG = site de pause
role de Nus A = facteur terminaison (suivi séquence riche en A)

formation épingle à cheveux (site palindromiques) déstabilisent hybride ARN-ADN

81
Q

nommer deux mécanismes de terminaisons

A

épingle à cheveux + fréquent

à l’aide de rho (hélicase ATP dépendante)
se fixe sur 5’ fait tout ADN et bump ARN pol

82
Q

les deux diff co-inducteur

A

lactose (inhibiteur)
catabolite (activateur)

83
Q

structure d’un opéron

A

opérateur-promoteur-structure

84
Q

Le CAP protéine est importante pour quoi et qu’est ce qui active le CAP protéine

A

pour attirer l’ARN pol

l’AMPc active le CAP

85
Q

quelles sont les types de remaniements de transcrits primaires

A

ajout nucléotides
soustraction nucléotides
modifier covalente de certaines base

** but rendre ARN plus stable

86
Q

comment on fait la maturation des ARNt et ARNr chez E.coli

A

par RNA P
par RNA D
par ARN nucléotidyl transférase (ajout CCA en 3’ à ARNt)

87
Q

fct maturation chez e.coli

A

RNA P va couper à 5’ dautres endonucléase vont couper à d’autres endroit.
RNA D va couper 3’ et gruger jusqu’à temps de trouver CCA ou jusqu’à homoduplexe de l’ARN.

si pas trouver ARNt nucléotidyl Transférase va venir greffer le CCA

88
Q

précurseurs commun pour ARNr chez procaryotes

A

par la Ribonucléase 3

89
Q

grosseur petite et grande sous-unités

A

petite = 16s
grande = 23s

90
Q

diff entre maturation ARNm chez procaryote et eucaryote

A

pas dépissage chez procaryote (5’pppA et 3’ OH)

pas simultané chez eucaryote pour transcription et traduction.(5’ GTP coiffe et 3’ queue polyA)

91
Q

la coiffe protège l’ARNm de quoi chez les eucaryote

A

des exonucléases

92
Q

le G6P à un effet inhibiteur sur la glucokinase (foie et pancréas) Vrai su faux

A

faux seulement sur hexokinase

93
Q

comment se nomme l’enzyme qui phosphoyl la PFK 2

A

protéine kinase

94
Q

+ tu as de CG + ADN sera…

A

solide et les bases seront plus rapproché

95
Q

par quoi la torsion est engendré dans ADN

A

les noyaux hydrophobes

96
Q

qui est hyperchromique entre sb et db

A

simple brin car c’est les bases qui captent la lumière

97
Q

le collier de perles est possible grâce à..

A

les prots basiques qui veut s’attacher à ADN acide

*histones importantes = prots qui ont un role de contentement

98
Q

nucléosome =

A

octamère (H1 + pesant et H4 - pesant)
2x H2A
2x H2B
2x H3
2x H4

+ H1

99
Q

définition solénoïde

A

fibre de chromatine de 30nm

100
Q

forme adn bactéries

A

ronde

101
Q

Chez eucrayote on a plusieurs…

A

fourche de réplication

102
Q

qui fait réplication ADN chez bactérie

A

ADN pol 3

e: correction
a; synthèse
têta; active correction

103
Q

ADN pol 3 nécessite quoi

A

matrice et une amorce avec extrémité 3’OH

104
Q

**eucaryote moins … que E.coli

A

erreurs

105
Q

la primase est une …

A

amorce

106
Q

la longueur des fragments d’okazaki sont plus long chez

A

procaryote

107
Q

que fait ADN pol 1

A

remplace ARN des amorce (10 nts)

108
Q

4eme problème de réplication

A

qu’il n’ait pas de boucle du brin discontinu si yen a pas peut causer de diffusion des enzymes d’ADN pol 3

109
Q

les dimères de thymine sont situé sur le…

A

même brin

110
Q

role intron

A

augmenter répertoire des protéines pour coder sur un seul gêne
mais on transcrit pas

111
Q

la transcription se base sur combien de brin

A

1

112
Q

la région promoteur est avant ou après le gêne

A

avant

113
Q

la transcription des procaryotes se fait ou

A

cytoplasme

**eucaryote noyau transcription et cytoplasme traduction

114
Q

quelle sont les deux exceptions pour qui le code génétique n’est pas dégénéré

A

Trop
Met

115
Q

les codons avec une pyrimidines en position 2 codent pour quel type de aa

A

hydrophobes

116
Q

qu’est ce qu’un isoaccepteur

A

codon qui peut reconnaitre le mm aa

117
Q

quel est la tige acceptrice pour la traduction

A

CCA 3’

118
Q

forme de ARNt en 3D

A

L

119
Q

fct amynoacyl ARNt synthétase

A

reconnait aa.
se fait activer par ATP
après ARNt se lie au aa sur le complexe de aminoacyl-ARNt synthétase.
ca va libérer AMP.

et ensuite libérer le aa activé

** LE LIEN ESTER SE FAIT POSITION 3’ du ribose

120
Q

structure ribosome procaryote et eucaryote

A

procaryote:
g; 50 (ARNr 23s) p;30 (ARNr16s) M; 70

eucaryote:
g;60 (ARNr 5,8s ou 28s) p;40 (ARNr 18s) M;80

121
Q

les différents sites sur le ribosome

A

Site A: entrée ARNt amino-acylé
Site P : ancrage chaine polypeptidique naissante
Site E

122
Q

étape de la traduction et le facteur associé à l’étape

A

initiation (if)
élongation (ef)
terminaison (rrf)

123
Q

différence traduction pour procaryote et eucaryote

A

initiateur doit être formylé pour procaryote. ajout du groupe formyl par methionyl-ARNtf met formyltransférase.

***Chez eucaryote un SEUL TYPE aminoacyl ARNt synthétase

124
Q

facteur initiation traduction chez pro et eucaryote

A

eucaryote: eif1-8

procaryote :IF1 = attache sous unité amplifie if2 et if3
IF2= sélection arnti et repousse autre aminoacyl-ARNt
IF3 = empêche fixation grosse unité
aligne Fmet-ARNtmet sur site P

125
Q

chez eucaryote la transcription ou traduction qui est plus rapide

A

transcription

126
Q

terminaison de la traduction
facteur de largage

A

rf1; Reconnait UAA UAG
rf2; Reconnait UAA UGA
rf3; fixe GTP et augmente efficacité des 2 autres

127
Q

chez eucaryote combien de facteur de relargage pour traduction

A

1 = RF

128
Q

une fois la fin de la traduction l’hydrolyse va briser quoi

A

le lien COO

129
Q

quel énergie ca prend pour activation de aa et pour l’enchainement de aa

A

activation = 2ATP
enchainement = 2 GTP

130
Q

pk avec un faible taux de glucose on a un haut taux de lactose et haut taux AMPc

A

car on fait de la glycolyse anaréobique