hérédité Flashcards
définition acide nucléiques
polymères de nucléotides
différence entre ribose et déoxyribose
ribose possède un Oxygène de plus que le déoxyribose
Ribose trois liens OH
deoxyribose deux lien OH
Quelles sont les purines (+ structure de base)
adénine et guanine
un cycle de 6 et un cycle de 5 (possède 4 N en tout)
quelles sont les Pyrimidines (+ structure)
thymine
uracile
Cytosine
Structure cycle de 6, 3 double liaison, 2 N
Particularités de chacune des structures des bases azotées.
adénine (fct NH2 sur le sur cycle à 6)
guanine (fct cétone à la place du NH2 de l’adénine + NH2 en bas à gauche)
Cytosine (cétone en haut, NH2 en bas gauche)
Uracile ( cétone en haut et en bas à gauche)
Thymine (Cétone en haut et en bas à gauche + CH3 en haut à droite)
Qu’est ce qu’un nucléotide
sucre à 5 carbones (ribose/déoxyribose)
Avec qui se fait le lien beta glycosidique
purine: N9 avec C1 du sucre
pyrimidines: N1 avec C1 du sucre
Quelles sont les deux autres types de liens
lien phopho-ester
lien phopho-anhydryde RICHE EN ÉNERGIE
Quelle est la base azoté qui a seulement un role dans ARN
Uracile
qu’est ce qu’un déoxyribonucléotide (composante)
base azoté
deoxyribose (un lien OH)
phosphate
- même chose pour un ribonucléotide (sauf ribose car deux lien OH)
Les nucléotides tri phosphate sont des ..
Les nucléotides cycliques sont des…
- monnaies énergétiques
- messagers intracellulaires + régulateur métabolisme et reproduction
Caractéristiques principales des bases azotés triphosphate
ATP: énergie
GTP: participe synthèse prots
CTP: participe synthèse lipide
UTP: Impliqué métabolisme glucide
règle de chargaff
A/T = C/G = 1
A+T pas égal C+G
Watson et Crick on créé un modèle
A = T
G = C
orientation de la liaison phosphodiester
5’ à 3’
nb de liaisons entre A-T et C-G
2: A-T, OH et NH
3: C-G, OH, NH, OH
caractéristique double hélice ADN
5’ à 3’
extrémité 5’ = phosphate
extrémité 3’ = OH
base sont perpendiculaires aux montants
torsion engendré par noyau des bases
incrément = 10,4 pbs
à pH neutre comment agit le nucléotide
sera un polyanions associés avec du Mg ou protéines cationiques (K ou R)
Quelles sont les forces qui stabilisent la double hélice
hydrophobes
van de Waals entre bases
liaison H entre bases
interactions électrostatiques (entre P, Mg ou protéines cationiques)
*ADN monocaténaire moins stable que bicaténaire
ADN et la vie sont basé sur quoi
phi , angle entre les deux pentagone (36 degré) de l’un des cotés
qu’est ce que le nombre d’or
ce qui nous plait le mieux
quels sont les types d’agents dénaturants
In vivo (réplication ou transcription)
In vitro (augmentation température, agent chaotropiques ex: urée ou chlorure de guanidium)
plus la température est élevé plus il y a de … dans le génome
de base C et G
Qu’elles sont les trois conformations de l’ADN
A: adn encore plus tordu
B: pu tant de diff entre sillons, pas problème
Z: detwister cela fait apparaitre encore plus les bases, plus facile pour prots de lire la séquence
Qu’elles sont la grandeur des conformations
A = + petit
B = moyen
Z = + long
Quels sont les trois types ADN
ADN génomique
ADN mitochondriale
ADN chloroplaste
quelle est la structure des polynucléotides monocaténaires quand ils sont stable
ils veulent former des épingles/boucles
ARN structure
sucre= ribose
T remplacé par U
brins monocaténaires peuvent s’apparier et former régions bicaténaires (DUPLEX)
Différent type ARN et proportion
ARNr = 80%
ARNt = 15%
ARNm = 3%
snRNA= activités catalytiques, maturations grands ARN
Qu’est ce qui se passe chez l’eucaryote en lien avec ADN
2m ADN dans un noyau de 5um
condensation 100 000x
stade compression ADN
ADN à interphase
perle sur une corde - solénoïde (6 nucleosome par tour) - loop (50 tour par loop)
ADN chromosomique
miniband (18 loops) - Chromosome (empilement minibands)
Étape collier de perle (interphase et compression ADN)
ADN + histones (octamère d’histones)
histones : H1, H2A, H2B, H3 et H4
prots basiques riche en R et K
séquence aa bien conservé
146pbs
54pbs + H1 va venir sceller le tout
2 autres Étapes interphase
- solénoïde : = chromatine
- boucle de chromatine associés au prots non-histoniques
Que vont faire le R et K dans la compression de ADN
neutraliser les charges négatives du phosphate
ADN des bactéries et archéobactéries sont associés à ..
des protéines non-histoniques (=prots chargé +)
la réplication de l’ADN est …
semi-conservatrice
elle est faite par machinerie protéique
Réplication de l’ADN chromosomique chez E.Coli (caractéristique)
bidirectionnel
origine et terminaison unique
20-30min
Réplication de l’ADN génomique chez eucaryote
plusieurs bulles de réplications donc multiples origines et terminaisons
1h
enzymes de réplication chez E.coli (réplication et/réparation ADN)
ADN pol 1 : les deux
ADN pol 2 :juste réparation
ADN pol 3 : juste réplication
rx élongation d’une chaine par adn pol (fct)
1.appariement du NTP
2. attaque nucléophile phosphore alpha par le 3’ OH libre
3. formation lien phosphodiester et élimination groupe pyrophosphate (formation IRRÉVERSIBLE)
4.enzyme saute nucléotide suivant
Que nécessite ADN pol 3
une matrice et une amorce avec extrémité 3’OH
caractéristique de ADN pol 3
enzyme processive (contre la distributivité)
av: besoin de peut pour copier entièreté du génome
TRÈS VITE
Quelles sont les deux activités de l’ADN pol 3
activité polymérase 5’ à 3’
activité exonucléase 3’ à 5’
- elle est capable de défaire ce qu’elle fait
** erreur cumulative arrive chez E.coli avant Eucaryote
on lit de … à …
on tricote de … à …
- 3’ à 5’
- 5’ à 3’
Au fur et à mesure de la réplication il y aura des…
brins discontinues
avec quoi on fait la synthèse d’un amorce d’ARN
avec quoi on fait la synthèse d’un ADNsb (sb= simple brin)
la primase du primosome
ADN pol 3
Role ADN pol 1
activité exonucléase :
-éliminer amorce de l’ARN 5’-3’
-lecture d’épreuve 3’-5’ (détacher mauvais duo de base)
activité polymérase : synthèse adn 5’-3’
ADN ligase role et condition de fctionnement
role: éliminer des brèches , essentiels entre fragments d’okazaki
conditions; 3’ OH-ADN et 5’ P-ADN
et de ATP chez eucaryote/bactériophagies et NAD+ chez bactéries
Quelle est le deuxième problème dans La Fourche de réplication et cet on le gère
déroulement entraine des torsions en aval
détorsion par les topoisomérase (comme gyrase)
hélicase sépare les brins
** nécessite ATP
quelles est le troisième problème dans La Fourche de réplication et cet on le gère
éviter formation d’épingles a cheveux
SSB ou prots qui se fixe sur le brin monocaténaire empêche ADN de se réapparier
qu’est ce qu’un SSB
tétramères
qui se fixe coopérativements (recouvre 32 nts)