Grandes voies métaboliques, rappel notions de base Flashcards
Processus global qui assure aux organismes vivants l’apport et l’utilisation de l’énergie libre pour assurer leurs différentes fonctions = ?
Séries de réactions enzymatiques successives qui forment des produits spécifiques = ?
Substrats, intermédiaires et produits sont appelés ?
Métabolisme
Voies métaboliques
Métabolites
Principales sources d’énergie voies anaboliques =
L’énergie libérée au cours du catabolisme (dégradation) est captée en synthétisant de l’ATP à partir ? et ? ou en réduisant ? en ?
ATP et NADPH
d’ADP et phosphate
NADP+ en NADPH
5 caractéristiques des voies métaboliques :
- Voies métaboliques sont réversibles ou irréversibles?
- Anabolisme et catabolisme doivent emprunter des voies ?
- Chaque voie métabolique comprend une réaction ?
- Est-ce que les voies métaboliques sont régulées?
- Chez les ?, les voies métaboliques se déroulent dans des sites intracellulaires spécifiques.
Irréversibles
différentes
d’engagement
OUI
eucaryotes
Fonctions métaboliques d’organites d’eucaryotes
- Cycle acide citrique, transport électrons et phosphorylations oxydatives, oxydation acides gras, dégradation acides aminés
- Glycolyse, voies pentoses phosphate, biosynthèse acides gras, réactions gluconéogenèse
- Digestion enzymatique de constituants et de substances ingérées
- Réplication et transcription ADN, maturation ARN
- Maturation post-traductionnelle protéines membranaires ou sécrétées; formation membrane plasmique et vésicules de sécrétion
- Synthèse protéines liées aux membranes ou sécrétées
- Biosynthèse lipides et hormones stéroidiennes
- Réactions oxydatives catalysées par aminoacide oxydases et catalase; chez plantes, réactions cycle glyoxylate
- Mitochondrie
- Cytosol
- Lysosomes
- Noyau
- Appareil de Golgi
- Réticulum endoplasmique rugueux
- Réticulum endoplasmique lisse
- Péroxysomes (glyoxysomes chez les plantes)
Presque toutes les réactions des voies métaboliques sont des réactions ? ?
On peut diviser les réactions biochimiques en 4 catégories :
Dans les systèmes biologiques, les réactions chimiques impliquent fréquemment la rupture d’une liaison C-H. Cette rupture peut être ? ou ?.
organiques enzymatiques
- Réactions transfert de groupes
- Oxydoréductions
- Éliminations, isomérisations et réarrangements
- Réactions formation et rupture liaisons C-C
Homolytique (électrons séparés également, forme instable) ou hétérolytique (forme prédominante avec électrons séparés non également)
Composés qui participent aux réactions avec ruptures hétérolytiques et à la formation de liaisons sont classés en 2 grandes catérgories :
Nucléophiles : aiment noyau, riches en électrons, chargés négativement ou ont des paires d’électrons non partagés, caractères nucléophiles et basiques étroitement liés
Électrophiles : aiment les électrons, composés déficients en électrons, peuvent être chargés positivement ou pas
Réactions de transfert de groupes
Les transferts de groupe, aussi appelés ? dans les systèmes biochimiques, impliquent le transfert d’un groupe électrophile d’un nucléophile à l’autre.
Les trois groupes les plus fréquemment transférés sont ?
substitution nucléophile
acyle, phosphoryle, glycosyle
Les réactions d’oxydo-réduction (redox) se traduisent par ?
Plusieurs impliquent rupture liaison C-H (-2é par C qui sont transférés à ?)
Pour les organismes aérobies, l’accepteur terminal des paires d’électrons provenant des métabolites oxydés est ?
Ce dernier ne peut accepter le transfert d’électrons qu’un à la fois. Ceci est possible grâce à l’intervention de coenzymes dont ?
perte ou gain d’électrons
un accepteur d’électrons comme le NAD+
O2 (oxygène moléculaire)
la flavine adénine dinucléotide (FAD)
Les réactions ? mènent à la formation de C=C.
La substance la plus souvent éliminée est ?. (Autres possibilités = NH3, ROH alcool, RNH2 amine primaire)
La formation d’une double liaison peut entraîner 2 configurations.
d’élimination
H2O
trans (anti) qui est la plus fréquente et cis (syn) du même côté
Molécules avec même formule brute mais propriétés chimiques et biologiques différentes = ?
Nommer les différents types
isomères
isomères de structure (même formule brute mais pas développée), stéréoisomères (différence dans arrangement spatial), diastéréoisomères (pas des images miroirs, cis et trans), énantiomères (images miroirs non superposables, formes L et D)
Les réactions ? biochimiques impliquent le déplacement intramoléculaire d’un atome afin de déplacer la position d’une double liaison.
La plus importante dans le métabolisme = ?
d’isomérisation
interconversion aldose-cétose (réaction à catalyse acido-basique au cours de laquelle se forment des intermédiaires anion ènediolate)
? est une réaction d’isomérisation dans laquelle un atome d’hydrogène d’un centre chiral modifie sa localisation stéréochimique.
Si la molécule comporte plusieurs centres chiraux, la réaction d’isomérisation autour d’un seul carbone asymétrique est appelée ?
La racémisation
épimérisation
Les réactions de ? modifient les squelettes carbonés. Ces réactions rompent et reforment des liaisons C-C. (il en existe peu)
Quelles réactions constituent la base du métabolisme de dégradation et de biosynthèse?
réarrangements
réactions de formation et de rupture de liaisons carbone-carbone
Réactions de transfert de groupements phosphoryle ont une importance métabolique considérable.
Présent dans tous les êtres vivants, il est le composé riche en énergie le plus courant?
Son hydrolyse libère l’énergie nécessaire à de nombreux processus biochimiques.
*Il est loin d’être le plus énergétique par contre.
ATP
Potentiel thermodynamique qui représente le maximum d’énergie utilisable pour effectuer un travail mécanique = ?
Valeur delta G : différence en énergie et force motrice pour réactions chimiques. Pousse la tendance pour atteindre l’équilibre
Quand est-ce qu’une réaction est favorable/spontanée?
Quand delta G = 0?
Énergie libre de Gibbs ou enthalpie libre
Quand delta G est négatif
Réaction à l’équilibre
Les demi-réactions d’oxydo-réduction ont lieu au cours du métabolisme oxydatif lors du transfert vital d’électrons qui se déroule dans les mitochondries, sous la dépendance de ?
Pression en électrons exercée par une pile électrochimique = ?
**Par contre, on dit réaction d’oxydation quand on passe de réducteur à oxydé ET réaction de réduction quand on passe d’oxydé à réduit
la cytochrome c oxydase
potentiel d’oxydo-réduction (delta E positif veut dire delta G négatif donc réaction spontanée… E seul positif veut dire accepteur et agent oxydant, E seul négatif veut dire donneur et agent réducteur)
