Génétique microbienne Flashcards
Grâce à quoi les décès infantiles ont diminué ?
Vaccins
Quels sont les 3 types de résistance aux AB (niveau physiologique) ?
- Altération de la perméabilité
- Modification/destruction de l’AB
- Modification/changement de la cible (ex : mutants)
Quelle est la principale différence entre un plasmide et un chromosome ?
Absence de gènes essentiels
V/F Une bactérie peut avoir deux chromosomes
Vrai
V/F Une bactérie peut avoir deux plasmides
Vrai
Quelle est la différence entre plasmide et chromosome lors de la division par fission binaire ?
Chromosome = parfaitement répliqué
Plasmides pas tout le temps parfaitement divisé
Concernant la régulation de l’expression des gènes, quel est :
- L’objectif
- Le moyen
- Le compromis
- Minimiser ses dépenses énergétiques.
- Activer seulement au besoin.
- Mais toujours être prêts à produire ce qu’il faut pour répondre rapidement.
Qu’est-ce qu’un promoteur ? Qu’est-ce qu’un opérateur ? Et par quoi sont-ils reconnus ?
- Promoteur : Séquence d’ADN située en amont d’un gène. Reconnue par ARN polymérase.
- Opérateur : Séquence d’ADN adjacente à un gène. Séquence reconnue par une protéine régulatrice (répresseur/activateur).
À quoi se lie un répresseur ?
- Promoteur
- Opérateur
- Opérateur
À quoi se lie un activateur?
A. Promoteur
B. Opérateur
A. Promoteur
Compléter : La régulation (et l’autorégulation) de l’expression des gènes est ordinairement un
processus actif qui exige que la cellule soit dans un état ____ ____
métabolite actif
Qui suis-je ? Un promoteur pour contrôler un gène. A. Régulation simple B. Régulation dans un opéron C. Régulation par un régulon D. Régulation par un stimulon
A. Régulation simple
Qui suis-je ? Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents. A. Régulation simple B. Régulation dans un opéron C. Régulation par un régulon D. Régulation par un stimulon
B. Régulation dans un opéron
Qui suis-je ? Une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome. A. Régulation simple B. Régulation dans un opéron C. Régulation par un régulon D. Régulation par un stimulon
C. Régulation par un régulon
Qui suis-je ? Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus. A. Régulation simple B. Régulation dans un opéron C. Régulation par un régulon D. Régulation par un stimulon
D. Régulation par un stimulon
Quelles sont les deux types de mutations ?
- Spontanées (erreurs pendant réplication)
2. Induites (ex : agents mutagènes)
Définir ce qu’est une mutation :
- Mauvais sens
- Non sens
- Sauvage
- Silencieuse
- Autre acide aminé créé
- Existe pas du coup STOP
- Normal
- Même acide aminé formé que normal
Toutes les bactéries forment de la résistance, pourquoi pas toujours problématique ?
Parce que système immunitaire se débarrasse du reste
Comment se fait-il que de la résistance puisse se proliférer au-dessus de la CMI ?
Car il faut que la concentration soit au-dessus de la CMI des bactéries résistantes.
Quels sont les 2 mots d’ordre pour éviter le développement de résistance dans le tx AB ?
- Traitez vite (population, biofilm)
2. Traitez efficacement (AB, dose, durée)
Il existe 5 groupes de systèmes de réparation de l’ADN chez les bactéries. Lesquels ? Et quels sont les 2 importants ?
- La réparation directe de l’ADN
- La réparation par excision
- La réparation par recombinaison
!! 4. La réponse SOS (peut stimuler le transfert horizontal de gènes)
!! 5. La réparation sujette à erreur (peut entraîner des mutations)
L’action de quels (2) AB peut activer quel système de réparation ?
La réparation sujette à erreur (peut entraîner des mutations)
Bêta-lactamines et quinolones à faible concentration
Quels sont les 3 modes d’échange de gènes chez les bactéries ?
- Transformation
- Conjugaison
- Transduction
Qu’est-ce que la transformation ?
Absorption d’ADN libre à partir de cellules lysées dans l’environnement
Qu’est-ce que la transduction ?
Le matériel génétique est introduit à partir d’un phage dans les génomes bactériens.
Qu’est-ce que la conjugaison ?
Implique le transfert d’ADN à travers des pili conjugatifs et constitue le mécanisme prédominant de transfert d’ADN entre bactéries.
Quel mode d’échange des gènes constitue le mécanisme prédominant ?
Conjugaison
Qu’est-ce que la compétence chez les bactéries ?
Capacité qu’ont certaines cellules d’être transformées
La compétence est naturelle chez certaines espèces bactériennes. Lesquelles ? (4)
- Bacillus sp.
- H. influenzae
- Neisseria sp.
- S. pneumoniae
Quel mode d’échange permet à une bactérie d’absorber de l’ADN libre provenant d’autres bactéries mortes ?
Transformation
V/F La transformation est beaucoup plus efficace entre bactéries d’une même espèce
Vrai, très peu efficace si espèces différentes
De quelle façon les AB peuvent favoriser la transformation ? (3)
- Pression sélective
- Stimulus externe augmentation la compétence
- Favorisant la lyse de cellules = ADN libre
V/F Lors de la conjugaison, le plasmide R a tout le matériel génétique pour se transmettre.
Vrai
Quel est le rôle de la cellule hôte dans le cycle lysogénique ?
Matériel génétique pour se répliquer et propager l’ADN du phage
Décrire les 5 étapes du cycle lysogénique (puis lytique) d’un bactériophage.
Diapo 86-87
Quelle est la transduction la plus fréquente ?
A. Spécialisée
B. Généralisée
Généralisée
Quelles sont les 2 différences entre la transduction spécialisée et généralisée ?
- Spécialisée : il y a le génome du phage, peut se propager
2. Généralisée : uniquement ADN de l’hôte, ne peut pas se propager
Nommez quelques (5) exemples de gènes transférés par transduction.
- Corynebacterium diphteriae
- E. Coli
- Scarlatine
- Clostridium botulinum
- Certains gènes de résistance aux bêta-lactamines chez les Pseudomonas
Qu’est-ce que la transposition ? Et que requiert-elle ?
- Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule
- Proximité
De quoi sont composés les transposons :
- Simples
- Complexes
- IS uniquement
2. IS + autres gènes
Pourquoi les transposons complexes sont importants ?
Peuvent encoder à l’intérieur de leur région centrale des gènes/toxines/résistance aux AB
Qu’est-ce qu’un intégron ?
Éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément
Quelle est la différence entre microbiome et microbiote ?
- Microbiome : lié environnement
2. Microbiote : lié hôte vivant en général
Quand lui sont transmis les premiers bons microbiotes du bébé ?
Lors de l’accouchement
Nommez quelques conséquences possibles des perturbations répétées du microbiote par les AB chez l’enfant. (8)
- Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI)
- Asthme
- Obésité
- Diabète type I
- Dermatite atypique
- Sclérose en plaques
- Cancer ?
- Autisme ?
Nommez un exemple d’évolution verticale.
Mutation
Nommez 3 exemples d’évolution horizontale.
- Transformation
- Conjugaison
- Transduction
V/F Dans le sol, les bactéries ont plus de mobilité et de sélection que chez l’humain
Faux (inverse)
Quels sont les deux (2) principaux systèmes utilisés par les bactéries pour limiter les échanges génétiques ?
- Systèmes de restriction/modification : En gros, enzyme de restriction coupe. Enzyme de modification remplace + ajout méthyl pour que enzyme de restriction ne coupe pas. Si bouts de chromosome étranger/plasmides = pas de méthyl = coupés
- CRISPR/Cas : coupe un bout qui appartient au virus et va s’en souvenir
Énumérer quelques applications de la génétique moléculaire dans la production de médicaments.
- Hormone de croissance humaine
- Insuline humaine
- Alpha-1-antitrypsine humaine
- Érythropoïétine humaine (EPO)
- DNase humaine
- Activateur du plasminogène humain
- Vaccin contre l’hépatite B
- Anticorps monoclonaux humanisés