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session 2 génétique > génétique cours 4 > Flashcards

génétique cours 4 Flashcards

1
Q

la transcription nécessite___

A

enzymes synthétisant nouveau brin d”acides nucléiques complémentaire au brin matrice

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2
Q

différence entre la réplication et la transcription:

A

dans la transcription: brin constitués de ribonucléotides
ARN polymérase : ne requiert pas d’amorce
L’ARN ne reste pas apparié au brin matrice (enzyme déplace la chaine naissante)
transcription moins fidèle que la réplication

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3
Q

combien y a t-il d’ARN polymérase chez les bactéries?

A

une seule

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4
Q

combien y a t-il d’ARN polymérase chez les Eucaryotes?

A

3 ARN polymérase (pol I, pol II, pol III)
Pol I: transcrit précurseur de l’ARNr
Pol II: plupart des gènes (tous les gènes codants des protéines)
Pol III: ARNt et ARNr 5S

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5
Q

les polymérases procaryote et eucaryote sont très apparentées (vrai ou faux)

A

vrai

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6
Q

p. 6 les homologues de polymérases chez les procaryotes et chez les eucaryotes

A

p.6 sous-unités équivalentes

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7
Q

quelle sont les phase du cycle de transcription

A

initiation, élongation, terminaison

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8
Q

qu’est ce que le promoteur?

A

séquence ADN qui fixe l’ARN polymérase + facteurs d’initiation requis (SANS PROMOTEUR, IL N’Y A PAS DE TRANSCRIPTION)

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9
Q

Initiation de la transcription en 3 étapes:

A
  1. formation complexe fermé (ADN; double brin)
  2. formation complexe ouvert (ADN: simple-brin)
  3. Polymérase démarre transcription: détache du promoteur

synthèse initiale de Arn est inefficace (courts transcrits - de 10 nucléotides)
synthèse abortive

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10
Q

ARN polymérase synthétise des brins de quelle longueur?

A

court ARN d’environ 10 bases

Si ARN de plus de 10 bases : libération ARN polymérase

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11
Q

pendant la phase d’Élongation; combien de nucléotides par seconde ?

A

52 nucléotides par seconde (polymérase bactérienne)

-déroule ADN devant elle
-réassocie brins derrière complexe
-dissocie chaine ARN de la matrice durant progression
-corrige erreurs potentielles

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12
Q

le cycle de la transcription chez les bactéries ?

A

ARN polymérase minimale (5 sous-unités): peut initier transcription n’importe où sur l’ADN
(vrai in vitro mais pas in vivo)

p.10 addition d’un facteur sigma : converti l’enzyme minimale
“holoenzyme de l’ARN polymerase” : initie transcription uniquement aux promoteurs

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13
Q

Chez E. coli : facteur σ prédominant = σ70
Promoteurs reconnus par σ70 partagent:

A

Éléments -10 et -35 (chacun 6 nucléotides/ pb en longueur)
Pas identiques pour tous les gènes

**identifier séquence consensus d’u promoteur (c’est-à-dire la séquence la plus probable de se retrouver dans un promoteur)

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14
Q

élément UP?

A

élément additionnel qui augmente la liaison polymérase: permet interaction spécifique supplémentaire Enzyme/ ADN (ex: gène ARN ribo.)

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15
Q

Certains promoteurs σ70: pas élément -35 : Possèdent région -10 allongée
(ex. gènes gal )

+ récemment, élément discriminateur en aval de ___

A

-10

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16
Q

σ70: divisé en 4 régions (régions 1 à 4)

que fait chaque région?

A

Régions 2 et 4 : reconnaissent éléments -10 et -35
Région 4 : porte 2 hélices formant motif hélice-coude-hélice:
-1ère hélice: grand sillon ADN élément -35
-2ème hélice: située en travers au dessus du sillon: établit contacts avec squelette ADN

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17
Q

les autres régions du facteur σ:

A

Élément -10 : aussi reconnu par hélice α (région 2) : interaction moins caractérisée et + complexe Élément ‘-10 allongé’ (lorsque présent): reconnu par hélice α (région 3)
Élément ‘discriminateur’ (lorsque présent): reconnu par région 1.2

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18
Q

élément UP est reconnu par quoi?

A

Pas reconnu par une hélice σ, mais par domaine C-terminal de sous-unité α de polymérase:
αCTD
αCTD relié à αNTD par pont flexible

Régions σ liant ADN (σ2 et σ4): exposées à la surface de l’enzyme et non enchâssées
p.16

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19
Q

la transition pour passer de complexe fermé à complexe ouvert implique des modifications structurales dans l’ARN poly et le promoteur

A

-Transition complexe fermé (réversible) complexe ouvert (irréversible):
-Nécessite modification structurale de l’enzyme +séparation brins ADN (expose brin matrice + brin sens)
-Au niveau positions -11(amont) à +3(aval)

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20
Q

la transition pour passer de complexe fermé à complexe ouvert implique des modifications structurales dans l’ARN poly et le promoteur

changement dans polymérase + σ70 ?

A

Dans polymérase + σ70 : transition –isomérisation
Pas d’énergie de l’hydrolyse de l’ATP

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21
Q

les canaux d’entrée et de sortie du complexe ouvert. combien de canaux et quels sont ces canaux?

A

L’enzyme comporte 5 canaux:
Canal d’entrée des NTPs au centre actif (pas visible) Canal de sortie de l’ARN
3 autres canaux: permettent l’entrée et sortie de l’ADN

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22
Q

les canaux d’entrée et de sortie du complexe ouvert

quels sont les deux changements structuraux saisissants observés?

A

1-fermeture des machoires

2-déplacmement région N-terminale σ (σ1.1)
Dans complexe fermé: σ1.1 dans foyer catalytique
Dans complexe ouvert: σ1.1 est déplacé

Brins d’ADN se séparent à partir de +3 dans centre catalytique
Brin sens : quitte le centre actif par le canal NT
Brin matrice : suit parcours passant par centre catalytique puis canal brin matrice (T)
Double hélice se reforme en -11

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23
Q

initiation de la transcription:

A

ARN polymérase: initie synthèse d’ARN sur ADN matrice sans amorce
-1er ribonucléotide amené au site actif + maintenu stable sur la matrice
-2ème NTP présenté pour permettre à la polymérisation de se dérouler

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24
Q

qu’est ce qui est particulièrement difficile dans l’initiation de la transcription

A

Particulièrement difficile : ARN polymérase débute plupart transcrits par un A
-Se lie au nucléotide matrice (T) par seulement 2 liens H+
-Enzyme doit établir interactions spécifiques avec 1er et/ou 2ème nucléotide: maintient l’un ou les 2 fermement = permettre attaque chimique du NTP entrant
-Implique différentes parties de l’holoenzyme (linker3/4 de σ)

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25
qu'est ce qui constitue à ce jour encore une énigme dans le mécanisme d'initiation de la transcription?
Mode de déplacement site actif sur matrice ADN (cycles avortés)
26
quest ce que le modèle « excursion transitoire »
Cycles translocation ARN polymérase avant/arrière
27
quest ce que le modèle « inchworming » (chenille arpenteuse)
Existerait élément flexible de polymérase Permet au module (site actif) de se déplacer vers l’aval en synthétisant court transcrit avant de se rétracter dans le corps de l’enzyme (promoteur)
28
quest ce que le modèle de compression (« scrunching ») :
ADN en aval tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme ADN s’y accumule (boucles simple brin)
29
quel modèle permet de mieux expliquer mécanisme d'initiation de la transcription
le modèle de compression (« scrunching ») : (+stable et + fréquent)
30
quest ce que la libération du promoteur implique?
briser des interactons polymérise-promoteur et noyaux de la polymérase σ
31
quest ce que la Transcription abortive?
phase initiale de transcription produisant courts transcrits (< 9 nucléotides) Ensuite, la Polymérase va se libérer du promoteur ---- phase d’élongation: Lorsqu’elle parvient à synthétiser transcrit de 10 nucléotides ARN naissant: ne peut pas rester contenu dans région où il s’hybride à l’ADN Commence à s’insérer dans le canal de sortie ARN
32
quelle région imite l'ARN?
Région du linker (lien) 3/4 qui imite l’ARN : joue rôle de mime moléculaire À élongation: éjection de la région 3/4:
33
éjection de la région 3/4 a un impact sur quoi?
probablement responsable de la diminution de la force de liaison de σ à l’enzyme σ se décroche du complexe d’élongation (après synthèse ARN ≈80 nucléotides)
34
lors de la libération du promoteur, comment est l'empilement de l'ADN dans l’enzyme (scrunching) que permet ce processus?
inversé lors de la libération du promoteur ADN est donc ré-enroulé: Réduction bulle de transcription de 22-24 nucléotides à 12-14 nucléotides ce processus: fournit énergie requise par polymérase pour: i) rompre interactions polymérase- promoteur et ii) libérer noyau de l’enzyme du facteur σ Compression : entrepose+mobilise énergie durant l’initiation transcription Libération énergie : permet polymérase détacher du promoteur + séparer σ de l’enzyme
35
quel type d'erreur survienne pendant l'élongation?
erreurs d'Incorporation À tout moment: seul 8 ou 9 nucléotides chaine ARN naissante appariés à ADN matrice
36
ARN polymérase possède 2 fonctions correctrices?
1ère : correction pyrophospholytique Catalyse enlèvement 1 ribonucléotide incorrect par incorporation PPi (P2O74-) Incorporer autre nucléotide 2ème : correction hydrolytique Enzyme recule un ou plusieurs nucléotides et clive ARN (d)
37
L’ARN polymérase peut être bloquée et doit alors être enlevée de la matrice Cause courante blocage? comment peut être la conséquence des arrêts?
brin d’ADN endommagé les conséquences peuvent être catastrophiques Obstruction pour autres polymérases essayant transcrire ce gène
38
machinerie qui enlève la polymérase bloquée et recrute enzymes de réparation (endonucléase Uvr[A]BC) cette réparation est couplée à la transcription, qui est assurée par une enzyme, laquelle?
TRCF (‘Transcription Repair Coupling Factor’) TRCF: permet la réparation des dommages: recrute enzymes de réparation (endonucléase Uvr[A]BC)
39
rôle de la TRCF (‘Transcription Repair Coupling Factor’)
-Lie ADN double brin en amont (derrière) polymérase -Utilise moteur ATPase pour se déplacer sur -ADN rencontre l’ARN polymérase bloquée Collision pousse la polymérase vers l’avant **2 issus possibles? Soit: reprend élongation ou se dissocie complexe ternaire (ARN pol/ADN matrice/ARN transcrit)
40
de quoi dépend la terminaison de la transcription?
de signaux dans la séquence d'ARN Séquences appelées « terminateurs »: Conduisent polymérase en élongation à se dissocier ADN et à libérer l’ARN
41
quels sont les 2 types de terminateurs chez les bactéries?
1er : Rho-dépendant : nécessite protéine Rho pour provoquer terminaison 2ème : Rho-indépendant : provoque terminaison sans autres facteurs
42
qu'est ce que Rho?
anneau de 6 sous-unités identiques Se fixe à l’ARN simple-brin dès qu’il sort de ARNpol (aux sites rut (Rho utilization)) Sites rut: ≈70 nucléotides sans structure secondaire: riches en C (situé près de fin gène) **Rho possède activité ATPase Énergie hydrolyse ATP requise pour terminaison *Rho incapable de lier ARN en traduction Rho induit terminaison uniquement des transcrits en cours de transcription au-delà de la fin d’un gène (ou d’un opéron)
43
quest ce que les sites rut?
≈70 nucléotides sans structure secondaire: riches en C (situé près de fin gène)
44
quel est le modèle d'action de Rho
-Rho pousserait la polymérase en avant -Rho arracherait l’ARN de la polymérase -Rho atteint duplexe hybride ARN-ADN: sépare ARN de ADN -Rho induirait un changement de conformation de la polymérase
45
Séquence d’un terminateur Rho-indépendant, aussi appelés Terminateurs intrinsèques
Deux éléments de séquence : Courte séquence répétée inversée + paires de bases A-T (≈8) Fonctionnent sur ARN et non ADN ARN en transcription: Forme structure tige-boucle (« épingle à cheveux ») Désorganisation complexe d’élongation Terminaison
46
L'épingle à cheveux conduirait à la terminaison
Provoque déplacement vers l’avant de polymérase Extirpe transcrit de la polymérase Induit changement conformation dans polymérase Fonctionne efficacement uniquement si elle est suivie par une série de bases T (U dans l’ARN)
47
chez les bactéries, la transcription nécessite une seule polymérase Ne requiert qu’un seul facteur d’initiation additionnel : (σ) chez les eucaryotes; possèdent 3 polymérases différentes : Pol I, Pol II et Pol III
Requiert plusieurs facteurs d’initiation = facteurs généraux de transcription (FGT) Accomplissent les fonctions de σ dans transcription bactérienne Aident Pol II à se fixer au promoteur + séparer brins ADN Aident Pol II détacher promoteur et engager élongation Requiert également facteurs supplémentaires: i) Protéines régulatrices liant ADN (facteurs de transcription/régulateurs) ii) Complexe « Médiateur » iii) Enzymes modification de la chromatine
48
qu'est-ce que Le promoteur minimal Pol II? quels sont les éléments
Promoteur minimal = plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par la machinerie de Pol II in vitro 40-60 nucléotides en amont ou en aval du site d’initiation de la transcription Élément reconnu par TFIIB (BRE) Élément (boîte) TATA Élément initiateur (Inr) Éléments d’aval du promoteur (DPE, DCE et MTE)
49
On en reconnaît différentes catégories selon: localisation, organisme concerné, fonction 1. Éléments proximaux du promoteur 2. Les séquences activatrices amont (UAS) 3. Les « enhancers » ou amplificateurs 4. D’autres éléments (« silencers », éléments frontière et isolateurs)
50
Initiation de la transcription par l’ARN polymérase II
Initiation de la transcription par l’ARN polymérase II Requiert formation du complexe de préinitiation (’PIC’): Ensemble des FGTs + Pol II liés au promoteur Boîte TATA (-30): TATA Reconnue par TFIID (critique pour initiation): TFIID est un Complexe de sous-unités comprenant: TBP (‘TATA binding protein’) + TAFs (‘TBP Associated Factors’) Complexe TBP-TATA: fournit plateforme pour attirer sur le promoteur d’autres FGTs + pol II TFIIA -- TFIIB -- TFIIF+polymérase -- TFIIE -- TFIIH
51
que requiert la fusion ADN du promoteur? quest ce qui stimule le déroulement de l'ADN ?
Requiert hydrolyse de l’ATP avec l’aide de TFIIH hélicase; stimule déroulement ADN Libération promoteur (eucaryotes) = 2 étapes absentes chez bactéries: 1. Hydrolyse d’ATP (en + de hydrolyse ATP pour fusion ADN par TFIIH) 2. Phosphorylation de la Pol II > sous-unité Pol II = domaine C-terminal (CTD): « queue » Série de répétitions (52 homme) heptapeptide Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser Phosphorylation CTD: aide Pol II à se défaire de la plupart des FGTs
52
que permet la Phosphorylation CTD:
aide Pol II à se défaire de la plupart des FGTs
53
Le complexe TBP-ADN
TBP: utilise large région constituée d’un feuillet β pour reconnaître petit sillon au niveau boîte TATA Inhabituel: protéines lient ADN par hélice α dans > sillon
54
Pour sélectionner TATA:
TBP se fie à la capacité de cette séquence de subir déformation structurale TBP: interagit avec phosphates (-) armature ADN par résidus Lys + Arg (+) Provoque élargissement < sillon jusqu’à configuration presque plane Replie également ADN d’un angle ≈ 80° Spécificité: dépend chaines latérales de 2 résidus phénylalanine = s’intercalent entre les paires de bases aux extrémités TATA
55
Les FGTs: TAF et TBP forment___
TBP = associée à ≈ 10 TAF Ensemble: forment le FGT TFIID
56
quelles TAF ont des similitudes avec les histones?
TAF42 et TAF62 Proposé (pas démontré) : ces TAFs lient ADN de manière semblable aux histones (ex: TAF42 et TAF62 (Droso): forment structure ressemblant tétramère H3/H4)
57
quels TAF lient les éléments du promoteur ?
Deux (TAF42 et TAF62 (TAF2 et TAF6)) lient éléments promoteur (ex : Inr et éléments en amont ou en aval)
58
Ces TAFs de type ‘histones’: présents dans TFIID mais aussi en association avec enzymes modification des histones (complexe SAGA (levure))
59
Les FGTs: TFIID (TBP+TAFs)
60
qui interagit avec TBP/TFIID et stabilise complexe?
Deux chaines polypeptidiques : interagit avec TBP/TFIID et stabilise complexe
61
Fonctions de TFIIA ?
i) Interaction TFIIA-TBP/TFIID: élimine interaction de répresseurs avec TBP qui empêchent formation du complexe d’initiation (PIC) ii) Agit comme co-activateur pour certains activateurs TFIIA: Encodé par deux gènes distincts: TFIIAα/β (TOA1): sous-unité 55kDa TFIIAγ (TOA2): sous-unité 12kDa
62
avec qui interagit TFIIA ?
Interagit avec TBP et pas avec ADN
63
Les FGTs: TFIIB combien de chaine polypeptide et rejoint qui
Une seule chaine polypeptidique : rejoint complexe de préinitiation après TBP/TFIID et TFIIA Structure cristalline : Contacts spécifiques TFIIB-TBP et TFIIB-ADN Interactions base-spécifiques avec: > sillon en amont (BRE) et
64
TFIIF
TFIIF=recruté sur promoteur déjà associé à Pol II Humain: 2 sous-unités (essentielles) = RAP74 et RAP30 Levure: 3 sous-unités (essentielles) = Tfg1 (RAP74) et Tfg2 (RAP30) (non-essentielle) = Tfg3
65
Liaison de Pol II-TFIIF provoque quoi?
Stabilise complexe ADN-TBP-TFIIB Nécessaire avant arrivée TFIIE et TFIIH dans complexe préinitiation Croit ADN s’enroule 1x autour complexe préinitiation *TFIIF: contribuerait maintenir enroulement serré ADN
66
TFIIE (2 sous-unités) = se lie ensuite au complexe = recrute et régule TFIIH TFIIH: contrôle transition complexe préinitiation (fermé) au complexe ouvert (dépendant de l’ATP) TFIIH: Plus gros et + complexe des FGTs : 10 sous-unités Deux sous-unités TFIIH (XPD et XPB) = activité ATPase (hélicase) + activité protéine kinase :
Rôle dans fusion du promoteur et dans le détachement de PolII du promoteur Impliqué dans réparation ADN (excision de nucléotide: NER (‘nucleotide excision repair’)
67
In vivo: niveaux élevés transcription et la régulation de la transcription nécessitent:
Protéines régulatrices (facteurs de transcription) Complexe Médiateur Enzyme de modification des nucléosomes Justification besoin: ADN matrice in vivo empaqueté dans chromatine Complique la liaison au promoteur de la Pol II et de ses facteurs associés
68
le médiateur a-t-il beaucoup de sous-unité? permet quoi?
Le médiateur : constitué de beaucoup de sous-unités Facilite initiation en régulant activité CTD kinase de TFIIH Associé par une face à queue CTD de Pol II Délétion individuelle de certaines sous-unités : Souvent réduction d’expression de seulement un < groupe de gènes Différent pour chaque sous-unité affectée Autres faces: interactions avec activateurs liés à ADN
69
Comparaison des Médiateurs de la levure et de l’homme
Médiateur (levure + homme) possède + de 20 sous-unités (fonctions peu connues) Une seule (Srb4/Med17) = indispensable pour transcription de presque tous les gènes Pol II in vivo Médiateurs levure + homme : organisés en modules Modules peuvent être dissociés l’un de l’autre in vitro Existe différentes formes de Médiateurs : régulation de différents groupes de gènes
70
que se passe-t-il quand Pol II libérée promoteur et initie transcription
passe à phase d’élongation Se débarasse plupart facteurs d’intiation (FGTs +Médiateur) Nouveaux facteurs vont les remplacer : certains (tel TFIIS et hSPT5) = facteurs d’élongation D’autres = nécessaires pour maturation ARN Enzymes impliquées sont recrutées au CTD Pol II Préfèrent la forme phosphorylée de CTD
71
qu'est ce qui est important pour stimulé l'élongation?
Kinase P-TEFb: adjointes Pol II par activateurs transcriptionnels Phosphoryle résidu Ser 2 répétitions CTD Corrèle avec élongation P-TEFb: recrute, phosphoryle + active autre protéine : TAT-SF1 = facteur d’élongation
72
Facteur d’élongation de Pol II: ELL
Se lient à Pol II en phase d’élongation Suppriment arrêts temporaires de l’enzyme (fréquent) Améliore processivité de Pol II
73
TFIIS joue un rôle ... autres fonctions?
TFIIS stimule taux élongation en temps de pause Pol II sur séquences qui ralentissent sa progression Contribue à vérification de séquence par Pol II Stimule activité RNase de la Pol II Stratégie alternative pour éliminer bases incorrectes par hydrolyse limitée de l’ARN Comparable à correction hydrolytique (bactéries) stimulée par Gre
74
In vivo : Chromatine gêne la transcription Identifié facteur FACT (FAcilitates Chromatin Transcription) :
Hétérodimère de 2 protéines très conservées : Spt16 et SSRP1
75
Comment fonctionne FACT?
Spt16: lie à H2A/H2B SSRP1: lie tétramère H3/H4
76
Ajout guanine (G) méthylée à quel extrémité
Ajout guanine (G) méthylée à extrémité 5’ ARN via liaison particulière 5’-5’ impliquant 3 phosphates 3 étapes enzymatiques: 1ère étape : groupe phosphate enlevé extrémité 5’ ARN 2ème étape : ajout nucléotide GMP 3ème étape : méthylation du GMP
77
après les 3 étapes de méthylation, que se passe-t-il? (3 étapes enzymatiques: 1ère étape : groupe phosphate enlevé extrémité 5’ ARN 2ème étape : ajout nucléotide GMP 3ème étape : méthylation du GMP)
Addition de la coiffe: dès ARN émerge canal sortie de Pol II
78
que se passe-t-il après l'ajout de la coiffe? RÔLE DE LA COIFFE?
Déphosphorylation Ser5 du CTD: dissociation machinerie assemblage coiffe Phosphorylation Ser2 du CTD: assemblage de machinerie épissage Stabilise ARNm (protège ribonucléases) -Export ARNm dans cytoplasme -Recrutement ribosome
79
avec quoi vient la terminaison de la transcription?
Polyadénylation
80
qu'est ce que la Polyadénylation?
Polyadénylation: intimement lié à la terminaison Lorsque la Pol II atteint la fin d’un gène : Rencontre séquence spécifique (AATAAA) transcrite ARN (AAUAAA): Stimule transfert enzymes de polyadénylation du CTD à l’ARN *CE QUI CONDUIT À 4 ÉVÈNEMENTS: 1. Clivage de ARNm 2. Ajout d’un grand nb de résidus adénine à son extrémité 3’ 3. Dégradation de l’ARN encore associé à l’ARN Pol II 4. Terminaison de la transcription
81
quels sont les 2 complexes protéiques transportés par Pol II (CTD) lorsqu’elle s’approche de fin du gène:
CPSF (Cleavage and Polyadenylation Specificity Factor) CstF (Cleavage Stimulation Factor)
82
quest ce qui stimule transfert CPSF et CstF à ARN
Signaux Poly-A: stimulent transfert CPSF et CstF à ARN Clive ARN en aval signal AAUAAA
83
rôle de CPSF:
recrute Poly-A-polymérase Ajoute ≈200 As extrémité 3’ ARN clivé Recrutement des PABP (poly (A) binding proteins) Export ARNm mature au cytoplasme
84
Pol II s'arrête quand?
ne s’arrête pas immédiatement après clivage et polyadénylation ARN Déplace sur matrice = produisant 2ème molécule ARN Plusieurs milliers nucléotides avant de s’arrêter
85
découverte récente concernant polymérase?
enzyme dégradant 2ème ARN dès qu’il émerge de la polymérase a été identifiée Cette enzyme stimule terminaison selon « modèle torpille » de la terminaison
86
caractéristiques de Extrémité libre 2ème ARN
dépourvue d’une coiffe Nouvel ARN : reconnu par RNase = Rat1 (levure) ou Xrn2 (humain)/positionnées par Rtt103 (CTD) Rat1 = très processive : dégrade rapidement ARN 5’/3’ rattrape la Pol II en transcription Terminaison : ne requiert aucune interaction spécifique entre Rat1 et Pol II Rat1/Xrn2: pousserait Pol II vers avant et/ou arracherait transcrit naissant
87
Rat1/Xrn2: pousserait Pol II vers avant et/ou arracherait transcrit naissant = Modèle préféré
88
Modèles de la terminaison: allostérique?
Terminaison: dépendrait modification structurale Pol II Réduit caractère processif Pol II terminaison spontanée Liée à la polyadénylation Provoquée par transfert enzymes modifiant ARN (CPSF et CstF) de queue CTD Pol II à ARN
89
Pol I et Pol III reconnaissent quoi ? différence avec pol II?
Pol I et Pol III reconnaissent des promoteurs distincts mais nécessitant TBP Pol I et Pol III : ressemblent à Pol II (partagent plusieurs sous-unités) Toutefois Initient transcription sur promoteurs distincts de Pol II+ transcrivent gènes distincts de Pol II **Codent des ARN spécialisés et non des protéines TBP est cependant universelle : Impliquée dans initiation de transcription par Pol I et Pol III aussi bien que Pol II
90
Pol I utile où?
Nécessaire pour l’expression d’un seul gène : précurseur des ARNr 8Promoteur ARNr constitué de 2 parties : Promoteur central + Élément de contrôle amont (UCE)
91
Deux autres facteurs requis pour initiation : SL1 et UBF
Deux autres facteurs requis pour initiation : SL1 et UBF SL1 : comprend TBP + 3 TAFs spécifiques = fixe promoteur central + requiert UBF pour liaison UBF : lie UCE: recrute SL1 stimule transcription en recrutant Pol I
92
Coeur du promoteur Pol III Promoteurs Pol III existent sous différentes formes
Certains contiennent boîte A et boîte B séparées par court élément (ex : gènes ARNt) D’autres portent boîte A et boîte C (ex : gène codant ARNr 5S) D’autres portent boîte TATA
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qu'est-ce qui est différent dans la transcription in vitro vs in vivo?
la transcription in vivo requiert des protéines supplémentaires; médiateurs -protéines régulatrices -complexe médiateur -enzyme de modification des nucléosomes *Justification de ces besoins : ADN matrice in vivo est empaqueté sous forme de chromatine Complique la liaison au promoteur de la Pol II et de ses facteurs associés

session 2 génétique (7 decks)

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