génétique cours 3 Flashcards
lors de la réplication de l’ADN, combien de pb par seconde sans erreur?
80 000 pb/ sec sans erreur
réplication de l’ADN prend 10h
pourquoi dit-on que la réplication de l’ADN est complexe?
parce qu’elle doit être rapide et fidèle
hautement spécialisée
que nécessite la réplication de l’ADN
-dNTP (desoxyribonucléotides triphosphates)
-jonction amorce: matrice (brin mère)
quel analogie pour l’ADN polymérase?
une main
la paume est parfaite pour l’affinité jonction amorce matrice parfaite
qu’y a -t-il dans la paume de la main de l’ADN polymérase?
la paume de la main correspond à la maison catalytique
2 ions métalliques divalents :
-modifient l’environnement chimique du 3 OH et du dNTP
- un des ions réduit le 3 OH en 3 O
-L’autre stabilise les phosphates B et Y
les mésappariemenets ralentissent la catalyse et vont diminuer l’affinité de l’ADN Pol pour la jonction amorce: matrice, cela entraine __
cela entraine la sortie de l’amorce du site actif
L’amorce se lie à l’exonucléase et l’ADN désapparié est enlevé.
que font les doigts de la main dans l’ADN polymérase?
doigt de la main = flexible et mobile (se referme)
lors de l’appariement correcte, les doigts de la main se referment sur le dNTP:
-rapproche le nucléotide des ions métalliques
-augmente la vitesse de catalyse
les doigts induisent une rotation laquelle?
rotation de 90 degrés entre la 1ere et la 2e base de la matrice: tout ce qu’il voit est la première disponible, ce qui est efficace
(cela empêche tout appariement d’un dNTP avec la 2e base)
le rôle du pouce?
le pouce n’aide pas à la catalyse
il maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale
il permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat
étape limitante lors de ADN polymérase?
l’étape limitante devient alors la liaison de la polymérase à sa jonction amorce: matrice (1 sec) alors que l’ajout de nucléotides prend des millisecondes
que signifie fourche de réplication ?
L’endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaires : La Fourche de réplication
la réplication se fait dans quel sens?
du sens 5’ vers 3’
comment appelle-t-on le fragment d’Okazaki?
le brin discontinu
comment appelle-t-on le brin discontinu?
fragment d’Okazaki ( 100 à 2000 nt)
l’ADN polymérase est incapable de faire l’amorce seule, besoin de __
primase: ARN polymérase consacrée à la fabrication d’amorces courtes sur la matrice monocaténaire (5-10 nt)
où trouve-t-on RNase H ?
dans l’élimination des amorces d’ARN.
-elle dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN
-Enlève tout, sauf le dernier ribonucléotide
lors de l’élimination des amorces d’ARN, qui enlève le dernier ribonucléotide
exonucléase 5’
qui remplit le trou crée lors de l’élimination des amorces d’ARN
qui répare la césure?
ADN polymérase
ADN ligase
qu’est-ce que les hélicases?
-hexamètre sous forme d’anneau
-processives
-polarité 5’ vers 3’ ou 3’ vers 5’ selon l’hélicase
que font les SSB?
protéines liant l’ADNsb pour la stabiliser
empêche le rappariement, la dégradation et la formation de boucles
**liaison coopérative: la liaison d’une SSB facilite la liaison d’une autre SSB
que font les topoisomérases?
elles coupent l’ADN et font passer les brins dans la coupure
quelles sont les protéines de La Fourche ?
-L’hélicase: séparer les brins d’ADNdb
-SSB: stabilise l’ADNsb
-primase: permet d’initier la synthèse sur n’Importe quel segment d’ADNsb
-ADN polymérase: allonger le 3’OH d’une amorce appariée à une matrice monocaténaire seulement
-topoisomérase: élimine le surenroulement généré par l’hélicase (coupe l’ADN et font passer les brins dans la coupure)
spécialisation des ADN polymérase, quel type et leur rôle?
Pol alpha (a): synthèse des amorces pendant la réplication de l’ADN
Pol delta (s): synthèse du brin discontinu de l’ADN / réparation par excision de nucléotides (NER) et BER
Pol E: synthèse du brin continu l’ADN, NER et BER
role de la primase/ pol a
initiation des brins neuf
primase fait l’amorce
pol a commence la réplication
progressivité faible
