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session 2 génétique > divers > Flashcards

divers Flashcards

1
Q

quels médiateurs sont indispensables pour la transcription de presque tous les gènes Pol II in vivo pour la levure et pour les hommes?

A

Srb4 et Med17 (tant pour levure que pour humain)

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2
Q

les plasmides portent une résistance aux ____

A

antibiotique

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3
Q

Est-ce que les plasmides sont essentiel à la bactérie?

A

non, généralement pas

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4
Q

est-ce que les polyploides se divisent?

A

la plupart des polyploides ne se divisent plus

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5
Q

qu’est-ce qu’un mégacaryocyte?

rôle?

A

cellule géante de la moelle hématopoiétique

rôle: responsable de la production plaquettes sanguines dépourvues de chromosomes

en devenant polyploide, les mégacaryocytes maintiennent un très haut niveau d’activité métaboliquequi est nécessaire à la production massive de plaquette

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6
Q

la taille du génome correspond à quoi?

A

longueur de l’ADN compris dans un jeu haploïde de chromosomes

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7
Q

corrélation entre la taille du génome entra complexité de l’organisme est comment?

A

la corrélation est imparfaite

c’est le nombre de gènes plutôt que la taille du génome qui définit la complexité d’un organisme (plus évident lorsqu’on regarde la densité génique– les organisme les plus complexes ont une densité génique plus faible)

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8
Q

vrai ou faux: le génome d’E. coli est composé exclusivement de gènes

A

vrai

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9
Q

les organisme les plus complexes ont une densité génique plus ____

A

faible

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10
Q

qu’est-ce que la densité génique

A

nombre de gènes par mégabase d’ADN génomique?

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11
Q

qui est responsable de l’assemblage de la machinerie de réplication?

A

L’origine de réplication de E. coli

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12
Q

pourquoi densité génique de l’homme est-elle 100 fois plus faible?

A

1) augmentation de la taille des gènes
2) augmentation des séquences d’ADN présentes entre chacun d’eux (séquences intergénqiues)

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13
Q

quel est la proportion d’intron dans la séquence génique?

A

95% intron

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14
Q

séquence intergénique servent à quoi?

A

contrôle de la transcription

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15
Q

rôle de la transcriptase inverse (Ti) lors de l’infection?

A

Ti copie ARNm cellulaires en ADNc (peut s’intégrer un génome de l’hôte)

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16
Q

bcp de transposons dans les cellules humaines?

A

non (rare)

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17
Q

séquences intergéniques seulement chez les humains?

A

non

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18
Q

transposons ont permis quoi?

A

la création de nouveaux gènes

sources d’amortissement des mutations dû à l’environnement

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19
Q

qui protège et réplique les extrémités des chromosomes linéaires?

A

télomères

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20
Q

dynéine et kinésine rôle?

A

protéines moteurs qui génèrent force de déplacement des chromosomes

21
Q

MAD2 controle quoi?

A

controle attachement microtubules et la tension entre kinétochore soeur

22
Q

contrôle tubulaire c’est quoi?

A

empêche l’anaphase tant que tous les chromosomes ne sont pas attaché au microtubules

23
Q

La cohésion des chromatides sœurs et la condensation des chromosomes impliquent les protéines _______

A

SMC (protéines allongées, associées par paire)
Forment des complexes multiprotéiques avec des protéines non-SMC

24
Q

la cohésine est formée de quoi?

A

Grand anneau :2 protéines SMC + 2 protéines non-SMC

1- Smc1 et Smc3 (ATPases)
Dimérisent en présence ATP (forment anneau)

2-Scc1 et Scc3
Lient domaines ATPases de Smc1 et Smc3 (stabilisent anneau)

25
Q

cohésine comprend des protéines SMC quelles autres complexe en a besoin?

A

condensine (SMC 2 et SMC4)
Facilite condensation chromosomes en reliant entre elles différentes régions éloignées du même chromosome

26
Q

ségrégation des chromosomes débute par quoi?

A

protéolyse cohésine

27
Q

attachement bivalent dans la mitose vs attachement monovalent dans les méiose

A

vrai

28
Q

dans la méiose, élimination de la cohésion des centromèreslors de

A

l’anaphase II

29
Q

quel histone n’est pas un histone de l’octamère?

A

H1 (deux fois moins abondant que les autres histones (H2A, H2B, H3 et H4) qui sont en qté égale dans la cellule)

H1 se lie à l’ADN internucléosomique

30
Q

histone (font partie du nucléosome) sont des petites protéines chargés positivement donc elle se lie à l’ADN chargé négativement

A

vrai

31
Q

au moins 20% des résidus d’acides aminés qui composent les histones qui sont chargé positivement sont ____

A

lysine et arginine

32
Q

c’est quoi le domaine globulaire des histones?

A

une région conservée retrouvée dans toutes les histones de l’octamère : domaine globulaire des histones

3 régions en hélice séparées par 2 < boucles non-structurées
Permet formation structure intermédiaire moins organisée du nucléosome :

33
Q

H2A et H2B peuvent seulement former _____
alors que H3 et H4 _____

A

H2A et H2B peuvent seulement former hétérodimères en « tête à queue » (incapable de former des tétramères)

H3 +H4 forment hétérodimères
S’associent entre-elles pour former un
tétramère H3-H4

34
Q

assemblage du nucléosome?

A

1-Tétramère H3-H4 va d’abord se lier à l’ADN
2-2 dimères H2A-H2B s’associent au complexe ADN-H3-H4

35
Q

Histones de l’octamère possèdent une extension N-terminale (« queue »)

A

Mis en évidence par digestion à la trypsine (coupe protéines après un AA chargé +)
Pas nécessaires à l’association de l’ADN avec octamère

*Sont les cibles de modifications altérant la fonction individuelle d’un nucléosome :
Phosphorylation-acétylation-méthylation Résidus sérine, lysine et arginine

36
Q

nucléosome présente un double axe de symétrie nommé:

A

axe de la dyade

37
Q

combien de points de contact entre les histones et l’ADN?

A

14 points de contact différents: un à chaque fois que le petit sillon touche l’octamère d’histone

38
Q

quest ce qui est à l’origine de la force qui permet la courbure de l’ADN?

A

ce + grand nombre de liaisons H+

Facilité par nature fortement basique des histones qui masquent la charge (-) phosphates

39
Q

la nature fortement basique des histones permet de masquer___

A

la charge négative des phosphates

40
Q

Les 4 queues H2B et H3 émergent entre les 2 sillons de l’ADN :

Les queues N-terminales H2A et H4 émergent au-dessous ou au-dessus des 2 hélices d’ADN mais pas en travers de celles-ci

A

point de sortie se forme à partir de 2 petits sillons adjacents, réalisant une ouverture (gap) entre les 2 hélices d’ADN

41
Q

caractéristiques de l’hétérochromatine vs de euchromatine

A

L’hétérochromatine : caractérisée par marquage dense avec nombreux contrastes et apparence condensée Zones de faible expression de gènes
Importante pour suppression d’expression génique

L’euchromatine : présente caractéristiques inverses (faible marquage + structure ouverte). Correspond à des régions avec niveau d’expression génique élevé
Dans les 2 cas: ADN est condensé en nucléosomes

*Différence : réside dans l’assemblage (ou non) des nucléosomes en structures complexes
les nucléosomes de l’euchromatine sont assemblé plus simplement

42
Q

H1 est chargé comment?

rôle?

A

positivement comme les histones des octaèdres (32% lys-arg)

Interagit avec l’ADN internucléosomique : resserre l’association de l’ADN avec le nucléosome

Au 147 pb protégés par les histones de l’octamère:
H1 protège 20 pb additionnelles (nucléase micrococcale (Mnase))

43
Q

site de fixation de H1

A

1er dans ADN internucléosomique et 2ème au milieu des 147 pb associées au nucléosome

En rapprochant ces 2 régions d’ADN
H1 augmente la qtée d’ADN associée au nucléosome

44
Q

Fixation H1 donne un angle mieux défini pour l’entrée et la sortie de l’ADN du nucléosome,
affectée par quoi?

A

Affectée par des variables
(pH, [ sels ], présence d’autres protéines)

45
Q

ajout de H1 entraine formation fibre 30 nm correspond au ____

2 modèles pour la fibre de 30 nm (solénoïde et en zigzag= ADN inter au travers de l’axe central de la fibre)

A

second niveau de compaction de l’ADN
(ADN devient beaucoup moins accessible aux enzymes dépendantes de l’ADN (ARN polymérases)

46
Q

queues N-terminales des histones essentiels à __

A

formation fibre 30 nm

Fonction des queues N-terminales :
Stabiliser la fibre de 30 nm par interaction entre les nucléosomes adjacents

47
Q

identifier 2 classes de protéines dans matrice nucléaire :

A

Topoisomérase II (Topo II)
Topo II: fait partie mécanisme fixation ADN à la base de ces boucles

protéines SMC
Composants clés machinerie qui condense et assemble les chromatides sœurs durant duplication des chromosomes.

48
Q

Des variants d’histones altèrent la fonction du nucléosome

A

H2A.X phosphorylé – recrute enzymes de réparation de l’ADN au site du dommage

CENP-A; variant H3 présent dans les nucléosomes associés à l’ADN du centromère Nucléosomes: incorporés dans kinétochore
CENP-A : queue N-terminale + longue que celle de H3 mais région centrale de repliement similaire

session 2 génétique (7 decks)

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