divers Flashcards
quels médiateurs sont indispensables pour la transcription de presque tous les gènes Pol II in vivo pour la levure et pour les hommes?
Srb4 et Med17 (tant pour levure que pour humain)
les plasmides portent une résistance aux ____
antibiotique
Est-ce que les plasmides sont essentiel à la bactérie?
non, généralement pas
est-ce que les polyploides se divisent?
la plupart des polyploides ne se divisent plus
qu’est-ce qu’un mégacaryocyte?
rôle?
cellule géante de la moelle hématopoiétique
rôle: responsable de la production plaquettes sanguines dépourvues de chromosomes
en devenant polyploide, les mégacaryocytes maintiennent un très haut niveau d’activité métaboliquequi est nécessaire à la production massive de plaquette
la taille du génome correspond à quoi?
longueur de l’ADN compris dans un jeu haploïde de chromosomes
corrélation entre la taille du génome entra complexité de l’organisme est comment?
la corrélation est imparfaite
c’est le nombre de gènes plutôt que la taille du génome qui définit la complexité d’un organisme (plus évident lorsqu’on regarde la densité génique– les organisme les plus complexes ont une densité génique plus faible)
vrai ou faux: le génome d’E. coli est composé exclusivement de gènes
vrai
les organisme les plus complexes ont une densité génique plus ____
faible
qu’est-ce que la densité génique
nombre de gènes par mégabase d’ADN génomique?
qui est responsable de l’assemblage de la machinerie de réplication?
L’origine de réplication de E. coli
pourquoi densité génique de l’homme est-elle 100 fois plus faible?
1) augmentation de la taille des gènes
2) augmentation des séquences d’ADN présentes entre chacun d’eux (séquences intergénqiues)
quel est la proportion d’intron dans la séquence génique?
95% intron
séquence intergénique servent à quoi?
contrôle de la transcription
rôle de la transcriptase inverse (Ti) lors de l’infection?
Ti copie ARNm cellulaires en ADNc (peut s’intégrer un génome de l’hôte)
bcp de transposons dans les cellules humaines?
non (rare)
séquences intergéniques seulement chez les humains?
non
transposons ont permis quoi?
la création de nouveaux gènes
sources d’amortissement des mutations dû à l’environnement
qui protège et réplique les extrémités des chromosomes linéaires?
télomères
dynéine et kinésine rôle?
protéines moteurs qui génèrent force de déplacement des chromosomes
MAD2 controle quoi?
controle attachement microtubules et la tension entre kinétochore soeur
contrôle tubulaire c’est quoi?
empêche l’anaphase tant que tous les chromosomes ne sont pas attaché au microtubules
La cohésion des chromatides sœurs et la condensation des chromosomes impliquent les protéines _______
SMC (protéines allongées, associées par paire)
Forment des complexes multiprotéiques avec des protéines non-SMC
la cohésine est formée de quoi?
Grand anneau :2 protéines SMC + 2 protéines non-SMC
1- Smc1 et Smc3 (ATPases)
Dimérisent en présence ATP (forment anneau)
2-Scc1 et Scc3
Lient domaines ATPases de Smc1 et Smc3 (stabilisent anneau)
cohésine comprend des protéines SMC quelles autres complexe en a besoin?
condensine (SMC 2 et SMC4)
Facilite condensation chromosomes en reliant entre elles différentes régions éloignées du même chromosome
ségrégation des chromosomes débute par quoi?
protéolyse cohésine
attachement bivalent dans la mitose vs attachement monovalent dans les méiose
vrai
dans la méiose, élimination de la cohésion des centromèreslors de
l’anaphase II
quel histone n’est pas un histone de l’octamère?
H1 (deux fois moins abondant que les autres histones (H2A, H2B, H3 et H4) qui sont en qté égale dans la cellule)
H1 se lie à l’ADN internucléosomique
histone (font partie du nucléosome) sont des petites protéines chargés positivement donc elle se lie à l’ADN chargé négativement
vrai
au moins 20% des résidus d’acides aminés qui composent les histones qui sont chargé positivement sont ____
lysine et arginine
c’est quoi le domaine globulaire des histones?
une région conservée retrouvée dans toutes les histones de l’octamère : domaine globulaire des histones
3 régions en hélice séparées par 2 < boucles non-structurées
Permet formation structure intermédiaire moins organisée du nucléosome :
H2A et H2B peuvent seulement former _____
alors que H3 et H4 _____
H2A et H2B peuvent seulement former hétérodimères en « tête à queue » (incapable de former des tétramères)
H3 +H4 forment hétérodimères
S’associent entre-elles pour former un
tétramère H3-H4
assemblage du nucléosome?
1-Tétramère H3-H4 va d’abord se lier à l’ADN
2-2 dimères H2A-H2B s’associent au complexe ADN-H3-H4
Histones de l’octamère possèdent une extension N-terminale (« queue »)
Mis en évidence par digestion à la trypsine (coupe protéines après un AA chargé +)
Pas nécessaires à l’association de l’ADN avec octamère
*Sont les cibles de modifications altérant la fonction individuelle d’un nucléosome :
Phosphorylation-acétylation-méthylation Résidus sérine, lysine et arginine
nucléosome présente un double axe de symétrie nommé:
axe de la dyade
combien de points de contact entre les histones et l’ADN?
14 points de contact différents: un à chaque fois que le petit sillon touche l’octamère d’histone
quest ce qui est à l’origine de la force qui permet la courbure de l’ADN?
ce + grand nombre de liaisons H+
Facilité par nature fortement basique des histones qui masquent la charge (-) phosphates
la nature fortement basique des histones permet de masquer___
la charge négative des phosphates
Les 4 queues H2B et H3 émergent entre les 2 sillons de l’ADN :
Les queues N-terminales H2A et H4 émergent au-dessous ou au-dessus des 2 hélices d’ADN mais pas en travers de celles-ci
point de sortie se forme à partir de 2 petits sillons adjacents, réalisant une ouverture (gap) entre les 2 hélices d’ADN
caractéristiques de l’hétérochromatine vs de euchromatine
L’hétérochromatine : caractérisée par marquage dense avec nombreux contrastes et apparence condensée Zones de faible expression de gènes
Importante pour suppression d’expression génique
L’euchromatine : présente caractéristiques inverses (faible marquage + structure ouverte). Correspond à des régions avec niveau d’expression génique élevé
Dans les 2 cas: ADN est condensé en nucléosomes
*Différence : réside dans l’assemblage (ou non) des nucléosomes en structures complexes
les nucléosomes de l’euchromatine sont assemblé plus simplement
H1 est chargé comment?
rôle?
positivement comme les histones des octaèdres (32% lys-arg)
Interagit avec l’ADN internucléosomique : resserre l’association de l’ADN avec le nucléosome
Au 147 pb protégés par les histones de l’octamère:
H1 protège 20 pb additionnelles (nucléase micrococcale (Mnase))
site de fixation de H1
1er dans ADN internucléosomique et 2ème au milieu des 147 pb associées au nucléosome
En rapprochant ces 2 régions d’ADN
H1 augmente la qtée d’ADN associée au nucléosome
Fixation H1 donne un angle mieux défini pour l’entrée et la sortie de l’ADN du nucléosome,
affectée par quoi?
Affectée par des variables
(pH, [ sels ], présence d’autres protéines)
ajout de H1 entraine formation fibre 30 nm correspond au ____
2 modèles pour la fibre de 30 nm (solénoïde et en zigzag= ADN inter au travers de l’axe central de la fibre)
second niveau de compaction de l’ADN
(ADN devient beaucoup moins accessible aux enzymes dépendantes de l’ADN (ARN polymérases)
queues N-terminales des histones essentiels à __
formation fibre 30 nm
Fonction des queues N-terminales :
Stabiliser la fibre de 30 nm par interaction entre les nucléosomes adjacents
identifier 2 classes de protéines dans matrice nucléaire :
Topoisomérase II (Topo II)
Topo II: fait partie mécanisme fixation ADN à la base de ces boucles
protéines SMC
Composants clés machinerie qui condense et assemble les chromatides sœurs durant duplication des chromosomes.
Des variants d’histones altèrent la fonction du nucléosome
H2A.X phosphorylé – recrute enzymes de réparation de l’ADN au site du dommage
CENP-A; variant H3 présent dans les nucléosomes associés à l’ADN du centromère Nucléosomes: incorporés dans kinétochore
CENP-A : queue N-terminale + longue que celle de H3 mais région centrale de repliement similaire
