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divers Flashcards

1
Q

quels médiateurs sont indispensables pour la transcription de presque tous les gènes Pol II in vivo pour la levure et pour les hommes?

A

Srb4 et Med17 (tant pour levure que pour humain)

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2
Q

les plasmides portent une résistance aux ____

A

antibiotique

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3
Q

Est-ce que les plasmides sont essentiel à la bactérie?

A

non, généralement pas

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4
Q

est-ce que les polyploides se divisent?

A

la plupart des polyploides ne se divisent plus

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5
Q

qu’est-ce qu’un mégacaryocyte?

rôle?

A

cellule géante de la moelle hématopoiétique

rôle: responsable de la production plaquettes sanguines dépourvues de chromosomes

en devenant polyploide, les mégacaryocytes maintiennent un très haut niveau d’activité métaboliquequi est nécessaire à la production massive de plaquette

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6
Q

la taille du génome correspond à quoi?

A

longueur de l’ADN compris dans un jeu haploïde de chromosomes

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7
Q

corrélation entre la taille du génome entra complexité de l’organisme est comment?

A

la corrélation est imparfaite

c’est le nombre de gènes plutôt que la taille du génome qui définit la complexité d’un organisme (plus évident lorsqu’on regarde la densité génique– les organisme les plus complexes ont une densité génique plus faible)

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8
Q

vrai ou faux: le génome d’E. coli est composé exclusivement de gènes

A

vrai

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9
Q

les organisme les plus complexes ont une densité génique plus ____

A

faible

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10
Q

qu’est-ce que la densité génique

A

nombre de gènes par mégabase d’ADN génomique?

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11
Q

qui est responsable de l’assemblage de la machinerie de réplication?

A

L’origine de réplication de E. coli

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12
Q

pourquoi densité génique de l’homme est-elle 100 fois plus faible?

A

1) augmentation de la taille des gènes
2) augmentation des séquences d’ADN présentes entre chacun d’eux (séquences intergénqiues)

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13
Q

quel est la proportion d’intron dans la séquence génique?

A

95% intron

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14
Q

séquence intergénique servent à quoi?

A

contrôle de la transcription

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15
Q

rôle de la transcriptase inverse (Ti) lors de l’infection?

A

Ti copie ARNm cellulaires en ADNc (peut s’intégrer un génome de l’hôte)

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16
Q

bcp de transposons dans les cellules humaines?

A

non (rare)

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17
Q

séquences intergéniques seulement chez les humains?

A

non

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18
Q

transposons ont permis quoi?

A

la création de nouveaux gènes

sources d’amortissement des mutations dû à l’environnement

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19
Q

qui protège et réplique les extrémités des chromosomes linéaires?

A

télomères

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20
Q

dynéine et kinésine rôle?

A

protéines moteurs qui génèrent force de déplacement des chromosomes

21
Q

MAD2 controle quoi?

A

controle attachement microtubules et la tension entre kinétochore soeur

22
Q

contrôle tubulaire c’est quoi?

A

empêche l’anaphase tant que tous les chromosomes ne sont pas attaché au microtubules

23
Q

La cohésion des chromatides sœurs et la condensation des chromosomes impliquent les protéines _______

A

SMC (protéines allongées, associées par paire)
Forment des complexes multiprotéiques avec des protéines non-SMC

24
Q

la cohésine est formée de quoi?

A

Grand anneau :2 protéines SMC + 2 protéines non-SMC

1- Smc1 et Smc3 (ATPases)
Dimérisent en présence ATP (forment anneau)

2-Scc1 et Scc3
Lient domaines ATPases de Smc1 et Smc3 (stabilisent anneau)

25
cohésine comprend des protéines SMC quelles autres complexe en a besoin?
condensine (SMC 2 et SMC4) Facilite condensation chromosomes en reliant entre elles différentes régions éloignées du même chromosome
26
ségrégation des chromosomes débute par quoi?
protéolyse cohésine
27
attachement bivalent dans la mitose vs attachement monovalent dans les méiose
vrai
28
dans la méiose, élimination de la cohésion des centromèreslors de
l'anaphase II
29
quel histone n'est pas un histone de l'octamère?
H1 (deux fois moins abondant que les autres histones (H2A, H2B, H3 et H4) qui sont en qté égale dans la cellule) H1 se lie à l'ADN internucléosomique
30
histone (font partie du nucléosome) sont des petites protéines chargés positivement donc elle se lie à l'ADN chargé négativement
vrai
31
au moins 20% des résidus d'acides aminés qui composent les histones qui sont chargé positivement sont ____
lysine et arginine
32
c'est quoi le domaine globulaire des histones?
une région conservée retrouvée dans toutes les histones de l’octamère : domaine globulaire des histones 3 régions en hélice séparées par 2 < boucles non-structurées Permet formation structure intermédiaire moins organisée du nucléosome :
33
H2A et H2B peuvent seulement former _____ alors que H3 et H4 _____
H2A et H2B peuvent seulement former hétérodimères en « tête à queue » (incapable de former des tétramères) H3 +H4 forment hétérodimères S’associent entre-elles pour former un tétramère H3-H4
34
assemblage du nucléosome?
1-Tétramère H3-H4 va d’abord se lier à l’ADN 2-2 dimères H2A-H2B s’associent au complexe ADN-H3-H4
35
Histones de l’octamère possèdent une extension N-terminale (« queue »)
Mis en évidence par digestion à la trypsine (coupe protéines après un AA chargé +) Pas nécessaires à l’association de l’ADN avec octamère *Sont les cibles de modifications altérant la fonction individuelle d’un nucléosome : Phosphorylation-acétylation-méthylation Résidus sérine, lysine et arginine
36
nucléosome présente un double axe de symétrie nommé:
axe de la dyade
37
combien de points de contact entre les histones et l'ADN?
14 points de contact différents: un à chaque fois que le petit sillon touche l'octamère d'histone
38
quest ce qui est à l'origine de la force qui permet la courbure de l'ADN?
ce + grand nombre de liaisons H+ Facilité par nature fortement basique des histones qui masquent la charge (-) phosphates
39
la nature fortement basique des histones permet de masquer___
la charge négative des phosphates
40
Les 4 queues H2B et H3 émergent entre les 2 sillons de l’ADN : Les queues N-terminales H2A et H4 émergent au-dessous ou au-dessus des 2 hélices d’ADN mais pas en travers de celles-ci
point de sortie se forme à partir de 2 petits sillons adjacents, réalisant une ouverture (gap) entre les 2 hélices d’ADN
41
caractéristiques de l'hétérochromatine vs de euchromatine
L’hétérochromatine : caractérisée par marquage dense avec nombreux contrastes et apparence condensée Zones de faible expression de gènes Importante pour suppression d’expression génique L’euchromatine : présente caractéristiques inverses (faible marquage + structure ouverte). Correspond à des régions avec niveau d’expression génique élevé Dans les 2 cas: ADN est condensé en nucléosomes *Différence : réside dans l’assemblage (ou non) des nucléosomes en structures complexes les nucléosomes de l'euchromatine sont assemblé plus simplement
42
H1 est chargé comment? rôle?
positivement comme les histones des octaèdres (32% lys-arg) Interagit avec l’ADN internucléosomique : resserre l’association de l’ADN avec le nucléosome Au 147 pb protégés par les histones de l’octamère: H1 protège 20 pb additionnelles (nucléase micrococcale (Mnase))
43
site de fixation de H1
1er dans ADN internucléosomique et 2ème au milieu des 147 pb associées au nucléosome En rapprochant ces 2 régions d’ADN H1 augmente la qtée d’ADN associée au nucléosome
44
Fixation H1 donne un angle mieux défini pour l’entrée et la sortie de l’ADN du nucléosome, affectée par quoi?
Affectée par des variables (pH, [ sels ], présence d’autres protéines)
45
ajout de H1 entraine formation fibre 30 nm correspond au ____ 2 modèles pour la fibre de 30 nm (solénoïde et en zigzag= ADN inter au travers de l'axe central de la fibre)
second niveau de compaction de l'ADN (ADN devient beaucoup moins accessible aux enzymes dépendantes de l’ADN (ARN polymérases)
46
queues N-terminales des histones essentiels à __
formation fibre 30 nm Fonction des queues N-terminales : Stabiliser la fibre de 30 nm par interaction entre les nucléosomes adjacents
47
identifier 2 classes de protéines dans matrice nucléaire :
Topoisomérase II (Topo II) Topo II: fait partie mécanisme fixation ADN à la base de ces boucles protéines SMC Composants clés machinerie qui condense et assemble les chromatides sœurs durant duplication des chromosomes.
48
Des variants d’histones altèrent la fonction du nucléosome
H2A.X phosphorylé -- recrute enzymes de réparation de l’ADN au site du dommage CENP-A; variant H3 présent dans les nucléosomes associés à l’ADN du centromère Nucléosomes: incorporés dans kinétochore CENP-A : queue N-terminale + longue que celle de H3 mais région centrale de repliement similaire

session 2 génétique (7 decks)

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