Génétique bactérienne Flashcards
«Les ____ sont les acteurs du vivant.»
protéines
Quelles sont les étapes du dogme de la biologie moléculaire? (4)
Réplication ADN
Transcription
Traduction
Protéine
Unité structurale qui permet la traduction de l’ARN en protéine:
Ribosome
Quels sont les trois grands modes de résistances possible aux antibiotiques?
altération de la perméabilité
modification/destruction de l’antibiotique
modification/changement de la cible
Type de bactérie la plus évoluée, qui bénéficie des acquis de ses ancêtres :
protéobactérie
Quelles sont les cibles possibles des antibiotiques? (9)
membrane paroi gyrases à ADN Fragmentation ADN Polymérase ARN 30s du ribosome (synthèse protéine) 50s du ribosome (synthèse protéine) isoleucine aminoacyl ARNt synthétase biosynthèse d'acide folique
Catégorie de bactéries qui possède une membrane externe :
Gram -
Structure dans laquelle on retrouve l’ADN des bactéries sous forme d’empaquetage compact :
nucléoïde
La plupart des bactéries ont en général ___ chromosome(s) de forme ____
1
circulaire
V/F : les plasmides sont dépendants du chromosome principal pour leur réplication.
faux, indépendants.
Habituellement, les plasmides ne codent pas pour _____
fonctions essentielles
Mode de division des bactéries :
fission binaire
Quels sont les trois grands types de régulation et d’expression des gènes que les bactéries utilisent afin de minimiser les dépenses énergétiques ?
changement dans la séquence d’ADN
changement dans le nombre de transcrits
changement dans la quantité de produit de gène actif
Si la bactérie n’a pas besoin de synthétiser de protéines, elle ne le fait pas grâce à la régulation post-transcriptionnelle (changement dans la quantité de produit de gène actif). Les 3 moyens de contrôle sont :
cofacteur ou groupe prostétique
clivage protéolytique (précurseur inactif)
interactions avec d’autres macromolécules
Qu’est-ce qui est produit lorsque le gène tetB est exprimé?
pompe à efflux (résistance à la tétracycline)
régulation de la résistance : pas de tétracycline -> la protéine du ___ est produite et bloque le ____ de tetB et tetR, donc empêche la transcription de ces deux gènes.
répresseur
promoteur
régulation de résistance : en présence de tétracylcine -> formation d’un ____ avec le régresseur -> ne peut plus bloquer le promoteur donc permet la ____ puis la ____ qui mène à la production de la pompe à efflux qui pompe la tétracycline hors de la bactérie.
complexe
transcription
traduction
Durant quelle phase les systèmes de régulation sont-ils le plus actif?
phase de croissance exponentielle car processus actif.
Quelles sont les 2 manières de faire de la régulation transcriptionnelle?
contrôle négatif = represseur
contrôle positif = activateur
Régulation : qu’est-ce qu’un régulon?
plusieurs promoteurs qui régulent à partir de la même protéine régulatrice (expression corégulée)
Mutatations : quelles sont les deux façons d’obtenir une mutation spontanée ?
radiations naturelles
erreurs lors de réplication
Quelle polymérase fait le + d’erreurs?
celle du rétrovirus VIH
Type de substitution de nucléotide menant généralement à une protéine de pleine longueur mais qui est défectueuse :
quel est le problème rencontré?
mauvais sens
mauvaise transcription donne un code pour un autre a.a. = pas la bonne séquence pour la protéine voulue
Type de substitution de nucléotide menant à une protéine incomplète :
quel est le problème rencontré?
non sens
mauvaise transcription donne un code non viable pour un a.a. = stop la traduction = protéine incomplète
Type de substitution de nucléotide menant tout de même à une protéine normale :
quel est le problème rencontré?
silencieuse
mauvaise transcription mène à un autre codon qui code pour le même a.a.
V/F : la pression sélective crée des mutations.
faux, elle aide au processus de sélection des mutants, mais pas à leur création
Qu’est-ce qu’une fenêtre de sélection ?
concentration d’antibiotique qui n’est pas assez élevée et qui sélectionne donc les mutants résistants
Pourquoi est-il important de prendre ses antibiotiques aux heures prescrites et prendre la quantité totale?
Pour ne pas tomber dans fenêtre de sélection et sélectionner les bactéries résistantes.
Quels sont les groupes de systèmes de réparation de l’AND pour les bactéries? (5)
réparation directe réparation par excision réparation par recombinaison réponse SOS réparation sujette à erreur
Quel type de réparation de l’ADN peut mener à des mutations?
réparation sujette à erreur
Quel type de réparation de l’ADN peut mener à un transfert de gènes?
réponse SOS
Quels antibiotiques peuvent activer les systèmes de réparation des bactéries?
bêta-lactamines
quinolones
(à faible concentration)
Quels sont les mécanismes qui permettent l’échange de gènes chez les bactéries? (3)
transformation
conjugaison
transduction
Qu’est-ce que la transformation?
bactérie peut acquérir certaines propriétés d’une autre bactérie (morte) en utilisant son ADN. exemple une bactérie non pathogène peut devenir pathogène en prenant l’ADN (contact nécessaire) d’une bactérie pathogène tuée = transformation.
Espèces ou la transformation comme mode d’échange de gènes est naturelle : (4)
Bacillus sp.
Haemophilus influenza
Neisseria sp.
Streptococcus pneumoniae
V/F: la transformation est possible uniquement entre bactéries d’une même espèce.
Faux, possible entre différentes espèces mais moins efficace.
Nom du plasmide nécessaire à la conjugaison entre bactéries pour échange de gène :
plasmide conjugatif
Nom donné au phénomène selon lequel un plasmide non conjugatif peut être transféré.
mobilisation
V/F: La conjugaison est un phénomène unidirectionnel
vrai
Structure nécessaire au rapprochement des bactéries faisant un échange de gène de type conjugaison
pili sexuel
Qu’est-ce qu’un bactériophage?
virus parasite des bactéries
Étapes du cycles lysogénique : (5)
- phage entre dans bactérie
- génome du phage s’intègre dans chromosome
- réplication
- Stress -> excision du génome du phage
- nouvelles particules de phage, libération via lyse de la bactérie.
Type de transduction qui permettrait la propagation d’une résistance dans le cas où un gène de résistance serait empacté par erreur dans le génome des nouveaux phages:
transduction spécialisée
Type de transduction où il y a un empaquetage accidentel d’ADN de l’hôte mais qui ne peut se propager:
transduction généralisée
Gènes importants transférés par transduction : (5)
type de gène, bactérie
TOXINE Corynebacterium diphteriae ENTÉROTOXINE E.Coli TOXINE Strep pyogenes TOXINES C. botulium RÉSISTANCE AUX B-LACTAMINES pseudomonas
Qu’est-ce que la transposition ?
mouvement de segments d’ADN dans une même cellule
De quoi est formé un transposon complexe?
Pourquoi ont-ils une importance médicale?
séquence d’insertion + autre(s) gène(s)
peuvent encoder des gènes de toxines/résistance dans la partie centrale (entre IS)
Quelles les 3 classes de transposons?
séquence d’insertion
transposons complexes
phages transposables
Les intégrons peuvent récolter des gènes de résistances et les intégrer l’un à la suite de l’autre devant des _________, ce qui permet d’exprimer ces gènes simultanément.
promoteurs forts
Éléments nécessaires pour faire une amplification par PCR: (5)
ADN amorce nucléotides Mg++ Polymérase
À chaque cycle de PCR, il faut monter la tempéture à 95oC pour que l’ADN double brin se ____
dénature = simple brin
Après la dénaturation, il y a l’étape d’appariement des amorces à une température de ___
55oC
L’élongation se fait à 72oC et avec l’aide des ___
polymérases
Chaque cycle de PCR permet d’augmenter la quantité de segments d’ADN de façon :
exponentielle.
Combien d’allèles possèdent chaque gène de bactéries?
un
enzyme responsable de la transcription
ARN polymérase
