Génétique 2 Claude Asselin Flashcards
Qui suis-je? Processus biologique menant à la production de deux copies identiques d’ADN à partir d’une molécule d’ADN originelle
Réplication de l’ADN
Comment pourrait-on définir la mitose?
Ségrégation des chromosomes condensés
Qu’est-ce que la cytokinèse
Division du cytoplasme
Que veut dire la réplication semi conservative du modèle de Watson Crick?
Un brin d’ADN parental est conservé et l’autre brin est une copie
La réplication de l’ADN est unidirectionnelle ou bidirectionnelle?
Bidirectionnelle
Qu’est ce qui fait le complexe de pré réplication chez les eucaryotes?
Complexe de reconnaissance de l’origine (ORC)
Protéines
Minichromosome de maintenance (MCM)
Quelles sont les similitudes entre l’initiation de la réplication chez les bactéries et eucaryotes?
Besoin d’origines de réplication
Besoin d’hélicase
Origines bi directionnelles
Besoins de plusieurs enzymes
Sélectionner pour l’initiation de la réplication chez les bactéries
* ADN polymérase I avec activité
* ADN polymérase sans activité
ARNase (protéines spécialisées
ARNase nécessaires)
* Nucléosomes à
désassembler/réassembler
* Plusieurs origines de réplication
ARNase pour enlever les
amorces
* Pas de nucléosomes à
désassembler/réassembler
* Une origine de réplication
*
ADN polymérase I avec activité
ARNase pour enlever les
amorces
*
Pas de nucléosomes à
désassembler/réassembler
*
Une origine de réplication
Sélectionner pour l’initiation de la réplication chez les eucaryotes
* ADN polymérase I avec activité
* ADN polymérase sans activité
ARNase (protéines spécialisées
ARNase nécessaires)
* Nucléosomes à
désassembler/réassembler
* Plusieurs origines de réplication
ARNase pour enlever les
amorces
* Pas de nucléosomes à
désassembler/réassembler
* Une origine de réplication
*
ADN polymérase sans activité
ARNase (protéines spécialisées
ARNase nécessaires)
*
Nucléosomes à
désassembler/réassembler
*
Plusieurs origines de réplication
L’élongation de l’ADN sr fait-il sur un sens 5’ vers 3’ ou 3’ vers 5’?
5’ vers 3’
Comment fonctionne la synthèse de l’ADN du brin indirect dans un bulle de réplication?
Formation de fragments d’Okazaki de 5’ vers 3’ joints par une
ADN ligase
Combien de nt sont incorporés incorrectement durant la réplication?
1 sur 10e5
Comment l’ADN polymérase corrige lorsqu’elle met un mauvais nt?
ADN polymérase avec une activité 3’ vers 5’ exonucléase: “recule” et corrige immédiatement le mauvais nt déposé
Comment fonctionne le processus d’amorce ARN pour la réplication de l’ADN chez les bactéries?
Synthèse brin ARN sur matrice ADN simple brin par une primase
Initiation réplication à partir de l’amorce
ARN dégradé par ADN polymérase 1
Liaison des fragments par une ligase
Choix de réponse:
* Déroulent l’ADN par hydrolyse d’ATP
* Brisent les ponts H en avant de la fourche
a) Topoisomérases
b) Protéines liant l’ADN simple brin (SSB)
c) ADN hélicase
c) ADN hélicase
Choix de réponse:
*Gardent l’ADN déroulé et accessible
b) Protéines liant l’ADN simple brin (SSB)
Choix de réponse:
*Enlèvent le surenroulement causé par le
processus de réplication
*Agissent en avant de la fourche
a) Topoisomérases
Qu’est ce qui se passe avec les nucléosomes durant la réplication chez les eucaryotes?
Relâchement devant la fourche de réplication
Nucléosomes reformés sur les brins nouvellement formés
Qui suis-je?
*composés d’unités d’ADN répétées en tandem (5’
TAGGG 3’)
*100 à 1500 copies
*À l’extrémité des ADN linéaires
Télomères
Que fait la télomérase?
Addition ‘ARN complémentaire à l’extrémité 3’ de l’ADN
Que fait l’ADN pour se protéger de la dégradation?
Formation d’une boucle fermée à l’extrémité ADN des télomères
Vrai ou faux: les télomérases sont exprimées dans la plupart des cellules
Faux
Quelles sont les 3 dommages possibles à l’ADN?
Mutations spontanées durant la réplication
Glissement durant la réplication
Dommages spontanées à des bases
Quelle est la forme la plus commune d’erreur de réplication spontanée?
Mésappariement de bases
Qu’est ce qu’un glissement de brins dans l’ADN
Augmentation du nombre de réplications et formation d’une tige boucle
Qu’est ce qu’une dépurination de l’ADN?
Hydrolyse du lien entre la base et le sucre dans l’ADN ce qui provoque la perte d’une purine
Qu’est ce que la déamination de l’ADN?
Hydrolyse causant la perte d’un groupement amino sur C, G ou A, ce qui change l’appariement de la base affectée
Quelles sont les 4 types de dommages à l’ADN?
Mutations induites par des mutagènes
Mutagènes environnementaux
Produits chimiques
Radiation
Quelle est l’effet d’un agent modifiant les bases de l’ADN?
Ajout d’un groupement à base comme une éthylation
Quelle est l’Effet d’un agent intercalant dans l’ADN?
Altèrent la forme de la double hélice ce qui produit des bris dans l’ADN
Quelle est l’effet des radiations UV sur l’ADN?
Formation d’un dimère de pyrimidines (T-T covalent) ce qui affecte la transcription et la réplication
Quelles sont les 4 mécanismes de réparation de l’ADN?
Réparation:
- par des Excision de bases
- par des Excision de nucléotides
- des mésappariements
- des bris double brin
Quelle enzyme s’occupe de la réparation par excision de bases et comment fonctionne-t-elle?
Bases déasminés ou dépurinés reconnus par ADN glycosylases:
Clivage entre base et sucre pour enlever base,
Enlèvement sucre phosphate par endonucléase AP
Synthèse par ADN polymérase
Reformation lien phosphodiester par ADN ligase
Dans quelle cas effectue-t-on la réparation par excision de nucléotides?
Lors de formations de dimères de pyrimidines
Comment fonctionne la réparation par excision de nucléotides?
Reconnaissances de distorsion dans la double hélice
Recrutement complexe UVR
Coupure brin ADN de part et d’autre du dimère T-T
Enlèvement du brin endommagé par hélicase
Réparation par ADN polymérase et ligase
Comment fonctionne la réparation des mésappariements?
Reconnaissance par MutS
Reconnaissance brin parental méthylé par MutH et coupure du brin répliqué non méthylé
Enlèveemnt bases entre coupure et mésappariement
Remplacement par la séquence correcte
Xeroderma pigmentosum est associé à la mutation de quelle type de répration
Par excision de nucléotides
Hereditary non polyposis colon cancer (HNPCC) est associé à la mutation de quelle réparation?
De mésappariements
Comment fonctionne la réparation de bris double brin non homologues?
Reconnaissance des extrémités de l’ADN brisé par les protéines Ku
Élagage des extrémités par des exonucléases
Ligation par ADN ligase IV
Peut provoquer des erreurs par la perte de pb
Comment fonctionne la réparation des bris double brin par recombinaison homologue?
Dégradation d’une porte de chaque brin par des nucléases
Invasion d’un brin de chaque chromatide soeur et appariement
Synthèse régions manquantes et utilisant comme matrice l’ADN intact
Formation de la jonction de Holliday
Quelles sont les 2 résolutions possibles de la jonction de Holliday?
Échange permanent d’ADN entre les deux chromosomes
Réparation de l’ADN brisé sans échange
Quelles sont les 4 phases du cycle cellulaire et leur temps?
G1: quelques minutes à 10h
S: 6-8h
G2: 4-6h
M: 1h
Quelles sont les 2 processus de la phase M du cycle cellulaire et leur explication?
Mitose: ségrégation des chromosomes condensés grâce aux microtuble du fuseaux mitotique en deux noyaux
Cytokinèse: Division du cytoplasme en 2 cellules filles génétiquement identique
Quelles sont les 5 phases de la mitose?
Prophase
Prométaphase
Métaphase
Anaphase
Télophase
Que se passe-t-il lors de la prophase?
Disparition du nucléole, séparation de deux chromosomes en direction opposé
Formation du fuseau mitotique constitué de microtubules qui se polymérisent à partir du centrosome contenant des centrioles
Que se passe-t-il lors de la prométaphase?
Membranes de l’enveloppe nucléaire se fragmentent
Centrosomes complètent mouvement vers les pôles
Microtubules contactent les chromosomes au niveau des centromères
Qu’est-ce qu’un centromère?
Séquence d’ADN répété en CEN
CENP-A et d’autres protéines forment le kinétochorem site d’attachement aux microtubules du fuseau
De quoi est formé le kinétochore?
Protéines qui lient l’ADN du centromère
Protéines qui lient l’extrémité + des microtubules
Que se passe-t-il lors de la métaphase?
Les chromosomes s’alignent sur la plaque équatoriale
Quelles sont les 3 types de microtubules?
Fibres du kinétochore
Fibres polaires
Fibres astériennes
Que se passe-t-il lors de l’anaphase?
Séparation de chromatides soeur et mouvement vers les pôles
Anaphase A ou B?
*Mouvement des
chromosomes vers les
pôles du fuseau
*Mouvement des deux
pôles du fuseau menant à
leur éloignement l’un de
l’autre
*Anaphase A
*Mouvement des
chromosomes vers les
pôles du fuseau
*Anaphase B
*Mouvement des deux
pôles du fuseau menant à leur éloignement l’un de l’autre
Que se passe-t-il lors de la télophase et cytokinèse?
Arrivée des chromosomes aux pôles
Décondensation des chromosomes en chromatine
Formation du nucléole et la membrane nucléaire
Division de la cellule en deux cellules filles
Quelles sont les 3 protéines moteurs responsables du mouvement des chromosomes durant l’anaphase?
Mouvement des chromosomes: le kinétochore en premier, vers les pôles durant l’anaphase A ( kinésines et MT du kinétochore
* Mouvement des pôles
du fuseau durant l’anaphase B ( moteurs kinésines bipolaires et MT polaires )
* Mouvement du fuseau vers le cortex cellulaire
de microfilaments d’actine à la membrane cellulaire ( dynéine et MT astraux
Comment fonctionne la cytokinèse?
Formation d’un sillon de division perpendiculaire au fuseau mitotique
Clivage causé par un anneau contractile
Anneau se contracte autour du cytoplasme
Quelle phase dicte la variation dans la longueur du cycle cellulaire?
G1
Donner un type de cellule pour chaque:
Cellules souches qui se divisent continuellement pour remplacer des cellules perdus
Cellules qui se divisent si elles sont stimulés
Cellules qui ne se divisent pas
Cellules souches qui se divisent continuellement pour remplacer des cellules perdus: cellules souches de l’intestin
Cellules qui se divisent si elles sont stimulés: Cellules du foie, lymphocytes
Cellules qui ne se divisent pas: cellules musculaires, nerveuses
De quoi doit s’assurer le contrôle du cycle cellulaire?
Assurer que les événements de chaque phase sont réalisés dans l’ordre
Assurer que chaque phase est compléter avant la suivante
Répondre aux conditions externes de la cellule
Qu’est ce qui influence le point de restriction en G1?
Passage influencé par des facteurs de croissance
Qu’est ce qui influence le point de transition G2-M?
Passage influencé par grosseur de la cellule, dommage à l’ADN et réplication de l’ADN
Qu’est ce qui influence le point de transition G2-M?
Passage influencé par grosseur de la cellule, dommage à l’ADN et réplication de l’ADN
Qu’est ce qui influence la transition métaphase-anaphase en phase M?
Influencé par l’attachement des chromosomes au fuseau
Qu’est ce qui contrôlé la progression à travers le cycle cellulaire?
Des kianses dépendantes des cyclines
Vrai ou faux: la concentration des cyclines ne varie pas selon les phases du cycle cellulaire
Faux
3 mécanismes du contrôle de l’activité des complexes CDK-cyclines?
Disponibilité des cyclines
Phosphorylation et déphosphorylation des CDK
Inhibition des complexes CDK-cyclines
Quelle type de CDK est constant durant le cycle cellulaire?
CDK mitotiques
Quelle est l’effet de l’activation des CDK-cyclines mitotiques?
Phosphorylent les lamines (déstabilisent l’enveloppe nucléaire)
Phosphorylent la condensine
Phosphorylent les protéines associés aux microtubules
Stimulent la destruction des cyclines mitotiques en milieu de mitose
Qu’est ce qui permet la sortie de la phase M?
Complexe de promotion de l’anaphase
Quelle est l’effet du complexe de promotion de l’anaphase?
Dégrade les cyclines mitotiques et la sécurine (inhibiteur de la séparase pour les chromatides soeurs)
Comment fonctionne le point de contrôle en G1-
S?
Activation de CDK cyclines G1
Phosphorylation de Rb
Libération de E2F de Rb et activation de la transcription de gènes impliqués dans l’entrée en phase S
Quel est le travail de P53?
Gardien du génome, s’assure de la réparation des dommages à l’ADN
Qu’est ce qui se passe au point de contrôle des dommages à l’ADN dans le cas de bris double brin?
Activation de kinases ATM/ATR, phosphorylent et stabilisent la protéine p53
Inhibent l’interaction avec Mdm2
Quelles sont les 2 résultats possibles de l’activation de p53 lors de dommages double brins de l’ADN?
- Induction de l’arrêt du cycle cellulaire et réparation:
Augmente transcription d’un inhibiteur de CDK-cycline
Pas de phosphorylation de Rb
Arrêt prolifération
Augmente la transcription des gènes impliqués dans la réparation de l’ADN - Induction de l’apoptose si dommages non réparés:
Augmente expression des gènes induisant la mort cellulaire comme Puma
Puma lie BCL-2, un inhibiteur de mort cellulaire
Mort cellulaire
Expliquer la régulation du cycle cellulaire par les facteurs de croissance de la voie ras et MAP kinases
Facteur de croissance se lie à un récepteur membranaire
Activation d’une cascade de kinases ras-raf
Translocation de MEK phosphorylé au noyau
Phosphorylation de facteurs de transcriptions régulateurs
Mettre en ordre la régulation du cycle cellulaire par les facteurs de croissance de la voie Akt-PI3-kinase
Facteur de croissance se lie à un récepteur membranaire
Activation PI3-kinase
Phosphorylation et activation de AKt
Akt inhibe l’apoptose
AKT active la croissance cellulaire
Comment décrire l’apoptose et pourquoi survient-elle?
Série programmé d’événements qui mène à la destruction des contenus d’une cellule pour empêcher d’endommager les cellules avoisiantes
Quelles sont les protéines importantes dans l’apoptose?
Protéines anti-apoptotiques comme bcl2
Protéines pro apoptotique comme bad
Clivage des procaspases en caspase active
Expliquer le mécansime d’apoptose extrinsèque (par des signaux de mort cellulaire)
Signaux de mort cellulaire
CD95 à la surface de cellules infectées
CD95 reconnu par un ligand
Regroupement de récepteurs et recrutement de propascapse-8
Activation en caspase 8
Activation de procaspase 3 en caspase 3
Induction de l’apoptose
Expliquer le mécanisme de l’apoptose par le retrait de facteurs de survie (intrinsèque)
Absence de facteurs de survie
Accumulation de protéines pro apoptotiques
Inhibition de proétines anti apoptotiques
Relâchement du cytochrome c de la mitochondrie
Stimulation de la relâche de calcium
Activation de la procaspase 9 en caspase 9 (initiatrice)
Activation de la procaspase3 en caspase 3 (exécutrice)
