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Cytophysiologie > 1er cours Examen 3 > Flashcards

1er cours Examen 3 Flashcards

1
Q

De quoi les ARN polymérases chez les eucaryotes ont besoin pour permettre la liaison de l’ARN polymérase au bon promoteur?

A

Des facteurs de transcription généraux

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Q

Expliquer la cascade de recrutement de facteurs de transcription généraux pour l’ARN polymérase II chez les eucaryotes

A

TFIID lie la boite TATA par la sous unité TBP
TFIIA et TFIIB forment complexe TFIID
Le complexe lie ARN polymérase II lié à TFIIF
Addition TFIIE et TFIIH complète le complexe de pré initiation

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3
Q

Quelles sont les 4 rôles de TBP dans l’ARN polymérase II?

A

Lie la boite TATA
Lie facteurs de transcription
Induit un pli dans ADN
Peut lier protéines associées à promoteurs sans boite TATA

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4
Q

Quelles sont les 3 rôles de TFIIH de l’ARN polymérase II?

A

Activité hélicase
Activité kinase (sur queue C-terminale de la grosse sous-unité de l’ARN polymérase II pour relâcher le promoteur
Permet de passer d’un complexe de pré-initiation à un complexe d’initiation

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Q

Expliquer le processus de la terminaison eucaryote des 3 ARN polymérases

A

I: Reconnaissance de signal de terminaison de 18 nt dans l’ARN
II: Clivage 10-35 nt en aval du signal de polyadénylation AAUAA et addition d’une queue polyA
III: Courte série de U sans besoin de protéines auxiliaires

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6
Q

Comment définir les modifications post-transcriptionnelles?

A

Changements chimiques des ARN primaires eucaryotes

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7
Q

Quelle type d’ARNr fait partie de la petite sous-unité ribosomale?

A

18S

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8
Q

Quelles sont les 3 types d’ARNr qui font partie de la grosse sous-unité ribosomale?

A

27S, 5.8S, 5S

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9
Q

Vrai ou faux: 150 à 200 copies arrangées en tandem d’un gène encodant un ARN précurseur des ARNr 18S, 5.8S et 28S

A

Vrai

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10
Q

Quelles sont les 2 modifications post transcriptionnelles des ARNr?

A

Clivage pour enlever les intervalles transcrits
Pré-ARNr modifié par ajout de groupements méthtyl (protège du clivage)

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11
Q

Qui guide la méthylation et le clivage des ARNr?

A

Les snoARN

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12
Q

Quelle ARN polymérase transcrit l’unité de transcription du pré-ARNt?

A

ARN polymérase III

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13
Q

Quelle forme est adopté par l’ARNt après modification chimique?

A

Structure secondaire en feuille de trèfle

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14
Q

Quelles sont les 4 modifications post transcriptionnelles des pré-ARNt?

A

Enlèvement d’une séquence de tête de 16 nt à l’extrémité 5’
Enlèvement des 2 nt terminaux et remplacement par CCA à l’extrémité 3’
Modification chimiques de 10-15% des nt de l’ARNt
Enlèvement d’une séquence interne, un intron ARN de 14 nt

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15
Q

Vrai ou faux: l’ARNm des bactéries doit subir des modifications post-transcriptionnelles

A

Faux

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16
Q

Quelles sont les 3 types de modification post transcriptionnelles de l’ARNm chez les eucaryotes?

A

Pose de la coiffe
Polyadénylation
Épissage

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17
Q

Comment se fait la pose de la coiffe sur les pré-ARNm chez les eucaryotes et le rôle de la coiffe?

A

Ajout d’un nucléotide modifié (guanosine méthylé)
Rôles: Stabilité de l’ARNm par la dégradation
Signal qui assure le positionnement de l’ARNm sur le ribosome

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18
Q

Expliquer les étapes de la polyadénylation du pré-ARNm chez les eucaryotes

A

Clivage de 10-35 nt en aval d’une séquence de polyadénylation AAUAAA
Addition de 50 à 250 A par une polyA polymérase

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19
Q

Quelles sont les 3 rôles de la queue polyA?

A

Stabilité de l’ARNm
Signal permettant à des protéines permettant l’exportation de l’ARNm du noyau au cytoplasme
Signal reconnu par le ribosome

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20
Q

Comment décrire le phénomène d’épissage?

A

Processus de retirer les introns et lier les exons

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21
Q

Vrai ou faux: le nombre d’introns est presque identique d’un gène à l’autre

A

Faux, il varie grandement

22
Q

Qu’est ce qui catalyse le retrait des introns et qu’est-il?

A

Un spliceosome est un complexe contenant 5 types de snARN

23
Q

Expliquer les étapes de l’épissage du pré-ARNm

A

Liaison snRNP U1 à la jonction 5’ de l’intron
Liaison U2 à la boite de branchement
Liaison U4/U6 et U5 qui rapproche les extrémités de l’intron
Clivage de l’extrémité 3’ de l’intron
Jonction de l’extrémité 5’ avec un nt A localisé dans la boite de branchement créant un lasso
Clivage de l’extrémité 3’ de l’intron
Relâchement et dégradation de l’intron sous forme de lasso et ligation des exons
Liaison d’un complexe de jonctions des exons (EJC)

24
Q

Quelles sont les 3 rôles des introns?

A

Peuvent donner des produits fonctionnels
Permet l’épissage alternatif
Permet l’évolution de nouveaux gènes

25
Q

Comment décrire l’épissage alternatif?

A

Utilisation de certains sites d’épissage au lieu et d’autres et création de protéines avec des fonctions différentes

26
Q

À quoi sert le domaine C-terminal de l’ARN polymérase II?

A

Coordonne co-transcriptionnellement les modifications de l’ARN par l’intermédiaire de répétitions phosphorylées sur sérines

27
Q

Quelles sont les 5 composantes majeurs de la traduction?

A

Ribosomes
ARNt
Aminoacyl-ARNt synthétases
ARNm
Facteurs protéiques

28
Q

En quoi les ribosomes sont responsables de la synthèse des polypeptides?

A

Oriente l’ARNm et les ARNt
Catalyse la formations des liens peptidiques

29
Q

Quelles sont les 4 sites de liaison du ribosome?

A

Pour l’ARNm
Site A qui lie l’ARNt nouvellement arrivé
Site P qui lie l’ARNt portant la chaîne polypeptidiques
Site E qui lie l’ARNt déchargé

30
Q

Comment décrire l’ARNt?

A

Adaptateur qui sert d’intermédiaire entre l’AA et l’ARNm

31
Q

Quelles sont les 2 sites de liaison de l’ARNt?

A

Le codon et l’anticodon

32
Q

Comment est lié l’ARNt à l’acide aminé?

A

Lien ester entre l’AA et le 3’-OH de l’extrémité 3’ des ARNt

33
Q

Combien existe-t-il de 20 aminoacyl-ARNt synthétase?

A

20 pour lier chaque AA à l’ARNt

34
Q

Qu’est ce qu’un anticodon?

A

Séquence de 3 nt de l’ARNt complémentaire à un ou plusieurs codons de l’ARNm

35
Q

Pourquoi l’ARNt peut reconnaitre plus d’un codon?

A

Grâce à une flexibilité de pairage avec la 3e base du codon appelé wobble

36
Q

À quoi set les aminoacyl-ARNt synthétases?

A

Catalysent la formation d’un lien ester entre l’AA et l’ARNt

37
Q

Quelles sont les étapes de l’activation d’un AA par l’aminoacyl-ARNt synthétases?

A

AA et ATP lient le site actif de l’enzyme
ATP hydrolysé qui permet la liaison de l’AMP et de l’AA au site actif
AMP est déplacé par ARNt créant un ARNt aminoacylé
ARNt aminoacylé est relâché de l’enzyme

38
Q

Quelles sont les structures de l’ARNm des procaryotes et des eucaryotes?

A

Procaryote:
Région 5’ non traduite avec site de liaison du ribosome
Site d’initiation de traduction AUG
Séquence codante suivi d’un codon d’arrêt de traduction
Eucaryote:
Coiffe et région 5’ non traduite
Site d’initiation de traduction AUG
Séquence codante suivi d’un codon d’arrêt de traduction
Région 3’ non traduite et queue polyA

39
Q

Qu’est ce qui permet la reconnaissance de l’orientation de l’ARNm par les ribosomes chez les procaryotes et les eucaryotes?

A

Pro:
Site de liaison du ribosome (séquence Shine-Dalgarno) de 3 à 9 purines
Eucaryote: Coiffe

40
Q

Qu’est ce qui est nécessaire pour l’initiation, l’élongation et la terminaison?

A

Des facteurs protéiques

41
Q

Expliquer les étapes de la traduction chez les bactéries

A

3 facteurs d’intiation (IF1, IF2-GTP,IF3) lient la petite sous-unité ribosomale 30S
IF2-GTP permet la reconnaissance des ARNt avec méthionine formylée
ARNt intiateur et ARNm lient 30S pour former le complexe d’initiation 30S
La grosse sous unité ribosomale 50S lie 30S entraînant l’hydrolyse de GTP et le relâchement de IF2 et IF1

42
Q

Quelle est la différence de l’initiation de la traduction chez les eucaryotes et les bactéries?

A

ARNt initiateur porte une méthionine non formylée
Sous unités ribosomales plus grosses
Différents facteurs d’initiation (eIF)

43
Q

Expliquer le mécanisme de l’initiation de la traduction chez les eucaryotes

A

eIF2 avec GTP lie l’ARNt initiateur
Formation d’un complexe de préinitiation 43Sliant l’ARNm
eIF2-GTP hydrolysé en GDP
Petite sous unité ribosomale portant ARNt parcourt ARNm jusqu’à AUG (précédé d’une séquence conservée (séquence de Kozak ACCAUGG)
Appariement de l’ARNt à AUG et recrutement de la grande sous unité ribosomale

44
Q

À quoi sert l’interaction entre la queue polyA et le facteur d’initiation de traduction?

A

Promotion de l’initiation de la traduction et stabilisation des extrémités 5’ et 3’ des ARNm

45
Q

Expliquer le mécanisme général de l’élongation de la chaîne polypeptidique chez les bactéries

A

Liaison de l’ARNt aminoacylé au site A
Formation du lien peptidique entre carboxyl de AA au site P et groupe amino du site Apour former lien peptidyl ARNt catalysé par ARNr 23S
Translocation: ARNm avance de 3 nt, peptidyl ARNt en A se déplace au site P et l’ARNT vide se déplace au site E

46
Q

Expliquer la terminaison de la chaîne polypeptidique chez les bactéries (Codons de terminaison ne sont pas reconnus par des ARNt)

A

Une fois au site A, des facteurs de largage avec GTP lient le codon de terminaison
Relâchement du polypeptide de l’ARNt peptidyl par clivage hydrolytique et hydrolyse du GTP
Dissociation du ribosome

47
Q

Quelles sont les 2 types de mutation affectant une paire de bases?

A

Substitution
Insertions ou délétions

48
Q

Assoicer le bon type de substitutions
Faux sens
Non sens
Silencieuse
Codon d’arrêt est au mauvais endroit
Dernier codon donne le même AA
Changement d’AA

A

Faux sens: Changement d’AA
Non sens: Codon d’arrêt est au mauvais endroit
Silencieuse: Dernier codon donne le même AA

49
Q

Quelles sont les 4 types de mutation affectant de longs segments d’ADN?

A

Insertion et délétion
Duplication
Inversion
Translocation

50
Q

Comment fonctionne la dégradation des ARNm non-sens?

A

Reconnaissance d’un codon d’arrêt dans l’ARNm avant le dernier complexe de jonctions des exons (codon d’arrêt prématuré)
Arrêt de la traduction et destruction de l’ARNm par des nucléosomes

51
Q

Comment fonctionne la dégradation des ARNm sans codon de terminaison?

A

Ribosome bloqué à la fin d’un ARNm sans codon de terminaison
Liaison d’un complexe de dégradation de l’ARN au site A vide de l’ARNm et dégradation de l’ARNm

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