Cours 2: compartiments cellulaires des protéines Flashcards
Le peptide signal fait-il partie de la séquence qui encode la protéine dans la séquence continue?
Non
Quelle type de protéines donne des protéines à séquence discontinue?
Des protéines transmembranaires
Quelles sont les 4 fonctions de la mitochondrie?
Production d’énergie
Mort cellulaire (relâchent les cytochromes)
Réservoir de calcium
Production de chaleur
Par quelle complexe sont reconnus les protéines avec un signal en N terminal vers la mitochondrie?
Le complexe TOM 20
Quelle complexe reconnait les protéines avec un signal interne?
Le complexe TOM 70
Quel est le rôle des protéines chaperonnes Hsp70?
Maintient le peptide dans une forme linéaire pour son entrée dans la mitochondrie
Quelles sont les 6 étapes du mécanisme d’importation des polypeptides dans la mitochondrie?
- Liaison des Hsp70
- Reconnaissance du séquence de transit par TOM
- Engagement du polypeptide dans le complexe de translocase TOM-TIM
- Clivage du séquence de transit
- Translocation du polypeptide (mtHsp70 maintien le polypeptide sous forme immature)
- Le polypeptide acquiert sa forme mature à l’aide des Hsp60
Quelle enzyme détache la séquence de transit?
La transit peptidase
Vrai ou faux: le détachement des Hsp70 ne se fait pas avec l’ATP
Faux
Que fait comme chemin les polypeptides destinés à la matrice mitochondriale?
TOM - TIM23 - PAM - MPP
Que fait comme chemin les polypeptides destinés à la membrane externe de la mitochondrie?
TOM - small tims - SAM
Que fait comme chemin les polypeptides destinés à la membrane interne de la mitochondrie?
TOM - small tims - TIM22
Quelles sont les 2 enzymes oxydatives principales dans les péroxysomes?
Catalse et oxydase
Les péroxysomes contiennent quelle famille de cytochrome?
La famille du cytochrome P450
Quelle protéine s’occupe du transport dans les péroxysomes?
Les peroxynes ou PEX
Quelles sont les 3 rôles dans le développement des péroxysomes par le transport des protéines?
Formation de la membrane
Prolifération de péroxysomes
Importation des protéines
Quelles sont les 3 étapes de la biogénèse des péroxysomes?
Arrivé des lipides, des protéines membranaire et de la matrice du cytosol
Division du péroxysome
Arrivé des protéines PEX induit la biogénèse et donne le signal de division
Quel est le processus d’importation des protéines dans la membrane des péroxysomes?
Liaison de PMP à PEX19p
Liaison du complexe PMP/Pex19p à PEX3p
Libération de PMP par Pex19p et libération de celle-ci pour une autre importation
Quelles sont les rôles de PEX19? (2)
Chaperon soluble et récepteur d’information
Stabilise le PMP
Quelle est le processus d’importation des protéines dans la matrice des péroxysomes?
- Ciblage et liaison de PTS1 à PEX5
- Liaison du complexe PEX5-PTS1 à la membrane
- Translocation et relâche du PTS1 par l’importemer (ATP indépendant)
- Recyclage du récepteur PEX5
Quelles sont les effets d’une monoubquitinylation et d’une polyubquitinylation de PEX5?
Mono: Recyclage
Poly: Dégradation
Quelles sont les types de protéines pour KDEL et KKXX?
KDEL: protéine soluble
KKXX: protéines membranaire
Quelles sont les 6 étapes de l’importation co-traductionnelle dans le RER?
- Liaison de SRP à la séquence signal (bouchon)
- Liaison du SRP à son récepteur, ancrage du ribosome à la membrane du RER
- Liaison du GTP au complexe SRP/SRP-R, ouverture pore et insertion polypeptide
- Hydrolyse GTP et libération protéines SRP
- Clivage séquence signal et importation du polypeptide dans la lumière du RER
- Libération du polypeptide dans la lumière, libération du ribosome et fermeture du pore du translocon
Quelles sont les 2 types de protéines dans la lumière du RE?
Protéine en transit
Protéines résidentes
Quelle est la séquence de signal pour une protéine membranaire à plusieurs passages?
Start/ Start/ stop/ start, etc
Quelles sont les translocons qui reconnaissent les start/ stop?
Les SEC61
Quelles sont les étapes de glycosylation des protéines dans le RER?
- Ajout d’un premier groupe N-acétylglucosamine-PO4
- Ajout d’un deuxième groupe N-acétylglucosamine-PO4
- Ajout de 5 résidus mannoses
- Transolcaction de l’oligosaccharide du cytosol vers la lumière du RER avec flippase
- Transfert du groupement saccharide sur un résidu asparagine de la protéine
- Hydrolyse de 3 unités glucose et 1 unité de mannose
Quelles sont les 4 étapes du QC des glycoprotéines?
- A’jout d’un résidu mannose par UGGT
- Reconnaissance par calnexin et formation de liens disulfures
- Si protéines pas dans la bonne conformation, reconnaissance par UGGT et ajout d’un autre unité de glucose pour autre ronde QC
- Si protéine OK, pas de reconnaissance de UGGT et celle-ci quitte le RER
Quelle est l’importance de la glycosylation? (4 raisons)
- Glyco-code
- Plus de résistance à la digestion protéolytique
- Modifie les propriétés antigéniques d’une protéine
- Module la signalisation et la spécificité des récepteurs membranaires
Quelles sont les 2 types de transport entre le RE et le Golgi?
Transport antérograde
Transport rétrograde
Avec quoi se fait l’adresse des vésicules?
Avec les Rab
Quelles sont les 3 types de manteau qui assure la protection des vésicules?
Manteau de clatherine
Manteau COP I
Manteau COP II
Quelle est la forme des molécules du manteau de clatherine?
Triskelion
Quelles sont les 4 étapes de l’assemblage du vésicule de transport?
Assemblage du manteau et sélection des cargos
Formation du bourgeon
Formation du vésicule
Détachement du manteau
Quel est le rôle des dynamines?
Vient libérer les vésicules en fusionnant avec la membrane
Dans quelle type de transports retrouve-t-on les manteau COP I et COP II?
COP I: entre différents éléments du Golgi
COP II: entre RE et Golgi
Quelle système de récepteurs complémentaire s’assure de l’ancrage du vésicule à la membrane?
Les SNARE
Quelles sont les 2 modèles de transport dans le Golgi?
Modèle de transport vésiculaire (Golgi statique)
Modèle de maturation cisterne (dyanmique)
Quelle Groupement mentionne que le peptide est destiné au lysosome?
Le mannose-6-phosphate
Quelles sont les rôles des lysosomes? (2)
Digestion: macrophagie et microphagie
Digestion d’éléments extracellulaires
Pourquoi la cellule fait de l’autophagie?
Recycler des constituants cytoplasmiques pour la survie de la cellule
Quelles sont les 2 types d’endoctyose?
Phagocytose
Pinocytose
Combien de % de membrane sont consommés par minute avec l’endocytose?
1-5%
Quelle est le mécanisme d’endocytose par récepteur interposé? (8)
- Liaison du ligand au récepteur
- Diffusion latérale
- Invagination du contenu
- Formation du vésicule
- Détachement du manteau de clatherine
- Fusion avec un endosome précose et libération du ligand
7a. Transport de l’endosome mature et au lysosome pour digestion
7b. Transport du récepteur jusqu’à la surface de la cellule pour recyclage
Quelles sont les 2 voies de sécrétion d’exocytose?
Voie constitutive (majorité des protéines d’exportation, renouvellement protéine membranaire et matrice)
Voie régulée (retrouvé dans cellules spécialisés, sécrétion sur demande)