2e cours Examen 3 Flashcards
Quelle est la définition de la différenciation cellulaire?
Cellules différenciées produites à partir de cellules non-spécialisées et immatures (cellules souches)
Quelles ont été les 2 conclusions du clonage à partir de cellules adultes?
1: Le noyau de cellules différenciées contient tous les gènes menant à la création d’un organisme du même type: noyau totipotent
2: La différenciation d’une cellule n’est pas irréversible
Quelle est la caractéristique des cellules souche
Capacité de se diviser continuellement et de produire des cellules progénitrices se différenciant en quelques types cellulaires (cellules multipotentes) ou en tous types de cellules (cellules souches embryonnaires)
Cellules souches embryonnaires ou pluripotentes induites? Je suis dérivée du blastocyte, je peux être maintenu et me différencier en culture
Cellules souches embryonnaires
Choix de réponse: Augmentation de 4000 fois des 500 copies des gènes encodant les ARNr 5.8S et18S et 28S durant l’ovogénèse de Xenopus
a) Réarrangements de l’ADN
b) Amplification
c) Délétion
a) Amplification
Élimination du noyau cellulaire des globules rouges
a) Réarrangements de l’ADN
b) Amplification
c) Délétion
c) Délétion
Qu’est ce qui caractérise la chromatine décondensée dans les cellules de mammifères? (4)
Dégradation accrue de la chromatine transcriptionnellement active par la DNase I
Présence de sites hypersensibles à la DNase I
Absence de l’histone H1
Contenu en protéines HMG (protéines non-histones
Vrai ou faux: La méthylation de l’ADN est associée à l’accélération des gènes
Faux, il est associée à la répression des gènes
Vrai ou faux: La méthylation de l’ADN est une altération stable dans l’expression des gènes qui peut être transmise d’une génération cellulaire à l’autre sas changement dans la séquence de base
Vrai
Quelles sont les 2 mécanismes d’inactivation de la transcription par la méthylation de l’ADN?
- La méthylation peut inhiber la liaison de facteurs de transcription régulateur
- La méthylation peut servir de sites de liaison de protéines condensant la chromatine (MeCP2 lie au méthyl CpG, reconnaissance par des histones désacétylases qui mène à une compaction de la chromatine)
3 exemples de régulation épigénétique par la méthylation de l’ADN?
Inactivation du chromosome X chez les femelles
Méthylation différentielle de promoteurs selon leur activité
Empreinte génomique parentale
Vrai ou faux: L’environnement n’a aucun effet sur les patrons de méthylation
Faux
Qu’est ce qui forme le code histone?
Combinaisons différentes de modifications post-traductionnelles des queues N-terminales des histones
Quelles sont les 3 protéines impliquées dans les modifications d’histone et définir qu’est ce qu’elles font
Writer: Enzyme qui ajoute une modification acétyl, méthyl ou autre aux histones
Eraser: Enzyme qui enlève une modification acétyl, méthyl ou autre aux histones
Reader: Protéine qui reconnaît une ou des modifications d’histones par des domaines de reconnaissance comme un bromodomaine ou un chromodomaine
Quelle protéine effectue l’acétylation des histones et son rôle avec la chromatine
Acétylation se fait par les HAT promeut une décondensation de la chromatine ce qui favorise l’expression des gènes
Quelle protéine effectue la désacétylation des histones et son rôle avec la chromatine
Désacétylation se fait par les HDAC et promeut la condensation de la chromatine et réprime l’expression des gènes
La méthylation de la lysine 9 de l’histone H3 (H3K9), H3K4 et H3K27 est associé à une répression ou une activation transcriptionnelle?
H3K9: Répression
H3K4: Activation
H3K27: Répression
Vrai ou faux: Les lysines peuvent porter 1 seul groupement méthyl
Faux, peut en porter 1,2 ou 3
Que font les protéines de remodelage de la chromatine de la famille SWI/SNF avec l’ATP
Font glisser les nucléosomes, ou les éjectent, ou remplacent les histones par d’autres histones et peuvent lier les régions acétylés des histones
Qui sont responsable de la transcription différentielle des gènes?
Facteurs de transcription régulateurs et chromatine
Quels sont les éléments de contrôle de la transcription dans l’ADN?
Promoteur de base, facteur de transcriptions généraux, éléments de contrôle proximaux, amplificateur, silencer et insulateur
Expliquer qu’est ce qu’un amplificateur et son action
Plusieurs courtes séquences d’ADN rapprochés liant des facteurs de transcription régulateur dont l’action est indépendante de la position et de l’orientation
Que fait un silencer et un insulateur?
Silencer: inhibe la transcription
Insulateur: retreint l’utilisation des amplificateurs et silencers
Quelles sont les 3 rôles des facteurs de transcription régulateurs?
Augmentent ou diminuent l’initiation de transcription en recrutant et stabilisant les composants du complexe transcriptionnel
Recrutent des co activateurs ou co répresseurs
Recrutent un complexe appelé médiateur, un coactivateur qui sert de pont entre les facteurs de transcription régulateur liées à des amplificateurs et le complexe transcriptionnel
Qu’est ce que prévoit le modèle combinatoire dans les facteurs de transcription régulateur?
Le modèle combinatoire
prévoit que l’expression des
gènes dépend d’une
combinaison de facteurs de
transcription régulateurs
ubiquitaires et tissu
spécifiques, liant de multiples
éléments de contrôle dans
l’ADN qui varient d’un gène à
l’autre.
Expliquer le modèle d’action d’un amplificateur
Facteurs de transcription régulateurs lient la séquence ADN de l’amplificateur
Liaison entraîne la formation d’une boucle dans l’ADN qui rapproche l’amplificateur du promoteur
Facteurs de transcription régulateur interagissent avec modificateur histones HAT ou SWI/SNF
Facteur de transcription régulateur lient complexe médiateur qui stabilise le complexe transcriptionnel au promoteur
Comment s’appelle le complexe de l’activateur et du facteur de transcription régulateur?
Enhanceosome
Quelles sont les 2 domaines principaux des facteurs de transcription régulateur?
Domaine de liaison à l’ADN
Domaine de régulation transcriptionnelle ou d’activation impliqué dans des interactions protéine-protéine
Quelle est le 3e domaine de liaison des récepteurs stéroïdiens?
Un domaine de liaison aux ligands hormonaux
Quelles sont les 4 classes de facteurs de transcription régulateur selon les motifs de liaison à l’ADN?
Motif hélice-tour-hélice
Motif doigt de zinc
Motif leucine zipper
Motif hélice-boucle-hélice
Quelles sont les 3 effets possibles de la régulation post-traductionnelles des facteurs de transcription par phosphorylation avec des kinases?
Augmente ou diminue la capacité de lier l’ADN
Augmente ou diminue la capacité d’activation ou des répression (modifie les interactions protéine-protéine)
Modifie la localisation (translocation)
Expliquer le mécanisme d’activation de la transcription par un ligand avec un récepteur des glucostéroides
Mécanisme d’activation
–GR cytosolique lié à des protéines
chaperon Hsp
–Liaison de cortisol à GR et relâchement des
protéines Hsp
–Translocation
au noyau et liaison à une
séquence GRE sous forme de dimères
–Recrutement de coactivateurs
(300/CBP)
Expliquer le mécanisme de régulation de la transcription par phosphorylation
–Suite à un signal, production
d’ AMPc et activation de la protéine kinase A
–Translocation de la protéine kinase A au noyau
–Phosphorylation de CREB présent sur le site CRE dans la chromatine sur sérine 133
– Recrutement du coactivateur CBP (CREB binding protein ), une HAT qui acétyle les histones
