Génétique Flashcards
Quelles sont les 2 catégories de pathologies de l’hérédité ?
- Anomalie due à une mutation génétique (identifiée par la biochimie ou biologie moléculaire, souvent suspecté à l’histologie) (maladies de surcharge)
- Anomalie visible morphologiquement et est identifié par la cytogénétique
Le génome est composé de combien de gènes ?
20 000 à 25 000 gènes
Combien de % de l’ADN est occupé par les gènes humains ?
2% seulement
Donne la définition d’un gène.
Un gène correspond à un segment dADN contenant une information particulière.
Donne la définition de génotype ou génome.
Ensemble des gènes d’un individu
Donne la définition de caractère.
Un caractère est une particularité observable chez un individu. Un caractère représente l’expression d’un gène particulier, la manifestation de ce gène.
Donne la définition de phénotype.
Ensemble des caractéristiques observables/apparents (que l’on voit) chez un individu sans consulter son histoire familiale.
Vrai ou faux
Un gène = un caractère phénotypique.
Faux
Un gène n’égale pas nécessairement un caractère phénotypique.
Donne la définition de locus.
Un locus se définit comme l’endroit occupé physiquement par une fonction génique (un gène) sur un chromosome et son homologue.
Donne la définition d’allèle.
Un allèle est l’une ou l’autre forme d’un gène occupant un locus défini sur une paire chromosomique déterminée.
Définis ce qu’est la polyallélie.
Pour une fonction génique, il peut y avoir plusieurs allèles dans une population
Vrai ou faux
Un individu normal peut posséder plus de deux allèles à la fois pour un locus donné.
Faux,
il NE peut PAS posséder plus de deux allèles à la fois pour un locus donné.
Donne la définition de syndrome.
Le syndrome est une condition clinique dans laquelle on peut reconnaître un nombre important de modifications phénotypiques constantes chez plusieurs individus.
Vrai ou faux
Une personne porteuse d’un gène anormal peut être phénotypiquement normale pendant une bonne partie de sa vie.
Vrai
Est-ce que le phénotype est toujours une indication fidèle du génotype ?
Non, car les étapes du développement peuvent produire des effets différents pour un même gène.
Qu’est-ce que le pléiotropisme ?
Un même gène peut avoir plusieurs effets
Qu’est-ce que l’hétérogénéité génique ?
Plusieurs gènes peuvent avoir le même effet.
Qu’est-ce que la phénocopie ?
Des agents du milieu peuvent stimuler les effets d’un gène.
Qu’est-ce qu’une maladie congénitale ?
Une maladie présente à la naissance
Vrai ou faux
Une maladie héréditaire est obligatoirement congénitale.
Faux, car une maladie héréditaire peut apparaitre plus tard dans la vie, donc elle est non-congénitale, mais héréditaire.
Qu’est-ce que le syndrome d’alcoolisation foetale ?
Il s’agit d’une maladie congénitale non héréditaire caractérisée par :
- un retard mentale
- microcéphalie
- anomalies cardiaques
- insuffisance réénal
- retard de croissance
Vrai ou faux
Certaines différences peuvent dépendre de l’environnement et de la génétique.
Vrai
Ex : cancers et infections
Qu’est-ce qui compose le nucléotide ? (3)
Base azotée, sucre, phosphate
Qu’est-ce que le nucléosme ?
Unité de base d’organisation de la chromatine.
Il s’agit d’un segment d’ADN + complexe d’histones en octamère (coeur protéique)
Que permet le nucléosome ?
Permet la condensation de l’ADN en chromatine
Plus l’ADN est condensé, _____ les gènes pourront être transcrits.
Plus l’ADN est condensé, MOINS les gènes pourront être transcrits.
Décris l’euchromatine. (2)
- Moins condensée
- Contient les gènes transcrits
Décris l’hétérochromatine. (4)
- Hyper compact
- Toujours condensée
- Contient les gènes non transcrit
- Contient peu de gènes : télomères et centromères
Qu’est-ce que le corps protéique ?
2 copies de H2A, H2B, H3, H4
Quelles sont les deux façon de modifier la conformation du nucléosome ?
- Complexe de remodelage
- Modification chimiques des histones ou épigénétique
Décris ce qu’est le complexe de remodelage.
Protéines, utilisant de l’ATP qui induit des changements de conformation du nucléosome.
Cela permet de condenser ou décondenser la structure et exerce donc un certain contrôle sur l’accessibilité des gènes au mécanisme de transcription
Décris ce qu’est la modification chimiques des histones ou l’épigénétique.
Acétylation et méthylation-phosphorylation-ubiquintinylation
Qu’est-ce que l’acétylation ?
- Mise en place par les histones-acétyltransférases
- Ajout d’un groupe acétyl qui modifie l’empaquetage des gènes par les histones
- Augmente l’accessibilité des gènes
- Réversible
Qu’est-ce que la méthylation ?
Ajout de groupement méthyles sur les histones, modifie la condensation => gènes plus ou moins accesibles
La réplication de l’ADN se fait dans quel sens ?
de 5’ vers 3’
Lors de quel étape, les introns sont-ils éliminés ?
Lors de la transcription
Qu’est-ce qu’une délétion ou insertion ponctuelle ?
Délétion ou insertion de multiples de 3 nucléotides. Toutefois, le cadre de lecture est respecté, c’est-à-dire qu’il y a absence de décalage du cadre de lecture.
Qu’est-ce que la mutation frameshift ?
Délétion ou insertion de non multiples de 3 nucléotides. Le cadre de lecture n’est pas respecté, alors résultat : protéine tronquée.
Quelles peuvent être les 2 conséquences d’une mutation frameshift ?
- Protéine tronqué = instable et dégradée (perte de fonction)
- Protéine tronquée = effet gain de fonction
Qu’est-ce qu’une mutation stop?
Arrêt de lecture = troncation
Pourquoi une mutation génique est si dommageable ?
La fonction de la protéine dépend souvent de sa structure 3D, donc de son repliement. Le repliement peut être altéré par une mutation génétique ou des facteurs environnementaux
Nomme 3 maladies dues à un mauvais repliement au niveau protéique.
- Maladie d’Alzheimer
- Drépanocytose
- Fibrose kystique
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens ?
Mutation ponctuelle qui consiste à substituer un nucléotide par un autre. Le cadre de lecture est respecté.
Donne un exemple de mutation faux-sens.
La drépanocytose.
Déformation du globule rouge => faucille, du fait de la modification de la beta-hémoglobuline.
Pourquoi appelle-t-on ‘‘maladie de surcharge’’ ?
- Noyau en périphérie comme si le cytoplasme prenait tous l’espace = maladie de surcharge, si gros parce que A s’est accumulé
- Surcharge parce qu’on surcharge la cellule
Donne un exemple de maladie enzymatique (métabolique/surcharge).
Maladie de Gaucher.
Déficit en glucocérebrosidase.
Donne un exemple de maladies des anti-enzymes.
Déficit en alpha1-antitrypsine => perte de fonction, car accumulation dans le réticulum endoplasmique
Quel type de maladie peut être engendrée par une perte de fonction enzymatique ?
Maladies de surcharge
Décris l’aspect microscopique d’un déficit en alpha1-antitrypsne
- Dépôts homogènes de matériel électro-dense dilatant le réticulum endoplasmique
- Parfois, matériel floconneux plus lâche aussi présent
Quelle maladie enzymatique peut apparaître lorsqu’il y a accumulation de la protéine ?
Amylose
Décris l’aspect microscopique de l’amylose.
Vaisseau très gros avec matériel amorphé.
Altère la fonction du vaisseau = - de sang arrive à passer, + rigide
Quel type de maladie peut survenir lorsqu’il y a une mutation qui altère les protéines de structure ?
Maladies du collagène
Ex : os courbés
Que peut engendrer une mutation qui provoque une altération des protéines de signalisation ?
Malformations et cancer
Quelle est la cause de la fibrose kystique du pancréas (canalopathies) ?
Due à un mauvais repliement de la protéine
Donne la définition d’un individu homozygote.
Il possède une paire d’allèles identiques (même allèle à l’état double ex: AA ou aa) situé sur un locus donné sur une paire de chromosomes homologues.
Donne la définition d’un individu hétérozygote.
Porteur de deux allèles différents (Aa) pour un gène
Donne la définition d’un individu hémizygote et dans quels cas peut-on retrouver cela ?
Hémizygote pour un gène donné s’il est porteur d’un seul exemplaire de la paire d’allèles.
Ex :chez tous les hommes pour la majorité des gènes présents sur les chromosomes X et Y et dans la cas de certaines pathologies chromosomiques.
Donne la définition d’un gène dominant.
Un gène est de type dominant lorsqu’il s’exprime à l’état hétérozygote (ex : Aa : un seul des 2 allèles est suffit pour que le caractère apparaisse).
Donne la définition d’un gène récessif.
Pour se manifester, il faut que le gène existe à l’état double ou homozygote (aa) ou encore qu’il soit seul (hémizygote).
Qu’est-ce que la codominance et donne une exemple de ce concept ?
Lorsque chacun des 2 allèles différents d’une même paire s’exprime de façon complète chez l’hétérozygote.
C’est le cas des personne du groupe sanguin AB (globules rouges ayant l’antigène A et B, allèles A et B = codominants).
Vrai ou faux
La majorité des maladies génétiques résulte d’une mutation génétique.
Vrai
Qu’est ce que l’hérédité mendélienne ?
Les 3 lois fondamentales de la génétique de Mendel sont applicables à tout être vivant.
Vrai ou faux
La transmission de la plupart des traits physiques et mentaux peuvent être expliquée seulement par l’hérédité mendélienne.
Faux
La transmission de la plupart des traits physiques et mentaux NE peuvent PAS être expliquée seulement par l’hérédité mendélienne.
Les variations génétiques rencontrées sont explicables seulement par l’action combinée de ______ et du ____ et aussi par l’existence de la ______.
Les variations génétiques rencontrées sont explicables seulement par l’action combinée de plusieurs gènes et du milieu (hérédité multifactorielle) et aussi par l’existence de la polyallélie.
Qu’est-ce que la polyallélie ?
Plusieurs allèles dans une population.
Qu’est-ce que le gonosome ?
Chromosome dont la fonction est la détermination du sexe (X ou Y)
Qu’est-ce que l’albinisme oculo-cutané de type 1?
Maladie autosomique récessive rare caractérisée par un défaut de synthèse de la mélanine, le pigment de la peau, des poils et de la rétine.
Problème
- Fleurette est albinos (aa). Elle attend un enfant d’un homme normal (AA). Quel est le risque que leur enfant soit albinos ?
0 parce aaxAA = tous les enfants vont être Aa
Vrai ou faux
Les parents d’un enfant atteint d’albinisme ou d’une maladie autosomale récessive sont souvent cosanguins.
Vrai
Qu’est-ce que le nanisme achondroplasique ?
- Forme héréditaire de nanisme due à une mutation génique qui engendre une croissance et un développement anormal des os longs. Il s’agit d’une transmission autosomale dominante.à
- Mutation du gène FGFR3 récepteur du facteur de croissance fibroblastique 3
- Sporadique (nouvelle mutation) pour la majorité des cas
Dans le cas du nanisme achondroplasique, le caractère est présent __________.
à toutes les générations sans en sauter une, car chaque individu atteint possède un parent atteint.
La maladie de Marfan est causé par quel type de mutation ?
Mutation autosomal dominante
Dans le cas d’une mutation récessive liée au X, en général, seuls les _____ sont atteints. Les femmes ______ l’affection, elles sont donc ______.
Dans le cas d’une mutation récessive liée au X, en général, seuls les hommes sont atteints. Les femmes transmettent l’affection sans être atteintes, elles sont donc porteuses.
Dans quelles circonstances d’une mutation liée à l’X les femmes peuvent-elles être atteintes ?
Rôle de l’inactivation du X
Donne un exemple de pathologie causée par une mutation récessive liée au X.
La dystrophie musculaire de Duchenne
Qu’est-ce que la dystrophie musculaire de Duchenne ?
C’est une maladie causée par une mutation du gène de la dystrophine. C’est la myopathie la plus répandue chez les enfants..
Donne un exemple de pathologie lié à l’hérédité dominant liée au X.
Le rachitisme vitamino-résistant
Qu’est-ce que le rachitisme vitamino-résistant ?
Résistant à la vitamine D
- Hypocalcéimie et courte taille
Vrai ou faux
Dans le cas du rachitisme vitamino-résistant, le caractère est présent à chaque génération, c’est-à-dire que chaque individu atteint possède un parent atteint
Vrai
Qu’est-ce qui distingue l’hérédité dominant liée à l’X de l’hérédité dominante autosomique ?
Les hommes transmettent l’affection à toutes leurs filles et à aucun de leurs garçons.
Donne un exemple de pathologie liée à l’hérédité lié au Y.
L’hypertrichose des oreilles.
Comme se passe la transmission d’une pathologie où l’hérédité est liée au Y ?
Dans la transmission, il y a absence de dominance ou de récessivité. Le gène muté s’exprime toujours.
Seuls les hommes sont atteints (de père en fils), aucune fille n’est atteinte
Lorsqu’un gène est soumis à empreinte parentale ___________
une seule des deux copies du gène est active (expression monallélique)
Les maladies rencontrées suite à empreinte parentale seront la conséquence de quoi ?(2)
- soit de la perte d’expression de l’allèle actif
- de l’expression anormale de l’allèle normalement silencieux (‘‘relaxation d’empreinte’’)
Donne un exemple de pathologie de ‘‘relaxation d’empreinte’’.
Syndrome de Beckwith-Wiedemann
Combien de gène sont soumis à empreinte ?
une cinquantaine
Comme agit un gène sous empreinte ?
agit comme si haploïde
Qu’est-ce qu’un avantage sélectif?
Caractère héréditaire ou acquis secondaire à une mutation. Initialement pour « échapper» au prédateur
Donne un exemple d’avantage sélectif.
Anomalie monogénique : hémoglobine S ou anémie falciforme
Qu’est-ce que l’anémie falciforme et pourquoi s’agit-il d’un avantage sélectif ?
Changement d’une seule paire de bases dans la molécule d’ADN entraîne la production d’une hémoglobine normale (l’acide glutamique est remplacé par la valine ce qui forme des cellules falciformes).
Cette anomalie offre une protection contre la malaria (hétérozygote) en Afrique.
Une anomalie chromosomique implique _______ et produit _______
Une anomalie chromosomique implique un grand nombre de gènes et produit plusieurs malformations ou malfonctionnements.
Qu’est-ce que la cytogénétique ?
Partie de la génétique qui s’occupe de l’hérédité au niveau cellulaire et plus particulièrement au niveau des chromosomes.
Qu’est-ce que le caryotype ?
Arrangement des chromosomes homologues/apparentés, suivant sa taille et sa forme. Dans un caryotype les chromosomes sont numérotés d’après une classification internationale.
Les anomalies chromosomiques sont la majeure cause de 3 choses, lesquelles ?
Échec de la reproduction (50% des cas), anomalies congénitales et elles sont fréquentes dans les cancers.
De quoi est composée la chromatine ?
ADN + histones (hétérochromatine et euchromatine)
Qu’est-ce qu’un chromosome ?
ADN linéaire fortement condensé
Qu’est-ce qu’une chromatide
Copie d’un chromosome répliqué, attaché à sa soeur par le centromère (un des deux nucléofilaments qui constituent le chromosome)
Qu’est-ce que le centromère ?
Région qui unit les chromatides soeurs
Qu’est-ce que le télomère ?
Extrémité du chromosome
Qu’est-ce que la mitose ?
Phase de division cellulaire en deux cellules filles diploïdes à l’identique
Qu’est-ce que l’interphase ?
Phase du cycle sans division cellulaire
Qu’est-ce que la méiose ?
Division cellulaire en 2 temps aboutissant à 4 cellules filles haploïdes.
Que signifie le p et le q du chromosome ?
p : bras court
q : bras long
Qu’est-ce que la constitution chromosomique ?
La composition en chromosomes des cellules d’un individu.
Par quoi s’exprime la constitution chromosomique ?
La formule chromosomique qui est constituée de :
- le nombre de chromosomes (ex : 46 ou 47)
- suivi par les gonosmes (XX ou XY)
- l’indication d’une anomalie chromosomique s’il y a lieu (ex : +21)
Comment se fait la nomenclature des chromosomes ?
du chromosome, bras (p ou q), localisation internationale
ex : bande 17p13.1
Les gamètes ou cellules germinales possèdent un nombre _____ de chromosomes (23 chromosomes chez l’espèce humaine).
haploïde
Les cellules dites somatiques ont un nombre ____ de chromosome (46) dont :
- ____
- ____
Les cellules dites somatiques ont un nombre DIPLOÏDE de chromosome (46) dont :
- 22 PAIRES DE CHROMOSOMES SONT DES AUTOSOMES
- 1 PAIRE DE CHROMOSOMES SEXUELS SONT DES GONOSMES
Qu’est-ce que la polyploïdie ?
Comporte l’addition anormale d’un ou de plusieurs compléments haploïdes (ex : jeu complet en triple = 69 chromosomes = triploïdie)
Qu’est-ce que l’aneuploïdie ?
Porte sur une paire de chromosomes homologues dont le nombre est augmenté ou diminué (anomalie de nombre)
Il peut y avoir
- une monosomie (1 chromosome au lieu de 2)
- trisomie (3 chromosomes au lieu de 2)
Vrai ou faux
Les monosomies d’un chromosome complet ne sont pas compatibles avec la vie.
Vrai
Selon le caryotype classique, les paires sont placées par _____, selon la ______ et selon leur _____.
Selon le caryotype classique, les paires sont placées par ORDRE DE GRANDEUR (LES PLUS GRAND D’ABORD), selon la POSITION DES CENTROMÈRES (INDEX CENTROMÉRIQUE et selon leur FORME.
Comment procède-t-on à l’analyse cytogénétique caryotypique ?
D’abord, il faut des cellules en division, 3 catégories :
1) des cellules en division spontanée et fréquente (moelle osseuse)
2) des cellules en division spontanée, mais moins fréquente (cellules tumorales ou fibroblastiques)
3) des cellules qui normalement ne se divisent pas dans l’organisme (lymphocytes sanguins)
Quelles sont les limites du caryotype ? (3)
- Résolution 5 Mb
- Caractérisation des anomalies difficiles, les bandes peuvent se ressembler
- Nécessité d’obtenir des mitose
Qu’est-ce que la cytogénétique moléculaire permet ?
Elle permet de détecter les anomalies chromosomiques de nombre ou de structure dans les cas où l’index mitotique des cellules à étudier est trop faible ou lorsque les anomalies elles-mêmes sont infra microscopiques.
Décris l’hybridation in situ fluorescente ou FISH. (3)
- Repose sur les propriétés de dénaturation et renaturation de la molécule d’ADN
- Sonde moléculaire (ou petite séquence d’ADN) marquée, qui s’hybride sur la séquence du génome correspondant (séquence complémentair) soit sur des chromosomes d’une mitose ou sur des noyaux interphasique
- Lecture et visualisation au microscope de la sonde
Quelles peuvent être les sondes marquées avec un fluorochrome (FISH) (4)?
- Spécifique de loci
- Peinture
- Break apart ou sonde de dysjonction
- Centromérique
Décris l’utilité de la sonde spécifique de loci (FISH).
pour identifier une région très précise du génome, utile pour recherche remaniements impliquant une région précis : translocation, microdélétions, inversions
Décris l’utilité de la peinture (FISH).
constituée d’un ensemble de petites sondes qui couvrent tout le génome, utile pour les translocations
Décris l’utilité du break apart ou sonde de dysjonction (FISH).
utile pour les translocations
Décris l’utilité des centromériques (FISH).
S’hybride au niveau des centromères, utile pour dénombrer des chromosomes
Quelles sont les limites de la technique FISH ?(2)
- Sondes spécifiques - break apart : étude ciblée
- Peintures : résolution de 1.5 Mb pour détecter des translocations télomériques. Si insertion, ne peuvent déterminer quelle est la région chromosomique impliquée
Qu’est-ce que la technique CGH (Hybridation génomique comparative sur métaphase) ? (4)
- Étude du contenu global de l’ADN
- Comparaison du nombre de molécules d’ADN d’un patient par rapport à un témoin avec établissement d’un ration ou rapport entre les deux.
- Le ratio d’intensité a une valeur théorique de 1 si nombre de molécule identique
- Valeur de 0.5 si délétion (perte) ou de 1.5 si gain (trisomie
Quelles sont les limites de la CGH ? (3)
- Mutations non détectés
- Ne détecte pas les anomalies équilibrées tels les translocations ou inversions équilibrées
- Ne détecte pas les anomalies déséquilibrés présentes dans moins de 10-20% des cellules (ex : mosaïque faible(
Quand faire de la cytogénétique(5) ?
- Conseil génétique et diagnostic prénatal
- Retards mentaux familiaux
- Problèmes d’avortements répétés
- Problèmes d’infertilité
- Les cancers
L'analyse chromosomique dans les cancers aide : - - - -
- la confirmation du diagnostic
- classification du type de tumeur
- pronostic
- orientation de la thérapie
Donne 7 caractéristique de la trisomie 21.
- 47, XX,+21 ou 47, XY, +21
- fentes papérables obliques en haut et en dehors (mongoloïdes)
- grosse langue
- pli palmaire médian unique
- hypotonie générale (diminution de tonus musculaire)
- retard de développement physique et mental
- malformations cardiaques fréquentes
Donne 8 caractéristiques de la trisomie 18 (syndrome d’Edwards).
- L’incidence est de 1/6000 à 1/8000 naissances.
- petit poids de naissance/RCIU
- retard mental
- hypertonicité
- dymorphie cranio-faciale : microrétrognathisme
- mains botes
- omphalocèle (hernie ombilical)
- mort précoce dans la majorité des cas
Donne 9 caractéristiques du syndrome de Turner.
- 45,X
- 1/2500 naissances
- phénotype féminin
- QI normal ou légèrement abaissé
- Taille plus petite que la moyenne
- faible développement des caractères sexuels secondaires
- infertilité
- Cou palmé, raccourcissement du 4e métacarpien, etc
- coartaction de l’aporte
Donne 8 caractéristique du syndrome de Klinefelter.
- 47, XXY
- 1/500 garçons
- phénotype masculin
- grand taukke
- développement au dessous de la moyenne des caractères sexuels secondaires (barbe, musculature, etc_
- gynécomastie (variable)
- hypogonadisme plus ou moins marqué, testicules toujours petits et absence de lignées germinales => infertilité
- prolifération germinale discrète
