Généralités Flashcards
3 critères qualité d’une hypothèse de travail d’un article de LCA ?
- Etre pertinente : impact
- Etre plausible/vraisemblable : rationnel de l’étude riche
- Etre précise
Définition d’un perdu de vu ?
= patient pour lequel la mesure du critère de jugement principal est impossible
=> ne concerne que les études prospectives car pour perdre de vu, nécessité d’un suivi
Etude transversale ?
= étude menée à une date précise avec recueil simultané des données relatives à la maladie et aux facteurs de risques étudié, de façon concomitante à l’inclusion du patient (< 24h)
Etude actuarielle ?
= étude prospective avec des durées de suivi différentes d’un sujet à l’autre (prévu dans le protocole)
Incidence en personne-années ?
= incidence calculée x nombre de personnes de la population étudiée x le nombre d’année
Etude factorielle ?
= étude qui vise à comparer les effets d’une molécule seule et en association
Etude en corps divise ?
= étude qui vise à comparer des parties différentes du corps du même individu (ex : placebo dans un oeil, molécule dans l’autre)
Notion de clause d’ambivalence ?
= pour les études interventionnelles :
“tout patient doit, pour être inclus, être à même de recevoir indifféremment l’une ou l’autre des interventions, selon ce que le hasard de la randomisation lui attribuera”
3 risques en cas de critères d’exclusions trop nombreux/restrictifs ?
- population source (et étudiée) non représentative de la population cible : baisse validité externe
- population étudiée plus homogène : augmente validité interne
- difficulté d’inclusion : manque de puissance
Quels sont les objectifs d’une randomisation déséquilibrée ?
=> toujours en faveur du groupe testé
- augmenter les données pour étude de la tolérance
- augmenter le recrutement si nombre important de données manquantes prévu mais NE PERMET PAS D’AUGMENTER LA PUISSANCE
Quelle randomisation élimine le biais “effet-temps” ?
La randomisation par bloc
Quelle randomisation élimine le biais “effet-centre” ?
La randomisation stratifié sur le centre en cas d’essai multicentriques
Randomisation par minimisation ?
= randomisation adaptative, type particulier de randomisation par stratification permettant une égalisation dynamiques des groupes
=> A chaque nouveau patient, on choisit le groupe pour assurer une minimisation des biais la plus optimale possible afin d’obtenir des groupes très similaires
=> surtout utile pour les études avec faibles effectifs
Comparabilité initiale ?
- Assurée par la randomisation
- Vérifier sur le tableau 1 “à vue d’oeil”
- Pour limiter le risque de biais de sélection
Comparabilité en cours d’essai ?
- Assurée par le double aveugle
- Vérifier sur le diagramme de flux : nombre de perdus de vue et patients exclus comparables
- Pour limiter le risque de biais de classement/suivi
Comparabilité finale ?
- Assurée par l’ITT
- Vérifier sur le diagramme de flux
- Pour limiter le biais d’attrition
Définition de l’analyse en intention de traiter ?
- tous les patients randomisés sont inclus dans l’analyse
- tous les patients sont analysés dans le groupe dans lequel ils ont été randomisés
- tous les perdus de vue sont pris en compte
Informations/vérifications primordiales à tirer d’un diagramme de flux ?
- applicabilité des résultats en terme de validité externe : dépend de la différence entre le nombre de patients éligibles et le nombre de patients finalement inclus
- déterminer le type d’analyse effectuée = ITT ou per-protocole ou en traitement reçu
- vérifier le nombre de perdus de vue, d’arrêt et de retrait des patients :
- nb de perdus de vue < 10-15% dans chaque groupe => sinon biais de sélection des perdus de vue
- nb de perdus de vue répartis équitablement => sinon biais de classement différentiel
- perdus de vue analysés en biais maximum => sinon biais d’attrition
Définition du NSN ?
= nombre de sujets chez qui le critère de jugement principal doit être évalué
NSN = nombre de sujet à inclure - nombre estimé de perdus de vue
Intérêts du calcul du NSN ?
- réduire les coûts
- réduire les délais de l’étude (pas de recrutement superflu)
- garantir la puissance statistique
Paramètres principaux nécessaire au calcul du NSN ?
- risque alpha : probabilité de conclure à une différence qui n’existe pas
- risque beta ou puissance : probabilité de ne pas conclure à une différence qui existe
- taille delta de la différence ou écart à mettre en évidence : plus elle est petite, plus NSN grand
- variance ou écart-type (CDJ quantitatif) ou risque de base (CDJ qualitatif)
- probabiité de survenue ou incidence du critère dans le groupe contrôle => si critère composite alors incidence cumulée
Paramètres secondaires à prendre en compte pour le calcul du NSN ?
- type d’étude : supériorité, infériorité, équivalence
- test statistique : unilatéral ou bilatéral
- plan expérimental : groupe parallèle, croisée, séquentiel
- durée de l’étude
- nombre de perdus de vue attendu : rajouter 5% au NSN calculé
Puissance a priori ?
= calcul du NSN
2 types d’articles médicaux à distinguer ?
- article de revue : article publié dans un journal par un expert d’un domaine dont le but est de faire l’état des lieux des connaissances scientifiques dans un domaine particulier
- article de recherche : étude scientifique visant à répondre à une question particulière à l’aide d’un ou plusieurs groupes de patients ou d’expériences sur l’animal ou en laboratoire
Critères à prendre en compte pour le choix du protocole ou plan expérimental ?
- niveau de preuve ++
- éthique
- faisabilité : coût, organisation…
+ si maladie rare ou à latence longue avec exposition fréquente : privilégier cas-témoins
+ si exposition rare, maladie fréquente et durée de suivi adapté : privilégier cohorte
Les 3 avantages d’une étude multicentrique ?
= les 3 R plus
- recrutement plus important : donc augmentation de puissance
- recrutement plus large : augmentation validité externe à condition d’une randomisation stratifiée sur le centre
- recrutement plus rapide : évite un biais «effet-temps» : augmentation validité interne
6 éléments à prendre en compte pour le choix du test statistique ?
- type de variable étudiée
- distribution de la variable : normale (test paramétrique) ou non normale (test non paramétrique)
- type d’expérience
- conditions d’application : n > 5 pour le Chi-2, n > 30 ou distribution normale pour le T de student ou l’ANOVA
- logiciels utilisés
- références bibliographiques : justifier l’utilisation de test peu courant
Variables qualitatives ou catégorielles ?
= variable qui n’est pas naturellement associée à une valeur numérique
- ordinales = catégories ordonnées
- nominales = catégories non ordonnées
+/- dichotomiques : uniquement 2 catégories possibles
Variables quantitatives ?
= mesure d’une quantité prenant des valeurs numériques avec une signification concrète : l’écart entre deux valeurs et le calcul d’une moyenne ont un sens
- discrète = nombre fini et dénombrable de valeurs possibles
- continue = nombre infini et non dénombrable de valeurs possibles
Distinction entre une variable quantitative discrète et une variable qualitative ordinale ?
- quantitative discrète : mesure mise en classes d’une caractéristique des sujets
- qualitative ordinale : si les écarts entre deux catégories ne peuvent pas être comparé
- on peut parler des 2 dénominations s’il s’agit du nombre de malades dans un échantillon limité par la taille de l’échantillon
Variables censurées ?
= suivi d’un groupe de patients sur une période donnée en recherchant comme critère de jugement la survenue d’un événement binaire jusqu’à une date de point.
=> après cette date, les données sont dites censurées
Tests statistiques adaptés selon la variable en cas de distribution normale ?
Qualitative : Chi-2, Mac Nemar si apparié ou test de Fisher
Quantitative :
- 2 groupes : T de student
- > 2 groupes : ANOVA
Données appariées :
- 2 groupes : T apparié
- > 2 groupes : ANOVA mesures répétées
Association entre 2 variables : régression linéaire, coefficient de corrélation (Pearson)
Courbe de survie :
- courbe de Kaplan-Meier = estimation de la probabilité de survie
- test du log rank = pour comparaison de 2 courbes de survie
- modèle de Cox = analyse multivariée (ajustement sur des potentiels facteurs de confusion)
Définition d’un test bilatéral ?
= test statistique qui permet d’explorer 2 seuils
- utile si on ignore si le traitement A est supérieur ou inférieur au traitement B
=> A < B ou A = B ou A > B
Définition d’un test unilatéral ?
= test statistique pour lequel on part du principe que la différence que l’on cherche à démontrer à un sens connu
=> A > B ou A = B
Différents cas de figure de comparaison possibles rencontrés en étude thérapeutique ?
- l’une des 2 interventions est meilleure que l’autre = hypothèse de supériorité bilatérale
- l’intervention A est meilleure que le comparateur B = hypothèse de supériorité unilatérale
- l’intervention testée est au moins aussi performante que le comparateur = hypothèse de non-infériorité
- les deux interventions sont autant performantes l’une que l’autre = hypothèse d’équivalence
Choix d’un test unilatéral ou bilatéral ?
= doit être défini a priori dans le protocole
- un test unilatéral ne doit être fait que si le sens de la différence attendue ne fait aucun doute et repose sur des données indiscutables de la littérature => essai de non-infériorité
Attention : un test bilatéral non significatif peut donner un test significatif en unilatéral car la puissance nécessaire pour un test unilatéral est moindre
Les deux intérêts d’utiliser un test unilatéral ?
- augmente la puissance : le degré de significativité p d’un test unilatéral est égal à la moitié du p d’un test bilatéral
- diminuer le nombre de sujet à inclure pour une même puissance mais attention NSN d’une étude de non-infériorité»_space;> NSN d’une étude de supériorité > NSN d’une étude d’équivalence
5 caractéristiques de la proportion des perdus de vue ?
- quantifiée
- faible < 10%
- équilibrée entre les groupes : sinon craindre un biais de classement par défaut du double aveugle
- étudiée : recherche des causes
- représentée sur un diagramme de flux
2 risques liés aux perdus de vue ?
- biais de sélection des perdus de vue : échantillon non représentatif de la population cible
- biais d’attrition : perte de la comparabilité des groupes
Définition d’une analyse multivariée pour ajustement ?
= analyse de l’effet d’une variable, en tenant compte de l’effet de covariable (facteurs de confusion potentiel) :
- si essais thérapeutiques = permet l’ajustement sur des facteurs de confusion potentiel
- si étude épidémiologiques = permet d’expliquer une variable en fonction des covariables dites explicatives
Analyse descriptive, univariée et multivariée en cas de courbes de survie ?
- Descriptive : courbe de survie de Kaplan-Meier
- univariée : log-rank
- multivariée : modèle de Cox
Analyse descriptive, univariée et multivariée en cas de variable qualitative ?
- descriptive : pourcentage
- univariée : test du chi-2
- multivariée : régression logistique
Analyse descriptive, univariée et multivariée en cas de variable quantitative ?
- moyenne
- t-student
- régression linéaire multiple
Calcul de durée de participation pour chaque patient d’une étude de survie ?
- décédée avant la date de point : différence entre la date de décès et la date d’entrée dans l’étude
- perdu de vue : différence entre la date du dernier contact et la date d’entrée dans l’étude
- présente l’événement binaire : différence entre la date de survenue et la date d’entrée
- n’a pas présenté l’événement binaire : différence entre la date de point et la date d’entrée
Quelles études utilisent les courbes de survie ?
- essais thérapeutique
- cohortes pronostiques
Interprétation graphique d’un log-rank : les deux courbes de survie sont décalées initialement puis restent écartées de manière parallèle ?
- il y a eu une différence au tout début de l’étude entre les deux groupes = avantage probable en phase précoce/aiguë
- puis la différence est restée constante, signifiant que le médicament testé n’a pas continué à faire une différence significative
=> avantage initial du traitement mais plus aucun effet supplémentaire au traitement contrôle ensuite
Interprétation graphique d’un log-rank : les deux courbes de survie sont décalées initialement puis l’écart ne cesse d’augmenter ?
- il y a eu une différence au tout début de l’étude entre les deux groupes
- puis la différence a continué à exister entre les 2 groupes tout au long de l’étude
=> différence significative entre les deux groupes avec un effet sur toute la durée de l’étude = situation idéale
Définition de médiane de survie ?
= durée au bout de laquelle la moitié du groupe a présenté l’événement binaire attendu (décès)
Définition d’un coefficient de corrélation ?
= formule mathématique permettant la mesure de l’intensité de la liaison entre 2 variables
- valeur comprise entre -1 et 1
Interprétation d’un coefficient de corrélation ?
- si coefficient de corrélation = 1 : corrélation parfaite entre les 2 variables
- si coefficient de corrélation = -1 : corrélation inverse parfaite entre les 2 variables
- si coefficient de corrélation = 0 : absence totale de corrélation entre les 2 variables
- si coefficient de corrélation > ou = 0,7 : corrélation correcte entre les 2 variables
Définition d’une analyse de sensibilité ?
= analyse réalisée pour évaluer la sensibilité des résultats d’une étude à des changements dans la façon dont cela a été fait
=> évaluer la robustesse des résultats par rapport à des décisions incertaines ou des hypothèses qui ont été faites sur les données et les méthodes utilisées