F9 proteintrafficking Flashcards
vad händer om man ändrar signalsekvensen?
Genom att ändra signalsekvensen ändras proteinets lokalisering t.ex. Swyer syndrome.
lösliga proteiner och proteiner som ska vara i ER har…
Proteiner som ska till ER har signalsekvensen i N- terminalen medan proteiner som ska vara kvar i cytosol saknar denna
vad är swyer syndrome?
När proteiner felplaceras kan sjukdomar/mutationer uppkomma t.ex. Swyer syndrome. Felplaceras proteinerna kan de inte utföra deras funktion som i sig påverkar andra proteiner vilket påverkar hela systemet. Swyer syndrome beror på att sry genen har muterats och sry proteinet inte finns i kärnan längre utan finns i utanför.
posttranslational import delas in i tre mekanismer, vilka?
nukleär transport, protein translocators och vesiklar
vad händer under nukleär transport?
Transporten genom den nukleära poren sker genom att proteinet har en nuclear localization signal binder till en nuclear import receptor och interagerar med cytosoliska fibriller, i kärnan kommer proteinet stöta på GTPase, RAN, som bär på en GTP. RAN- GTP binder till receptorn vilket får den att släppa proteinet. Receptorn är dock fortfarande bunden till GTP när den transporteras tillbaka till cytosolen. I cytosolen hydrolyserar RAN GTP så att RAN- GDP kan binda till ett nytt protein.
vad händer under mekanism 2?
Receptorn känner igen signalpeptiden hos det protein som ska transporteras. Proteinet, receptorn och translocator komplexet kommer sedan gå igenom det yttremembranet tills de stöter på en 2nd translocator i det inremembranet. Genom bägge translocator kommer proteinet (ej antagit som konformation pga. chaperoner) transporteras igenom.
vad händer under mekanism 3?
Proteiner som transporteras mellan ER och det endomembrane system transporteras genom vesiklar.
Exocytos= utsöndring av ämnena. Börjar med proteinsyntes i ER där proteinerna sedan får transporteras genom golig till plasmamembranet innan det utsöndras (iform av vesikel).
Endocytos= insöndring. Insöndring (material från plasmamembranet kommer in) sker när ämnen ska brytas ner i t.ex. lysosomer.
hur går det till när en vesikel når sin slutdestination?
En vesikel måste känna igen sin slutdestination och det gör den genom komplementära receptorer på det membran den ska sammanfogas med. Rab proteiner (som är GTPase) finns på vesikelns yta där varje typ av vesikel har specifika Rab proteiner. För varje Rab finns ett komplementärt protein på membranet. När vesikeln är framme kommer Rab att interagera med ett protein vilket ”dockar” vesikeln närmare membranet vilket möjliggör det för v- snare och t- snare att tvinnas kring varandra så att endocytos kan ske. För att vesikeln ska kunna ”docka” måste avståndet vara runt 1,5 nm för då undantrycks molekyler.
vad är cotranslational import?
Sker samtidigt som translationen och går igenom ER, golgi och sedan ut i vesiklar.
hur överförs proteiner i ER lumen? (cotranslational import)
SRP i cytosol binder till ER signalsekvensen hos en växande polypeptid vilket saktar ner proteinsyntesen. SRP receptorn i ER membranet binder till SRP samt släpper SRP för att sedan föra över ribosomen till en translocation kanal där proteinsyntesen kan återupptas. Translocation kanalen binder till ER signalsekvensen (lösliga proteiner har den ofta på N- terminalen) och transporteras som en loop. Väl inne kommer signalsekvensen att avlägsnas av signal peptidase.
