F7 DNA till protein Flashcards
vad är SNP?
Single nucleotide polymorphism, SNP, är ett nukleotidsubstitut som ger variation till genomet. SNPs uppkommer efter ungefär 1000 baspar och bidrar till polymorfism; gör individer unika samt kan ge sjukdomar.
vad är STR?
Är upprepande sekvenser (2–7 baspar) som ligger efter varandra i en följd. Hur många som uppkommer i rad beror på regionen och kan variera.
hur går PCR till?
PCR är en metod för att fördubbla mängden DNA. Vid PCR ökar man först temperaturen till 95° C för vid denna temp. kommer vätebindningarna mellan kvävebaserna i helixen att brytas så att kedjorna separeras. Temp. sänks sedan till 60° C och primer:na binder in till kedjan. DNA polymeras kan vid
72° C fästa/använda som startpunkt vid dessa primer och börja syntetisera DNA 5’ till 3’. Vill man ytterligare duplicera mängden DNA upprepas cykeln.
hur går DNA replikationen till?
DNA helikas lindar upp helixen genom att bryta vätebindningarna. När bindningarna bryts kommer en öppning, replication fork, fås. Helixen strävar efter att återgå till sin stängda position, detta hindra då single strand protein binder in.
Sedan kommer DNA primase att binda in och utgör en startpunkt dit DNA polymers kan binda och börja syntetisera en ny kedja då DNA polymeras inte kan börja på måfå. DNA polymeras behöver även sliding clamp då DNA polymeras har en tendens att lossna.
Vid leading strand sker syntesen kontinuerligt men vid lagging strand sker syntesen diskontinuerligt i okazaki fragment då syntesen alltid sker i 5’ till 3’, okazaki fragmenten sammanfogas sedan av DNA ligas. Vid lagging strand kommer RNA primer att binda in och RNA byts sedan ner av RNase H, DNA polymeras kan sedan binda dit DNA.
vad är topoisomeras roll i replikationen?
Topoisomeras klipper en kedja samt återsluter den igen för att undvika att spänningar uppkommer. Topoisomeras fortsätter klippa/återsluta tills replikationen är klar.
vad händer
under splicing?
intronerna tas bort?
hur byggs en gen upp?
En gen byggs upp av en promotor- exon- intron- exon- intron osv. där promotorn reglerar genes uttryck genom att genreglerande proteiner binder in.
hur går transkribtionen till?
RNA polymeras binder till genens promotor och mRNA syntesen sker i 5’ till 3’ och upphör när en terminator på 3’ änden påträffas. mRNA genom går tre modifikationer.
vilka tre modifikationer går mRNA igenom?
Capping: behövs bl.a. för att transportera mRNA från kärnan till cytoplasman. RNA trifosfat katalyserar fästningen av 5’ locket till mRNA som håller på att syntetiseras.
Polyadenylering: skyddar mot enzymatisk nedbrytning.
Splicing: är den process där intronerna och promotorn klipps bort så att endast exonerna består. Splicing kan även steget efter klippa bort exoner och göra olika varianter av mRNA.
berätta om translation
Delas in i tre stadier:
Initiation: mRNA, tRNA och ribosomen binder till varandra. mRNA börjar avläsas i ribosomen och tRNA med start kodon binder in.
Elongation: aminosyrorna som bärs av tRNA adderas till varandra via en peptidbindning i en kedja.
Termination: ett stop- kodon binder in och peptidkedjan släpps från ribosomen.
hur läses mRNA av i ribosomen?
Ribosomen har tre säten: A, P och E.
Vid A sätet binds nya tRNA in och vid P sätet sitter en tRNA med ett växande protein, aminosyran som bärs av tRNA från säte A binder till tRNA från säte P och plockar således med alla aminosyror. mRNA går framåt och tRNA hamnar i E sätet där det lämnar ribosomen samtidigt som en ny tRNA med komplementär sekvens binder in i A sätet.
