Extracción y purificación del DNA Flashcards

1
Q

Objetivos de la extracción y purificación del DNA

A

I. Comprender los principios moleculares de la purificación del DNA
II. Describir las generalidades de los diversos mecanismos de extracción del DNA
III. Comprender la necesidad de la extracción del DNA para su uso en pruebas diagnosticas

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2
Q

Características del DNA

A

El ADN está constituido por dos cadenas de nucleótidos unidas entre sí formando una doble hélice. Los nucleótidos
están integrados por un azúcar (desoxirribosa), un grupo fosfato y una base nitrogenada (adenina, guanina, timina o citosina)

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3
Q

Técnica de extracción (la mayoría de las veces se utiliza una combinación de todos estos métodos)

¿Cuáles son los métodos?

A

Químicos
Físicos
Mecánicos
Enzimáticos

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4
Q

¿Cuáles son los pasos de la técnica de extracción?

A

Extracción
Purificación
Precipitación

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5
Q

De qué paso estamos hablando:
Lisis celular para liberar el DNA del núcleo celular

A

Extracción

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6
Q

¿Cuáles son los métodos de la extracción?

A

Químicos: detergentes (sodio dodecil sulfato :SDS)

Físicos: calor

Enzimáticos: Proteinasa K

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7
Q

(Extracción)
Método químico: Buffer de lisis

Degrada la membrana celular capturando lípidos y proteínas, evitando que el DNA quede atrapado en los restos celulares

A

Detergente SDS

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8
Q

(Extracción)
Método químico: Buffer de lisis

EDTA: Molécula ________, que posee 4 grupos carboxilos y dos grupos amino y tiene la función de unirse a iones _______, el magnesio funciona como un cofactor de las enzimas que degradan el DNA como las _______, por lo tanto al agregar el EDTA estas son inhibidas protegiendo así el DNA

A

Quelante
Magnesio
Nucleasas

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9
Q

(Extracción)
Método químico: buffer de lisis

NaCl:
Algunas sales como el _______________________ forman una capa iónica suave que recubre el DNA y así lo protege y ayuda a evitar su __________, además de _________ y ________ proteínas celulares

A

Cloruro de sodio
Degradación
Deshidratar
Precipitar

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10
Q

(Extracción)
Método químico: buffer de lisis

Tris HCL:
Es una ____________________ que mantiene el pH de la solución estable, aproximadamente entre _____ y ____

A

Solución buffer
7.5 y 8.2

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11
Q

(Extracción) Método enzimático

Es una enzima que permite degradar proteínas y otras enzimas como las nucleasas, de esta forma ayuda a purificar cada vez mas el DNA

A

Proteinasa K

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12
Q

Incubación
Una vez agregado el _____________ y la ________, se realiza una incubación entre ________________ durante ________, la incubación facilita la ruptura de los lípidos de la membrana celular

A

Buffer de lisis
Proteinasa
50 y 70° C
10 minutos

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13
Q

¿Cuáles son los buffer de lisis que se pueden agregar en el método químico de la extracción?

A

Detergente SDS
EDTA
NaCl
Tris HCL

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14
Q

Paso de la técnica de extracción en donde hay eliminación de proteínas y lípidos de membrana mediante el uso de solventes orgánicos como el fenol y el cloroformo, centrifugación o sedimentación

A

Purificación

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15
Q

Paso de la técnica de extracción que se lleva acabo agregando etanol absoluto frio, el cual elimina las sales
agregadas anteriormente y permite que el DNA se visualice como una fibra blanca

A

Precipitación

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16
Q

La integridad del DNA

Se determina realizando un gel de electroforesis con _____________

Se corre a __________ durante _________, y se observa utilizando __________

A

Agarosa al 0.8 -1 %

90 volts
30 min
luz UV

17
Q

La concentración que se considera como optima es entre ___ y ___ ng/µl.

A

50
100

18
Q

La pureza se mide por _________ y la ideal es que la relación ________ tenga un valor de entre _____ y ____

A

Absorbancia
260/280
1.6
1.9

19
Q

La concentración y pureza se ve en el

A

Espectrofotómetro de microgota
Nanodrop

20
Q

¿Cuáles son los usos de la extracción y purificación del DNA?

A

-Reacción en cadena de la polimerasa PCR
-Tipificación por huella genética
-Análisis de restricción
-Clonación
-Diagnostico

21
Q

Pasos y procedimiento de la extracción y purificación del DNA (práctica de laboratorio)

A
  1. Recoger las células: pasar un cepillo o hisopo por el
    interior de la mejilla
  2. Disolver las membranas: añadir buffer de lisis
  3. Romper proteínas y hacer al ADN menos soluble en agua: añadir proteasa e incubar a 50 ºC
  4. Precipitar elADN: añadir alcohol frío sobre el extracto celular