Examen 3 partie 2 Flashcards
Qu’est-ce qu’une mutation?
Changement d’un allèle d’un gène en un allèle différent
Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle?
Mutatio qui survient au niveau d’une seule paire de base dans la séquence d’ADN
Qu’est-ce qu’une mutation dominante?
S’il y a présence d’une mutation sur l’un des deux allèles, alors il y a une mutation dans le phénotype
Quels sont les 2 grands types de mutations ponctuels?
- Substitutions de bases
- Additions ou délétions de bases
Qu’est-ce que la substitution de bases?
- Une paire de base est remplacée par une autre
Quels sont les 2 types de substitutions de bases?
- Transition
- Transversion
Qu’est-ce que la transition?
Remplacement d’une base par l’autre base de la même catégorie chimique (purine ou puridine)
Qu’est-ce que la transversion?
REmplacement d’une base par une autre base d’une catégorie chimique différente
Quelle est la conséquence d’une mutation silencieuse?
Mutation change un codon correspondant à un acide aminé en un autre codon du même acide aminé
Quelle est la conséquence d’une mutation faux-sens?
LE codon d’un acide aminé est remplacé par le codon d’un autre acide aminé
Quelle est la conséquemce d’une mutation non-sens?
Le codon d’un acide aminé est remplacé par un codon de terminaison de la traduction
Qu’est-ce qu’une mutation extragénique?
Mutation qui cause des changements à l’extérieur du gène, par exemple sur un site de régulation du gène
Est-ce qu’une mutation dans un exon d’un gène rend toujours une protéines inactive?
Non
- Il faut que la mutation aie lieu dans un site important pour la fonction de la protéine, certaines mutations dans les exons non important n’ont pas d’impact
Que peut-on obtenir sur un Western blot dans une mutation de faux-sens
La protéine exprimé va être identique que celle du wild-type parce que la mutation ne modifie pas la longueur de la protéine, mais seulement possiblement sa fonction
Que peut-on obtenir dans un western blot pur une mutation non-sens?
La protéine sera plus petite que la protéine wild-type parce qu’un codon stop à été ajouté dans le milieu de la protéine au site de la mutation
QUe peut-on obtenir dans un Western blot pour une mutation qui modifie le cadre de lecture ouvert?
La protéine peut être plus grosse ou plus petit dépendamment de où se trouve le nouveau codon stop sur le nouveau cadre de lecture
Que peut-on obtenir dans un Western blot pour une mutation extragénique?
Pas de protéine présente car le gène ne peut pas être traduit
Qu’est-ce qu’une mutation induite?
Apparissent à la suite d’un traitement délibéré par des mutagènes (agents de l’environnement qui augmente le taux de mutations)
Qu’est-ce qu’une mutation spontanées?
Apparaissent en absence de traitement mutagène connu. Constituent la première cause de variation génétique naturelle que l’on observe dans la population
Qu’est sont les types de mutations spontanées causé par l’environnement cellulaire?
- Dépurination
- Désamination
- Dommage oxydatif
Quelles sont les mutations induites par un agents extérieur chimique?
- Agents alcalins
- Bulky adducts (aflatoxin)
- Analogues de base
- Agents intercalants
Quelles sont les mutations induites par un agents extérieur physique?
- UV
- Radiation ionisante
Quel est le principe de l’UV comme mutagène?
2 thymines côte à côte se lient ensemble ce qui bloque la réplication de l’ADN et sa transcription
Quel est le principe des radiations ionisantes comme mutagène?
Les rayons font des coupures dans l’ADN et brisant le lien covalent entre 2 bases d’un même brins, lorsque la système de réparation recolle les brins, il se peut qu’il se trompe et recolle 2 brins différents ensemble
Quel est l’un des analogue de la thymine et à quelle base se lie-t-il?
- 5-bromouracile
- Ressemble à la cytosine donc se lie à la guanine
Quel est l’analogue de l’adénine et quelle base lie-t-il?
- 2-aminopurine
- Ressemble à la guanine donc lie un cytosine
Qu’est-ce qu’un tautomère
Une des forme alternatives d’une molécules qui diffère par la position d’un atome
Quelle est la forme tautomérique normale pour les bases?
Forme céto
Quels sont les autres tautomères de base possibles?
- Énols
- Imino
Comment fonctionne une mutation par transformation tautomérique?
S’il y a présence d’un tautomère énol de guanine dans l’un des 2 brins de d’ADN, un T va s’y apparier. Ainsi, la première génération va avoir un G-T. la deuxième génération fait à partir de ces 2 brins va être de 1 brins mutant A-T et un brin wild-type C-G
Nommez 3 agents intercalants.
- Proflavin
- Acridine orange
- ICR-101
Qu’est-ce que le modèle de Streinsinger?
Mécanisme qui explique comment se produisent les erreurs spécifiques dans la réplication de l’ADN
- Présent dans les régions contenant des séquences répétées
- Glissements de l’ADN polymérase
Que brise le modèle de Streinsinger?
Le cadre de lecture original
En quoi consiste le modèle de Streinsinger?
- Lors de l’insertion d’un agent intercalant dans un région contenant des séquences répétées
- Il y a décalage d’un des brins par rapport à l’autre ce qui cause l’ajout ou le retrait d’un nucléotides dans le brin synthétisé
Nommez 2 types de lésions spontanées de l’ADN?
- Dépurination
- Aflatoxine B1
Qu’est-ce que la dépurination?
PErte d’une base purique (A ou G) avec formation d’un site abasique dans l’ADN
Qu’est-ce que l’aflatoxine B1?
- Substance chimique carcinogène produite par certaint champignon
- Favorise la dépurination
Est-ce que la dépurination est grave?
- Pas vraiment car c’est souvent corrigé par le système de réparation
- 1 cellule perd 10^4 purines/20h
Qu’est-ce que la désamination?
- Retrait d’un groupe amine
- Cytosine devient Uracile
- Adénine devient Hypoxanthine
- 5-methylcytosine (dérivé cytosine) devient thymine
Que cause la désamination sur une séquence ADN?
Amène des modification dans la séquence ADN ce qui peut causer des mutations
Nommez 3 cancérogènes à action directe.
- b-propiolactone
- Méthane sulfonate d’éthyl (EMS)
- Diméthylsulfate (DMS)
- Moutarde azotée
- Méthyl nitroso-urée (MNU)
Nommez 6 cancérogènes à action indirecte.
- Benzo(a)pyrène
- Dibenzanthracène
- Naphtylamine
- Diméthylnitrosamine
- Chlorure de vinyle
- 2-Acétulaminofluorène
- Safol
- Aflatoxine B1
Qu’est-ce qu’un cancérogène à action directe?
Cancérogène plus rare, qui possède des groupes très réactionnels électrophiles
Qu’est-ce que les cancérogènes à action indirecte?
Cancérogènes qui sont activés par le métabolisme hépatique et acquièrent des groupes réactionnelles électrophiles
Quel est le rôle du foie par rapport au substances chimiques cancérogènes?
Solubiliser les molécules lipophiles en ajoutant des groupes hydrophiles et les éliminer par excrétion rénale
Est-ce que l’estrogène est un agent cancérigène?
Oui elle fait partie de la liste des agents cancérigènes
Nommez 2 gènes supresseurs de tumeurs?
- APC
- DCC
Est-ce que des substances chomiques mutagènes pour les bactéries le sont aussi pour les mammifères?
très probablement
Potentiel mutagène =?
pouvoir cancérigène
Comment prouver qu’une substance est cancérigène et qu’elle transforme la cellule?
Faire une test de Ames
Comment se déroule un test de Ames?
1) La substance testé est mélangée avec les bactéries et le mélange S9
2) Si la subtance est pro-mutagène, le mélange S9 la transforme et elle devient mutagène active et interragit avec l’ADN
3)
Que contient le mélange S9 dans le test de Ames?
- À partir de tissus hépatiques et contient les enzymes métaboliques du foie
- Cytochromes P450
- Enzymes de conjugaison
Qu’est-ce qu’un pro-mutagène?
Substance chimique qui n’est pas mutagène à son état initial mais le devient après avoir été métabolisé dans l’organisme
Quel est le rôle des enzymes du foie dans le test de Ames?
- Activent les pro-mutagènes
Comment est évalué le résultat du test de Ames?
- 2 plaques sont faites : 1 témoin neg sans substance testée et une avec
- On dénombre le nombre de colonies qui ont poussée
- Les colonies comptées sont celles qui ont subi une mutation réverse (croissance en l’absence d’histidine
Quelle type de souche bactérienne sont utilisées dans le test de Ames?
Des souches auxotrophes pour l’histidine (ne pousse pas en absence d’histidine)
Pourquoi il faut faire un contrôle négatif dans le test de Ames?
Parce qu’il y a toujours une quantité de bactérie qui vont avoir subi une réversion spontanée qui n’est pas dû à la substance
Quels sont les effets des rayons UV sur l’ADN?
- UV absorbés par les bases azotées (Thymine particulièrement sensible)
- Dimère de thymine se forme quant 2 thymine sont à côté par liaison covalente
- Cause une perturbation structurelle ce qui provoque des erreurs dans la réplication et la transcription
QUe provoque les radiations ionisantes?
La rupture des chaînes d’ADN
Que peut causer la réparation incorrecter d’un brin d’ADN qui à été coupé?
- Translocation
- Activation de proto-oncogène : normalement joue un rôle dans la régulation de la croissance et division
- Lorsque activé anormalement, devient oncogène (gène de fusion)
Que peuvent causer les UV et les radiations ionisantes comme mutagène?
Des leucémies
Par quel mécanisme peut être réparé un dimère thymine-thymine (cyclobutylthymine)?
Mécanisme d’excision-remplissage
Qu’est-ce que le gène Rec A et qu’arrive-t-il en cas de mutation du gène?
Gène crucial pour la réparation de l’ADN chez les bactéries
Si mutation :
- Cellules snsibles aux rayons UV
- Dommages à l’ADN ne sont plus réparé
- Mort cellulaire
L’évolution à permis aux organismes plus complexes de développer quoi?
Des systèmes de réparation de l’ADN plus efficaces
Qu’est-ce que le mécanisme de réparation SOS?
- Chez les bactéries
- En cas de nb élevé de lésions à l’ADN
- Nucléotides insérés aléatoirement pour réparer rapidement
- Cause bcp d’erreur
- AVantage : permet d’Accélérer l’évolution si stress
Qu’arrive-t-il si les systèmes de réparation chez l’humain sont déficients?
AUgmentation du risque de cancer car mutation favorisent prolifération cellulaire incontrôlée
Qu’est-ce qu’une cassure d’un brin bicaténaire?
- Cassure des 2 brins d’ADN au même endroit au même moment
- ## Difficilement réparable
Qu’arrive-t-il aux extrémités libres des molécules d’ADN des cellules ?
Le système cellulaire de réparation de l’ADN ne les supportent pas
- Ils sont dégradés
- Ils sont fusionnés avec d’Autres extrémités où il y a aussi eu cassure bicaténaire
Que provoque la fusion d’extrémités où il y a eu cassure bicaténaire?
- Translocations qui activenet à l’occasion des oncogène
- Mutation/délétions dans les gènes suppresseurs de tumeurs
Qu’est-ce que la maladie Xeroderma pigmentosum?
- MAladie autosomique récessive
- Sensibilité aux UV
- PAs de réparation de dimères de thymines
- Un seul phénotypes mais plusieurs génotypes qui touchent toujours des gènes de réparation de l’ADN
Qu’est-ce que la maladie de l’Ataxie télangectasique?
- Cellules sensibles aux rayons X
- Pas de réparation de ponts intercaténaires
Quel sont les types de systèmes de réparation chez E. coli?
- Détoxification
- Élimination directe des lésions
- Excisions générale
- Excision spécifique
- Post-réplication
Nommez les types de réparation directe de l’ADN?
- Photoréactivation
- Réparation par alkyltransférase
Qu’est-ce que la photoréactivation?
- Réparation directe de l’ADN endommagée
- Une enzyme (CPT photolyase) scinde en deux les dimères formé
- Nécessite de la lumière pour fonctionner
Qu’est-ce que la réparation par l’alkyltransférase?
- Réparation directe de l’ADN endommagée
- Enlèvent les groupements alkyle en position O-6 de la guanine
- Transfère l’alkyl au MGMT qui est inactivé
Qu’est-ce que la réparation par excision de base?
- Un nucléotide ou une séquence plus longue d’ADN est retiré et remplacé par un segment néosynthétisé complémentaire du brin opposé au brin matrice
- Système dépendant de l’homologie
Comment fonctionne la réparation par escision de base?
- ADN glycosylase retire la base endommagée -) sites apuriniques
- AP coupe le brin endommagé
- retrait d’une partie du segment et reconstruction de la séquence
Est-ce que la réparation par excision de base est identique entre les bactéries et les eucaryotes?
- Non il y a quelques différences dans les enzymes
Quelles sont les 4 phases de la réparation par excision de nucléotides?
1) REconnaissance des bases endommagées
2) Asseblage d’un complexe multiprotéique au niveau du site de la lésion
3) COupure du brin endommagéet retrait des nucléotides entre les coupures
4) ADN pol synthétise à l’aide du brin matrice
Quel type de réparation est la réparation des mésappariements?
Réparation post-réplicationnelle
Comment fonctionne la réparation des mésappariements?
1) Reconnaissance des paires de bases mal appariées par protéine
2) Détermination de la base incorrecte à l’intérieur du mésappariement
3) Excision de la base incorrecte et synthèse réparatrice
Comment fonctionne la réparation par synthèse translésionnelle de l’ADN?
- La polymérase réplicative se rend jusqu’à la lésion
- Elle est ensuite remplacé par une polymérase translésionnelle qui permet la synthèse par dessus la lésion (taux d’erreur plus élevé car pas de 3’-)5’)
- La polymérase réplicative reprend sa pace et continue à synthétisé
Comment fonctionne la réunion d’extrémité non homologue?
- Reconnaissant de la lésion par fixation de protéines aux extrémités cassées
- Recrutement de protéines pour limiter les dégâts
- ADN ligase relie les 2 brins
Dans une cellule cancéreuse, quels sont les signaux reçu par la cellule?
- Elle produit elle-même des signaux de survie et de prolifération
- Les signaux de mort cellulaire et d’inhibition de croissance sont inhibé
Quel type de cellule se renouvellent normalement rapidement?
- Épithélium intestinal
- Endomètre utérin
- Épithélium ovarien
Qu’est-ce qui est à l’origine de cancer?
Le remaniement d’ADN
Quels sont les 3 mécanismes prédominants du cancer?
- Le fonctionnement anormal du système de réparation de l’AD
- La transformation d’un gène normal en oncogène
- Le fonctionnement anormal d’un gène suppresseur de tumeur
Quelles sont des sources de mutations conductrices dormantes?
- Erreur de réplication spontanées et vieillissement
- Mutagènes environnementaux
- Obésité, régime alimentaire, blessures et inflammation
Quels facteurs influencent la sélection des mutations?
- Tissu et bagage génétique
- Promoteurs environnementaux connus ou suspectés
- Processus endogènes
Nommez des promoteurs environnementaux connus ou suspectés.
- Pollution de l’air
- Contamination de l’eau
- Pesticide
- cigarette
- liquides chauds
- Microplastique
- Infection
Nommez des processus endogènes.
- Âge
- Obésité
- Inflammation
- Stress
- Manque de sommeil
- Immunosuppression
Est-ce que les tumeurs bénignes sont dangereuses?
- Non, elles sont circonscrites et non menaçantes pour l’hôte
Quel type de molécules expriment les tumeurs bénignes?
Molécules superficielles de connaissance cellulaire (restent dans leur tissus)
Pourquoi les tumeurs bénignes sont facilement supprimable chirurgicalement?
Car elles sont souvent délimitées par une capsule fibreuse
De quels types de cellule sont composés les tumeurs bénignes?
Cellules non dé-différenciées
(elles ont les même propriétés que les cellules du tissu originel)
Quels peuvent être les problèmes des tumeurs bénignes si elles sont trop grosses?
- Interfère dans le fonctionnement de l’organe
- peuvent sécréter des hormones en grande quantité active
Qu’est-ce que le two-hit theorie
- Une première mutation survient dans une copie d’un suppresseur de tumeur
- La cellule fonctionne encore normalement
- Une deuxième mutation survient qui entraine la perte complète du gène -) perte de la fonction -) formation de tumeur
Quelles sont les caractéristiques des tumeurs malignes?
- Envahissantes (pénètrent les tissus voisins -) sys. circulatoire -) métastases
Comment sont les cellules des tumeurs malignes?
Elles sont moins différenciées car elles sont subit une dédifférenciation
Quels types de variations sont présentes dans les cellules des tumeurs malignes?
- Du phénotypes (perte de leurs fonctions d’origine)
Du génotype (nombre anormal et instable de chromosomes
Quels sont les caractères histologiques des cellules cancéreuses?
- Rapport noyau/cytoplasme élevé
- Nucléoles bien marqués (ARNr abondant)
- Cellule en mitose
- Cellule peu différenciée
Comment sont classifié les tumeurs malignes?
- En fonction de leur origine embryonnaire
À quel endroit se situe un carcinome?
Endoderme ou ectoderme
À quel endroit se situe un sarcomes?
Mésoderme
Qu’arrive-t-il dans une situation où les cellules sont cancéreuses?
- Perte d’interaction protéines-protéines
- Production accrue de récepteurs de la lame basale
- Production d’enzymes qui dégradent la lame basale
- Barrière physique d’un tissu cible
Qu’est-ce que le sarcome?
Type de cancer qui se forme dans les tissus conjonctifs, ou mous, comme le cartilage, les tissus fibreux et les muscles, ou dans les os
Qu’est-ce qu’un carcinome?
Il peut se déclarer dans les cellules qui tapissent les poumons, les intestins, la vessie, les seins, l’utérus, les reins et la prostate, ou dans les cellules de la peau
Qu’est-ce que l’adénome?
Tumeur non cancéreuse constituée de cellules recouvrant certaines glandes du corps
QU’est-ce que le néoplasme?
Formation de cellules anormales
Désigne principalement les tumeurs malignes
Qu’est-ce que l’adénocarcinome?
Type de cancer consistant en un tissu glandulaire anormal revêtant la paroi interne de certains organes du corps
Quel est le type de cancer le plus courant?
Carcinome
Comment les cellules cancéreuses peuvent échapper le système immunitaire?
- Elles arrivent à masque ou supprimer des antigènes du CMH
Comment injecter des cellules cancéreuses d’une autre espèce dans des souris sans qu’elle ne soit détruites et rejetées?
Utiliser des souris “nude” Nu/Nu
Comment est la prolifération des cellules cancéreuses?
Prolifération anarchique (de manière incontrôlé)
De quoi dépend la capacité des cellules à proliférer?
- De la fonction du tissu
- De l’âge de l’organisme
Par quoi est finement régulé la prolifération dans les cellules normales?
- Cytokines
- Facteurs de croissance
Quels sont les traitement possible pour le cancer?
- Chirurgie
- Chimiothérapie
- Radiothérapie
Thérapie génique
Nouveaux composé anti-angiogéniques
Anticorps monoclonaux
Vaccins
Comment se nomme les phase cellulaire et où se trouve l point de régulation?
- G0
- G1 (point de régulation)
- S
- G2
- M
À quoi sert le point de régulation dans le cycle cellulaire?
Permet de s’assurer qu’il n’y est pas de mutation, un besoin de réparation ou d’enclencher la mort cellulaire
Que font les complexes de CDK et de cyclines?
Permettent la phosphorylation de protéines, ce qui initie une cascade d’évènements qui aboutit à l’activation de certains facteurs de transcription
Les facteurs de transcription activé lors du cycle cellulaire permettent quoi?
Initier la transcription de certains gènes avec des produits essentiel pour un stade ultérieur du cycle
Qu’Est-ce que la protéine Rb?
Protéine de séquestration qui empêche le facteur de transcription E2F de fonctionner
Est-ce que Rb est un suppresseur de tumeur ou un oncogène?
Suppresseur de tumeur car il empêche la prolifération
Explique le concept des facteurs de transcription Rb et E2F?
- Rb est lié au facteur de transcription E2F
- LE complexe cyclique CDK2-CyclinA phosphoryle Rb se qui la détache de E2F
- E2F peut alors aller se lier à l’ADN et initier la transcription pour une protéine essentielle pour passer de la phase G1 à S
Quel est un synonyme d’apoptose?
Mort cellulaire programmée
Quelles sont les protéines exécutrices de l’apoptose?
Caspases
Sous quelle forme se retrouve les caspases?
Sous forme de zymogène (pré-curseur), enzyme inactive qui doit être clivée pour être active
Comment sont activées les caspases?
- Les caspases initiatrices sont activées par voie extrinsèque ou intrinsèque
- Les caspases effectrices sont ensuite activée par les caspases initiatrices
Expliquer le principe de détection de l’apoptose par propidium iodide.
Le PI est un colorant qui entre dans la cellule seulement si la membrane est perméable -) survient seulement en mort cellulaire
Expliquer le principe de détection de l’apoptose par annexine V.
Annexine V est une prot. qui a une forte affinité avec la phosphatidylsérine (phospholipide dans la face inter de la membrane)
En cas d’apoptose, il y a une externalisation qui peut être détecté avec l’annexine V
Qu’est-ce que le marquage avec Hoechst?
Marquage de l’ADN des cellules ce qui permet de voir si une cellule est en état de mort cellulaire
Comment détecter l’apoptose par gel d’électrophorèse?
Si l’ADN total de la cellule semble être dégradé (smear avec presque plus d’ADN génomique en haut du gel)
Expliquer le principe de détection de l’apoptose TUNEL
- Permet de détecter les fragments d’ADN résultant de l’apoptose
- Une terminal transférase ajoute des nucléotide marqué aux extrémités libres de l’ADN qui on été fragmenté par les endonucléases - signal qu’il y a de l’apoptose
Expliquer le principe de détection de l’apoptose par Comet Assay?
Migration sur gel les cellules complètes de manière individuelle
- La présence de trainé derrière la cellule = bout d’ADN dégradé -) il y a de l’apoptose
Comment peut-on détecter l’apoptose par western blot?
On effectue un Western Blot en ciblant des caspases clivées -) présence de bande signifie qu’il y a de l’apoptose
Quel est l’utilité du gène p53?
- P53 détecte les dommages dans l’ADN et active la protéine p21
Que fait la protéine p21?
Elle bloque le complexe CDK2/cyclin pour l’empêcher de phosphorylé Rb
- Permet de stopper la prolifération
