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Biologie moléculaire > Examen 3 > Flashcards

Examen 3 Flashcards

1
Q

Pourquoi la caractérisation des génomes complets est important?

A

Pour comprendre les principes sous-tendant l’organisation des organismes vivants et pour la découverte de nouveaux gènes tels que ceux impliqués dans les maladies génétiques humaines

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Q

Qu’est-ce que la génomique structurale?

A

Caractérisation de la nature physique des génomes entiers

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3
Q

Qu’est-ce que la génomique fonctionnelle?

A

Caractérisation du protéome et des différents modes d’expression des gènes

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4
Q

De quoi sont composé les DNA microarrays chips?

A

Petite plaque sur laquelle sont fixées des milliers de sondes ADN, qui correspondent aux exons d’un génome

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5
Q

COmment sont fabriqué une microarrays chip?

A

La séquence qui est associée à chaque puits est reconstruite en ajoutant les nucléotides 1 à 1 en bloquant les puits pour lequel le nucléotide ajouté ne correspond pas à la séquence. On obtient ensuite un probe dans chaque puit qui correspond à une partie du gènome par exemple

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6
Q

Comment fonctionne l’ADN microarrays chips?

A

Lorsque les probe sont dans les puits, on utilise des séquences d’ADN complémentaire marquées par fluorescence dont on souhaite déterminer la présence dans l’échantillon et on effectue une hybridation, on peut ensuite voir les puits où les sondes se sont liées.

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7
Q

Qu’est-ce qu’un cluster?

A

Groupe de gènes qui sont impliqués dans un but commun

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8
Q

Qu’est-ce que la familles des gènes dispersés

A

Séquences répétitives fonctionnelles
FAmilles de gènes apparenté dispersés dans tout le génome

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9
Q

Nommez 2 gènes qui font parti de la familles de gènes dispersés.

A
  • Ovalbumine (famille de 3 gènes)
  • Histones (famille de 100 à 1000 gènes)
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10
Q

Qu’est-ce qu’un pseudogènes?

A

Gènes de la familles de gènes dispersés qui sont devenus non fonctionnels qui sont non-transcrits

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11
Q

Les cellules ont besoin de certains produits de gènes en _____ quantité, comme ceux des gènes codant les composants de la ____________

A

Grande
Transcription

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12
Q

Pourquoi dans certaines situations, il est nécessaire d’avoir plusieurs gènes codant pour la même protéine?

A

CAr s’il y a une mutation et que le gène est unique, cela pourrait causer la mort de l’organisme

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13
Q

Qu’est-ce que les répétitions en tandem?

A

Segments d’ADN composé de motifs de séquences nucléotidiques répétés de manière adjacente

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14
Q

Nommez un type de gène qui fonctionne par répétitions en tandem.

A

Les gènes de histones
- Bloc de genes répété des centaines de fois en tandem (côte à côte)
- Répété aussi sur plusieurs chromosomes

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15
Q

Quel est un exemple de séquence fonctionnelle non-codante?

A

Les télomères

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16
Q

Pourquoi les télomères sont considéré comme une séquence fonctionnelle non-codante?

A

Car ils contiennent des répétitions en tandem de séquences simples d’ADN qui ne codent aucun ARN ni protéine, mais ont néanmoins une fonction définie

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17
Q

Quelle est la séquence des télomère?

A

TTAGGG

18
Q

Pourquoi les répétitions télomériques sont présentes?

A

Pour résoudre un problème fonctionne, inhérent à la réplication des molécules linéaires d’ADN

19
Q

Comment est contré le racourcissement du Xome?

A

La télomérase ajoute les unités répétées simples aux extrémités

20
Q

Quel type d’ADN contient les séquences sans fonctions connues?

A

L’ADN hautement répétitif encadrant le centromère

21
Q

Où se trouve l’ADN satellite?

A

DAns les régions d’hétérochromatine dense et très compacte encadrant les centromères (peu de transcription à cet endroit)

22
Q

Qu’est-ce que les VNTR?

A
  • Répétitions en nombre variable (ADN minisatellite)
  • Séquences de 1 à 5 Kb comportant un nombre variable d’une unité de base, longue de 15 à 100 nucléotides
23
Q

Qu’est-ce qu’une empreinte d’ADN?

A

Une empreinte d’ADN est visible lorsqu’on coupe l’ADN total à l’aide d’une enzyme de restriction qui ne possède pas de site dans un VNTR. Les fragments sur le gel sont de différentes longueurs ce qui correspond au différents nombre d’individu. Selon les allèles hérités par les parents, chaque individus est différent

24
Q

Comment obtenir une empreinte d’ADN?

A

Avec un sonde de VNTR

25
Q

Est-ce qu’un VNTR fait parti d’un gène?

A

Non, il se trouve au milieu d’un gène codant mais fait parti des introns

26
Q

Qu’est-ce que les ADN microsatellite?

A

Répétition en tandem de 2 bases (plus commun - CA)

27
Q

Qu’est-ce que les RAPD?

A

RAndomly amplified polymorphic DNA (marqueurs d’ADN basés sur l’amplification aléatoire par PCR

28
Q

Qu’est-ce que les SNP?

A

Single-nucleotide polymorphism
- Variation d’un nucléotide dans une séquence précise entre 2 individus
- Individus 1 : ATCG
- Individus 2 : AGCG

29
Q

Quel est la récurrence des SNP dans le génome?

A

1 SNP par 1000 nucléotides

30
Q

Est-ce que les SNP ont un impact?

A

Dans certains cas oui, ils peuvent causer des mutations qui impact un promoteur ou un gène et le rende non fonctionnel

31
Q

Qu’est-ce qu’un transposon?

A

Élément répétitif qui se sont propagés dans le génome (copie), ils se déplacent sous forme d’ADN

32
Q

Comment se propage les rétrotransposons?

A

Par eux même sous l’action de la transcriptase inverse

33
Q

QUe contient la catégorie des rétrotransposons?

A

Les séquences répétitives dont les structures sont similaires à celle des rétrovirus et pourraient provenir de ces virus

34
Q

Comment on initialement été identifié les transposons?

A

Comme éléments génétiques mobiles conférant une résistance à une substance chimique

35
Q

Qu’est-ce qu’un élément IS?

A

Plus petits transposons

36
Q

Qu’est-ce qu’un transposon complexe?

A

DEux élément IS reconnaissables qui encadrent un gène codant une résistance à une substance chimique

37
Q

Sous quelle appelation sont regroupés les transposons et les éléments IS?

A

Éléments transposables

38
Q

Quel sont les 2 classes de transposons?

A
  • Rétrotransposons (à ARN)
  • Transposons à ADN
39
Q

Comment fonctionne les rétrotransposons?

A
  • Création d’un ARN du transposon
  • ADNc avec transcriptase inverse
  • Intégration dans l’ADN cible
40
Q

Comment fonctionn les transposons à ADN?

A
  • Excision du transposon par Transposase
  • Insertion dans l’ADN cible
41
Q

Quel est la structure des transposons complexe?

A
  • Structure en sucette
  • Loop qui est relié par les deux séquences IS aux extrémités qui sont complémentaire (inverse)
  • COntient des gènes dans la loop dont un gène de résistance
42
Q
A

Biologie moléculaire (4 decks)

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