Examen 2 ( 6-8) Flashcards
Catabolisme - Anabolisme
- Dégradation des composés organiques ( protéines, glucides, lipides) en substances plus simples
- Production d’énergie sous forme d’ATP.
- Biosynthèse des molécules organiques complexes (protéines, glucides …) à partir de conposantes plus simples..
- Nécessite de l’énergie sous forme d’ATP
Définition métabolisme
Ensemble réactions biochimiques qui se déroulent dans l’organisme ou la cellule bactérienne.
Toutes les réactions métaboliques nécessitent…
Des enzymes
Les enzymes…
Sont des protéines qui interviennent dans les réactions métaboliques
Servent de catalyseurs biologiques: accélèrent la vitesse de réaction
Agit sur un substrat de façon spécifique
Caractéristiques Métabolisme microbien
10 à 100X plus rapide que les cellules humaines
Besoin nutritionnel très varié comparativement aux cellules humaines
Habilité à utiliser d’autres composantes que l’O2 comme accepteur final d’électrons
Les tests biochimiques d’identification sont basés sur…
Le métabolisme bactérien. Les bactéries démontrent une grande diversité nutritionnelle: capacité à dégrader différents nutriments pour produire de l énergie = réactions cataboliques
Principe de base d’identification des bactéries par les tests biochimiques…
Substrat (présent dans le milieu) . Flèche enzyme, flèche produit (excrété dans le milieu) , flèche visualisation du produit par réaction colorimétrique : indicateur de pH , ajout de réactif
Métabolisme des glucides …
Production d’énergie à partir de la dégradation des glucides.
Se fait par 2 processus : - respiration cellulaire (aérobie et anaérobie) - fermentation (anaérobie)
Respiration cellulaire aérobie
- processus aérobie
- accepteur final d’électron : oxygène
- 1 molécule de glucose produit 38 ATP
Respiration cellulaire anaérobie
- processus anaérobie
- accepteur finale d’électron : substance inorganique
- peu d’ATP produit
Caractéristiques des bactéries anaérobie
- croissance moins rapide, métabolisme plus lent
- moins d’énergie produite
Caractéristique des bactéries anaérobie- facultatives…
- la présence d’O2 les fait passer en mode aérobie
- métabolisme augmenté, croissance plus rapide.
- en absence d’O2, passent en mode anaérobie
- énergie produite est diminuée, croissance ralentit
3 étapes de la respiration cellulaire aérobie
1- glycolyse
2- cycle de krebs
3- chaîne de transport des électrons
1ère étape du métabolisme des glucides (glycolyse) …
Les glucose est oxydé en pyruvate (ou acide pyruvique)
- production d’un peu d’ATP et de NADH ( donneur d’électrons qui servira à produire de l’énergie)
- le pyruvate est oxydé en acétyl CoA (production de NADH)
2ieme étape de la respiration cellulaire aérobie (cycle de Krebs)
- l’acétyl CoA est incorporé dans le cycle de krebs
- oxydation de l’acétyl CoA par une série de réactions chimiques (production d’ATP, NADH, FADH2 (transporteur d’é) et CO2)
3ieme étape de la respiration cellulaire aérobie ( chaîne de transport des électrons )
- NADH et FADH2 sont oxydés lors d’une ‘cascade’ de réactions d’oxydoreduction (en présence d’oxygène)
- production considérable d’ATP
Chez les bactéries le cycle de krebs et la chaîne de transport des électrons se déroule ….
Au niveau de la membrane plasmique (à la place de la mitochondrie)
Étapes de la respiration cellulaire anaérobie
- processus anaérobie
- accepteur final d’électrons : autre que l’O2
- accepteur final : • nitrate (NO3-) • sulfate (SO4-) • carbonate (CO3 2-)
Fermentation
- processus anaérobie
- accepteur finale d’électrons est une molécule organique
- seulement 2 ATP produits
Après la glycolyse, le pyruvate est converti en d’autres produits finaux SANS PASSER PAR LE CYCLE DE KREBS: • acide lactique • alcool • acide formique • autres …
Métabolisme des lipides
- certaines bactéries élaborent des enzymes extra cellulaires appelées lipases qui hydrolysent les lipides en acides gras et en glycérol
- les acides gras et le glycérol sont métabolisés séparément selon les voies différentes en AcetylCoA
- AcetylCoA est incorporé dans le cycl de krebs
Métabolisme de protéines
- certaines bactéries élaborent des enzymes extra cellulaires appelées protéases et peptidases qui hydrolysent les protéines en peptides puis en AA
- peut entrer dans le cycle de krebs, les AA doivent d’abord été convertis
- la conversion peut se faire de 2 façons: decarboxylation (perte de CO2) ou désamination (perte de NH2)
Épreuve de la catalase …
Détection de l’enzyme catalase qui décompose H2O2 en O2 et H2O
L’accumulation de H2O2 est létale pour la bactérie.
Attention de ne pas prélever de la GS , les GR sont catalase +
Ne pas utiliser anse, utiliser bâton bois
Épreuve de l’oxydase
Détections de l’enzyme cytochrome-oxydase, une enzyme qui intervient dans la chaîne respiratoire comme transporteur d’électrons
Détection par une réactif (tétraméthyl-p-phénylènediamine) qui agit comme receveur artificiel d’électrons. Changement de couleur lorsqu’oxydé par la présence du cytochrome oxydase.
A partir de GS ou chocolat
Coagulase
Identification de Staph aureus. On doit d’abord s’assurer d’avoir un Staph…
La coagulase est une enzyme qui calalyse la transformation du fibrinogène en fibrine. (Formation de caillot)
Un vivo, le caillot de fibrine sert a protéger la bactérie contre les défenses immunitaires de l’organisme.
Facteur de virulence.
Liée : sur la paroi
Libre : enzyme extra cellulaire libérée a l’extérieur de la cellule bactérienne.
Toutes 2 produites par S. Aureus. , toutes 2 réagissent avec le fibrinogène pour former caillot. Souches capsulées de Staph. Donnent faux neg.
Détection coagulase liée
Provoque une réaction d’agglutination en présence du réactif test qui contient des particules de latex recouvertes de fibrinogène.
Un contrôle négatif est fait en parallèle avec un réactif qui contient particules de latex sans fibrinogène : il doit nécessairement donner un résultat négatif.
Si agglutination du Contrôle : invalide
Vérifier pureté de la souche.
Confirmation par coagulase libre.
Détection de la coagulase libre
Colonies ajoutées à du plasma de lapin ( contient fibrinogène)
Formation de caillot = présence de coagulase libre.
Vérifier résultat après 4h d’incubation. Si négatif poursuivre incubation X 24h.
Un faux neg après 24h pourrait être causé par la présence d’une staphylokinase. Qui détruit le caillot initialement formé.
Test sensibilité à la bacitracine
Test d’identification présomptif: permet de distinguer le genre Staphylococcus du genre micrococcus.
Bacitracine Inhibe micrococcus. (> ou= a 10mm)
Staph. toujours résistants à bacitracine . (<10mm)
Test de sensibilité à la novobiocine
Test d’identification présomptif : permet d’identifier Staphylococcus saprophyticus.
Toujours résistant à novobiocine (< ou = à 16mm)
Staph autre que saprophyticus (> 16mm)
Une bactérie produit des colonies incolores sur une gélose MAC et une pente et un culot acide sur la gélose TSI (trois sucres-fer) fermente:
Le glucose et le sucrose
La catalase…
Décompose le H2O2
Quel réactif est utilisé dans l’épreuve Voges-Proskauer?
Alpha-naphtol
Les tubes de Durham dans le bouillon servent à…
Déceler la production de gaz d’un microorganisme
Lors de l’épreuve de réduction des nitrates, il n’y a pas de production de couleur après l’addition des réactifs et de la poudre de Zn. Quelle est votre interprétation des résultats?
Les nitrates sont réduits au-delà des nitrites
Quel réactif est utilisé dans l’épreuve de l’oxydase?
Tétraméthyl-para-phénylène diamine dehydrochlorure
Quelle réaction a lieu dans une réaction positive à l’épreuve de l’ornithine décarboxylase?
Réaction alcaline dans le tube avec ornithine et acide dans le tube contrôle
Concernant l’épreuve de l’esculine…
- Un précipité noir est observé lors d’un résultat positif
- L’esculine est hydrolysé en esculétine
Les produits finaux de la réaction sont alcalins…
Lysine décarboxylase
L’indicateur de pH utilisé dans le milieu Kligler est…
Rouge de phénol
Les bactéries produisant l’enzyme tryptophanase désaminent le tryptophane en…
Indole
Que signifie l’apparition d’une couleur rouge seulement après l’addition de la poudre de Zn dans une épreuve de réduction des nitrates?
Pas de réduction des nitrates
Dans laquelle des épreuves utilise-t-on l’hydroxyde de K?
Voges-Proskauer
Après ensemencement, le bouchon d’un milieu Kligler doit permettre un échange d’air entre le tube et le milieu extérieur. Quelle en est la raison?
Permettre l’oxydation ds protéines et peptones
Concernant le milieu Kligler…
Contient citrate ferrique permettant de déceler la production de sulfure d’hydrogène.
La coloration jaune retrouvée dans une réaction positive de l’épreuve OMPG est dépendante de …
Ortho-nitrophénol
Quelle enzyme bactérienne est responsable de la conversion de la phénylalanine en acide pyruvique?
Phénylalanine désaminase
Quel réactif permet la détection d’une réduction des nitrates?
Acide sulfanilique
Quel énoncé correspond à un test de MR positif? L’ajout de rouge de méthyl produit:
Une coloration rouge car ;a bactérie a fermenté le glucose et généré un pH de 4.4 et moins
L’enzyme détectée en présence du tétraméthyl-p-phénylène-diamine se nomme…
Oxydase
Quelles sont les concentrations de sucres dans la gélose TSI?
0.1% Glucose
1% Lactose
1% Sucrose
Quel résultat correspond à l’épreuve de lysine décarboxylase négative?
Une coloration jaune dans le tube épreuve et contrôle
L’indicateur de pH utilisé pour l’épreuve uréase est…
Rouge phénol
Quel réactif est utilisé dans l’épreuve de réduction des nitrates?
Acide sulfanilique
Quel énoncé ne s’applique PAS à la production d’indole…
Peut être décelé avec l’addition d’une solution d chlorure ferrique à 10% au milieu
Quel est le résultat attendu dans l’épreuve de l’ornithine décarboxylase pour une bactérie qui produit l’enzyme ornithine décarboxylase? Les tubes sont recouverts d’huile minérale.
Le tube contrôle est jaune et le tube test est mauve.
Quelle réaction utilise le paradiméthylaminobenzaldéhyde?
L’indole
Quel est l’indicateur de pH utilisé dans le milieu Simmons pour la détection du citrate?
Bleu de bromothymol
Quel énoncé s’applique au tétra-p-phénylènediamine dehydrochlorure?
Donne une réaction bleue après avoir réagit avec le cytochrome-oxydase.
Dans quelle épreuve utilise-t-on le réactif alpha-naphthylamine?
Réduction des nitrates
Interpreter le résultat de l’épreuve des nitrates suivante. Aucun changement de couleur n’apparaît après l’addition des réactifs A et B, une coloration est apparue après l’ajout de la poudre de Zn…
Les nitrates n’ont pas étés réduits.
Quel énoncé ne s’applique PAS à l’oxydase…
Le test se fait sur des colonies prélevées sur MAC
Quel est le résultat attendu si une bactérie réduit les nitrates au delà des nitrites?
Aucune apparition de couleur après l’ajout des réactifs A et B , il n’y a aucune coloration suite à l’ajout de la poudre de Zn
Résultat obtenu sur Kligler: Pente rouge, culot jaune…
Le glucose est ferment/
Bactérie qui produit une réaction acide dans un tube à épreuve et de contrôle à l’épreuve de l’ornithine décarboxylase. Interpréter…
Je peux valider mes résultats et la couleur observée dans les tubes épreuve et contrôle sera pourpre.
Une bactérie produit de l’acide phénylpyruvique à partir de la phénylalanine. Quel type de réaction s’agit-il?
Désamination
Quelle est l’interprétation d’un résultat positif dans une épreuve positive à l’uréase?
L’urée est dégradée en ammoniac permettant d’obtenir une couleur rose.
Commensalisme…
L’un des organismes tire avantage de l’autre sans lui nuire.
Mutualisme…
Les 2 organismes tirent un avantage de l’association. Ex. Bactéries de la flore intestinale synthétisent de la vit K
Rôle de la flore normale
Créer une barrière afin de prévenir la croissance et l’implantation de microorganismes nuisibles en: -Occupant tout l’espace
-produisant des substances bactériostatiques
-diminuant la qt d’O2 dispo.
-modifiant pH et environnement.
utilisant les nutriments dispo.
Parasitisme…
Un des organismes est favorisé au détriment de l’autre.
Flore normale de la peau…
- Staphylococcus epidermidis (SCN)
- Corynebacterium sp.
- Levures (Candida sp.)
- Autres…
Flore normale voies respiratoires supérieures…
- Streptococcus viridans
- Staphylococcus epidermidis
- Staphylococcus aureus
Flore normale voies digestives…
Bouche : Steptococcus viridans, Anaérobies, levures.
Estomas: La plupart ne peuvent s’y implanter.
Duodénum : Peu de bactéries.
Côlon: Flore abondante(Entérobactéries:E.Coli. - Anaérobies; Bacteroides , Enterococcus faecalis)
Flore normale vaginale…
- Lactobacillus(Maintient pH acide 4.5, empêche implantation de pathogènes)
Flore Voies urinaires
Stériles, mais la partie distale est colonisée par des bactéries de la FN de la peau. Miction=drainage des bactéries. pH urinaire 6.0 empêche implantation bactéries.