Examen 1 (Lipides et acides aminés) Flashcards
Définir la structure des acides gras
- Groupe carboxyle sur le C1.
- Chaîne hydrocarbonée (chaîne avec des carbones et des hydrogènes) allant de 4 à 28 atomes de carbone ou plus.
1 groupe carboxyle + plusieurs carbones + hydrogènes
Définir la classification des acides gras. (2)
Classifiés selon : Saturé/Insaturé
Classifié selon : Longueur de la chaîne de carbone
Ça veut dire quoi un acide gras monoinsaturé et polyinsaturé
Monoinsaturés : Une seule double liaison
Polyinsaturés : Plusieurs doubles liaisons
Définir les acides gras essentiels et nommer deux exemples.
Les acides gras essentiels (AGE) sont des acides gras que le corps humain ne peut pas synthétiser par lui-même et qui doivent donc être obtenus par l’alimentation. Les deux principaux acides gras essentiels sont :
1. Acide linoléique (oméga-6) : Présent dans les huiles végétales, les noix et les graines.
2. Acide alpha-linolénique (oméga-3) : Trouvé dans les graines de lin, les noix et certaines huiles végétales.
Expliquer l’estérification des acides gras.
L’estérification des acides gras est une réaction chimique où un acide gras réagit avec un alcool, généralement le glycérol, pour former un ester, qui est un triglycéride.
L’estérification sert à faire quoi?
Des triglycérides
Des phospholipides (étape clé dans leur formation)
Comment se forme les triglycérides?
- Acides gras et glycérol : Trois acides gras et une molécule de glycérol sont disponibles.
- Réaction d’estérification : Chaque acide gras se lie à un groupe hydroxyle (-OH) du glycérol.
- Libération d’eau : Pour chaque liaison formée, une molécule d’eau (H₂O) est libérée.
- Formation du triglycéride : Les trois acides gras sont maintenant liés au glycérol, formant un triglycéride.
Comment se forment les phospholipides?
- Deux acides gras se lient à une molécule de glycérol (ce qui libère de l’eau et crée des liaisons ester), créant deux “queues” hydrophobes.
- Un groupe phosphate se lie au troisième site du glycérol, souvent avec une petite molécule polaire attachée, créant une “tête” hydrophile.
Définir les classes d’eicosanoïdes(4)
Leucotriènes
Prostaglandines
Thromboxanes
Prostacycline
Définir les origines et les rôles(2) des leucotriènes
- Origine : Produits principalement par les leucocytes (globules blancs) à partir de l’acide arachidonique.
- Rôles :
o Impliqués dans les réactions inflammatoires.
o Certains leucotriènes sont conjugués à un acide aminé, la cystéine, ce qui leur permet d’interagir avec des récepteurs spécifiques.
Définir les origines et les rôles(4) des prostaglandines
- Origine : Synthétisées à partir de l’acide arachidonique par l’action des cyclooxygénases (COX).
- Rôles :
o Agissent comme molécules de signalisation entre les cellules et les hormones
o Participent à la vasodilatation, facilitant le flux sanguin.
o Inhibent l’agrégation des plaquettes
o Impliquées dans la réponse inflammatoire
Définir les origines et les rôles(2) des thromboxanes
- Origine : Dérivés des prostaglandines, ils sont produits par les plaquettes.
- Rôles :
o Joue un rôle clé dans la vasoconstriction
o Favorise l’agrégation des plaquettes, contribuant à la formation de caillots pour arrêter les saignements.
Définir les origines et les rôles(2) des prostacyclines
- Origine : Dérivée des prostaglandines, produite principalement par l’endothélium des vaisseaux sanguins.
- Rôles :
o Joue un rôle clé dans la vasodilatation
o Inhibe l’agrégation des plaquettes, réduisant ainsi le risque de formation de caillots.
Donner les caractéristiques des leucotriènes.
Ce sont des molécules oxygénées, mais elles ne contiennent pas de cycles.
Donner les caractéristiques des prostaglandines(3)
o Classes de lipides de signalisation contenant un cycle à 5 carbones, ce qui les distingue des leucotriènes.
o Thromboxanes et prostacycline dérivent d’une prostaglandine
o Molécules oxygénées
Donner les caractéristiques des thromboxanes
Contiennent un cycle à 6 carbones et un groupe fonctionnel oxygéné
Donner les caractéristiques des prostacyclines
Contient un cycle à 6 carbones similaire aux thromboxanes, mais avec des effets opposés. C’est une molécule oxygénée.
C’est quoi de l’acide arachidonique? (Type d’acide gras, structure, présence où dans les membranes, précurseurs de …, rôle dans …)
Type d’acide gras : Acide gras polyinsaturé de la famille des oméga-6.
Structure : Composé de 20 atomes de carbone avec quatre doubles liaisons.
Présence dans les membranes : Se trouve dans les phospholipides des membranes cellulaires.
Précurseur d’eicosanoïdes : Sert de base à la synthèse de molécules biologiquement actives appelées eicosanoïdes (comme les prostaglandines, thromboxanes et leucotriènes).
Rôle dans l’inflammation : Impliqué dans des processus inflammatoires, immunitaires et d’autres réponses physiologiques.
C’est quoi de l’acide palmitique? (Type d’acide gras, structure, sources, rôle dans le corps, fonction dans les membranes)
- Type d’acide gras : Acide gras saturé (pas de doubles liaisons).
- Structure : Composé de 16 atomes de carbone (C16:0).
- Sources : Présent dans de nombreux lipides, y compris les graisses animales et certaines huiles végétales, comme l’huile de palme.
- Rôle dans le corps : Utilisé comme source d’énergie et impliqué dans la synthèse de lipides, y compris les triglycérides et les phospholipides.
- Fonction dans les membranes : Contribue à la structure des membranes cellulaires.
C’est quoi un eicosanoïde et c’est quoi ses rôles(3)?
Lipides de signalisation à 20 carbones dérivés de l’acide arachidonique
Il est impliqués dans …
* l’inflammation
* la régulation de la pression artérielle
* la formation de caillots
Les 4 types d’eicosanoïdes ont une modification d’oxygénation, mais laquelle n’a pas de modification de cyclisation?
Leucotriène
C’est quoi une cyclooxygénase et c’est quoi ses rôles?
La cyclooxygénase est une enzyme clé dans la production de prostaglandines.
Rôle des cyclooxygénases
- Production de prostaglandines
- Réponse à l’inflammation : COX-2 est centrale dans l’inflammation, favorisant la réduction de la douleur et de l’inflammation.
Donner les effets des AINS non sélectif (ex. aspirine, ibuprofène) et des AINS sélectif.
Donner aussi un inconvénient des non sélectif et un avantage des sélectif.
anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS)
AINS non sélectifs (ex. : aspirine, ibuprofène) :
Inhibent à la fois COX-1 et COX-2.
Inconvénient : Problèmes gastro-intestinaux (diminution de la protection de la muqueuse).
AINS sélectifs pour COX-2 (ex. : célécoxib) :
Inhibent principalement COX-2.
Avantage : Réduction de l’inflammation et de la douleur avec moins d’effets secondaires sur la muqueuse gastrique.
De quoi est composé un terpène
D’au moins deux unités d’isoprène
Ils peuvent contenir un groupement prényle.
Nommer un exemple de terpène en indiquant ça structure et son rôle.
Expliquer qu’est-ce qu’un Coenzyme Q10.
Polyprénols : Terpène contenant au moins un groupement OH
- Sert au transfert des électrons dans la chaine de transport des électrons
Un coenzyme Q10 est une molécule organique composée de polyprénols situé dans la structure de la membrane interne des mitochondries
Le cholestérol sert de base pour la synthèse de diverses hormones stéroïdiennes. Nomme les.
- Œstrogènes : Hormones sexuelles féminines impliquées dans la régulation du cycle menstruel et de la fertilité.
- Testostérone : Hormone sexuelle masculine qui joue un rôle dans le développement des caractéristiques sexuelles et la reproduction.
- Cortisol : Hormone de stress qui aide à réguler le métabolisme, l’inflammation et la réponse au stress.
- Aldostérone : Hormone qui joue un rôle dans la régulation de la pression artérielle et de l’équilibre hydrique.
Le cholestérol est précurseur de quoi et est situé où?
- Précurseur des hormones stéroïdiennes
- Composant des membranes biologiques
Vrai ou Faux
Le cholestérol est une molécule cyclique synthétisée à partir d’unités d’isoprène.
Vrai
Nommer les 4 têtes polaires pour les phosphoglycérides.
- Choline (phosphatidylcholine)
- Étanolamine (phosphatidylétanolamine)
- Inositol (phosphatidylinositol)
- Sérine (phosphatidylsérine)
Donner la structure générale, les rôles et les précurseurs des phospholipides.
Structure générale : Tête hydrophile + Queue hydrophobe
Rôles : Plusieurs petits rôles (selon le sous-type), mais sert à isoler l’extérieur de la cellule de l’intérieur (barrière semi-perméable).
Précurseurs : Dépend du type de phospholipides
Donner la structure générale, les rôles(4) et les précurseurs des phosphoglycérides.
Structure générale : Tête polaire + glycérol + phosphate + 2 acide gras
Rôle : Structure membranaire, signalisation cellulaire, réserve d’énergie, interactions avec des protéines (dépend de la tête polaire)
Précurseurs : Acide phosphatidique et acide lysophosphatidique
Donner la structure générale de l’acide phosphatidique et de l’acide lysophosphatidique.
- Phosphate + glycérol + 2 acide gras
- Phosphate + glycérol + 1 acide gras
Donner la structure générale d’un diacylglycérol, ainsi que son rôle.
Structure générale : Glycérol + 2 acide gras
Rôles : Signalisation cellulaire
C’est quoi en vrai un diacylglycérol?
C’est un acide phosphatidique qui a perdu son phosphate. Résultat, il change de rôle et devient une molécule de signalisation.
Donner la structure générale d’un cardiolipide, ainsi que ses rôles(2) et son précurseur.
Structure générale : Glycérol polaire + 2 phosphates + 4 acides gras
(en gros, Glycérol + 2 acide phosphatidiques)
Rôles : Réguler la structure et la fonction des mitochondries
Précurseurs : Acide phosphatidique
Nommer tous les types de phosphoglycérides et indiquer ce qu’ils ont en commun.
Acide phosphatidique
Acide lysophosphatidique
Cardiolipide
Diacylglycérol
Commun : Ils contiennent tous un glycérol-3-phosphate, sauf le diacylglycérol qui a perdu son phosphate donc il a juste un glycérol.
Les phospholipides sont séparé en 2 types, lesquels?
Phosphoglycérides (contient glycérol-3-phosphate)
Sphingolipides (contient sphingosine)
C’est quoi un céramide?
C’est un sphingolipide qui contient uniquement une sphingosine et un acide gras.
Les glycolipides sont dérivés des céramides, qui se forment par l’ajout d’un acide gras à la sphingosine par une liaison amide.
C’est quoi la structure d’un sphingomyéline?
Tête polaire (choline) + phosphate (sur C1) + sphingosine + acide gras
ou encore
Tête polaire (choline) + phosphate (sur C1) + céramide
Est-ce que les céramides et les sphingomyélines font parties des sphingolipides avec phosphates?
Oui
Nommer deux types de sphingolipides avec sucre.
Cérébroside
Ganglioside
Donner la structure générale des cérébrosides
Sucre (glucose ou galactose) + sphingosine + acide gras
ou
Sucre (glucose ou galactose) + céramide
Donner la structure générale des gangliosides
(≥ 3) Résidus glucidiques + (≥1) acide (acétique ou N-acétylneuraminique) + sphingosine + acide gras
ou
(≥ 3) Résidus glucidiques + (≥1) acide (acétique ou N-acétylneuraminique) + céramide
Quels sont les rôles des glycolipides? (3)
Rôle dans la reconnaissance des membranes cellulaires, l’immunité, la transmission synaptique(abondant dans le cerveau).
Vrai ou Faux
Une sphingosine est un dérivé aminé d’un acide gras contenant une liaison double.
Vrai
Décrire la structure générale des acides aminés, incluant l’énantiomère généralement retrouvé dans la nature.
- Un carbone central (α), appelé carbone asymétrique (ou chiral), car il est lié à quatre groupes différents :
o Un groupe amine (-NH₂)
o Un groupe carboxyle (-COOH)
o Un atome d’hydrogène (H)
o Un groupe radical (R), qui varie selon chaque acide aminé et détermine son identité spécifique.
Dans la nature, les acides aminés se retrouvent principalement sous la forme L-énantiomère.
C’est quoi les caractéristiques des acides aminés essentiels ?
- Ne peuvent pas être synthétisés par le corps.
- Doivent être obtenus par l’alimentation.
9 acides aminés ne peuvent pas être synthétisés par nos cellules. Nomme les.
valine, isoleucine, leucine, méthionine, phénylalanine, tryptophane, thréonine, histidine, lysine
Nomme les 3 acides aminés non polaire qu’on apprend, les 6 polaires ou acides qu’on apprend et les 3 basiques qu’on apprend.
Acides aminés non polaire :
- Glycine
- Proline
- Méthionine
Acides aminés polaires ou acides :
- Sérine, thréonine, tyrosine
- Cystéine
- Asparagine, glutamine
Acides aminés basiques :
- Lysine, arginine
- Histidine
Donne les caractéristiques de l’acide aminé suivant : Glycine
Un acide aminé non polaire
o Chaîne latérale (R) : un seul H.
o Il n’est pas strictement non polaire, car il est relativement neutre. (Pas vraiment non polaire.)
Donne les caractéristiques de l’acide aminé suivant : Proline (super important pour l’examen)
Type
Ce qui le différencie des autres
Rôle
Un acide aminé non polaire
o Chaîne latérale (R) attachée au groupe amine du carbone α.
o Brise les hélices alpha dans les structures protéiques.
Donne les caractéristiques de l’acide aminé suivant : Méthionine
Type
Ce qui le différencie des autres
Contient quoi?
Un acide aminé non polaire
o Premier acide aminé (AA) de toutes les protéines.
o Contient du soufre dans sa chaîne latérale.
Donne les caractéristiques de l’acide aminé suivant :
Donne les caractéristiques des acides aminés suivant : Sérine, thréonine, tyrosine
Type
Ils contiennent quoi?
Ils peuvent subir quoi?
Un d’entre eux est différent, lequel et pourquoi?
Acides aminés polaires ou acides
o Contiennent un groupe hydroxyle (-OH).
o Peuvent subir une phosphorylation.
o Tyrosine est hydrophobe malgré la présence d’un groupe OH.
Donne les caractéristiques de l’acide aminé suivant : Cystéine
Type
Il contient quoi?
Il forme quoi qui stabilisent les protéines?
Acides aminés polaires ou acides
o Contient un groupe sulfhydrile (-SH).
o Forme des ponts disulfure qui stabilisent les protéines.
Donne les caractéristiques des acides aminés suivant : Asparagine, glutamine (le deuxième est super important pour l’examen)
Type
Forme aminé de quoi?
Acides aminés polaires ou acides
o Formes aminées de l’acide aspartique et de l’acide glutamique.
Donne les caractéristiques des acides aminés suivant : Lysine, arginine
Type
Ils contiennent quoi?
La lysine est impliquée dans quoi?
Acides aminés basiques
o Contiennent un groupe amine dans leur chaîne latérale.
o Lysine est impliquée dans l’ubiquitination.
Donne les caractéristiques de l’acide aminé suivant : Histidine
Type
Le noyau à quoi de particulié?
Acides aminés basiques
o Noyau imidazole partiellement protoné à pH physiologique (pKa ≈ 7).
Comment les acides aminés sont regroupés?
Ils sont regroupés selon les caractéristiques de leur chaine latérale R, donc si elle est de nature
* Non polaire
* Polaire non chargé
* Acide
* Basique
Décrire les acides aminés non polaires (hydrophobes)
Est-ce qu’ils se dissolvent dans l’eau?
Ils préfèrent se localiser où?
Ces acides aminés ont des chaînes latérales qui ne se dissolvent pas dans l’eau et préfèrent se localiser à l’intérieur des protéines.
Décrire les acides aminés polaires non chargés
Ils interagissent souvent avec quoi ? Et font quelle type de liaison?
Ces acides aminés possèdent des groupes fonctionnels polaires mais ne portent pas de charge nette à pH physiologique. Ils interagissent souvent avec l’eau ou forment des liaisons hydrogène.
Décrire les acides aminés acides (chargés négativement à pH physiologique)
Ces acides aminés possèdent un groupe carboxyle (-COOH) dans leur chaîne latérale, qui est déprotoné à pH physiologique, leur conférant une charge négative.
Décrire les acides aminés basiques (chargés positivement à pH physiologique)
Ces acides aminés ont des chaînes latérales contenant des groupes amines qui sont protonés à pH physiologique, leur donnant une charge positive.
Quels sont les acides aminés spéciaux?
Cystéine, sélénocystéine, glycine, proline
Expliquer comment les acides aminés peu communs (modifiés) sont incorporés dans les protéines, et comment cela diffère pour la sélénocystéine
Certains acides aminés peu communs sont modifiés après la synthèse des protéines
Sélénocystéine :
* Version modifiée de la cystéine qui est directement incorporée pendant la synthèse des protéines, et non après.
Donner trois exemples d’acides aminés peu communs modifiés une fois la protéines synthétisée. Indiqué où ils sont positionné ou produit.
- Hydroxyproline et hydroxylysine : présents dans le collagène.
- Thyroxine : Hormones thyroidiennes
Nommer les caractéristiques de la sélénocystéine.(3)
- Version modifiée de la cystéine qui est directement incorporée pendant la synthèse des protéines, et non après.
- Utilise un codon spécial dans le code génétique pour être ajoutée pendant la traduction.
- Présente dans certaines enzymes spécifiques, comme les oxydoréductases (sélénoprotéines).
Nommer les acides aminés qui ne forment pas de protéines. (6)
- GABA (acide γ-aminobutyrique)
- Sérotonine
- Histamine
- Adrénaline, noradrénaline, dopamine
D’où vient la GABA et c’est quoi son rôle?
Dérivé du glutamate, c’est un neurotransmetteur
D’où vient la sérotonine et c’est quoi son rôle?
Produite à partir du tryptophane, agit comme un neurotransmetteur.
D’où vient l’histamine et c’est quoi son rôle?
Issue de la décarboxylation de l’histidine, elle a des rôles variés dans la signalisation paracrine
D’où viennent l’adrénaline, noradrénaline et la dopamine et quels sont leurs rôles?
Toutes dérivées de la tyrosine, elles sont impliquées dans la signalisation nerveuse et hormonale.
Rôles : Hormones et neurotransmetteurs
C’est quoi le nom systémique des acides gras saturés et des acides gras insaturés?
Acide gras saturé: anoïque
Acide gras insaturé: ènoïque
(oïque: acide carboxylique)
La notation oméga dans les acides gras est utilisé pourquoi?
La notation oméga (ω) est utilisée pour désigner la position des doubles liaisons dans les acides gras en comptant à partir de l’extrémité méthyle (ou terminale) de la chaîne carbonée.
Donne les caractéristiques des acides gras saturés.(4)
Carbone mobile?
Quelle conformation les rends plus stable?
Permet quoi entre les acides gras?
Structure est …..
- Tous les carbones sont mobiles
- Conformation étirée plus stable
- Permet de coller les acides gras entre eux
- Structure moins fluide, plus rigide
Donne les caractéristiques des acides gras insaturés.(5)
Cis ou Trans
La réponse de avant cause quoi dans la molécule?
Provoque quoi entre les acides gras?
Molécule …
La structure finale adoptée va dépendre de quoi?
- Acides gras naturels généralement en cis
- Cause une pliure dans la molécule
- Éloigne les acides gras les uns des autres
- Plus fluide
- La structure finale adoptée va dépendre du nombre d’insaturations
Caractéristiques des triglycérides(3).
Graisse neutre
Forme principale de stockage des acides gras
Peuvent contenir 3x le même acide gras ou des acides gras différents
Vrai ou Faux
Les acides gras sont tous associés à un glycérol.
Faux
La majorité des acides gras sont associés à un glycérol, mais pas toujours. Parfois, ils sont associés à une sphingosine.
Les phosphoglycérides sont synthétisés à partir de quoi?
Synthétisés à partir d’un sn-glycérol-3-phosphate
sn: stereospecific numbering – C1 est en haut quand OH sur C2 est à gauche dans la projection de Fisher
Phosphatidylsérine (PS) et phosphatidylinositol (PI) jouent un rôle dans quoi ?
Phosphatidylsérine (PS) : apoptose
Phosphatidylinositol (PI) : Signalisation cellulaire (phosphorylation)
